Name: examination of the telomere g-overhang structure in trypanosoma brucei
Uploaded: 2011-01-26T17:00:00
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Gostaríamos de agradecer ao Dr. Carolyn Preço para discussões científicas e sugestões perspicaz. Este trabalho é suportado pelo NIH conceder AI066095 (PI: Bibo Li).

1. Detectar T. brucei Telomere G saliência usando Native Hibridização In-gel 3 Princípio (Figura 1): Em condições nativas, um fim-rotulados (CCCTAA) 4 (TELC) oligo sonda só pode hibridizar o telômero single-stranded G-saliência região. A intensidade de hibridização é proporcional ao comprimento do balanço. Após desnaturação e neutralização, a mesma sonda será capaz de hibridizar para a região dos telômeros todo. A intensidade de hibridizaç?...

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	<li>Munoz-Jordan, J. L., Cross, G. A., de Lange, T., Griffith, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=t-loops+at+trypanosome+telomeres.">t-loops at trypanosome telomeres.</a> EMBO J. 20, 579-588 (2001).</li><li>Li, B., Espinal, A., Cross, G. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trypanosome+telomeres+are+protected+by+a+homologue+of+mammalian+TRF2.">Trypanosome telomeres are protected by a homologue of mammalian TRF2.</a> Mol Cell Biol. 25, 5011-5021 (2005).</li><li>Wellinger, R. J., Wolf, A. J., Zakian, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Saccharomyces+telomeres+acquire+single-strand+TG1-3+tails+late+in+S+phase.">Saccharomyces telomeres acquire single-strand TG1-3 tails late in S phase.</a> Cell. 72, 51-60 (1993).</li><li>McElligott, R., Wellinger, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+terminal+DNA+structure+of+mammalian+chromosomes.">The terminal DNA structure of mammalian chromosomes.</a> EMBO J. 16, 3705-3714 (1997).</li><li>Harrington, L. A., Greider, C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Telomerase+primer+specificity+and+chromosome+healing.">Telomerase primer specificity and chromosome healing.</a> Nature. 353, 451-454 (1991).</li><li>Jacob, N. K., Skopp, R., Price, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=G-overhang+dynamics+at+Tetrahymena+telomeres.">G-overhang dynamics at Tetrahymena telomeres.</a> Embo J. 20, 4299-4308 (2001).</li><li>Barry, J. D., McCulloch, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antigenic+variation+in+trypanosomes:+enhanced+phenotypic+variation+in+a+eukaryotic+parasite.">Antigenic variation in trypanosomes: enhanced phenotypic variation in a eukaryotic parasite.</a> Adv Parasitol. 49, 1-70 (2001).</li><li>Yang, X., Figueiredo, L. M., Espinal, A., Okubo, E., Li, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RAP1+is+essential+for+silencing+telomeric+variant+surface+glycoprotein+genes+in+Trypanosoma+brucei.">RAP1 is essential for silencing telomeric variant surface glycoprotein genes in Trypanosoma brucei.</a> Cell. 137, 99-109 (2009).</li></ol>

Trypanosoma brucei causa a doença do sono em humanos. Esta doença, se não tratada, é inevitavelmente fatal. T. células brucei em hospedeiros mamíferos sofrer variação antigênica regularmente, de modo a evitar o ataque imune do hospedeiro 7. Por isso, é muito difícil eliminar a T. células brucei uma vez que uma infecção é estabelecida. Recentemente, demonstrou que os telômeros desempenhar um papel importante na regulação da expressão de T. bru...

