Name: born normalization for fluorescence optical projection tomography for whole heart imaging
Uploaded: 2009-06-02T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Born Normalization for Fluorescence Optical Projection Tomography for Whole Heart Imaging at JoVE.com

C. Vinegoni erkänner stöd från National Institutes of Health (NIH) bevilja 1-RO1-EB006432.

Imaging Förfarande Den experimentuppställning visas i detalj i figur 1. En ljuskälla LS fungerar både som belysning för absorption mätningar och som exciteringskälla för fluorescens mätningar och det är filtreras med ett smalt band pass avstörningsfilter BPF. En uppsättning av fasta och rörliga neutrala täthetsfilter ND kombination med förekomsten av en automatisk slutare S gör det möjligt att styra mängden ljus på provet och att hålla den tillräckligt låg för att förhi...

<ol>
	<li>Sharpe, J., Ahlgren, U., Perry, P., Hill, B., Ross, A., Hecksher-Sorensen, J., Baldock, R., Davidson, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optical+projection+tomography+as+a+tool+for+3D+microscopy+and+gene+expression+studies.">Optical projection tomography as a tool for 3D microscopy and gene expression studies.</a> Science. 296, 541-544 (2002).</li><li>Lee, K., Avondo, J., Morrison, H., Blot, L., Stark, M., Sharpe, J., Bangham, A., Coen, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Visualizing+plant+development+and+gene++in+three+dimensions+using+optical+projection+tomography.">Visualizing plant development and gene in three dimensions using optical projection tomography.</a> Plant Cell. 18, 2145-2156 (2006).</li><li>Oldham, M., Sakhalkar, H., Wang, Y. M., Guo, P. Y., Oliver, T., Bentley, R., Vujaskovic, Z., Dewhirst, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-dimensional+imaging+of+whole+rodent+organs+using+optical+computed+and+emission+tomography.">Three-dimensional imaging of whole rodent organs using optical computed and emission tomography.</a> J. Biomed. Opt. 12, 1-10 (2007).</li><li>Ntziachristos, V., Weissleder, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Experimental+three-dimensional+fluorescence+reconstruction+of+diffuse+media+by+use+of+a+normalized+Born+approximation.">Experimental three-dimensional fluorescence reconstruction of diffuse media by use of a normalized Born approximation.</a> Opt. Lett. 26, 893-895 (2001).</li></ol>

born normalization for fluorescence optical projection tomography for whole heart imaging

Optisk projektion tomografi är en tredimensionell bildteknik som nyligen har införts som en avbildning verktyg främst i utvecklingsbiologi och gen studier uttryck. Tekniken gör biologiska prov optiskt transparent genom att först torkning dem och sedan placera i en blandning av bensylalkohol och bensylbensoat i förhållandet 2:1 (Babb eller Murray s Klar lösning). Tekniken gör biologiska prover optiskt transparent genom att först torkningen dem i graderade etanol-lösningar sedan placera dem i en blandning av bensylalkohol och bensylbensoat i förhållandet 2:1 (Babb eller Murray s Klar lösning) för att rensa. Efter clearingen spridningen bidrag i provet kan minskas väsentligt och gjort nästan försumbara medan absorptionen bidrag inte kan elimineras helt. När jag försöker rekonstruera fluorescens fördelning i urvalet som undersöks, påverkar detta bidrag de rekonstruktioner och leder oundvikligen till bild artefakter och fel kvantifiering .. Medan absorptionen kan minskas ytterligare med en varaktighet veckor eller månader i clearingen media kommer detta att leda till gradvis förlust av fluorescens och en orealistiskt lång prov handläggningstiden. Detta gäller när rekonstruera både exogena kontrastmedel (molekylära kontrastmedel) samt endogena kontrast (t.ex. rekonstruktioner av genetiskt uttryckt fluorescerande proteiner).

Watch this Scientific Journal Video about Born Normalization for Fluorescence Optical Projection Tomography for Whole Heart Imaging at JoVE.com

Born Normalization for Fluorescence Optical Projection Tomography for Whole Heart Imaging

Vi föreslår ett Born normaliserad strategi för Optical Projection Tomography (BnOPT) som svarar för upptaget egenskaper avbildas prover för att få korrekt och kvantitativa fluorescens tomografisk rekonstruktioner. Vi använder den föreslagna algoritmen för att rekonstruera fluorescens molekylär sonden distribution inom litet djur organ.

Född Normalisering för fluorescens Optical Projection Tomography för hela hjärtat Imaging

Optical projection tomography is a three-dimensional imaging technique that has been recently introduced as an imaging tool primarily in developmental ...

Research

JoVE Journal

Biology

Proper Care and Cleaning of the Microscope

Korrekt vård och rengöring av mikroskopet

Keeping the microscope optics clean is important for high-quality imaging. Dust, fingerprints, excess immersion oil, or mounting medium on or in a ...

Major Components of the Light Microscope

Viktigaste komponenterna i ljusmikroskop

The light microscope is a basic tool for the cell biologist, who should have a thorough understanding of how it works, how it should be aligned for ...

Phase Contrast and Differential Interference Contrast (DIC) Microscopy

Phase Contrast and Differential Interference Contrast DIC Microscopy

Faskontrast och differentierad interferenskontrast (DIC) Mikroskopi

Phase-contrast microscopy is often used to produce contrast for transparent, non light-absorbing, biological specimens. The technique was discovered by ...

Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts

Semi-automatisk optisk Heartbeat Analys av små hjärtan

We have developed a method for analyzing high speed optical recordings from Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts (Fink, et. al., 2009). Our ...

Mesoscopic Fluorescence Tomography for In-vivo Imaging of Developing Drosophila

Mesoscopic Fluorescence Tomography for In-vivo Imaging of Developing Drosophila

Mesoskopisk Fluorescens Tomografi för In-vivo Imaging för att utveckla Drosophila</em

Visualizing  developing organ formation as well as progession and treatment of disease often  heavily relies on the ability to optically interrogate ...

Long-term Culture of Human Breast Cancer Specimens and Their Analysis Using Optical Projection Tomography

Långsiktig kultur för mänskliga Prover bröstcancer och deras analys Använda optisk Projection Tomography

Breast cancer is a leading cause of mortality in the Western world. It is well established that the spread of breast cancer, first locally and later ...

Fluorescence Imaging with One-nanometer Accuracy (FIONA)

Fluorescence Imaging with One-nanometer Accuracy FIONA

Fluorescens Imaging med One-nanometer Noggrannhet (FIONA)

Fluorescence imaging with one-nanometer accuracy (FIONA) is a simple but useful technique for localizing single fluorophores with nanometer precision in ...

Drosophila Preparation and Longitudinal Imaging of Heart Function In Vivo Using Optical Coherence Microscopy (OCM)

Drosophila Preparation and Longitudinal Imaging of Heart Function In Vivo Using Optical Coherence Microscopy OCM

Drosophila Upprättande och Längs avbildning av hjärtfunktionen In Vivo Använda optisk koherens mikroskopi (OCM)

Longitudinal study of the heartbeat in small animals contributes to understanding structural and functional changes during heart development. Optical ...

Strategies for Optimization of Cryogenic Electron Tomography Data Acquisition

Strategier för optimering av kryogen elektrontomografi dataförvärv

Cryogenic electron tomography (cryoET) is a powerful method to study the 3D structure of biological samples in a close-to-native state. Current ...

Mesoscopic Optical Imaging of Whole Mouse Heart

Mesoskopisk optisk avbildning av hela mushjärtat

Both genetic and non-genetic cardiac diseases can cause severe remodeling processes in the heart. Structural remodeling, such as collagen deposition ...