Name: dna-based fish species identification protocol
Uploaded: 2010-04-28T17:00:00
Duration: 9 min 15 s
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Agilent Stratagene उत्पाद प्रभाग <ul><li> HARINI रवि </li><li> नतालिया Novorodovskaya </li><li> स्कॉट Basehore </li><li> जेफ Braman </li><li> राहेल Formosa </li><li> Ronda एलन </li><li> राजेश बग्गा </li><li> डेरेक हॉल </li><li> सारा Jandle </li><li> डेनिएल Huffman </li></ul> Agilent प्रयोगशालाओं <ul><li> रॉबर्ट किनकैड </li><li> मैरी McBride </li></ul> Agilent है यूरोप <ul><li> निगेल स्किनर </li><li> Juergen Schneider </li><li> स्टीफन म्यूएलर </li><li> मार्टिन Kratzmeier </li></ul> Campden BRI <ul><li> स्टीव गैरेट </li></ul>

<ol>
	<li>Dooley, J. J., Sage, H. D., Brown, H. M., Garrett, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+fish+species+identification+by+use+of+lab-on-a-chip+technology.">Improved fish species identification by use of lab-on-a-chip technology.</a> Food Control. 16 (7), 601-607 (2004).</li><li>Dooley, J. J., Sage, H. D., Clarke, M. -. A. L., Brown, H. M., Garrett, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fish+species+Identification+Using+PCR-RFLP+Analysis+and+Lab-on-a-Chip+Capillary+Electrophoresis:+Application+to+Detect+White+Fish+Species+in+Food+Products+and+an+Interlaboratory+Study.">Fish species Identification Using PCR-RFLP Analysis and Lab-on-a-Chip Capillary Electrophoresis: Application to Detect White Fish Species in Food Products and an Interlaboratory Study.</a> J. Agric. Food Chem. 53, 3348-3357 (2005).</li><li>Dooley, J., Garrett, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Determination+of+PCR-RFLP+Profiles+for+Fish+Species+Using+the+Agilent+2100+Bioanalyzer.">Determination of PCR-RFLP Profiles for Fish Species Using the Agilent 2100 Bioanalyzer.</a> Agilent Technologies Application Note. , (2005).</li><li>Dooley, J. J., Clarke, M. L., Sage, H. D., Brown, H. M., Garrett, S. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Application+of+a+chip-based+capillary+electrophoresis+system+to+enable+simple+PCR-RFLP+identification+of+fish+species.">Application of a chip-based capillary electrophoresis system to enable simple PCR-RFLP identification of fish species.</a> FSA Final Report Q01069. , (2004).</li></ol>

लेखकों Agilent टेक्नोलॉजीज है कि अभिकर्मकों और इस लेख में इस्तेमाल उपकरणों का उत्पादन द्वारा नियोजित कर रहे हैं.

हम एक सरल, तेजी से और सटीक समुद्री खाद्य उत्पादों में मछली प्रजातियों की पहचान के लिए डीएनए आधारित स्क्रीनिंग विधि प्रदर्शित करता है. इस शक्तिशाली विधि कम से कम एक दिन काम में प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य, सटीक परिणाम प्रदान करता है और यह वाणिज्यिक सुव्यवस्थित प्रोटोकॉल और साधारण सेटअप के कारण परीक्षण सुविधाओं में कार्यान्वित किया जा सकता है. यह उद्देश्य डेटा है कि प्रयोगात्मक व्युत्पन्न मछली प्रजातियों प्रोफाइल के एक विस्तार योग्य डेटाबेस के साथ RFLP विकोडक सॉफ्टवेयर का उपयोग कर विश्लेषण किया है की पीढ़ी की विशेषता है. दिनचर्या कार्यान्वयन के साथ, इस परीक्षण विधि समुद्री खाद्य उत्पादों की mislabeling रोकने के लिए और सरकारी नियमों के अनुपालन के लिए उपयुक्त सटीक रिकॉर्ड बनाए रखने में सहायता करने की क्षमता है.

