Name: gibberella zeae ascospore production and collection for microarray experiments.
Uploaded: 2006-11-30T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments. at JoVE.com

<p> Författarna tackar Karen Hilburn för utmärkt teknisk support. Projektet stöddes av National Research Initiative av USDA kooperativa staten forskning, utbildning och Extension Service (Award # 2004-35604-14327). Matias Pasquali stöds av Branco Weiss Fellowship. Den amerikanska vete och korn sårskorpa initiativet är också erkänt för fortsatt stöd till forskningen. </p>

<ol><li> Morot agar (Klittich och Leslie, 1988) har upprättats i 9-cm diameter petriskålar. </li><li> En 2 mm kub av agar med färskt mycel växer på potatis dextros tillämpades på mitten av varje petriskål. </li><li> Kulturer odlades vid 25 ° C och ett 12-h fotoperiod för 96 timmar. </li><li> En ml vattenlösning 2,5% Tween 60 tillämpades på ytan av kultur (Trail och Common, 2000) och spred sig över kulturen med en plast stav, genom att försiktigt trycka. </li><li> Perithecia skytte ascospores utvecklat 7-10 dagar efter denna induk...

<ol>
	<li>Beyer, M., Verreet, J. A., Francl, L., Shaner, G., Bergstrom, G., Gilbert, J., Pedersen, W., Dill-Macky, R., Sweets, L., Corwin, B., Jin, Y., Gallenberg, D., Wiersma, J., Goswami, R. S., Kistler, H. C., Klittich, C. J. R., Leslie, J. F., Trail, F., Common, R., Tschantz, A. T., Horst, R. L., Nelson, P. E., Tschanz, A. T., Horst, R. K., Nelson, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Germination+of+Gibberella+zeae+ascospores+as+affected+by+age+of+spores+after+discharge+and+environmental+factors.">Germination of Gibberella zeae ascospores as affected by age of spores after discharge and environmental factors.</a> <em style='font-style: italic'>Genetics</em>. <b>118</b>, 417-2013 (2005).</li></ol>

<p> Protokollet presenteras här bygger på tidigare förfaranden som används för perithecial produktion för Fusarium spp.. (Klittich och Leslie, 1988; Trail och Common, 2000). Standardisering av förfarandet genom vilken stora mängder ascospores (tillräckligt för microarray analys) genererades var avgörande för reproducerbarhet av försöket. Det har rapporterats att miljöfaktorer, ålder och substrat skillnader kan ändra biologiska karaktär ascospores (Beyer och Verreet, 2005). Därför är användning av video kan belysa små deta...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Petri dish 9 cm Diameter</td>
<td>Tool</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tween 60 (20%)</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Carrot agar (20% w/v organic carrots and 1.5% w/v agar) </td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>
			<div>
					</div>
		

gibberella zeae ascospore production and collection for microarray experiments.

<p class="jove_content">Fusarium graminearum Schwabe (teleomorph Gibberella zeae) är en växt patogen som orsakar sårskorpa sjukdomar på vete och korn som minskar avkastning och spannmål kvalitet. F. graminearum orsakar också stjälk och öron ruttnar av majs och är en producent av mykotoxiner såsom trikotecener som förorenar spannmål och är skadliga för människor och boskap (Goswami och Kistler, 2004). Svampen producerar två typer av sporer. Ascospores det förökningsmaterial till följd av sexuell reproduktion, är den viktigaste källan av primär infektion. Dessa sporer är med våld ut från mogna perithecia och sprids med vinden (Francl et al 1999). Sekundära infektioner orsakas huvudsakligen av macroconidia som produceras av asexuell betyder på anläggningen ytan. För att studera utvecklingsprocesser av ascospores i den här svampen, var ett förfarande för insamling i stora mängder under sterila förhållanden krävs. Vår protokollet filmades för att generera den högsta nivån av information för förståelse och reproducerbarhet, avgörande aspekter när den är full genomet genexpression profiler genereras och tolkas. I synnerhet variabilitet ascospore groning och biologiska aktiviteten är beroende av tidigare manipulation av materialet. Användningen av video för att dokumentera varje steg i ascospore produktionen föreslås i syfte att öka standardiseringen, som uppfyller allt hårdare krav på microarray analys. Förfarandet kräver endast Vanlig laboratorieutrustning. Åtgärder visas för att förhindra förorening och främja tidssynkronisering av ascospores.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments. at JoVE.com

Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments.

