Aconitum sarkaç Örneklerinin Analizi için Moleküler Ağ İşleminin 2D-HPLC-MS'ye Entegrasyonu

Veri hazırlamaya başlamak için 2D HPLC-MS ham kütle spektral verilerini dışa aktarın. WINSCP arayüzünde yer alan GNPS FTP sunucusuna bağlanmak için yanındaki Oturum Yapılandırması sayfasını doldurun ve bağlantı bilgilerini doldurun. Bilgileri doldurduktan sonra GNPS FTP sunucusuna bağlantı kurmak için Start (Başlat) butonuna tıklayınız.

Bir web tarayıcısı açarak ve GNPS web sitesini ziyaret ederek moleküler ağlar oluşturun. Yeni kullanıcıların bir hesaba kaydolması ve ardından oturum açması gerekir. GNPS web sitesinin ana arayüzünde, Veri Analizi altında Moleküler Ağ Oluştur'a tıklayın.

Görev Oluşturma sayfasında, Giriş Dosyalarını Seç düğmesine tıklayın, ardından veri dosyasını seçin ve yükleyin. İş Akışı Seçeneği sekmelerinde, moleküler ağı veya MN'yi oluşturan çeşitli parametreleri ayarlayın. Bu parametreler, tepe çıkarma algoritmasını, hareket değeri üzerinden zirveyi, benzerlik hesaplama yöntemini vb. içerir. Gerektiği gibi uygun parametre ayarlarını yaptıktan sonra, görevi çalıştırmak için sayfanın altındaki Gönder düğmesine tıklayın.

Görev çalıştırıldıktan sonra, İşler sekmesinde oluşturulan görevleri bulun ve analiz sonuçlarını görüntülemek için iş akışı adına tıklayın. Web sitesi MN diyagramları, ikameler, simbiyotik ağlar ve diğer ilgili bilgileri sağlar. MN tarafından tanımlanan APB örneklerindeki alkaloid bileşenlerden dördü akonitin, 14-benzoilakonin, 14-O-asetilneolin ve hipakonitin idi.

Dört bileşik aynı ana çekirdeğe sahipti. Akonitin, 14-benzil akonin, 14-benzoylakonin ve hipakonitin benzerdi ve sadece ikame ediciler farklıydı.