Name: semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts
Uploaded: 2009-09-16T13:00:00
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<p class="jove_content"> KOとACは、米国心臓協会からの助成金やフェローシップでサポートされています。 SIBとRBは、NIHからの補助金によってサポートされています。 </p>

<p class="jove_content"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/1435/SOHA_overview.pdf">半自動化されたハートビートの分析（SOHA）手順の概要を表示するにはここをクリック。</a> </p><p class="jove_content">半自動の光ビートの分析</p><p class="jove_title"> 1。プリプロセス - </p><p class="jove_content">このステップでは、収縮期血圧および拡張期心径に関する情報を提供します。 </p><p class="jove_content">ハートのエッジは最大拡張期と収縮期に?...

<ol>
	<li>Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myosin+Transducer+mutations+differentially+affect+motor+function,+myofibril+structure,+and+the+performance+of+skeletal+and+cardiac+muscles.">Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles.</a> <em style='font-style: italic'>Mol Biol Cell</em>. <b>19</b> (2), 553-562 (2008).</li><li>Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=KCNQ+potassium+channel+mutations+cause+cardiac+arrhythmias+in+Drosophila+that+mimic+the+effects+of+aging.">KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging.</a> <em style='font-style: italic'>Proc Natl Acad Sci U S A</em>. <b>104</b>, 3943-3948 (2007).</li><li>Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+method+for+the+detection+and+quantification+of+heartbeat+parameters+in+Drosophila,+zebrafish+and+embryonic+mouse+hearts.">A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts.</a> <em style='font-style: italic'>Biotechniques</em>. <b>46</b>, 101-113 (2009).</li></ol>

<p class="jove_content">ショウジョウバエモデルでは、胎生発育から学習や記憶に至るまで、科学的なさまざまな質問に対処するために使用されている強力な遺伝学的ツールであることが証明されている。最近この多目的なモデル生物は、心臓機能の遺伝学を調査するために使用されています。成体ショウジョウバエで心臓生理学を定量化するための試行回数は、腹部のクチクラを通してそのままハエで行った観測?...

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		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>MatLab software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Math Works, Inc</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Required environment for the analysis software.</td>
</tr>
<tr>
<td>EM-CCD digital camera</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>9100 or 9300</td>
<td>Other high speed digital cameras will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>HC image  data capture software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Other image capture software that produces movies in avi format will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>Light Microscope with 10x objective </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Leica</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts

<p class="jove_content">我々から高速光記録を分析するための方法を開発した<em&gt;ショウジョウバエ</em&gt;、ゼブラフィッシュとマウス胎児の心臓（フィンク、ら、2009）。私たちの半自動光ビート解析（SOHAは）個々の収縮と弛緩のイベントに関連付けられている心臓の動きを検出することができる新たな動き検出アルゴリズムを使用しています。プログラムは、収縮期および拡張期の間隔、心拍数だけでなく、ハートビートarrhythmicityの定性的および定量的措置を含む生理学的に適切な読み出しのホストを提供します。プログラムはまた、短縮率と小数面積の変化が計算された拡張期と収縮期の両方の間に心臓の直径の測定値を計算します。出力はほとんどのスプレッドシートプログラムと互換性のあるデジタルファイルとして提供されています。測定は、出力の統計的検出力を増加させる、レコード内のすべてのハートビートのために作られています。我々は、ユーザー入力が必要な各ステップを示し、すべての3つの遺伝的に扱いやすい心モデルにおける心機能の分析に私たちの方法論の適用を示す。</p>

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Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts

<p class="jove_content">我々は、より高速の光記録を分析するための半自動化された光ビートの分析法（SOHA）を開発しました<em&gt;ショウジョウバエ</em&gt;、ゼブラフィッシュとマウス胎児の心臓。我々は、ショウジョウバエとマウス胎児の心臓の心機能の分析に私たちの方法論の適用を示しています。</p>

スモールハーツの半自動光ビート解析

We have developed a method for analyzing high speed optical recordings from Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts (Fink, et. al., 2009). Our ...

Research

JoVE Journal

Biology

Proper Care and Cleaning of the Microscope

顕微鏡の適切な手入れとクリーニング

Keeping the microscope optics clean is important for high-quality imaging. Dust, fingerprints, excess immersion oil, or mounting medium on or in a ...

Major Components of the Light Microscope

光学顕微鏡の主要なコンポーネント

The light microscope is a basic tool for the cell biologist, who should have a thorough understanding of how it works, how it should be aligned for ...

Phase Contrast and Differential Interference Contrast (DIC) Microscopy

Phase Contrast and Differential Interference Contrast DIC Microscopy

位相コントラストおよび微分干渉コントラスト（DIC）顕微鏡

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Optical Mapping of Langendorff-perfused Rat Hearts

ランゲンドルフ灌流ラット心臓の光学的マッピング

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Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

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The  interaction of viruses and their prokaryotic hosts shaped the evolution of  bacterial and archaeal life. Prokaryotes developed several strategies to ...

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Semi-automated Imaging of Tissue-specific Fluorescence in Zebrafish Embryos

ゼブラフィッシュ胚における組織特異的蛍光の半自動イメージング

Zebrafish embryos are a powerful tool for large-scale screening of small molecules. Transgenic zebrafish that express fluorescent reporter proteins are ...

Isolation of Cardiomyocytes from Fixed Hearts for Immunocytochemistry and Ploidy Analysis

免疫細胞化学とプロイド分析のための固定心からの心筋細胞の分離

The adult mammalian heart is composed of various cell types including cardiomyocytes, endothelial cells and fibroblasts. Since it is difficult to reliably ...

Small-Scale Plasma Membrane Preparation for the Analysis of <em>Candida albicans</em> Cdr1-mGFPHis

Small-Scale Plasma Membrane Preparation for the Analysis of Candida albicans Cdr1-mGFPHis

<em>カンジダ・アルビカンス</em>Cdr1-mGFPHisの分析のための小スケールプラズマ膜調製

The successful biochemical and biophysical characterization of ABC transporters depends heavily on the choice of the heterologous expression system. Over ...

Quantitative Analysis of Viscoelastic Properties of Red Blood Cells Using Optical Tweezers and Defocusing Microscopy

光ピンセットとデフォーカス顕微鏡を用いた赤血球の粘弾性特性の定量的解析

The viscoelastic properties of erythrocytes have been investigated by a range of techniques. However, the reported experimental data vary. This is not ...