Name: a microfluidic device for quantifying bacterial chemotaxis in stable concentration gradients
Uploaded: 2010-04-19T17:40:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable Concentration Gradients at JoVE.com

Detta arbete stöddes delvis av National Science Foundation (CBET 0.846.453).

1. Tillverkning av kisel mästare med standard SU-8 fotolitografi 1 (visas inte i denna video). <ol><li> Använd standard SU-8 fotolitografiska metoder för att skapa en SU-8 &quot;master&quot; (SU-8 2025, MicroChem, Newton, MA) för att tillverka de PDMS mögel som innehåller mikroflödessystem nätverket och chemotaxis kammare. Sådan herre formar kan tillverkas i alla mikrofabrikation anläggning (t ex Stanford Mikrofluidik Foundry, <a href="http://thebigone.stanford.edu/foundry/">http://thebig...

<ol>
	<li>McDonald, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prototyping+of+microfluidic+devices+in+poly(dimethylsiloxane)+using+solid-object+printing.">Prototyping of microfluidic devices in poly(dimethylsiloxane) using solid-object printing.</a> Anal Chem. 74, 1537-1545 (2002).</li><li>Hansen, M. C., Palmer, R. J. J., Udsen, C., White, D. C., Molin, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessment+of+GFP+fluorescence+in+cells+of+Streptococcus+gordonii+under+conditions+of+low+pH+and+low+oxygen+concentration.">Assessment of GFP fluorescence in cells of Streptococcus gordonii under conditions of low pH and low oxygen concentration.</a> Microbiol. 147, 1383-1391 (2001).</li><li>Englert, D. L., Manson, M. D., Jayaraman, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Flow-Based+Microfluidic+Device+for+Quantifying+Bacterial+Chemotaxis+in+Stable,+Competing+Gradients.">A Flow-Based Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable, Competing Gradients.</a> Appl Environ Microbiol. 75, 4557-4564 (2009).</li><li>Englert, D. L., Jayaraman, A., Manson, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Microfluidic techniques for the analysis of bacterial chemotaxis. , (2009).</li><li>Mao, H., Cremer, P. S., &amp;amp, M. a. n. s. o. n. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+sensitive,+versatile+microfluidic+assay+for+bacterial+chemotaxis.">A sensitive, versatile microfluidic assay for bacterial chemotaxis.</a> PNAS. 100 (9), 5449-5454 (2003).</li></ol>

Den chemotaxis fördelningskoefficient (CPC) och kemotaxi migration koefficienten (CMC) kan beräknas enligt beskrivningen i Mao et al 5. Om en cell upptäcks på den höga koncentrationen sidan ges det ett värde på 1, medan en cell upptäcks på den låga koncentrationen sidan ges ett värde på -1. Värdena summeras och delas med det totala antalet celler att generera CPC. Tecknet för CPC (positiv eller negativ) ger riktning migration (mot eller bort från en signal). Även om CPC visar om cell...

a microfluidic device for quantifying bacterial chemotaxis in stable concentration gradients

Chemotaxis gör att bakterier att närma källor lockbete kemikalier eller för att undvika källor till motbjudande kemikalier. Bakterier övervakar ständigt koncentrationen av specifika chemoeffectors genom att jämföra den nuvarande koncentrationen till koncentrationen upptäckt några sekunder tidigare. Denna jämförelse bestämmer netto färdriktning. Trots att flera konkurrerande gradienter ofta samexistera i naturen, konventionella metoder för undersökning av bakteriell chemotaxis är suboptimala för att kvantifiera migration som svar på koncentrationsgradienter av tilldragande och repellerande medel. Här beskriver vi utvecklingen av en mikroflödessystem chemotaxis modell för att presentera exakt och stabil koncentrationsgradienter av chemoeffectors för bakterier och kvantitativt undersöka deras svar på den tillämpade övertoningen. Enheten är mångsidig i att koncentrationsgradienter av önskad absolut koncentration och gradient styrka kan lätt genereras av diffus blandning. Enheten visas med hjälp av respons<em&gt; Escherichia coli</em&gt; RP437 till gradienter av aminosyror och joner nickel.

Watch this Scientific Journal Video about A Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable Concentration Gradients at JoVE.com

A Microfluidic Device for Quantifying Bacterial Chemotaxis in Stable Concentration Gradients

Detta protokoll beskriver utvecklingen av en mikroflödessystem anordning för att undersöka bakterie chemotaxis i stabila koncentrationsgradienter av chemoeffectors.

Ett mikroflödessystem enhet för att kvantifiera Bakteriella chemotaxis i stabila koncentrationsgradienter

Chemotaxis allows bacteria to approach sources of attractant chemicals or to avoid sources of repellent chemicals. Bacteria constantly monitor the ...

Research

JoVE Journal

Biology

Studies of Bacterial Chemotaxis Using Microfluidics - Interview

Studier av Bakteriella chemotaxis Använda Mikrofluidik - Intervju

Fabrication of a Microfluidic Device for the Compartmentalization of Neuron Soma and Axons

Tillverkning av en mikroflödessystem enhet för uppdelning av Neuron Soma och Axoner

In this video, we demonstrate the technique of soft lithography with polydimethyl siloxane (PDMS) which we use to fabricate a microfluidic device for ...

A Microfluidic Device with Groove Patterns for Studying Cellular Behavior

En mikroflödessystem enhet med Groove Mönster till Studera Cellular Behavior

We describe a microfluidic device with microgrooved patterns for studying cellular behavior.  This microfluidic platform consists of a top fluidic channel ...

A Gradient-generating Microfluidic Device for Cell Biology

En gradient som genererar mikroflödessystem enhet för cellbiologi

 The fabrication and operation of a gradient-generating microfluidic device for studying cellular behavior is described.  A microfluidic platform is an ...

Preparing E18 Cortical Rat Neurons for Compartmentalization in a Microfluidic Device

Förbereda E18 kortikala Råtta Nervceller för uppdelning i en mikroflödessystem enhet

In this video, we demonstrate the preparation of E18 cortical rat neurons. E18 cortical rat neurons are obtained from E18 fetal rat cortex previously ...

CD4+ T-Lymphocyte Capture Using a Disposable Microfluidic Chip for HIV

CD4 + T-lymfocyter ta med en engångs Mikroflödessystem Chip för HIV

Cell Capture Using a Microfluidic Device

Cell ta med en mikroflödessystem enhet

Assessing Neural Stem Cell Motility Using an Agarose Gel-based Microfluidic Device

Bedöma Neurala Motility Stem Cell Använda en agarosgel-baserade mikroflödessystem enhet

While microfluidic technology is reaching a new level of maturity for macromolecular assays, cell-based assays are still at an infant stage1. This is ...

Generation of Stable Transgenic C. elegans Using Microinjection

Generering av Stabil Transgena C. elegans Använda mikroinjektion

Transgenic Caenorhabditis elegans can be readily created via microinjection of a DNA plasmid solution into the gonad 1.  The plasmid DNA rearranges to ...

A Multi-Parametric Islet Perifusion System within a Microfluidic Perifusion Device

En Multi-parametriska Islet Perifusion System inom en mikroflödessystem Perifusion enhet

A microfluidic islet perifusion device was developed for the assessment of dynamic insulin secretion of multiple islets and simultaneous fluorescence ...