Name: examination of the telomere g-overhang structure in trypanosoma brucei
Uploaded: 2011-01-26T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei at JoVE.com

Мы хотели бы поблагодарить доктора Каролин Цена для научных дискуссий и проницательный предложения. Эта работа проводится при поддержке гранта NIH AI066095 (PI: Бибо Li).

1. Обнаружение T. brucei теломер G-навес с помощью собственных В-гель Гибридизация 3 Принцип (рис. 1): В родном состоянии, конец меченных (CCCTAA) 4 (TELC) олиго зонд может только гибридизуются с одноцепочечной теломер G-навес регионе. Гибридизации интенсивность пропорц...

<ol>
	<li>Munoz-Jordan, J. L., Cross, G. A., de Lange, T., Griffith, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=t-loops+at+trypanosome+telomeres.">t-loops at trypanosome telomeres.</a> EMBO J. 20, 579-588 (2001).</li><li>Li, B., Espinal, A., Cross, G. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trypanosome+telomeres+are+protected+by+a+homologue+of+mammalian+TRF2.">Trypanosome telomeres are protected by a homologue of mammalian TRF2.</a> Mol Cell Biol. 25, 5011-5021 (2005).</li><li>Wellinger, R. J., Wolf, A. J., Zakian, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Saccharomyces+telomeres+acquire+single-strand+TG1-3+tails+late+in+S+phase.">Saccharomyces telomeres acquire single-strand TG1-3 tails late in S phase.</a> Cell. 72, 51-60 (1993).</li><li>McElligott, R., Wellinger, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+terminal+DNA+structure+of+mammalian+chromosomes.">The terminal DNA structure of mammalian chromosomes.</a> EMBO J. 16, 3705-3714 (1997).</li><li>Harrington, L. A., Greider, C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Telomerase+primer+specificity+and+chromosome+healing.">Telomerase primer specificity and chromosome healing.</a> Nature. 353, 451-454 (1991).</li><li>Jacob, N. K., Skopp, R., Price, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=G-overhang+dynamics+at+Tetrahymena+telomeres.">G-overhang dynamics at Tetrahymena telomeres.</a> Embo J. 20, 4299-4308 (2001).</li><li>Barry, J. D., McCulloch, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antigenic+variation+in+trypanosomes:+enhanced+phenotypic+variation+in+a+eukaryotic+parasite.">Antigenic variation in trypanosomes: enhanced phenotypic variation in a eukaryotic parasite.</a> Adv Parasitol. 49, 1-70 (2001).</li><li>Yang, X., Figueiredo, L. M., Espinal, A., Okubo, E., Li, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RAP1+is+essential+for+silencing+telomeric+variant+surface+glycoprotein+genes+in+Trypanosoma+brucei.">RAP1 is essential for silencing telomeric variant surface glycoprotein genes in Trypanosoma brucei.</a> Cell. 137, 99-109 (2009).</li></ol>

Trypanosoma brucei причины сонной болезни у людей. Это заболевание, если его не лечить, неизбежно фатальным. Т. brucei клеток млекопитающих хостов пройти антигенные изменения регулярно, так как уклониться от иммунной атаки хозяина 7. Следовательно, очень трудно устранить Т. brucei ...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>SeaKem LE Agarose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Lonza</td>
<td>50004</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Agarose Type VII (low melting agarose)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>A4018</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Proteinase K, recombinant, PCR grade</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostic</td>
<td>03 115801001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Exo I</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0293</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Exo T</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0265</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>T7 exonuclease</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0263</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>T4 DNA polymerase</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0203</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>QIAquick nucleotide removal kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Qiagen</td>
<td>28304</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

