Name: digital microfluidics for automated proteomic processing
Uploaded: 2009-11-06T16:00:00
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Nous remercions les sciences naturelles et en génie (CRSNG) et la Société canadienne du cancer pour le soutien financier. CSSC grâce CRSNG et VNL remercie les bourses d&#39;études supérieures de l&#39;Ontario (CGO) du programme de bourses d&#39;études supérieures. ARW remercie la CRC pour une Chaire de recherche du Canada.

Partie 1: fabrication de dispositifs <ol><li> Substrats de verre dans une solution de nettoyage Piranha (3:1 d&#39;acide sulfurique concentré:. Peroxyde d&#39;hydrogène à 30%). Laissez les substrats en solution Piranha pendant 10 min en agitant fréquemment. </li><li> Après un rinçage à l&#39;eau désionisée (DI) de l&#39;eau et le séchage des substrats avec gaz N 2, place les substrats dans la chambre de faisceau d&#39;électrons pour le dépôt de chrome (épaisseur de 250 nm). </li><li> Pour dés...

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	<li>Abdelgawad, M., Wheeler, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Digital+Revolution:+A+New+Paradigm+for+Microfluidics.">The Digital Revolution: A New Paradigm for Microfluidics.</a> Adv. Mat. 21, 920-925 (2009).</li><li>Jebrail, M., Wheeler, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Digital+Microfluidic+Method+for+Protein+Extraction+by+Precipitation.">A Digital Microfluidic Method for Protein Extraction by Precipitation.</a> Anal. Chem. 81, 330-335 (2009).</li><li>Luk, V. N., Wheeler, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Digital+Microfluidic+Approach+to+Proteomic+Sample+Processing.">A Digital Microfluidic Approach to Proteomic Sample Processing.</a> Anal. Chem. 81, 4524-4530 (2009).</li></ol>

Le manque de manipulation des échantillons et le traitement standardisé de la protéomique est une limitation majeure pour le champ. De plus, la manipulation des échantillons conventionnels macroscopique implique plusieurs conteneurs et les transferts de solution, qui peut conduire à des pertes et la contamination de l&#39;échantillon. Une solution potentielle à ces problèmes est de former des systèmes intégrés pour le traitement des échantillons en s&#39;appuyant sur ​​une microfluidique digit...

digital microfluidics for automated proteomic processing

Protéomique clinique est apparue comme une discipline importante nouvelle, promettant la découverte de biomarqueurs qui seront utiles pour le diagnostic précoce et le pronostic de la maladie. Bien cliniques méthodes protéomiques varient largement, une caractéristique commune est le besoin de (i) l&#39;extraction de protéines à partir de liquides extrêmement hétérogènes (c&#39;est à dire le sérum, le sang total, etc) et (ii) un traitement complet avant l&#39;analyse biochimique. Ici, nous rapportons une nouvelle microfluidique digitale (DMF) méthode fondée intégrant plusieurs étapes de traitement utilisées en protéomique clinique. Cela inclut l&#39;extraction des protéines, resolubilisation, la réduction, l&#39;alkylation et la digestion enzymatique. Numérique microfluidique est un micro dynamique des fluides technique dans laquelle des gouttelettes d&#39;nanolitre-microlitre entreprises sont manipulés sur une surface ouverte. Les gouttelettes sont positionnées sur le dessus d&#39;un réseau d&#39;électrodes qui sont recouverts par une couche diélectrique - quand un potentiel électrique est appliqué à la goutte, des charges s&#39;accumulent sur chaque côté du diélectrique. Les charges électrostatiques servent de poignées qui peuvent être utilisés pour contrôler la position des gouttelettes, et par une séquence de polarisation des électrodes en série, des gouttelettes peut être fait pour passer, déplacer, fusionner, mélanger et diviser sur la surface. Par conséquent, le DMF est un choix naturel pour le transport rapide, séquentielle, en plusieurs étapes, miniaturisé automatisé des dosages biochimiques. Cela représente une avancée significative par rapport aux méthodes conventionnelles (en s&#39;appuyant sur pipetage manuel ou des robots), et a le potentiel pour être un outil utile dans la nouvelle protéomique clinique. Maïs J. Djebrail, Vivienne N. Luk, et Steve CC Shih contribué également à ce travail. Adresse actuelle Sergio LS Freire est à l&#39;Université des Sciences de Philadelphie situé au 600, rue du Sud 43ème, Philadelphie, PA 19104.

