Bu malzeme Grant BCS 1063774 altında Ulusal Bilim Vakfı tarafından desteklenen çalışma dayanmaktadır.

1. Polar açı Topoğrafya Stimulus ve Psikofizik SC bir polar açı retinotopic haritası elde etmek için, biz uyarıcı olarak hareket eden noktalar 90 ° kama (eksantriklik görsel açı 2-9 °, nokta-hız 4 ortalama ° / sn) (Şekil 1) kullanın. Bu SC aktivite gizli dikkatini 5 uygulanarak geliştirilmiştir biliniyor, dolayısıyla biz mevcut sinyal artırmak için paradigmada bir dikkat görev kullanın. Her 2 s yargılanıyor, konular gizlice tüm kama katılmak ve fiksasyon korurken bir hız ayrımcılık görevi gerçekleştirmek için talimat vardır. Kama rastgele diğer tüm noktalar daha yavaş veya hızlı hareket eden, her mahkemeye seçilen sektörlerden biri noktalarla 2 × 3 sanal sektörlere ayrılmıştır. Her denemenin ardından, kama uyaran bir 24 sn süre ile tam döner böylece fiksasyon etrafında döndürülerek 30 ° dir. Her çalışma uyaranın 9.5 dönmeler (228 sn) oluşur ve deneysel oturumları içerir16-18 çalışır. Her çalışma süresi boyunca bu görevde tabi performansını korumak için, görevin zorluk iki rasgele içiçe iki-yukarı-aşağı bir merdiven kullanılarak ayarlanır. Her iki ardışık doğru denemeler sonra hız farkı% 8 oranında azalır ve her yanlış deneme için, aradaki fark% 8 oranında artmıştır. Tarama öncesinde bu performansı istikrarlı bir seviye elde edene kadar bütün konularda tarayıcı dışında görsel görev İnanç; bu 3-4 20 dakikalık süresi uygulama oturumları gerektirir. Tipik bir ayrım eşik 1 ° -1,5 ° / sn aralığı içindedir. 2. Konu Hazırlığı <ol><li> Denekler kafaları delik tarayıcının içine yerleştirilen önce kafa hareketleri en aza indirmek için ped ile teminat altına alınmıştır. Bu yüksek uzaysal çözünürlükte, fMRI hareket eserler özellikle duyarlıdır, bu yüzden kafa istikrar önemlidir. </li><li> Denekler bir MRI-compatib verilirle düğmesine bir elinde pad ve nokta hızı ile ilgili yargılarını belirtmek için basın hangi düğme ile ilgili talimat verdi. </li></ol> 3. SC yerelleştirme ve Reçete <ol><li> İnsan SC küçük ama belirgin bir yapıdır, orta beyin çatısında bulunan çapı ~ 9 mm. FMRI dilimleri küçük bir sayı kullanırken, birden Localizer görüntüleme serisi onun kesin lokalizasyonu için gereklidir. Biz, sagital aksiyel ve koronal düzlemleri boyunca bu dizi çalıştırın. </li><li> Daha sonra kesin 8-10 bitişik dilim, 1.2 mm kalınlığında, görüş alanı (FOV), eğik, yarı-aksiyel planda 170 mm SC reçete için bu Localizer resimleri kullanabilirsiniz. </li><li> Sonra, yüksek çözünürlüklü T 1 ağırlıklı yapısal görüntüleri bir kez öncesinde ve sonrasında bir kez fonksiyonel veri toplamak için üç boyutlu (3D) RF-şımarık ÇİM (SPGR) dizisi (15 ° flip angle, 1.2 mm vokseller) kullanılarak elde edilir. Bu görüntüler yüksek çözünürlüklü bir str fMRI verisinin hizalamak için bir referans olarak kullanılıructural referans volüm daha sonra tarif ayrı bir oturumda aldı. </li></ol> 4. Fonksiyonel MRI Parametreler Tüm görüntüleme GE tarafından sağlanan 8-kanal, baş bobini kullanarak bir GE Signa HD12 3T MR tarayıcı yapıldı. Uyarma bir 6.4 ms pencereli-sinc darbe tarayıcı vücut sarmalı kullanılarak uygulanmıştır. Insan SC 1.2 mm örnekleme elde etmek için, biz üç-shot spiral yörünge edinimi 6,7 kullanın. Üç çekim çeşitli nedenlerle ihtiyaç vardır. Bizim tarayıcı ve pratik olması çok uzun FOV gerektirir&gt; 77 msn, özellikle, tek-shot edinimi. Birden çok çekim başlangıç ​​değeri ve faz lineer trend çıkarılarak düzeltme sonrası birlikte birleştirilir. TE edilen ilk iki hacim bir alan haritası tahmin etmek için ilk çerçevesi üzerine 2 ms artırılır ve bu haritası lineer düzeltilmesi için kullanılır. Rekonstrüksiyon görüntüleri ~ 20 bir SNR vardı. SC Zamansal güç spektrumu genellikle voksellerfizyolojik gürültü ile ilişkili yapının biraz gösterdi; 3-shot edinimi kullanımı kardiyak nabız ve solunum nispeten yüksek frekanslı efektleri üzerinde güçlü bir filtreleme etkisi vardı. Diğer gürültü azaltma teknikleri bu yüksek çözünürlüklü bağlamında sorunludur. Örneğin, RETROICOR 6 gibi geriye dönük düzeltme yöntemleri çoklu çekim veriler için geçerli değildir ve kardiyak gating gürültü ve T 1 denge bozuklukları ile ilişkili artifakı tanıttı. Yankı zamanı, T E = 40 msn, biz kortikal gri cevher (~ 45 msn) gözlenen daha SC dokuda buna uygun uzun T 2 * (~ 60 msn) ölçüldü çünkü genellikle korteks (30 milisaniye) kullanılan daha uzun. Toplama bant genişliği bizim tarayıcı üzerinde istenmeyen ısınmasına neden olur pik gradiyent akımı azaltmak için 62.5 kHz ile sınırlıdır. Biz TR = 1 sn, yani üç çekim bir birimde her 3 elde edilir seçinsn. 