Name: seawater sampling and collection
Uploaded: 2009-06-17T19:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Seawater Sampling and Collection at JoVE.com

<p class="jove_content"> Vi vill tacka det kanadensiska institutet för innovation, British Columbia Kunskap utvecklingsfonden och Statens Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Kanada för att stödja pågående studier på låg syre regioner i kustnära och öppna hav vatten. Dessutom var DAW stöd av stipendier från NSERC, Killam och Tula stiftelsen finansierade Centrum för Mikrobiell diversitet och evolution. </p>

<p class="jove_title"> Del 1: Vatten Kollektion </p><ol><li> Djup tilldelas varje rösterna. </li><li> Djup som ska provtas och den totala volymen som ska samlas in för den aktuella gjutna bestäms. </li><li> Det är säkerställt att det Go-Flo och flaskor Niskin är öppna, och att deras ventiler och tappar är stängda. </li><li> CTD lastas ner på linjen och lägre i vattnet. </li><li> En flaska för det djupaste djup provtagits i gjuten första lastas på raden efter CTD, det är säkerställt att linjen är rätt monterad i konsolen och ...

<ol>
	<li>Cline, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spectrophotometric+determination+of+hydrogen+sulfide+in+natural+waters.">Spectrophotometric determination of hydrogen sulfide in natural waters.</a> <em style='font-style: italic'>Limnology &#38; Oceanography</em>. <b>14</b>, 454-458 (1969).</li><li>Holmes, R. M., Aminot, A., Kerouel, R., Hooker, B. A., Peterson, B. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+simple+and+precise+method+for+measuring+ammonium+in+marine+and+freshwater+ecosystems.">A simple and precise method for measuring ammonium in marine and freshwater ecosystems.</a> <em style='font-style: italic'>Canadian Journal of fisheries and Aquatic Science</em>. <b>56</b>, 1801-1808 (1999).</li></ol>

<p class="jove_content"> Sammantaget finns det en hel del förberedelser och planering krävs för denna typ av provtagning, så budgeten 2 dagar före resan för att få saker i ordning och en dag efteråt för rengöring allt. I allmänhet, låt inte saltvatten komma i kontakt med peristaltiska pumpar eller i aluminium Zarges rutan används för att transportera fältutrustning. Behandla utrustningen med respekt och det kommer att prestera bra under en lång tid framöver. </p>

		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>20L Carboys</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher</td>
<td>02-960-15</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>3/8" Tygon</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Parmer</td>
<td>06429-36</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sterivex filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher</td>
<td>SVG010RS</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Prefilter Housing Unit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>AMD</td>
<td>501200</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Luer Fitting</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Parmer</td>
<td>31507-27</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>1/4" Tygon tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Parmer</td>
<td>06429-24</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>1/4" Tygon tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Parmer</td>
<td>06429-24</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>1/4" Tygon tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Parmer</td>
<td>06429-24</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>50ml Plastic tubes</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Glass Serum Bottles</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Glass Sample Collection</td>
</tr>
<tr>
<td>Septa and aluminum caps for glass serum bottles</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Hand Crimper</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>20-200ul Pipette and Tips</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Glass Tubes</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Ammonium Sample Collection</td>
</tr>
<tr>
<td>30ml Plastic Bottles</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Nutrient Collection</td>
</tr>
<tr>
<td>Acrodisc Filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millipore</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>5 ml Tubes</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Nitrite Sample Collection</td>
</tr>
<tr>
<td>37% Formaldehyde</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For cell count samples</td>
</tr>
<tr>
<td>20% Zinc Acetate</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For sulfide samples</td>
</tr>
<tr>
<td>Mercuric Chloride</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For gas samples</td>
</tr>
<tr>
<td>milliQ water</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Ammonium Working Reagent</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Borate buffer, sodium sulfite, orthophaladialdehyde</td>
</tr>
<tr>
<td>Sulfanilamide</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>5g into 450ml water and 50ml HCl</td>
</tr>
<tr>
<td>N-(1-naphthy)-ethylenediamine dihydrochloride solution</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>0.5g into 500ml water</td>
</tr>
</tbody>
</table>