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		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
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		<tbody>
		
<tr>
<td>SeaKem LE Agarose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Lonza</td>
<td>50004</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Agarose Type VII (low melting agarose)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>A4018</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Proteinase K, recombinant, PCR grade</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostic</td>
<td>03 115801001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Exo I</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0293</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Exo T</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0265</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>T7 exonuclease</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0263</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>T4 DNA polymerase</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0203</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>QIAquick nucleotide removal kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Qiagen</td>
<td>28304</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

examination of the telomere g-overhang structure in trypanosoma brucei

O telômero estrutura G-saliência tem sido identificada em eucariotos, incluindo muitos fungos, vertebrados, e Trypanosoma brucei. Serve como substrato para telomerase para a síntese de DNA de novo do telômero e, portanto, importante para a manutenção dos telômeros. T. brucei é um parasita protozoário que causa a doença do sono em humanos e nagana em bovinos. Uma vez infectado hospedeiro mamífero, T. célula brucei regularmente alterna a sua antígeno de superfície para escapar ataque do sistema imunológico do hospedeiro. Temos recentemente demonstraram que o T. brucei estrutura dos telômeros desempenha um papel essencial na regulação da expressão gênica do antígeno de superfície, que é crítico para T. patogênese brucei. No entanto, T. brucei estrutura dos telômeros não tem sido extensivamente estudada devido à limitação de métodos de análise dessa estrutura especializada. Temos agora adotada com sucesso o nativo em gel hibridação e mediada por ligadura métodos cartilha de extensão para exame da estrutura G-saliência dos telômeros e um método de ligadura adaptador para determinação do terminal de nucleotídeos dos telômeros em T. células brucei. Aqui, vamos descrever os protocolos em detalhe e comparar suas vantagens e limitações.

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Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Os telômeros são essenciais para a estabilidade cromossômica ea estrutura G-saliência dos telômeros é essencial para a telomerase mediada manutenção dos telômeros. Recentemente, aprovou dois métodos para detectar a estrutura G-saliência dos telômeros em<em&gt; Trypanosoma brucei</em&gt;, Que são nativas em gel-hibridação e ligadura mediada por extensão de primer, que serão descritas.

Exame da estrutura G-Telomere saliência na Trypanosoma brucei</em

The telomere G-overhang structure has been identified in many eukaryotes including yeast, vertebrates, and Trypanosoma brucei. It serves as the substrate ...

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Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

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Microondas Assistida Diagnóstico Rápido de Doenças vírus de planta por Microscopia Eletrônica de Transmissão

Investigations of ultrastructural changes induced by viruses are often necessary to clearly identify viral diseases in plants. With conventional sample ...

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Multi-target Parallel Processing Approach for Gene-to-structure Determination of the Influenza Polymerase PB2 Subunit

Abordagem de processamento paralelo multi-alvo para Gene-a-estrutura Determinação da polimerase da gripe PB2 Subunidade

Pandemic outbreaks of highly virulent influenza strains can cause widespread morbidity and mortality in human populations worldwide. In the United States ...

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Exame de seleção positiva e negativa Tímico por citometria de fluxo

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Microglia are the resident macrophage-like cells of the central nervous system (CNS) and, as such, have critically important roles in physiological and ...

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Immune cell networks in tissues play a vital role in mediating local immunity and maintaining tissue homeostasis, yet little is known of the resident ...

High-throughput Gene Tagging in Trypanosoma brucei

High-throughput Gene Tagging in Trypanosoma brucei

De alto rendimento Gene Tagging no<em&gt; Trypanosoma brucei</em

Improvements in mass spectrometry, sequencing and bioinformatics have generated large datasets of potentially interesting genes. Tagging these proteins ...

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

detecção de<em&gt; Trypanosoma brucei</em&gt; Switching Variant glicoproteína de superfície por Magnetic celular ativado Seleção e citometria de fluxo

Trypanosoma brucei, a protozoan parasite that causes both Human and Animal African Trypanosomiasis (known as sleeping sickness and nagana, respectively) ...

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Exame de fenótipos de acolhimento em<em&gt; Gambusia affinis</em&gt; Após o tratamento antibiótico

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host ...

Assessment of the Cytotoxic and Immunomodulatory Effects of Substances in Human Precision-cut Lung Slices

Avaliação do citotóxicos e efeitos imunomoduladores de substâncias no pulmão humano de precisão de corte fatias

Respiratory diseases in their broad diversity need appropriate model systems to understand the underlying mechanisms and enable development of new ...

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Exame quantitativos de susceptibilidade antibiótica de Neisseria gonorrhoeae agregados usando ATP-utilização comercial ensaios e coloração Live/mortos

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...