5.. Yapısal MRG ve 3D Modelleme Her konu için tek bir ayrı oturumda, (0.7 mm örnekleme) T 1-ağırlıklı sekans iyi doku kontrastı (3D SPGR, 15 ° flip angle, T I = 450 hazırlanan inversiyon verir kullanarak referans hacmi yüksek çözünürlük elde msn, 2 uyarılmaları, ~ 28 dakika süre, 0.7 mm vokseller). Bu referans hacmi, biz segmenti orta beyin, beyin sapı ve ITK-SNAP uygulaması 2 tarafından sağlanan otomatik ve manuel teknikleri bir arada kullanarak talamus (Şekil 2A) bölümlerini doku. Özellikle, biz bir otomatik bölümleme aracı kullanmak gereken her beyin sapı içindeki kullanıcı tohumlar birden fazla nokta; yazılım otomatik kontrast ve yoğunluk kriterleri tanımlanmış bir bölge içinde kısıtlı tohum noktaları etrafında segmentasyon genişletir. Bu otomatik bölümleme sonra ayarlaed, gerektiği takdirde, manuel kullanılarak, &quot;boya benzeri&quot; voksel araçları. SC beyin omurilik sıvısı doku arayüzü isodensity yüzeye mozaikleme kullanarak segmentasyon enterpolasyonlu, ve bu ilk yüzeyi varyasyonel deforme yüzey algoritması kullanılarak 3 aliasing eserler (Şekil 2, B ve D) azaltmak için rafine edilir. Bu yüzey köşeleri ve laminer hesaplamalar için bir referans (aşağıda açıklanmıştır) gibi fonksiyonel veriler görsel bir aracı olarak kullanılmak üzere dışarı doğru normal vektörleri sağlar. 6. Image Analysis FMRI verileri analiz etmek, biz mrVista yazılım paketi (indirilebilir kullanabilirsiniz <a href="http://white.stanford.edu/mrvista.php" target="_blank">http://white.stanford.edu/mrvista.php)</a> yanı sıra laboratuarımızda mrVista çerçeve üzerinde geliştirilen araçlar. Önümüzdeki birkaç adımda biz standart mrVista paketi araçları kullanabilirsiniz: <ol><li> Initializeuzamsal bobin homojen etkilerini azaltmak için ortalama veri yoğunluğu normale seçeneğini mrVista oturum,. Normalleşme tahmin gürültü için bir katkı sağlam düzeltme ile zamansal ortalama hacmi görüntü yoğunluğu düşük-pass filtre versiyonu bölünerek, bir homomorfik yöntemi kullanır. Görüntüler (12 sn) ilk yarısında döngüsü geçici MR denge ve hemodinamik etkileri önlemek için atılır. </li><li> Çalışma içi hareket düzeltin. Hareket hacim zaman dizi tahmin edilmektedir. Ancak, görüntülerin nispeten düşük sinyal-gürültü oranı (SNR), biz ilk zaman serisi üzerine yumuşatma 5 numune yük vagonu gerçekleştirin. Her hacmi sonra son 5 numunelerin ortalaması kayıtlı. Yumuşatma yalnızca hareket tahmin etmek için kullanılan unutmayın ve gerçek veri düz olmayacaktır. </li><li> Her çalıştırma hareket-düzeltilmiş görüntü verilerinin zamansal ortalamaları Form ve arasında işletilen hareket USI düzeltmek için bu ortalamaların kullanınreferans olarak ng son dönemde. </li><li> Bir dilim zamanlama düzeltme gerçekleştirin. Biz sıralı dilim satın kullanmak, yani hareket düzeltme sonrası zamanlama düzeltme işlemi nedeniyle hatalar (~ 125 msn) küçük olacaktır. </li><li> Ortalama birden SNR geliştirmek için her seans içinde kaydedilen çalışır. </li><li> Sağlam bir yoğunluk tabanlı kayıt algoritmasını 8 kullanarak referans yapısal birime fMRI oturumdan yapısal veri hizalayın. MrVista içine uyum ve segmentasyon yükleyin. </li><li> Parçalara referans hacmi fonksiyonel zaman serisi verileri dönüştürmek. Aşağıdaki adımları daha ileri analiz yapmak laboratuarımızda geliştirilen araçlarını kullanın. </li><li> Her SC doku voksellerden ve SC yüzeye en yakın tepe arasındaki mesafeyi hesaplayarak mesafe haritası hesaplayın. Bu mesafeleri referans hacmi içinde laminer pozisyonu ölçmek için kullanılır. </li><li> Th geliştirmek için zaman serisi veri derinliği ortalama etkinleştirmek için bir laminar segmentasyon işlemi gerçekleştirine SNR. Küçük doku (1.6 mm çap) diskleri tamamını yüzeysel SC yüzeyi boyunca yüzeyi modeli