seawater sampling and collection

<p class="jove_content">Denna video dokument metoderna för insamling av kust-prover havsvatten och bearbeta dem för olika tillämpningar i efterföljande led inklusive biomassa koncentration, nukleinsyra rening, cell överflöd, närings-och spårämnen analyserar gas. För dagens demonstration togs från däcket på HMS John Strickland verksamma i Saanich Inlet. En A-ram lyftbom, med en multi-purpose vinsch och kabel-system, används i kombination med Niskin eller Go-Flo vattenflaskor provtagning. Konduktivitet, temperatur och djup (CTD) sensorer används också för att provet den underliggande vattenmassan. För att minimera utgasning är spårgas prover som samlats in först. Sedan är näringsämnen, vattenkemi, och räknar celler bestäms. Slutligen vatten samlas för biomassa filtrering. Upplägget och insamling tid för en enda rösterna ~ 1,5 timmar vid ett maximalt djup av 215 meter. Därför är totalt 6 timmar i regel krävs för att slutföra insamlingen serien beskrivs här.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Seawater Sampling and Collection at JoVE.com

Seawater Sampling and Collection

<p class="jove_content">Denna video dokument metoderna för insamling av kust-prover havsvatten och bearbeta dem för olika tillämpningar i efterföljande led inklusive biomassa koncentration, nukleinsyra rening, cell överflöd, närings-och spårämnen analyserar gas.</p>

Havsvatten Provtagning och insamling

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Research

JoVE Journal

Biology

Gibberella zeae Ascospore Production and Collection for Microarray Experiments.

Gibberella zeae Ascospore Produktion och insamling för microarray experiment.

Fusarium graminearum Schwabe (teleomorph Gibberella zeae) is a plant pathogen causing scab disease on wheat and barley that reduces crop yield and grain ...

Collection and Cryopreservation of Hamster Oocytes and Mouse Embryos

Insamling och Frysförvaring av Hamster äggceller och embryon Mus

Embryos and oocytes were first successfully cryopreserved more than 30 years ago, when Whittingham et al. 1 and Wilmut 2 separately described that mouse ...

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples

Stor volym (20L +) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For this method, ...

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples

Liten mängd (1-3L) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For today s ...

Diagnostic Necropsy and Selected Tissue and Sample Collection in Rats and Mice

Diagnostiska obduktion och Selected Tissue och Provtagning på råttor och möss

There are multiple sample types that may be collected from a euthanized animal in order to help diagnose or discover infectious agents in an animal ...

Milk Collection Methods for Mice and Reeves' Muntjac Deer

Mjölk Collection Metoder för möss och Reeves &#39;Muntjac Deer

Animal models are commonly used throughout research laboratories to accomplish what would normally be considered impractical in a pathogen&#8217;s native ...

Non-Terminal Blood Sampling Techniques in Guinea Pigs

Icke Terminal Blood Provtagningstekniker i marsvin

Guinea pigs possess several biological similarities to humans and are validated experimental animal models1-3. However, the use of guinea pigs currently ...

Repeated Blood Collection for Blood Tests in Adult Zebrafish

Upprepad Blood Collection för Blodprov i vuxen Zebrafish

Repeated blood collection is one of the most common techniques performed on laboratory animals. However, a non-lethal protocol for blood collection from ...

Gamete Collection and In Vitro Fertilization of <em>Astyanax mexicanus</em>

Gamete Collection and In Vitro Fertilization of Astyanax mexicanus

Gamete Collection och in vitro fertilisering av <em>Astyanax Auktor</em>

Astyanax mexicanus is emerging as a model organism for a variety of research fields in biological science. Part of the recent success of this teleost fish ...

Collection and Identification of Pollen from Honey Bee Colonies

Insamling och identifiering av pollen från honungsbikolonier

Researchers often collect and analyze corbicular pollen from honey bees to identify the plant sources on which they forage for pollen or to estimate ...