Name: large volume (20l+) filtration of coastal seawater samples
Uploaded: 2009-06-18T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

<p class="jove_content"> Vi vill tacka det kanadensiska institutet för innovation, British Columbia Kunskap utvecklingsfonden och Statens Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Kanada för att stödja pågående studier på låg syre regioner i kustnära och öppna hav vatten. DAW stöddes av stipendier från NSERC, Killam och Tula stiftelsen finansierade Centrum för Mikrobiell diversitet och evolution. </p>

<ol><li> <strong>Sätt upp av filtreringsapparaten</strong> <strong></strong><ol><li> För att ställa in filtreringsapparaten använder pincett för att placera en klass GF / D-filtret i förfilter bostadshuset. Dra åt huset för hand. Som en tumregel, inte åt för hårt eller enheten kommer att läcka när pumpningen börjar. </li><li> Byt Damejeanne locket med autoklaveras locket och fäst slangen genom att försiktigt föra den interna slangen i Damejeanne utan att röra den. Om det behövs använder pincett för att styra slangen i Damej...

<p class="jove_content"> Det är viktigt att torka av bänkar och pumpar med en fuktig handduk efter användning för att ta bort eventuella kvardröjande spår av salt vatten som annars skulle korrodera utrustning. Även om förfarandet är enkelt, kan den tid som kravet omfattande beroende på koncentrationen av biomassa eller skräp i provet filtreras. </p>

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Peristaltic pump</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>77913-20, 77200-62, 77200-04</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tygon LFL tubing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Masterflex (Cole Palmer)</td>
<td>06429-24</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Hose clamps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>0683204</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>1/4&#x201D; x 3/16&#x201D;  pipe adaptors</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31702-20</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Polypropylene prefilter housing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>ADVANTEC</td>
<td>501200</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>Metal luer fitting (Hose end to Male luer lock)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Cole Palmer</td>
<td>31507-27</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>2&#x201C; Magnets</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>3 port carboy caps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For filtration apparatus</td>
</tr>
<tr>
<td>GV 0.22 &mu;m STERIVIX filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millipore</td>
<td>SVGV01R5</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>47 mm diameter 2.7 &mu;m GF/D filters</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Whatman</td>
<td>1823047</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Lysis buffer</td>
<td>   Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>0.75 M sucrose, 40 mM EDTA, 50 mM Tris (pH 8.3)</td>
</tr>
<tr>
<td>0.1 % HCl</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>
<tr>
<td>Autoclaved water</td>
<td>Reagent</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>For post-filtration rinse</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

large volume (20l+) filtration of coastal seawater samples

<p class="jove_content">Arbetsflödet börjar med insamling av kustnära marina vatten för nedströms mikrobiella, närings-och spårgas analyser. För denna metod har prover som tagits från däcket på HMS John Strickland verksamma i Saanich Inlet. Denna video dokument stor volym (≥ 20 L) filtrering av mikrobiella biomassan, mellan 0.22μm och 2.7μm i diameter, ur vattnet. Två 20L prover kan filtreras samtidigt med en enda pump utrustad med fyra roterande huvuden. Filtreringen sker i fältet på förlängda resor eller omedelbart efter avkastning för dagsutflykter. Det är viktigt att registrera den mängd vatten som passerar genom varje sterivex filter. För att förhindra att biofilm bildas mellan provtagning resor måste all utrustning för filtrering sköljas med utspädd HCl och avjoniserat vatten och autoklaveras direkt efter användning. Denna procedur tar cirka 5 timmar plus en extra timme för sanering.</p>

Watch this Scientific Journal Video about Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples at JoVE.com

Large Volume 20L+ Filtration of Coastal Seawater Samples

<p class="jove_content">Denna video dokument stor volym (≥ 20 L) filtrering av mikrobiella biomassan, mellan 0.22μm och 2.7μm i diameter, ur vattnet.</p>

Stor volym (20L +) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For this method, ...

Research

JoVE Journal

Biology

Large Volume (20L+) Filtration of Coastal Seawater Samples

Large-Scale Screens of Metagenomic Libraries

Storskaliga skärmar Metagenomic bibliotek

Metagenomic libraries archive large fragments of contiguous genomic sequences from microorganisms without requiring prior cultivation.  Generating a ...

Seawater Sampling and Collection

Havsvatten Provtagning och insamling

This video documents methods for collecting coastal marine water samples and processing them for various downstream applications including biomass ...

Small Volume (1-3L) Filtration of Coastal Seawater Samples

Small Volume 1-3L Filtration of Coastal Seawater Samples

Liten mängd (1-3L) Filtrering av Coastal Havsvatten Prover

The workflow begins with the collection of coastal marine waters for downstream microbial community, nutrient and trace gas analyses. For today s ...

Large Insert Environmental Genomic Library Production

Stora Sätt Miljö Genomic Bibliotek Produktion

The vast majority of microbes in nature currently remain inaccessible to traditional cultivation methods. Over the past decade, culture-independent ...

Absolute Quantum Yield Measurement of Powder Samples

Absolut Quantum Yield Mätning av Pulver prov

Measurement of fluorescence quantum yield has become an important tool in the search for new solutions in the development, evaluation, quality control and ...

Measuring Peptide Translocation into Large Unilamellar Vesicles

Mätning Peptide Translokation i stora Unilamellar Blåsor

There is an active interest in peptides that readily cross cell membranes without the assistance of cell membrane receptors1.  Many of these are referred ...

A High-throughput Method for Measurement of Glomerular Filtration Rate in Conscious Mice

En hög genomströmning metod för mätning av glomerulär filtration Rate i medveten möss

The measurement of  glomerular filtration rate (GFR) is the gold standard in kidney function  assessment. Currently, investigators determine GFR by ...

Rapid Isolation And Purification Of Mitochondria For Transplantation By Tissue Dissociation And Differential Filtration

Snabb Isolering och rening av Mitokondrier För Transplantation Av vävnadsdissociering Och Differential Filtration

Previously described mitochondrial isolation methods using differential centrifugation and/or Ficoll gradient centrifugation require 60 to 100 min to ...

Physiology Lab Demonstration: Glomerular Filtration Rate in a Rat

Fysiologi Lab Demonstration: Glomerular Filtration Rate i en råtta

Measurements of glomerular filtration rate (GFR), and the fractional excretion of sodium (Na) and potassium (K) are critical in assessing renal function ...

Measuring Pressure Volume Loops in the Mouse

Tryckmätning Volym loopar i musen

Understanding the causes and progression of heart disease presents a significant challenge to the biomedical community. The genetic flexibility of the ...