her bir tepe noktası ile ilişkilidir, ve her bir disk sonra bireysel bir laminar komşu oluşturmak üzere lokal yüzey normalleri kullanılarak SC dokudan içe ve dışa doğru hem uzatılır 4. </li><li> SC yüzeyinde her nokta için, belirli bir derinlikte aralığında zaman serisi ortalamasını bu laminar dernekler kullanın. Bu yana, görsel duyarlı nöronlar görsel uyarılması deney için bizim 0-1,8 mm arasında bir derinliğe aralığı kullanılan, SC yüzeysel katlarının esas olarak mevcuttur. </li></ol> 7. Halihazır Harita Analizi Veri topografik gösterimi analiz için, Uyum analizi her voksel için Stimulus tekrarlama frekansında bir sinüzoidin (yani, yukarıda açıklanan 24 sn teşvik için 1/24 Hz) takarak derinliği ortalama zaman serisi yapılmaktadır. Bu uyum, biz sorumlu yüzey haritaları eldese genlik, tutarlılık, ve faz. Bu analiz, frekans uygulandı ve görsel korteks 9,10 olarak retinotopic haritalar ölçmek için yaygın bir tekniktir. Sinüzoidal uyum aşaması uyaranın konumunu ölçer. Sıfır faz üst dikey dorukta (Şekil 3) karşılık gelir. Uyaran sonra bu yüzden bir π / 2 faz uyaran sağ görme alanında yatay meridyen döndürülmüş olduğunda karşılık, saat yönünde dönmektedir. Fazın π radyan sonra, uyaran sol görme alanı içine geçer, ve benzeri. Ayrıca yüksek çözünürlüklü T1-ağırlıklı ses anatomi elle muayene ile SC tüm yüzeysel ölçüde sınırları aldı. Bu sınırlar Şekil işaretlenir. Kırmızı kesik çizgilerle 3. fMRI doğrudan sinir aktivitesini ölçmek değil, sıkı bir kan akışı yanıt ama yapışkan birleştiğinde değilnöronal aktiviteye. Bu faz cevabı bir hemodinamik gecikme ekler. Gecikme, her SC bölge-of-ilgi bizim tutarlılık eşiğin üzerinde tüm vokseller alarak ve karmaşık düzlemde π etrafında kendi yollarla merkezleme tarafından tahmin edilmektedir. Bizim SC verilerde, bu gecikmeler 2-4 sn düzenin, oldukça küçük. Biz renk haritası 45 derece (3 sn karşılık gelen) (Şekil 3) saat yönünün tersine çevirerek bu gecikme kaldırmak. 8. Temsilcisi Sonuçlar SC (Şekil 3) bir 3 boyutlu yüzey üzerine işlenmiş Faz verileri görsel uyarılara yanıt SC, yani sol görme alanı sağ SC temsil edilir ve vice-bir-versa içinde contralaterally temsil olduğunu gösterir. Bir etkinlik retinotopic örgütü vardır. Sağ üst görme alanı sol kollikulus (mavi-kırmızı) üzerinde mediale temsil edilmektedir, ve alt alan (kırmızı-sarı) yanal temsil edilmektedir. SimilArly, sol üst görme alanı sağ kollikulus (mavi-mavi) üzerinde mediale temsil edilir ve daha düşük (yeşil-sarı) yanal temsil edilmektedir. Tek ünite elektrofizyoloji kullanarak görsel uyarı için) 1 ve 2) mikrostimülasyonla bağlı sakkadik göz hareketleri 11,12 haritalama: Bu topografya SC yanıtların insan dışı primat çalışmaların sonuçları ile uyumludur. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/3746/3746fig1.jpg" /> Şekil 1. Orta sagital görüntü izlenebiliyor A) Dilim reçete. B) fonksiyonel görüntüler zamansal ortalama (1-run itibaren) A) kırmızı ile işaretlenmiş merkezi dilim elde. <img alt="Şekil 2" src="/files/ftp_upload/3746/3746fig2.jpg" /> Şekil 2. Polar açı topoğrafya uyarıcı. Gri bir arka plan üzerinde siyah-beyaz noktalar hareketli bir 90 ° kama fiksasyon etrafında yavaş yavaş döndürülür. Kama 6 virtû bir dizi ayrıldıal sektörler (gri çizgiler sektörler vurgulamak için eklendi) konusu, rasgele seçilen sektörde bir hız ayrımcılık görevi gerçekleştirmek için izin vermek. <img alt="Şekil 3" src="/files/ftp_upload/3746/3746fig3.jpg" /> Şekil 3. Segmentasyon ve yüzey modelleme. A) orta beyin, beyin sapı ve talamus bölümlerini yüksek çözünürlüklü MR anatomisi miktarlar parçalı idi. B) bir yüzey bölgesi segmented kenarında oluşturuldu. C) Sinüzoidal-fit aşama verileri bir düzlemlerinde oluşan dilim (tutarlılık&gt; 0.25) görüntülenebilir. D) beyin sapı yüzeyi modeli ile döndürülür ve bir büyütülmüş görünüşüdür SC faz veriler görsel için kullanıldı. <img alt="Şekil 4" src="/files/ftp_upload/3746/3746fig4.jpg" /> Şekil 4. Polar açı haritalar. görsel polar açı kodlamak iki konuda fMRI faz haritalar. Her harita için Koherens eşikleri sağ alt sağlanmaktadır. Renk tekerleği p uyaranın kaplanan aşamaları ile ilgilidirkendi görme alanı konumlarına olar açısı.