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<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Agilent 2100 Bioanalyzer (with chip priming station and IKA vortex mixer)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>G2939AA</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Agilent 2100 Bioanalyzer laptop &amp; Expert Software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>G2953CA</td>
<td>G2950CA - desktop PC &amp; Expert Software</td>
</tr>
<tr>
<td>Agilent Bioanalyzer DNA 1000 Reagent Kit (part #5067-1504)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>5067-1504</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Thermal Cycler</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>PCR Strip Tubes</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>401428</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>PCR Strip Caps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>401425</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>96-Well Working Rack</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>410094</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Fish Species Identification System DNA Isolation Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>Contact</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Fish Species Identification System PCR-RFLP Reagent Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>Contact</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>RFLP Matcher Software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>Contact</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>100% ethanol, 200 proof (USP grade or equivalent)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sterile, nuclease-free water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Pipettors</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Incubator or water bath set to 65&deg;C</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sterile glass bottle or polypropylene tube (e.g. 14-ml BD Falcon polypropylene)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>round-bottom tubes or 50-ml BD Falcon polypropylene conical tubes)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Vortex mixer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Microcentrifuge</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Microcentrifuge tubes 1.5ml</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Tube rack 1.5ml</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Pipette Tips</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Various</td>
<td>Various</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

dna-based fish species identification protocol

हम एक तेज, सरल और सटीक डीएनए आधारित स्क्रीनिंग मछली ताजा और प्रसंस्कृत समुद्री भोजन के नमूने में मौजूद प्रजातियों की पहचान विधि विकसित किया है. इस बहुमुखी जीनोमिक डीएनए, मछली के नमूने से निकाले प्रतिबंध टुकड़ा लंबाई बहुरूपता विश्लेषण (RFLP) द्वारा पीछा करने के लिए कि Agilent Bioanalyzer 2100 पर हल किया जा सकता है और सही RFLP पैटर्न मिलान सॉफ्टवेयर का उपयोग प्रजातियों करने के लिए मिलान टुकड़ा पैटर्न उत्पन्न की पीसीआर प्रवर्धन विधि कार्यरत हैं. मछली पहचान विधि एक सरल, विश्वसनीय, स्पिन स्तंभ आधारित प्रोटोकॉल का उपयोग करता है मछली नमूनों से डीएनए अलग. नमूने proteinase कश्मीर के साथ व्यवहार कर रहे हैं समाधान में न्यूक्लिक एसिड जारी है. डीएनए तो बंधन बफर में नमूना निलंबित और एक स्पिन माइक्रो सिलिका आधारित एक फाइबर मैट्रिक्स युक्त कप पर लोड करके अलग है. नमूना फाइबर मैट्रिक्स करने के लिए बाध्य में न्यूक्लिक एसिड. immobilized nucleic एसिड contaminants को दूर धो रहे हैं, और कुल डीएनए 100 μl के अंतिम मात्रा में बरामद किया है. पृथक डीएनए प्रदान प्राइमरों कि सभी मछली जीनोम में पाया दृश्यों के लिए बाध्य के साथ पीसीआर प्रवर्धन के लिए तैयार है. पीसीआर उत्पादों को फिर तीन विभिन्न प्रतिबंध एंजाइमों के साथ पचा रहे हैं और Agilent Bioanalyzer 2100 पर हल. पाचन प्रतिक्रियाओं में उत्पादित टुकड़ा लंबाई मछली की प्रजातियों में से जो डीएनए नमूना तैयार किया गया था निर्धारित करने के लिए, RFLP प्रयोगात्मक व्युत्पन्न व्यावसायिक रूप से प्रासंगिक मछली प्रजातियों से RFLP पैटर्न के एक डेटाबेस युक्त सॉफ्टवेयर मिलान पैटर्न का उपयोग करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है.

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DNA-based Fish Species Identification Protocol

इस प्रकाशन का वर्णन कैसे Agilent मछली प्रजाति पहचान प्रणाली का उपयोग करने के लिए डीएनए निकालने और पीसीआर और RFLP विश्लेषण के प्रदर्शन के द्वारा एक मछली की प्रजातियों की पहचान है.

डीएनए आधारित मछली प्रजाति पहचान प्रोटोकॉल

We have developed a fast, simple, and accurate DNA-based screening method to identify the fish species present in fresh and processed seafood samples. ...

Research

JoVE Journal

Biology

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The high-throughput expression analysis technologies available today give scientists an overflow of expression profiles but their resolution in terms of ...

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Detection of Viral RNA by Fluorescence in situ Hybridization FISH

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