<p class="jove_content">För att studera utvecklingsprocesser av ascospores i Gibberella zeae, ett förfarande för insamling under sterila förhållanden är filmad för att generera den högsta nivån av information för protokoll beskrivning. Detta bör underlätta reproducerbarhet av experimentet, en avgörande aspekt när den är full genomet uttryck profilen tester genomförs.</p>

Gibberella zeae Ascospore Produktion och insamling för microarray experiment.

Fusarium graminearum Schwabe (teleomorph Gibberella zeae) is a plant pathogen causing scab disease on wheat and barley that reduces crop yield and grain ...

Research

JoVE Journal

Biology

Application of Light-cured Dental Adhesive Resin for Mounting Electrodes or Microdialysis Probes in Chronic Experiments

Tillämpning av Ljus cured Dental Lim Resin för montering Elektroder eller sonder Mikrodialys vid kronisk Experiment

In chronic recording experiments, self-curing dental acrylic resins have been used as a mounting base of electrodes or microdialysis-probes. Since these ...

Preparation of Artificial Bilayers for Electrophysiology Experiments

Beredning av Artificiell bilayers för elektrofysiologi Experiment

Planar lipid bilayers, also called artificial lipid bilayers, allow you to study ion-conducting channels in a well-defined environment. These bilayers can ...

Seawater Sampling and Collection

Havsvatten Provtagning och insamling

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Microarray Analysis for <em>Saccharomyces cerevisiae</em>

Microarray Analysis for Saccharomyces cerevisiae

Microarray Analys för<em> Saccharomyces cerevisiae</em

In this protocol, gene expression in yeast (Saccharomyces cerevisiae) is changed after exposure to oxidative stress induced by the addition of hydrogen ...

Performing Custom MicroRNA Microarray Experiments

Utföra Custom Experiment MikroRNA Microarray

microRNAs (miRNAs) are a large family of &tilde; 22 nucleotides (nt) long RNA molecules that are widely expressed in eukaryotes 1.  Complex genomes encode ...

Sexual Development and Ascospore Discharge in <em>Fusarium graminearum</em>

Sexual Development and Ascospore Discharge in Fusarium graminearum

Sexuell utveckling och Ascospore Ansvarsfrihet<em> Fusarium graminearum</em

Fusarium graminearum has become a model system for studies in development and pathogenicity of filamentous fungi. F. graminearum most easily produces ...

Milk Collection Methods for Mice and Reeves' Muntjac Deer

Mjölk Collection Metoder för möss och Reeves &#39;Muntjac Deer

Animal models are commonly used throughout research laboratories to accomplish what would normally be considered impractical in a pathogen&#8217;s native ...

Repeated Blood Collection for Blood Tests in Adult Zebrafish

Upprepad Blood Collection för Blodprov i vuxen Zebrafish

Repeated blood collection is one of the most common techniques performed on laboratory animals. However, a non-lethal protocol for blood collection from ...

A Multi-hole Cryovial Eliminates Freezing Artifacts when Muscle Tissues are Directly Immersed in Liquid Nitrogen

En Multi-hål cryovial Eliminerar Frysning Artefakter när Muscle Vävnader Direkt Nedsänkt i flytande kväve

Studies on skeletal muscle physiology face the technical challenge of appropriately processing the specimens to obtain sections with clearly visible ...

Cryo-Electron Tomography Remote Data Collection and Subtomogram Averaging

Kryoelektrontomografi Fjärrdatainsamling och subtomogrammedelvärde

Cryo-electron tomography (cryo-ET) has been gaining momentum in recent years, especially since the introduction of direct electron detectors, improved ...