<ol>
	<li>Katyal, S., Zughni, S., Greene, C., Ress, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Topography+of+covert+visual+attention+in+human+superior+colliculus.">Topography of covert visual attention in human superior colliculus.</a> Journal of Neurophysiology. 104, 3074-3083 (2010).</li><li>Yushkevich, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=User-guided+3D+active+contour+segmentation+of+anatomical+structures:+significantly+improved+efficiency+and+reliability.">User-guided 3D active contour segmentation of anatomical structures: significantly improved efficiency and reliability.</a> NeuroImage. 31, 1116-1128 (2006).</li><li>Xu, G., Pan, Q., Bajaj, C. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Discrete+Surface+Modeling+Using+Partial+Differential+Equations.">Discrete Surface Modeling Using Partial Differential Equations.</a> Computer Aided Geometric Design. 23, 125-145 (2006).</li><li>Ress, D., Glover, G. H., Liu, J., Wandell, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Laminar+profiles+of+functional+activity+in+the+human+brain.">Laminar profiles of functional activity in the human brain.</a> NeuroImage. 34, 74-84 (2007).</li><li>Schneider, K. A., Kastner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+sustained+spatial+attention+in+the+human+lateral+geniculate+nucleus+and+superior+colliculus.">Effects of sustained spatial attention in the human lateral geniculate nucleus and superior colliculus.</a> J. Neurosci. 29, 1784-1795 (2009).</li><li>Glover, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simple+analytic+spiral+K-space+algorithm.">Simple analytic spiral K-space algorithm.</a> Magn. Reson. Med. 42, 412-415 (1999).</li><li>Glover, G. H., Lai, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Self-navigated+spiral+fMRI:+interleaved+versus+single-shot.">Self-navigated spiral fMRI: interleaved versus single-shot.</a> Magn. Reson. Med. 39, 361-368 (1998).</li><li>Nestares, O., Heeger, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Robust+multiresolution+alignment+of+MRI+brain+volumes.">Robust multiresolution alignment of MRI brain volumes.</a> Magn. Reson. Med. 43, 705-715 (2000).</li><li>Engel, S. A., Glover, G. H., Wandell, B. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retinotopic+organization+in+human+visual+cortex+and+the+spatial+precision+of+functional+MRI.">Retinotopic organization in human visual cortex and the spatial precision of functional MRI.</a> Cereb. Cortex. 7, 181-192 (1997).</li><li>Schneider, K. A., Kastner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visual+responses+of+the+human+superior+colliculus:+a+high-resolution+functional+magnetic+resonance+imaging+study.">Visual responses of the human superior colliculus: a high-resolution functional magnetic resonance imaging study.</a> Journal of Neurophysiology. 94, 2491-2503 (2005).</li><li>Cynader, M., Berman, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Receptive-field+organization+of+monkey+superior+colliculus.">Receptive-field organization of monkey superior colliculus.</a> Journal of Neurophysiology. 35, 187-201 (1972).</li><li>Robinson, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Eye+movements+evoked+by+collicular+stimulation+in+the+alert+monkey.">Eye movements evoked by collicular stimulation in the alert monkey.</a> Vision Research. 12, 1795-1808 (1972).</li><li>Schreiner, C. E., Langner, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Laminar+fine+structure+of+frequency+organization+in+auditory+midbrain.">Laminar fine structure of frequency organization in auditory midbrain.</a> Nature. 388, 383-385 (1997).</li><li>Baumann, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Orthogonal+representation+of+sound+dimensions+in+the+primate+midbrain.">Orthogonal representation of sound dimensions in the primate midbrain.</a> Nature Neuroscience. 14, 423-425 (2011).</li><li>Malmierca, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+discontinuous+tonotopic+organization+in+the+inferior+colliculus+of+the+rat.">A discontinuous tonotopic organization in the inferior colliculus of the rat.</a> J. Neurosci. 28, 4767 (2008).</li><li>Bender, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retinotopic+organization+of+macaque+pulvinar.">Retinotopic organization of macaque pulvinar.</a> Journal of Neurophysiology. 46, 672 (1981).</li><li>Grieve, K. L., Acuña, C., Cudeiro, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+primate+pulvinar+nuclei:+vision+and+action.">The primate pulvinar nuclei: vision and action.</a> Trends in Neurosciences. 23, 35-39 (2000).</li><li>Rodriguez-Oroz, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+subthalamic+nucleus+in+Parkinson's+disease:+somatotopic+organization+and+physiological+characteristics.">The subthalamic nucleus in Parkinson's disease: somatotopic organization and physiological characteristics.</a> Brain. 124, 1777 (2001).</li><li>Romanelli, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microelectrode+recording+revealing+a+somatotopic+body+map+in+the+subthalamic+nucleus+in+humans+with+Parkinson+disease.">Microelectrode recording revealing a somatotopic body map in the subthalamic nucleus in humans with Parkinson disease.</a> Journal of Neurosurgery. 100, 611-618 (2004).</li><li>DeLong, M. R., Crutcher, M. D., Georgopoulos, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Primate+globus+pallidus+and+subthalamic+nucleus:+functional+organization.">Primate globus pallidus and subthalamic nucleus: functional organization.</a> Journal of Neurophysiology. 53, 530 (1985).</li><li>Houeto, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Acute+deep-brain+stimulation+of+the+internal+and+external+globus+pallidus+in+primary+Dystonia+functional+mapping+of+the+pallidum.">Acute deep-brain stimulation of the internal and external globus pallidus in primary Dystonia functional mapping of the pallidum.</a> Archives of Neurology. 64, 1281-1286 (2007).</li></ol>

