Name: semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts
Uploaded: 2009-09-16T13:00:00
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<p class="jove_content"> KO und AC sind durch ein Stipendium und ein Stipendium der American Heart Association unterstützt. SIB und RB werden durch Zuschüsse aus NIH unterstützt. </p>

<p class="jove_content"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/1435/SOHA_overview.pdf">Klicken Sie hier, um einen Überblick über die halbautomatische Herzschlag-Analyse (SOHA) Verfahren zu sehen.</a> </p><p class="jove_content"> Semi-automatische optische Herzschlag Analyse </p><p class="jove_title"> 1. Vorverarbeitung - </p><p class="jove_content"> Dieser Schritt gibt Auskunft über den diastolischen und systolischen Herz Durchmesser. </p><p class="jove_content"> Herz Kanten werden erkannt und während der maximalen Diastole und Sys...

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	<li>Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myosin+Transducer+mutations+differentially+affect+motor+function,+myofibril+structure,+and+the+performance+of+skeletal+and+cardiac+muscles.">Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles.</a> <em style='font-style: italic'>Mol Biol Cell</em>. <b>19</b> (2), 553-562 (2008).</li><li>Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=KCNQ+potassium+channel+mutations+cause+cardiac+arrhythmias+in+Drosophila+that+mimic+the+effects+of+aging.">KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging.</a> <em style='font-style: italic'>Proc Natl Acad Sci U S A</em>. <b>104</b>, 3943-3948 (2007).</li><li>Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+method+for+the+detection+and+quantification+of+heartbeat+parameters+in+Drosophila,+zebrafish+and+embryonic+mouse+hearts.">A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts.</a> <em style='font-style: italic'>Biotechniques</em>. <b>46</b>, 101-113 (2009).</li></ol>

<p class="jove_content"> Die Drosophila-Modell hat sich als ein leistungsfähiges Tool, das genetische verwendet wurde, um eine Vielzahl von wissenschaftlichen Fragestellungen reichen von embryonalen Entwicklung, Lernen und Gedächtnis-Adresse sein. Kürzlich dieses vielseitige Modell-Organismus wurde verwendet, um die Genetik von Herz-Funktion zu untersuchen. Eine Reihe von Versuchen, Herz Physiologie bei erwachsenen Drosophila zu quantifizieren sind auf Beobachtungen in intakten fliegt durch die Bauchdecke Nagelhaut, gelten. Die meisten diese...

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		<div>
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		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>MatLab software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Math Works, Inc</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Required environment for the analysis software.</td>
</tr>
<tr>
<td>EM-CCD digital camera</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>9100 or 9300</td>
<td>Other high speed digital cameras will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>HC image  data capture software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Other image capture software that produces movies in avi format will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>Light Microscope with 10x objective </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Leica</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts

<p class="jove_content">Wir haben ein Verfahren zur Analyse optischen Hochgeschwindigkeits-Aufnahmen aus den entwickelten<em&gt; Drosophila</em&gt;, Zebrafisch und Maus embryonale Herz (Fink, et. Al., 2009). Unser Semi-automatische optische Heartbeat Analysis (SOHA) nutzt eine neuartige Bewegungserkennung Algorithmus, der in der Lage, Herz-Bewegungen mit einzelnen kontraktilen und Entspannung Ereignissen zu erkennen ist. Das Programm bietet eine Vielzahl von physiologisch relevanten Auslesen einschließlich des systolischen und diastolischen Intervalle, Herzfrequenz, sowie qualitative und quantitative Maßnahmen der Herzschlag arrhythmicity. Das Programm berechnet auch Herz Durchmesser Messungen sowohl bei Diastole und Systole aus dem fraktionelle Verkürzung und fraktionierte Bereich Veränderungen berechnet werden. Die Ausgabe erfolgt als digitale Datei kompatibel mit den meisten Tabellenkalkulations-Programmen zur Verfügung gestellt. Die Messungen werden für jeden Herzschlag in einer Rekordzeit Erhöhung der statistische Aussagekraft der Ausgang gemacht. Wir zeigen die einzelnen Schritte, in denen Benutzereingaben erforderlich ist, und zeigen die Anwendung unserer Methodik zur Analyse der Herzfunktion in allen drei genetisch manipulierbaren Modellen des Herzens.</p>

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Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts

<p class="jove_content">Wir haben eine Semi-automatische optische Heartbeat Analysemethode (SOHA) für die Analyse von optischen Hochgeschwindigkeits-Aufnahmen aus den entwickelten<em&gt; Drosophila</em&gt;, Zebrafisch und Maus embryonalen Herzen. Wir demonstrieren die Anwendung unserer Methode auf die Analyse der Herzfunktion in Fruchtfliege und Maus embryonalen Herzen.</p>

Semi-automatische optische Heartbeat-Analyse von kleinen Herzen

We have developed a method for analyzing high speed optical recordings from Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts (Fink, et. al., 2009). Our ...

Research

JoVE Journal

Biology

Proper Care and Cleaning of the Microscope

Richtige Pflege und Reinigung des Mikroskops

Keeping the microscope optics clean is important for high-quality imaging. Dust, fingerprints, excess immersion oil, or mounting medium on or in a ...

Forschung

Biologie

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Phase Contrast and Differential Interference Contrast DIC Microscopy

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