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Digital Microfluidics for Automated Proteomic Processing

Microfluidique digitale est une technique caractérisée par la manipulation de gouttelettes discrètes (~ nL - ml) sur un réseau d&#39;électrodes par l&#39;application de champs électriques. Il est bien adapté pour la réalisation rapide, séquentielle, miniaturisé automatisé des dosages biochimiques. Ici, nous rapportons une plate-forme capable d&#39;automatiser plusieurs étapes de traitement protéomique.

Microfluidique numérique pour le traitement automatisé protéomiques

Clinical proteomics has emerged as an important new discipline, promising the discovery of biomarkers that will be useful for early diagnosis and ...

Research

JoVE Journal

Biology

Chemotactic Response of Marine Micro-Organisms to Micro-Scale Nutrient Layers

Réponse chimiotactique des micro-organismes marins à l&#39;échelle micro nutriments des couches

The degree to which planktonic microbes can exploit microscale resource patches will have considerable implications for oceanic trophodynamics and ...

Recherche

Biologie

Studies of Bacterial Chemotaxis Using Microfluidics - Interview

Les études de chimiotactisme bactérien microfluidique - Interview

Applying Microfluidics to Electrophysiology

En appliquant la microfluidique à l&#39;électrophysiologie

Microfluidics can be integrated with standard electrophysiology techniques to allow new experimental modalities.  Specifically, the motivation for the ...

Electrophoretic Separation of Proteins

Séparation électrophorétique de protéines

Electrophoresis is used to separate complex mixtures of proteins (e.g., from cells, subcellular fractions, column fractions, or immunoprecipitates), to ...

Immunoblot Analysis

Analyse immunoblot

Immunoblotting (western blotting) is a rapid and sensitive assay for the detection and characterization of proteins that works by exploiting the ...

Staining Proteins in Gels

Coloration protéines dans les gels

Following separation by electrophoretic methods, proteins in a gel can be detected by several staining methods. This unit describes protocols for ...

Toxin Induction and Protein Extraction from Fusarium spp. Cultures for Proteomic Studies

Toxin Induction and Protein Extraction from Fusarium spp. Cultures for Proteomic Studies

L&#39;induction ou à toxines et d&#39;extraction de protéines à partir Fusarium Spp. Cultures pour les études protéomiques

Fusaria are filamentous fungi able to produce different toxins. Fusarium mycotoxins such as deoxynivalenol, nivalenol, T2, zearelenone, fusaric acid, ...

Evisceration of Mouse Vitreous and Retina for Proteomic Analyses

L&#39;éviscération des corps vitré et la rétine de la souris pour les analyses protéomiques

While the mouse retina has emerged as an important genetic model for inherited retinal disease, the mouse vitreous remains to be explored. The vitreous is ...

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

Metabolic Labeling and Membrane Fractionation for Comparative Proteomic Analysis of Arabidopsis thaliana Suspension Cell Cultures

Marquage métabolique et la membrane de fractionnement pour comparative Analyse protéomique de<em&gt; Arabidopsis thaliana</em&gt; Cultures Suspension cellulaires

Plasma membrane microdomains are features based on the physical properties of the lipid and sterol environment and have particular roles in signaling ...

Magnetic-Activated Cell Sorting Strategies to Isolate and Purify Synovial Fluid-Derived Mesenchymal Stem Cells from a Rabbit Model

Cellule magnétique activé tri des stratégies visant à isoler et purifier Synovial fluide mésenchymateuses cellules souches dérivées d’un modèle de lapin

Mesenchymal stem cells (MSCs) are the main cell source for cell-based therapy. MSCs from articular cavity synovial fluid could potentially be used for ...