Name: gibberella zeae ascospore production and collection for microarray experiments.
Uploaded: 2006-11-30T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments. at JoVE.com

<p> De auteurs danken Karen Hilburn voor een uitstekende technische ondersteuning. Dit project werd ondersteund door de National Research Initiative van de USDA Cooperative State Research, Onderwijs en Extension Service (Award # 2004-35604-14327). Matias Pasquali wordt ondersteund door Branco Weiss Fellowship. De Amerikaanse tarwe en gerst Scab Initiative is ook erkend voor de niet aflatende steun van het onderzoek. </p>

<ol><li> Wortel-agar (Klittich en Leslie, 1988) werd voorbereid in 9-cm diameter petrischalen. </li><li> Een 2 mm kubus van agar met vers mycelium gekweekt op aardappel-dextrose-agar werd toegepast op het midden van elke petrischaal. </li><li> Culturen werden gekweekt bij 25 ° C en een 12-uur lichtperiode voor 96 uur. </li><li> Een ml van de waterige 2,5% Tween 60 werd aangebracht op het oppervlak van de cultuur (Trail en Common, 2000) en verspreid over de cultuur met een plastic staafje, door voorzichtig op te drukken. </li><li> Perithecia sc...

<ol>
	<li>Beyer, M., Verreet, J. A., Francl, L., Shaner, G., Bergstrom, G., Gilbert, J., Pedersen, W., Dill-Macky, R., Sweets, L., Corwin, B., Jin, Y., Gallenberg, D., Wiersma, J., Goswami, R. S., Kistler, H. C., Klittich, C. J. R., Leslie, J. F., Trail, F., Common, R., Tschantz, A. T., Horst, R. L., Nelson, P. E., Tschanz, A. T., Horst, R. K., Nelson, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Germination+of+Gibberella+zeae+ascospores+as+affected+by+age+of+spores+after+discharge+and+environmental+factors.">Germination of Gibberella zeae ascospores as affected by age of spores after discharge and environmental factors.</a> <em style='font-style: italic'>Genetics</em>. <b>118</b>, 417-2013 (2005).</li></ol>

<p> Het protocol hier wordt gepresenteerd is gebaseerd op eerdere procedures voor perithecial productie van Fusarium spp. (Klittich en Leslie, 1988, Trail en Common, 2000). Standaardisatie van de procedure waarmee grote hoeveelheden ascosporen (voldoende voor microarray analyse) zijn gegenereerd was essentieel voor de reproduceerbaarheid van het experiment. Het is gemeld dat de milieu-factoren, leeftijd en substraat verschillen kunnen de biologische karakter van ascosporen (Beyer en Verreet, 2005) te wijzigen. Daarom is het gebruik van video ka...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Petri dish 9 cm Diameter</td>
<td>Tool</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tween 60 (20%)</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Carrot agar (20% w/v organic carrots and 1.5% w/v agar) </td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>
			<div>
					</div>
		

gibberella zeae ascospore production and collection for microarray experiments.

<p class="jove_content">Fusarium graminearum Schwabe (teleomorph Gibberella zeae) is een plant pathogeen veroorzaakt schurft ziekte op tarwe en gerst dat gewas opbrengst en graankwaliteit vermindert. F. graminearum veroorzaakt ook steel en oor rot van maïs en is een producent van mycotoxinen, zoals de trichothecenen dat graan vervuilen en zijn schadelijk voor mens en vee (Goswami en Kistler, 2004). De schimmel produceert twee soorten sporen. Ascosporen, de propagulen als gevolg van geslachtelijke voortplanting, zijn de belangrijkste bron van primaire infectie. Deze sporen zijn gedwongen ontslagen uit volwassen perithecia en verspreid door de wind (Francl et al. 1999). Secundaire infecties worden vooral veroorzaakt door macroconidia die worden geproduceerd door ongeslachtelijke middel op de plant oppervlak. De studie van de ontwikkelingsprocessen van de ascosporen in deze schimmel, was een procedure voor de collectie in grote hoeveelheden onder steriele omstandigheden vereist. Ons protocol werd gefilmd in om het hoogste niveau van informatie voor inzicht in en reproduceerbaarheid genereren; cruciale aspecten bij het volledige genoom gen-expressie profielen worden gegenereerd en geïnterpreteerd. In het bijzonder, de variabiliteit van ascospore kieming en de biologische activiteit zijn afhankelijk van de voorafgaande manipulatie van het materiaal. Het gebruik van video voor het documenteren van elke stap in ascospore productie is voorgesteld om normalisatie te vergroten, voldoen aan de steeds strengere eisen voor microarray analyse. De procedure maakt gebruik van standaard laboratoriumapparatuur. Stappen worden aangetoond dat besmetting en voor de tijd synchronisatie van ascosporen te voorkomen.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments. at JoVE.com

Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments.

