Name: semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts
Uploaded: 2009-09-16T13:00:00
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<p class="jove_content"> KO y AC son apoyados por una beca y beca a de la Asociación Americana del Corazón. SIB y RB son apoyados por las subvenciones del NIH. </p>

<p class="jove_content"> <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/1435/SOHA_overview.pdf">Haga clic aquí para ver un resumen de los semi automatizado de análisis latido del corazón (SOHA) procedimiento.</a> </p><p class="jove_content"> Semi-automatizado de análisis óptico de latidos del corazón </p><p class="jove_title"> 1. Preprocesar - </p><p class="jove_content"> Este paso ofrece información sobre los diámetros cardíaca diastólica y sistólica. </p><p class="jove_content"> Los bordes del corazón son identificados y marcados ...

<ol>
	<li>Cammarato, A., Dambacher, C. M., Reedy, M. C., Knowles, A. F., Kronert, W. A., Bodmer, R., Ocorr, K., Bernstein, S. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Myosin+Transducer+mutations+differentially+affect+motor+function,+myofibril+structure,+and+the+performance+of+skeletal+and+cardiac+muscles.">Myosin Transducer mutations differentially affect motor function, myofibril structure, and the performance of skeletal and cardiac muscles.</a> <em style='font-style: italic'>Mol Biol Cell</em>. <b>19</b> (2), 553-562 (2008).</li><li>Ocorr, K., Reeves, N., Wessells, R. J., Fink, M., Chen, H. -. S. V., Akasaka, T., Yasuda, S., Metzger, J., Giles, W., Posakony, J. W., Bodmer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=KCNQ+potassium+channel+mutations+cause+cardiac+arrhythmias+in+Drosophila+that+mimic+the+effects+of+aging.">KCNQ potassium channel mutations cause cardiac arrhythmias in Drosophila that mimic the effects of aging.</a> <em style='font-style: italic'>Proc Natl Acad Sci U S A</em>. <b>104</b>, 3943-3948 (2007).</li><li>Fink, M., Callol-Massot, C., Chu, A., Ruiz-Lozano, P., Izpisua Belmonte, J. C., Giles, W., Bodmer, R., Ocorr, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+method+for+the+detection+and+quantification+of+heartbeat+parameters+in+Drosophila,+zebrafish+and+embryonic+mouse+hearts.">A new method for the detection and quantification of heartbeat parameters in Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts.</a> <em style='font-style: italic'>Biotechniques</em>. <b>46</b>, 101-113 (2009).</li></ol>

<p class="jove_content"> El modelo de Drosophila ha demostrado ser una potente herramienta genética que se ha utilizado para tratar una variedad de problemas científicos que van desde el desarrollo embrionario para el aprendizaje y la memoria. Recientemente, este organismo modelo versátil se ha utilizado para investigar la genética de la función cardíaca. Un número de intentos de cuantificar la fisiología del corazón en adultos de Drosophila se han basado en observaciones realizadas en las moscas intacta a través de la cutícula abdom...

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		<div>
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		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>MatLab software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Math Works, Inc</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Required environment for the analysis software.</td>
</tr>
<tr>
<td>EM-CCD digital camera</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>9100 or 9300</td>
<td>Other high speed digital cameras will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>HC image  data capture software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hamamatsu Corp.</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Other image capture software that produces movies in avi format will also work.</td>
</tr>
<tr>
<td>Light Microscope with 10x objective </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Leica</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>A dipping lens that eliminates the air water interface greatly improves resolution</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

semi-automated optical heartbeat analysis of small hearts

<p class="jove_content">Hemos desarrollado un método para el análisis de grabaciones de alta velocidad óptica de<em&gt; Drosophila</em&gt;, El pez cebra y en los corazones de embriones de ratón (Fink, et. Al., 2009). Nuestros semi-automático de análisis latido óptico (SOHA) utiliza un algoritmo de detección de movimiento nuevo que es capaz de detectar los movimientos cardiacos asociados con cada contracción y relajación eventos. El programa ofrece una serie de lecturas fisiológicamente relevantes, incluyendo sistólica y diastólica, intervalos, ritmo cardíaco, así como las medidas cualitativas y cuantitativas de arrhythmicity latido del corazón. El programa también calcula las mediciones de diámetro de corazón durante tanto diástole y sístole de la cual se calcula la fracción de acortamiento fraccional y los cambios de zona. La salida se proporciona como un archivo digital compatible con la mayoría de los programas de hoja de cálculo. Las mediciones se realizan para cada latido del corazón en un registro de aumentar la potencia estadística de la salida. Se demuestra cada uno de los pasos que se requiere entrada del usuario y mostrar la aplicación de nuestra metodología para el análisis de la función cardíaca en los tres modelos del corazón genéticamente tratable.</p>

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Semi-automated Optical Heartbeat Analysis of Small Hearts

<p class="jove_content">Hemos desarrollado un método semi-automatizado de análisis óptico Heartbeat (SOHA) para el análisis de grabaciones de alta velocidad óptica de<em&gt; Drosophila</em&gt;, El pez cebra y en los corazones de embriones de ratón. Se demuestra la aplicación de nuestra metodología para el análisis de la función cardíaca en mosca de la fruta y los corazones de embriones de ratón.</p>

Semi-automatizado de análisis óptico latido de los corazones pequeños

We have developed a method for analyzing high speed optical recordings from Drosophila, zebrafish and embryonic mouse hearts (Fink, et. al., 2009). Our ...

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