Name: a microfluidic device for quantifying bacterial chemotaxis in stable concentration gradients
Uploaded: 2010-04-19T17:40:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable Concentration Gradients at JoVE.com

Questo lavoro è stato sostenuto in parte dalla National Science Foundation (cbet 0846453).

1. Fabbricazione di maestri silicio utilizzando le normali SU-8 fotolitografia 1 (non mostrato in questo video). <ol><li> Uso standard SU-8 metodi di fotolitografia per creare un SU-8 &quot;master&quot; (SU-8 2025, MicroChem, Newton, MA) per la realizzazione dello stampo PDMS che contiene la rete microfluidica e la camera di chemiotassi. Stampi maestro tale può essere fabbricato in qualunque impianto di microfabbricazione (ad esempio, Stanford Microfluidica Fonderia; <a href="http://thebigone.stan...

<ol>
	<li>McDonald, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prototyping+of+microfluidic+devices+in+poly(dimethylsiloxane)+using+solid-object+printing.">Prototyping of microfluidic devices in poly(dimethylsiloxane) using solid-object printing.</a> Anal Chem. 74, 1537-1545 (2002).</li><li>Hansen, M. C., Palmer, R. J. J., Udsen, C., White, D. C., Molin, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+GFP+fluorescence+in+cells+of+Streptococcus+gordonii+under+conditions+of+low+pH+and+low+oxygen+concentration.">Assessment of GFP fluorescence in cells of Streptococcus gordonii under conditions of low pH and low oxygen concentration.</a> Microbiol. 147, 1383-1391 (2001).</li><li>Englert, D. L., Manson, M. D., Jayaraman, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Flow-Based+Microfluidic+Device+for+Quantifying+Bacterial+Chemotaxis+in+Stable,+Competing+Gradients.">A Flow-Based Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable, Competing Gradients.</a> Appl Environ Microbiol. 75, 4557-4564 (2009).</li><li>Englert, D. L., Jayaraman, A., Manson, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Microfluidic techniques for the analysis of bacterial chemotaxis. , (2009).</li><li>Mao, H., Cremer, P. S., &amp;amp, M. a. n. s. o. n. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+sensitive,+versatile+microfluidic+assay+for+bacterial+chemotaxis.">A sensitive, versatile microfluidic assay for bacterial chemotaxis.</a> PNAS. 100 (9), 5449-5454 (2003).</li></ol>

Il coefficiente di partizione chemiotassi (CPC) e il coefficiente di migrazione chemiotassi (CMC) può essere calcolato come descritto in Mao et al 5. Se una cellula viene rilevato sul lato alta concentrazione, si è dato un valore di +1, mentre una cella individuata sul lato bassa concentrazione viene assegnato un valore di -1. I valori sono riassunti e diviso per il numero totale di cellule per generare il CPC. Il segno del CPC (positivo o negativo) dà la direzione della migrazione (verso o lonta...

a microfluidic device for quantifying bacterial chemotaxis in stable concentration gradients

Chemiotassi permette ai batteri di approccio fonti di sostanze chimiche attractant o per evitare le fonti di sostanze repellenti. I batteri di monitorare costantemente la concentrazione di chemoeffectors specifiche confrontando la concentrazione attuale alla concentrazione rilevata pochi secondi prima. Questo confronto determina la direzione netto di movimento. Anche se diversi, i gradienti concorrenti spesso coesistono in natura, gli approcci convenzionali per lo studio chemiotassi batterica non sono ottimali per quantificare la migrazione in risposta a gradienti di concentrazione di attrattivi e repellenti. Qui, descriviamo lo sviluppo di un modello di chemiotassi microfluidica per presentare i gradienti di concentrazione precisa e stabile di chemoeffectors a batteri e quantitativamente indagando la loro risposta al gradiente applicato. Il dispositivo è versatile in quanto gradienti di concentrazione di qualsiasi concentrazione desiderata in assoluto e la forza del gradiente può essere facilmente generato da miscelazione diffusivo. Il dispositivo è dimostrata utilizzando la risposta del<em&gt; Escherichia coli</em&gt; RP437 a gradienti di aminoacidi e ioni nichel.

Watch this Scientific Journal Video about A Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable Concentration Gradients at JoVE.com

A Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable Concentration Gradients

Questo protocollo descrive lo sviluppo di un dispositivo a microfluidi per indagare chemiotassi batterica in gradienti di concentrazione stabile di chemoeffectors.

Un dispositivo a microfluidi per quantificare chemiotassi batterica in gradienti di concentrazione stabile

Chemotaxis allows bacteria to approach sources of attractant chemicals or to avoid sources of repellent chemicals. Bacteria constantly monitor the ...

Research

JoVE Journal

Biology

Studies of Bacterial Chemotaxis Using Microfluidics - Interview

Gli studi di chemiotassi batterica Utilizzando Microfluidica - Intervista

Ricerca

Biologia

Fabrication of a Microfluidic Device for the Compartmentalization of Neuron Soma and Axons

Fabbricazione di un dispositivo a microfluidi per la compartimentazione dei Neuron Soma e assoni

In this video, we demonstrate the technique of soft lithography with polydimethyl siloxane (PDMS) which we use to fabricate a microfluidic device for ...

A Microfluidic Device with Groove Patterns for Studying Cellular Behavior

Un dispositivo a microfluidi con pattern Groove per studiare il comportamento cellulare

We describe a microfluidic device with microgrooved patterns for studying cellular behavior.  This microfluidic platform consists of a top fluidic channel ...

A Gradient-generating Microfluidic Device for Cell Biology

Un gradiente di generazione del dispositivo Microfluidic di Biologia Cellulare

 The fabrication and operation of a gradient-generating microfluidic device for studying cellular behavior is described.  A microfluidic platform is an ...

Preparing E18 Cortical Rat Neurons for Compartmentalization in a Microfluidic Device

Preparazione E18 neuroni corticali di ratto per compartimentazione in un dispositivo a microfluidi

In this video, we demonstrate the preparation of E18 cortical rat neurons. E18 cortical rat neurons are obtained from E18 fetal rat cortex previously ...

CD4+ T-Lymphocyte Capture Using a Disposable Microfluidic Chip for HIV

CD4 + T-linfociti Capture utilizzando un chip monouso Microfluidic per l&#39;HIV

Cell Capture Using a Microfluidic Device

Cattura cellula Utilizzando un dispositivo a microfluidi

Assessing Neural Stem Cell Motility Using an Agarose Gel-based Microfluidic Device

Valutare motilità delle cellule staminali neurali L&#39;utilizzo di un gel a base di Agarose dispositivo a microfluidi

While microfluidic technology is reaching a new level of maturity for macromolecular assays, cell-based assays are still at an infant stage1. This is ...

Generation of Stable Transgenic C. elegans Using Microinjection

Generazione di Stabile transgenici C. elegans Utilizzando Microiniezione

Transgenic Caenorhabditis elegans can be readily created via microinjection of a DNA plasmid solution into the gonad 1.  The plasmid DNA rearranges to ...

A Multi-Parametric Islet Perifusion System within a Microfluidic Perifusion Device

Un multi-parametrica Perifusion Sistema isolotto all&#39;interno di un dispositivo Perifusion Microfluidic

A microfluidic islet perifusion device was developed for the assessment of dynamic insulin secretion of multiple islets and simultaneous fluorescence ...