Çıkar çatışması ilan etti.

Bizim toplama ve veri analiz teknikleri yüksek çözünürlüklü (1.2 mm vokseller) de subkortikal insan beyin yapılarında nöral aktivitenin ölçümü sağlar. 3-shot spiral satın Ortabeyin etrafında fMRI ölçümleri özellikle zararlı olduğunu fizyolojik gürültüyü azaltır. Buna ek olarak, doku bizim laminer bölütleme us SNR arttırmada yardımcı verilerin ortalaması derinliği gerçekleştirmek için olanak sağlar. Biz görsel uyarı ve insan SC 1 gizli görsel dikkat hassas polar açı ...

high-resolution functional magnetic resonance imaging methods for human midbrain

Fonksiyonel MRI (fMRI) non-invaziv insan beyin aktivitesinin korele ölçmek için yaygın olarak kullanılan bir araçtır. Ancak, kullanımı en çok tercih örneğin orta beyin sapı ve olarak subkortikal bölgede daha serebral kortekse bir yüzey üzerinde aktivitesini ölçme üzerine odaklanmıştır. Uzamsal çözünürlük ve fizyolojik gürültü: subkortikal fMRI iki zorlukların üstesinden gerekir. Burada insan SC, ortabeyin dorsal yüzeyi üzerinde bir yapı içinde yüksek çözünürlüklü fMRI gerçekleştirmek için geliştirilen tekniği optimize edilmiş bir grubu tanımlar; yöntemleri, aynı zamanda resim, diğer beyin sapı ve subkortikal yapılar için kullanılabilir. Yüksek çözünürlüklü (1.2 mm vokseller) SC fMRI bir konvansiyonel olmayan bir yaklaşım gerektirir. İstenen uzamsal örnekleme bir çoklu çekim (serpiştirmeli) spiral edinimi 1 kullanılarak elde edilir. Yana, T SC doku 2 * uzun korteks, bir buna uzun eko zamanı (T E ~ 40 msn) daha olduğunu maxi için kullanılırfonksiyonel kontrast hale getirir. SC tam ölçüde karşılamak için, 8-10 dilim elde edilir. Her bir oturum için fMRI aynı kesit reçete ile bir yapısal anatomisine aynı zamanda yüksek bir çözünürlüğe sahip referans hacme işlevsel bir veri hizalamak için kullanıldığı, elde edilir. Ayrı bir oturumda, her konu için, biz (0.7 mm örnekleme) T 1 ağırlıklı iyi doku kontrastı verir dizisi kullanarak referans hacmi yüksek çözünürlüklü oluşturun. Referans volüm olarak, orta beyin bölgesi ITK-SNAP yazılım uygulamasını kullanarak 2 parçalı olduğunu. Bu segmentasyon 3 pürüzsüz ve doğru olarak orta beynin bir 3D yüzey gösterimi oluşturmak için kullanılır. Yüzey köşeleri ve normal doku 4 içinde Ortabeyin yüzeyinden derinliği bir harita oluşturmak için kullanılır. Fonksiyonel verileri parçalı referans volüm koordinat sistemine dönüştürülmüştür. Voksellerden derinliği derneklersinyal kalitesini artırmak için belirli bir derinliğe sınırlarda fMRI zaman serisi verilerinin ortalaması sağlar. Veri görselleştirme için 3 boyutlu yüzey üzerinde işlenir. Laboratuar biz SC 1 içinde görsel uyarı ve gizli ve açık görsel dikkat topografik haritalar ölçüm için bu tekniği kullanabilirsiniz. Bir örnek olarak, SC görsel uyarılmasına polar açısının topografik temsilini göstermektedir.

Watch this Scientific Journal Video about High-resolution Functional Magnetic Resonance Imaging Methods for Human Midbrain at JoVE.com

High-resolution Functional Magnetic Resonance Imaging Methods for Human Midbrain

Bu makalede, 3T tarayıcı kullanarak insan orta beyin ve subkortikal yapılarda 1.2 mm örnekleme ile yüksek çözünürlüklü fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme gerçekleştirmek için teknikler anlatılmaktadır. Insan üstün kollikulus (SC) görsel uyarım topografik haritalar çözmek için bu tekniklerin kullanılması örnek olarak verilmiştir.

İnsan orta beyin için yüksek çözünürlüklü Fonksiyonel Manyetik Rezonans Görüntüleme Yöntemleri

Functional MRI (fMRI) is a widely used tool for non-invasively measuring correlates of human brain activity. However, its use has mostly been focused upon ...

high-resolution-functional-magnetic-resonance-imaging-methods-for

Research

JoVE Journal

Neuroscience

12.8K Görüntüleme.  The University of Texas at Austin. Bu makalede, 3T tarayıcı kullanarak insan orta beyin ve subkortikal yapılarda 1.2 mm örnekleme ile yüksek çözünürlüklü fonksiyonel manyetik rezonans görüntüleme gerçekleştirmek için teknikler anlatılmaktadır. Insan üstün kollikulus (SC) görsel uyarım topografik haritalar çözmek için bu tekniklerin kullanılması örnek olarak verilmiştir.

Video: High-resolution Functional Magnetic Resonance Imaging Methods for Human Midbrain

Multiple-mouse Neuroanatomical Magnetic Resonance Imaging

The field of mouse phenotyping with magnetic resonance imaging (MRI) is rapidly growing, motivated by the need for improved tools for characterizing and evaluating mouse models of human disease. MRI is an excellent modality for investigating genetically altered animals. It is capable of whole brain coverage, can be used in vivo, and provides multiple contrast mechanisms for investigating different aspects of neuranatomy and physiology. The advent of high-field scanners along with the ability to scan multiple mice simultaneously allows for rapid phenotyping of novel mutations.
Effective mouse MRI studies require attention to many aspects of experiment design. In this article, we will describe general methods to acquire quality images for mouse phenotyping using a system that images mice concurrently in shielded transmit/receive radio frequency (RF) coils in a common magnet (Bock et al., 2003). We focus particularly on anatomical phenotyping, an important and accessible application that has shown a high potential for impact in many mouse models at our imaging centre. Before we can provide the detailed steps to acquire such images, there are important practical considerations for both in vivo brain imaging (Dazai et al., 2004) and ex vivo brain imaging (Spring et al., 2007) that should be noted. These are discussed below.

Magnetic resonance imaging (MRI) has become an increasingly popular tool for examining the phenotype of genetically altered mice. This article illustrates the methods necessary to achieve high-throughput phenotyping of genetically altered mice using multiple-mouse MRI.

Çoklu-fare nöroanatomik Manyetik Rezonans Görüntüleme

The field of mouse phenotyping with magnetic resonance imaging (MRI) is rapidly growing, motivated by the need for improved tools for characterizing and ...