<p class="jove_content">De studie van de ontwikkelingsprocessen van de ascosporen in Gibberella zeae, een procedure voor de collectie onder steriele omstandigheden wordt gefilmd om het hoogste niveau van informatie voor protocol beschrijving te genereren. Dit moet de reproduceerbaarheid van het experiment, een cruciaal aspect bij het volledige genoom expressie profiel testen worden uitgevoerd.</p>

Gibberella zeae Ascospore Productie en collectie voor microarray experimenten.

Fusarium graminearum Schwabe (teleomorph Gibberella zeae) is a plant pathogen causing scab disease on wheat and barley that reduces crop yield and grain ...

Research

JoVE Journal

Biology

Application of Light-cured Dental Adhesive Resin for Mounting Electrodes or Microdialysis Probes in Chronic Experiments

Toepassing van de Light-cured Dental lijm hars voor permanente montage elektroden of Microdialyseprobes bij chronische experimenten

In chronic recording experiments, self-curing dental acrylic resins have been used as a mounting base of electrodes or microdialysis-probes. Since these ...

Preparation of Artificial Bilayers for Electrophysiology Experiments

Voorbereiding van de Kunstmatige dubbellagen voor Elektrofysiologie Experimenten

Planar lipid bilayers, also called artificial lipid bilayers, allow you to study ion-conducting channels in a well-defined environment. These bilayers can ...

Seawater Sampling and Collection

Zeewater Bemonstering en Collection

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Microarray Analysis for <em>Saccharomyces cerevisiae</em>

Microarray Analysis for Saccharomyces cerevisiae

Microarray analyse voor<em> Saccharomyces cerevisiae</em

In this protocol, gene expression in yeast (Saccharomyces cerevisiae) is changed after exposure to oxidative stress induced by the addition of hydrogen ...

Performing Custom MicroRNA Microarray Experiments

Het uitvoeren van op maat MicroRNA microarray experimenten

microRNAs (miRNAs) are a large family of &tilde; 22 nucleotides (nt) long RNA molecules that are widely expressed in eukaryotes 1.  Complex genomes encode ...

Sexual Development and Ascospore Discharge in <em>Fusarium graminearum</em>

Sexual Development and Ascospore Discharge in Fusarium graminearum

Seksuele ontwikkeling en Ascospore Lozing in<em> Fusarium graminearum</em

Fusarium graminearum has become a model system for studies in development and pathogenicity of filamentous fungi. F. graminearum most easily produces ...

Milk Collection Methods for Mice and Reeves' Muntjac Deer

Melk Collection Methoden voor Mice and Reeves &#39;Muntjac Herten

Animal models are commonly used throughout research laboratories to accomplish what would normally be considered impractical in a pathogen&#8217;s native ...

Repeated Blood Collection for Blood Tests in Adult Zebrafish

Herhaalde bloedafname voor Blood Tests in Adult zebravis

Repeated blood collection is one of the most common techniques performed on laboratory animals. However, a non-lethal protocol for blood collection from ...

A Multi-hole Cryovial Eliminates Freezing Artifacts when Muscle Tissues are Directly Immersed in Liquid Nitrogen

Een multi-hole Cryovial Voorkomt bevriezen Artefacten als spierweefsel direct worden ondergedompeld in vloeibare stikstof

Studies on skeletal muscle physiology face the technical challenge of appropriately processing the specimens to obtain sections with clearly visible ...

Cryo-Electron Tomography Remote Data Collection and Subtomogram Averaging

Cryo-elektronentomografie Gegevensverzameling op afstand en subtomogrammiddeling

Cryo-electron tomography (cryo-ET) has been gaining momentum in recent years, especially since the introduction of direct electron detectors, improved ...