Name: semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts
Uploaded: 2009-09-16T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts at JoVE.com

<p class="jove_content"> KO e AC são suportados por uma bolsa e uma bolsa de estudos da Associação Americana do Coração. SIB e RB são suportados por concessões do NIH. </p>

<p class="jove_content"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/1435/SOHA_overview.pdf">Clique aqui para ver uma visão geral dos batimentos cardíacos semi automatizado de análise procedimento (SOHA).</a> </p><p class="jove_content"> Semi-automático de análise batimentos cardíacos óptico </p><p class="jove_title"> 1. Preprocess - </p><p class="jove_content"> Esta etapa fornece informações sobre os diâmetros cardíaca diastólica e sistólica. </p><p class="jove_content"> Bordas cardíacas são identificadas e marcadas durante a...

<ol>
	<li>Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myosin+Transducer+mutations+differentially+affect+motor+function,+myofibril+structure,+and+the+performance+of+skeletal+and+cardiac+muscles.">Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles.</a> <em style='font-style: italic'>Mol Biol Cell</em>. <b>19</b> (2), 553-562 (2008).</li><li>Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=KCNQ+potassium+channel+mutations+cause+cardiac+arrhythmias+in+Drosophila+that+mimic+the+effects+of+aging.">KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging.</a> <em style='font-style: italic'>Proc Natl Acad Sci U S A</em>. <b>104</b>, 3943-3948 (2007).</li><li>Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+method+for+the+detection+and+quantification+of+heartbeat+parameters+in+Drosophila,+zebrafish+and+embryonic+mouse+hearts.">A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts.</a> <em style='font-style: italic'>Biotechniques</em>. <b>46</b>, 101-113 (2009).</li></ol>

<p class="jove_content"> O modelo de Drosophila provou ser uma poderosa ferramenta genética que tem sido utilizado para tratar uma variedade de questões científicas que vão desde desenvolvimento embrionário para a aprendizagem e memória. Recentemente, este organismo modelo versátil, tem sido usado para investigar a genética da função cardíaca. Uma série de tentativas para quantificar a fisiologia do coração em adultos Drosophila têm contado com observações feitas em moscas intacta através da cutícula abdominal. A maioria dess...

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		<div>
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		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>MatLab software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Math Works, Inc</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Required environment for the analysis software.</td>
</tr>
<tr>
<td>EM-CCD digital camera</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>9100 or 9300</td>
<td>Other high speed digital cameras will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>HC image  data capture software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Other image capture software that produces movies in avi format will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>Light Microscope with 10x objective </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Leica</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts

<p class="jove_content">Nós desenvolvemos um método para analisar gravações ópticas de alta velocidade a partir de<em&gt; Drosophila</em&gt;, Peixe-zebra e corações embrionárias de camundongos (Fink, et. Al., 2009). Nosso semi-automático de análise de pulsação óptica (SOHA) utiliza um algoritmo de detecção de movimento que novela é capaz de detectar movimentos cardíacos associados com contráteis individuais e eventos relaxamento. O programa oferece uma série de leituras fisiologicamente relevantes, incluindo pressão arterial sistólica e diastólica intervalos, a freqüência cardíaca, bem como medidas qualitativas e quantitativas de arrhythmicity batimento cardíaco. O programa também calcula medições de diâmetro do coração durante a diástole e sístole tanto a partir do qual fração de encurtamento e mudanças área fracional são calculados. Saída é fornecido como um arquivo digital compatível com a maioria dos programas de planilha. As medições são feitas para cada batimento cardíaco em um registro de aumentar o poder estatístico da produção. Demonstramos cada uma das etapas em que a entrada do usuário é necessário e mostrar a aplicação da nossa metodologia para a análise da função cardíaca em todos os três modelos de coração geneticamente tratável.</p>

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Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts

<p class="jove_content">Nós desenvolvemos um método semi-automático de análise Optical Heartbeat (SOHA) para analisar as gravações ópticas de alta velocidade a partir de<em&gt; Drosophila</em&gt;, Peixe-zebra e corações embrionárias de camundongos. Nós demonstramos a aplicação de nossa metodologia para a análise da função cardíaca na mosca da fruta e corações embrionárias de camundongos.</p>

Semi-automático de análise de pulsação óptica de pequenos corações

We have developed a method for analyzing high speed optical recordings from Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts (Fink, et. al., 2009). Our ...

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