Nörobilim

A Rapid Approach to High-Resolution Fluorescence Imaging in Semi-Thick Brain Slices

A fundamental goal to both basic and clinical neuroscience is to better understand the identities, molecular makeup, and patterns of connectivity that are characteristic to neurons in both normal and diseased brain. Towards this, a great deal of effort has been placed on building high-resolution neuroanatomical maps1-3. With the expansion of molecular genetics and advances in light microscopy has come the ability to query not only neuronal morphologies, but also the molecular and cellular makeup of individual neurons and their associated networks4. Major advances in the ability to mark and manipulate neurons through transgenic and gene targeting technologies in the rodent now allow investigators to 'program' neuronal subsets at will5-6. Arguably, one of the most influential contributions to contemporary neuroscience has been the discovery and cloning of genes encoding fluorescent proteins (FPs) in marine invertebrates7-8, alongside their subsequent engineering to yield an ever-expanding toolbox of vital reporters9. Exploiting cell type-specific promoter activity to drive targeted FP expression in discrete neuronal populations now affords neuroanatomical investigation with genetic precision.
Engineering FP expression in neurons has vastly improved our understanding of brain structure and function. However, imaging individual neurons and their associated networks in deep brain tissues, or in three dimensions, has remained a challenge. Due to high lipid content, nervous tissue is rather opaque and exhibits auto fluorescence. These inherent biophysical properties make it difficult to visualize and image fluorescently labelled neurons at high resolution using standard epifluorescent or confocal microscopy beyond depths of tens of microns. To circumvent this challenge investigators often employ serial thin-section imaging and reconstruction methods10, or 2-photon laser scanning microscopy11. Current drawbacks to these approaches are the associated labor-intensive tissue preparation, or cost-prohibitive instrumentation respectively.
Here, we present a relatively rapid and simple method to visualize fluorescently labelled cells in fixed semi-thick mouse brain slices by optical clearing and imaging. In the attached protocol we describe the methods of: 1) fixing brain tissue in situ via intracardial perfusion, 2) dissection and removal of whole brain, 3) stationary brain embedding in agarose, 4) precision semi-thick slice preparation using new vibratome instrumentation, 5) clearing brain tissue through a glycerol gradient, and 6) mounting on glass slides for light microscopy and z-stack reconstruction (Figure 1).
For preparing brain slices we implemented a relatively new piece of instrumentation called the 'Compresstome' VF-200 (http://www.precisionary.com/products_vf200.html). This instrument is a semi-automated microtome equipped with a motorized advance and blade vibration system with features similar in function to other vibratomes. Unlike other vibratomes, the tissue to be sliced is mounted in an agarose plug within a stainless steel cylinder. The tissue is extruded at desired thicknesses from the cylinder, and cut by the forward advancing vibrating blade. The agarose plug/cylinder system allows for reproducible tissue mounting, alignment, and precision cutting. In our hands, the 'Compresstome' yields high quality tissue slices for electrophysiology, immunohistochemistry, and direct fixed-tissue mounting and imaging. Combined with optical clearing, here we demonstrate the preparation of semi-thick fixed brain slices for high-resolution fluorescent imaging.

Here we describe a rapid and simple method to image fluorescently labeled cells in semi-thick brain slices. By fixing, slicing, and optically clearing brain tissue we describe how standard epifluorescent or confocal imaging can be used to visualize individual cells and neuronal networks within intact nervous tissue.

Yarı Kalın Beyin Slices Yüksek Çözünürlük Floresans Görüntüleme Hızlı Bir Yaklaşım

A fundamental goal to both basic and clinical neuroscience is to better understand the identities, molecular makeup, and patterns of connectivity that are ...

The Use of Magnetic Resonance Spectroscopy as a Tool for the Measurement of Bi-hemispheric Transcranial Electric Stimulation Effects on Primary Motor Cortex Metabolism

Transcranial direct current stimulation (tDCS) is a neuromodulation technique that has been increasingly used over the past decade in the treatment of neurological and psychiatric disorders such as stroke and depression. Yet, the mechanisms underlying its ability to modulate brain excitability to improve clinical symptoms remains poorly understood 33. To help improve this understanding, proton magnetic resonance spectroscopy (1H-MRS) can be used as it allows the in vivo quantification of brain metabolites such as &#947;-aminobutyric acid (GABA) and glutamate in a region-specific manner 41. In fact, a recent study demonstrated that 1H-MRS is indeed a powerful means to better understand the effects of tDCS on neurotransmitter concentration 34. This article aims to describe the complete protocol for combining tDCS (NeuroConn MR compatible stimulator) with 1H-MRS at 3 T using a MEGA-PRESS sequence. We will describe the impact of a protocol that has shown great promise for the treatment of motor dysfunctions after stroke, which consists of bilateral stimulation of primary motor cortices 27,30,31. Methodological factors to consider and possible modifications to the protocol are also discussed.

This article aims to describe a basic protocol for combining transcranial direct current stimulation (tDCS) with proton magnetic resonance spectroscopy (1H-MRS) measurements to investigate the effects of bilateral stimulation on primary motor cortex metabolism.

Birincil Motor Cortex Metabolizması Üzerindeki Bi-hemisferik Transkraniyal Elektrik Stimülasyon Etkileri Ölçüm Aracı Olarak Manyetik Rezonans Spektroskopisi Kullanımı

Transcranial direct current stimulation (tDCS) is a neuromodulation technique that has been increasingly used over the past decade in the treatment of ...

Metabolomic Analysis of Rat Brain by High Resolution Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy of Tissue Extracts

Studies of gene expression on the RNA and protein levels have long been used to explore biological processes underlying disease. More recently, genomics and proteomics have been complemented by comprehensive quantitative analysis of the metabolite pool present in biological systems. This strategy, termed metabolomics, strives to provide a global characterization of the small-molecule complement involved in metabolism. While the genome and the proteome define the tasks cells can perform, the metabolome is part of the actual phenotype. Among the methods currently used in metabolomics, spectroscopic techniques are of special interest because they allow one to simultaneously analyze a large number of metabolites without prior selection for specific biochemical pathways, thus enabling a broad unbiased approach. Here, an optimized experimental protocol for metabolomic analysis by high-resolution NMR spectroscopy is presented, which is the method of choice for efficient quantification of tissue metabolites. Important strengths of this method are (i) the use of crude extracts, without the need to purify the sample and/or separate metabolites; (ii) the intrinsically quantitative nature of NMR, permitting quantitation of all metabolites represented by an NMR spectrum with one reference compound only; and (iii) the nondestructive nature of NMR enabling repeated use of the same sample for multiple measurements. The dynamic range of metabolite concentrations that can be covered is considerable due to the linear response of NMR signals, although metabolites occurring at extremely low concentrations may be difficult to detect. For the least abundant compounds, the highly sensitive mass spectrometry method may be advantageous although this technique requires more intricate sample preparation and quantification procedures than NMR spectroscopy. We present here an NMR protocol adjusted to rat brain analysis; however, the same protocol can be applied to other tissues with minor modifications.

