Başlamak için, disseke ve sabit fare böbreklerini PBS'ye yerleştirin. Beyin matrisini kullanarak böbreği bir milimetre kalınlığında bölümlere ayırın. Dilimleri %4 paraformaldehite aktarın ve gece boyunca dört santigrat derecede sabitleyin.
Işık tabakası mikroskobu için, tüm böbreği %4 PFA'ya batırarak ve 48 saat boyunca dört santigrat derecede inkübe ederek sabitleyin. Doku temizliği için, böbrek örneklerini 50 mililitrelik bir santrifüj tüpünde toplayın ve daha sonra 37 santigrat derecede 60 RPM'de çalkalayarak kübik L cinsinden temizleyin. Tatmin edici optik şeffaflık elde edilene kadar kübik L'yi aralıklı olarak değiştirin.
Numuneleri PBS'de her biri bir saat oda sıcaklığında hafifçe çalkalayarak üç kez yıkayın. Daha sonra numunelere kübik R uygulayın ve altı saat çalkalamaya bırakın. Temizlenmiş numuneleri doğrudan gözlemleyin veya bir hafta boyunca oda sıcaklığında kübik R ile doldurulmuş opak tüplerde saklayın.
