Name: tomato analyzer: a useful software application to collect accurate and detailed morphological and colorimetric data from two-dimensional objects
Uploaded: 2010-03-16T16:30:00
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Avaliação de alto rendimento e precisa da morfologia da planta de órgãos e cor é difícil devido à sua natureza quantitativa e quantificação muitas vezes subjetiva. TA fornece medidas objetivas e precisas de características morfológicas de frutas diversas e colorimétricas de uma forma de alto rendimento e semi-automáticas. A utilidade da TA tem sido demonstrada em estudos que levaram à identificação da forma do fruto de tomate QTL 2,4,5. Além disso, a classificação de cultivars6 ea taxonomia de um grupo de espécies foi avaliado utilizando a saída do TA 15,16. Alta expressão do fruto de tomate forma resultados gene dom em 17 frutos alongados. Utilizando forma de folha TA, e cotilédones foi determinada em linhas expressando dom a um alto nível 7, demonstrando que o aplicativo pode ser usado efetivamente para medir a morfologia de órgãos de outras plantas também. Além disso, TA tem sido muito importante na identificação da base genética do tamanho da semente de tomate e girassol 8,9. Por último, o módulo de teste de cores implementado em TA é mais preciso e exato, e menos caro do que outros métodos para analisar cor do fruto no tomate. Em resumo, a TA se tornou uma ferramenta fundamental para a avaliação objetiva e confiável da morfologia e da variação de cor dos órgãos da planta.

tomato analyzer: a useful software application to collect accurate and detailed morphological and colorimetric data from two-dimensional objects

Medir a morfologia de frutos e as características de cor de culturas vegetais e frutas de forma objetiva e reprodutível é importante para análises detalhadas fenotípica dessas características. Tomate Analyzer (TA) é um programa de software que mede 37 atributos relacionados a duas dimensões da forma em um 1,2 maneira semi-automática e reprodutível. Muitos desses atributos, tais como ângulos nas extremidades distal e proximal do fruto e áreas de recuo, são difíceis de quantificar manualmente. Os atributos são organizados em dez categorias dentro do software: Medição Basic, Índice de Forma Frutas, blockiness, Homogeneidade, Shape End Proximal Fruit, Shape extremidade distal Frutas, Assimetria, excentricidade Interna, Seção latitudinal e Morfologia. A última categoria não requer conhecimento prévio nem noções pré-determinada dos atributos forma, a análise morfométrica de modo oferece uma opção imparcial que pode ser melhor adaptado para high-throughput análises do que a análise de atributos. TA também oferece a aplicação do Teste de Cor, que foi projetado para coletar medidas de cor a partir de imagens digitalizadas e permitir a digitalização dispositivos a ser calibrado com padrões de cores 3. TA fornece várias opções para exportar e analisar atributo forma, morfométrica, e os dados de cor. Os dados podem ser exportados para um arquivo excel em modo de lote (mais de 100 imagens de uma só vez) ou exportados como imagens individuais. O usuário pode escolher entre a saída que exibe a média de cada atributo para os objetos em cada imagem (incluindo desvio padrão), ou uma saída que exibe os valores de atributo para cada objeto na imagem. TA tem sido um instrumento valioso e eficaz para identificando e confirmando tomate fruta forma Quantitative Trait Loci (QTL), bem como realizar análises em profundidade do efeito de genes de frutas chave forma na morfologia da planta. Além disso, a AT pode ser usada para classificar objetivamente frutas em categorias diversas formas. Por último, o formato do fruto e traços de cor em outras espécies de plantas, bem como órgãos de outras plantas, como folhas e sementes podem ser avaliadas com TA.

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Tomato Analyzer: A Useful Software Application to Collect Accurate and Detailed Morphological and Colorimetric Data from Two-dimensional Objects

Tomate Analyzer (TA) quantifica os atributos de duas formas tridimensionais e cor de uma forma reprodutível e preciso. Um procedimento passo-a-passo para a obtenção de imagens digitalizadas de alta qualidade de frutos de tomate, análises morfológicas e cor das imagens e aplicações diversas usando os dados gerados por este software são descritos.

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