The neurochemistry of mammalian brain is changed in many neurological and systemic diseases. Characteristic profiles of cerebral metabolites can be efficiently obtained based on crude extracts of brain tissue. To this end, high-resolution NMR spectroscopy is employed, enabling detailed quantitative analysis of metabolite concentrations (metabolomics).

Doku Esansı Yüksek Çözünürlük Nükleer Manyetik Rezonans Spektroskopisi ile Sıçan Beyin metabolomic Analizi

Studies of gene expression on the RNA and protein levels have long been used to explore biological processes underlying disease. More recently, genomics ...

High-resolution In Vivo Manual Segmentation Protocol for Human Hippocampal Subfields Using 3T Magnetic Resonance Imaging

The human hippocampus has been broadly studied in the context of memory and normal brain function and its role in different neuropsychiatric disorders has been heavily studied. While many imaging studies treat the hippocampus as a single unitary neuroanatomical structure, it is, in fact, composed of several subfields that have a complex three-dimensional geometry. As such, it is known that these subfields perform specialized functions and are differentially affected through the course of different disease states. Magnetic resonance (MR) imaging can be used as a powerful tool to interrogate the morphology of the hippocampus and its subfields. Many groups use advanced imaging software and hardware (&#62;3T) to image the subfields; however this type of technology may not be readily available in most research and clinical imaging centers. To address this need, this manuscript provides a detailed step-by-step protocol for segmenting the full anterior-posterior length of the hippocampus and its subfields: cornu ammonis (CA) 1, CA2/CA3, CA4/dentate gyrus (DG), strata radiatum/lacunosum/moleculare (SR/SL/SM), and subiculum. This protocol has been applied to five subjects (3F, 2M; age 29-57, avg. 37). Protocol reliability is assessed by resegmenting either the right or left hippocampus of each subject and computing the overlap using the Dice&#39;s kappa metric. Mean Dice&#39;s kappa (range) across the five subjects are: whole hippocampus, 0.91 (0.90-0.92); CA1, 0.78 (0.77-0.79); CA2/CA3, 0.64 (0.56-0.73); CA4/dentate gyrus, 0.83 (0.81-0.85); strata radiatum/lacunosum/moleculare, 0.71 (0.68-0.73); and subiculum 0.75 (0.72-0.78). The segmentation protocol presented here provides other laboratories with a reliable method to study the hippocampus and hippocampal subfields in vivo using commonly available MR tools.

High-resolution In Vivo Manual Segmentation Protocol for Human Hippocampal Subfields Using 3T Magnetic Resonance Imaging

The goal of this manuscript is to study the hippocampus and hippocampal subfields using MRI. The manuscript describes a protocol for segmenting the hippocampus and five hippocampal substructures: cornu ammonis (CA) 1, CA2/CA3, CA4/dentate gyrus, strata radiatum/lacunosum/moleculare, and subiculum.

Yüksek çözünürlük<em&gt; İn Vivo</em&gt; 3T Manyetik Rezonans Görüntüleme kullanma İnsan hipokampal alanlar için Manuel Segmentasyon Protokolü

The human hippocampus has been broadly studied in the context of memory and normal brain function and its role in different neuropsychiatric disorders has ...

High-resolution Structural Magnetic Resonance Imaging of the Human Subcortex In Vivo and Postmortem

The focus of this study was to test the resolution limits of structural MRI of a postmortem brain compared to living human brains. The resolution of structural MRI in vivo is ultimately limited by physiological noise, including pulsation, respiration and head movement. Although imaging hardware continues to improve, it is still difficult to resolve structures on the millimeter scale. For example, the primary visual sensory pathways synapse at the lateral geniculate nucleus (LGN), a visual relay and control nucleus in the thalamus that normally is organized into six interleaved monocular layers. Neuroimaging studies have not been able to reliably distinguish these layers due their small size that are less than 1 mm thick.
The resolving limit of structural MRI, in a postmortem brain was tested using multiple images averaged over a long duration (~24 h). The purpose was to test whether it was possible to resolve the individual layers of the LGN in the absence of physiological noise. A proton density (PD)1 weighted pulse sequence was used with varying resolution and other parameters to determine the minimum number of images necessary to be registered and averaged to reliably distinguish the LGN and other subcortical regions. The results were also compared to images acquired in living human brains. In vivo subjects were scanned in order to determine the additional effects of physiological noise on the minimum number of PD scans needed to differentiate subcortical structures, useful in clinical applications.

High-resolution Structural Magnetic Resonance Imaging of the Human Subcortex In Vivo and Postmortem

Here we present a protocol to determine the minimum number images that needed to be registered and averaged to resolve subcortical structures and test whether the individual layers of the LGN could be resolved in the absence of physiological noise.

İnsan Subcortex yüksek çözünürlüklü yapısal Manyetik Rezonans Görüntüleme<I&gt; İn Vivo</I&gt; Ve Postmortem

The focus of this study was to test the resolution limits of structural MRI of a postmortem brain compared to living human brains. The resolution of ...

A Magnetic Resonance Imaging Protocol for Stroke Onset Time Estimation in Permanent Cerebral Ischemia

MRI provides a sensitive and specific imaging tool to detect acute ischemic stroke by means of a reduced diffusion coefficient of brain water. In a rat model of ischemic stroke, differences in quantitative T1 and T2 MRI relaxation times (qT1 and qT2) between the ischemic lesion (delineated by low diffusion) and the contralateral non-ischemic hemisphere increase with time from stroke onset. The time dependency of MRI relaxation time differences is heuristically described by a linear function and thus provides a simple estimate of stroke onset time. Additionally, the volumes of abnormal qT1 and qT2 within the ischemic lesion increase linearly with time providing a complementary method for stroke timing. A (semi)automated computer routine based on the quantified diffusion coefficient is presented to delineate acute ischemic stroke tissue in rat ischemia. This routine also determines hemispheric differences in qT1 and qT2 relaxation times and the location and volume of abnormal qT1 and qT2 voxels within the lesion. Uncertainties associated with onset time estimates of qT1 and qT2 MRI data vary from &plusmn; 25 min to &plusmn; 47 min for the first 5 hours of stroke. The most accurate onset time estimates can be obtained by quantifying the volume of overlapping abnormal qT1 and qT2 lesion volumes, termed 'Voverlap' (&plusmn; 25 min) or by quantifying hemispheric differences in qT2 relaxation times only (&plusmn; 28 min). Overall, qT2 derived parameters outperform those from qT1. The current MRI protocol is tested in the hyperacute phase of a permanent focal ischemia model, which may not be applicable to transient focal brain ischemia.

A protocol for stroke onset time estimation in a rat model of stroke exploiting quantitative magnetic resonance imaging (qMRI) parameters is described. The procedure exploits diffusion MRI for delineation of the acute stroke lesion and quantitative T1 and T2 (qT1 and qT2) relaxation times for timing of stroke.

Manyetik rezonans görüntüleme protokolü için kontur başlangıçlı süresi tahmini olarak kalıcı serebral iskemi

MRI provides a sensitive and specific imaging tool to detect acute ischemic stroke by means of a reduced diffusion coefficient of brain water. In a rat ...

Diffusion Tensor Magnetic Resonance Imaging in Chronic Spinal Cord Compression

Chronic spinal cord compression is the most common cause of spinal cord impairment in patients with nontraumatic spinal cord damage. Conventional magnetic resonance imaging (MRI) plays an important role in both confirming the diagnosis and evaluating the degree of compression. However, the anatomical detail provided by conventional MRI is not sufficient to accurately estimate neuronal damage and/or assess the possibility of neuronal recovery in chronic spinal cord compression patients. In contrast, diffusion tensor imaging (DTI) can provide quantitative results according to the detection of water molecule diffusion in tissues. In the present study, we develop a methodological framework to illustrate the application of DTI in chronic spinal cord compression disease. DTI fractional anisotropy (FA), apparent diffusion coefficients (ADCs), and eigenvector values are useful for visualizing microstructural pathological changes in the spinal cord. Decreased FA and increases in ADCs and eigenvector values were observed in chronic spinal cord compression patients compared to healthy controls. DTI could help surgeons understand spinal cord injury severity and provide important information regarding prognosis and neural functional recovery. In conclusion, this protocol provides a sensitive, detailed, and noninvasive tool to evaluate spinal cord compression.

Here, we present a protocol for the application of diffusion tensor imaging parameters to evaluate spinal cord compression.

Kronik omurilik kompresyonu difüzyon tensor manyetik rezonans görüntüleme

Chronic spinal cord compression is the most common cause of spinal cord impairment in patients with nontraumatic spinal cord damage. Conventional magnetic ...

Standardized Data Acquisition for Neuromelanin-Sensitive Magnetic Resonance Imaging of the Substantia Nigra

The dopaminergic system plays a crucial role in healthy cognition (e.g., reward learning and uncertainty) and neuropsychiatric disorders (e.g., Parkinson's disease and schizophrenia). Neuromelanin is a byproduct of dopamine synthesis that accumulates in dopaminergic neurons of the substantia nigra. Neuromelanin-sensitive magnetic resonance imaging (NM-MRI) is a noninvasive method for measuring neuromelanin in those dopaminergic neurons, providing a direct measure of dopaminergic cell loss in the substantia nigra and a proxy measure of dopamine function. Although NM-MRI has been shown to be useful for studying various neuropsychiatric disorders, it is challenged by a limited field-of-view in the inferior-superior direction resulting in the potential loss of data from the accidental exclusion of part of the substantia nigra. In addition, the field is lacking a standardized protocol for the acquisition of NM-MRI data, a critical step in facilitating large-scale multisite studies and translation into the clinic. This protocol describes a step-by-step NM-MRI volume placement procedure and online quality control checks to ensure the acquisition of good-quality data covering the entire substantia nigra.

This protocol shows how to acquire neuromelanin-sensitive magnetic resonance imaging data of the substantia nigra.

Substantia Nigra'nın Nöromelanine Duyarlı Manyetik Rezonans Görüntülemesi için Standartlaştırılmış Veri Toplama

The dopaminergic system plays a crucial role in healthy cognition (e.g., reward learning and uncertainty) and neuropsychiatric disorders (e.g., ...

Acquisition of Resting-State Functional Magnetic Resonance Imaging Data in the Rat

Resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) has become an increasingly popular method to study brain function in a resting, non-task state. This protocol describes a preclinical survival method for obtaining rs-fMRI data. Combining low dose isoflurane with continuous infusion of the &#945;2 adrenergic receptor agonist dexmedetomidine provides a robust option for stable, high-quality data acquisition while preserving brain network function. Furthermore, this procedure allows for spontaneous breathing and near-normal physiology in the rat. Additional imaging sequences can be combined with resting-state acquisition creating experimental protocols with anesthetic stability of up to 5 h using this method. This protocol describes the setup of equipment, monitoring of rat physiology during four distinct phases of anesthesia, acquisition of resting-state scans, quality assessment of data, recovery of the animal, and a brief discussion of post-processing data analysis. This protocol can be used across a wide variety of preclinical rodent models to help reveal the resulting brain network changes that occur at rest.

This protocol describes a method for obtaining stable resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) data from a rat using low dose isoflurane in combination with low dose dexmedetomidine.

Sıçanda Dinlenme Durumu Fonksiyonel Manyetik Rezonans Görüntüleme Verilerinin Alınması

Resting-state functional magnetic resonance imaging (rs-fMRI) has become an increasingly popular method to study brain function in a resting, non-task ...