examination of the telomere g-overhang structure in trypanosoma brucei

Теломер G-навес структуры были выявлены во многих эукариот, включая дрожжи, позвоночных и Trypanosoma brucei. Она служит в качестве субстрата для теломеразы для вновь синтеза ДНК теломер и, следовательно, важным для поддержания теломер. Т. brucei является простейшим паразитом, который вызывает сонную болезнь у людей и Нагана крупного рогатого скота. После заражения млекопитающего, Т. brucei клетка регулярно переключает свой ​​поверхностный антиген уклониться от иммунной атаки хозяев. Недавно мы показали, что Т. brucei теломер структура играет важную роль в регулировании поверхностного антигена экспрессии генов, которая имеет решающее значение для Т. brucei патогенез. Тем не менее Т. brucei теломер структура не изучена из-за ограничений методов анализа этой специализированной структуры. Мы уже успешно внедрен в родном-гель гибридизации и лигирования-опосредованной удлинения праймера методы изучения теломер G-навес структуры и метод перевязки адаптер для определения теломеров терминал нуклеотид в Т. brucei клеток. Здесь мы опишем протоколов в деталях и сравнить их преимущества и ограничения.

Watch this Scientific Journal Video about Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei at JoVE.com

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Теломеры имеют важное значение для стабильности и хромосом теломеры G-навес структура будет необходима для теломеразы-опосредованной обслуживание теломер. Мы недавно приняли два метода для обнаружения теломер G-навес структуры в<em&gt; Trypanosoma brucei</em&gt;, Которые являются родными в-гель гибридизации и лигирования-опосредованной удлинения праймера, который будет описан.

Рассмотрение теломер G-навес структуры в Trypanosoma brucei</em

The telomere G-overhang structure has been identified in many eukaryotes including yeast, vertebrates, and Trypanosoma brucei. It serves as the substrate ...

Research

Education

JoVE Journal

JoVE Core

Biology

Immunology and Infection

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Genetics

DNA Structure and Function

SCIENTISTS IN ACTION

Microwave Assisted Rapid Diagnosis of Plant Virus Diseases by Transmission Electron Microscopy

Микроволновая печь Assisted экспресс-диагностики болезней растений Вирус помощью просвечивающей электронной микроскопии

Investigations of ultrastructural changes induced by viruses are often necessary to clearly identify viral diseases in plants. With conventional sample ...

Multi-target Parallel Processing Approach for Gene-to-structure Determination of the Influenza Polymerase PB2 Subunit

Многоцелевой параллельный подход для обработки Гена на элемент структуры Определение гриппа с использованием полимеразной PB2 субъединицы

Pandemic outbreaks of highly virulent influenza strains can cause widespread morbidity and mortality in human populations worldwide. In the United States ...

Examination of Thymic Positive and Negative Selection by Flow Cytometry

Экспертиза тимуса позитивной и негативной селекции с помощью проточной цитометрии

A healthy immune system requires that T cells respond to foreign  antigens while remaining tolerant to self-antigens. Random rearrangement of the  T cell ...

Culturing Microglia from the Neonatal and Adult Central Nervous System

Культивирование Микроглии от новорожденных и взрослых центральной нервной системы

Microglia are the resident macrophage-like cells of the central nervous system (CNS) and, as such, have critically important roles in physiological and ...

Isolation, Characterization and Functional Examination of the Gingival Immune Cell Network

Выделение, характеристика и функциональное обследование сотовый сети десен иммунной

Immune cell networks in tissues play a vital role in mediating local immunity and maintaining tissue homeostasis, yet little is known of the resident ...

High-throughput Gene Tagging in Trypanosoma brucei

High-throughput Gene Tagging in Trypanosoma brucei

Высокая пропускная способность гена Tagging в<em&gt; Trypanosoma brucei</em

Improvements in mass spectrometry, sequencing and bioinformatics have generated large datasets of potentially interesting genes. Tagging these proteins ...

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

обнаружение<em&gt; Trypanosoma brucei</em&gt; Вариант поверхности гликопротеин Переключение с помощью магнитных Активированный сортировки клеток и проточной цитометрии

Trypanosoma brucei, a protozoan parasite that causes both Human and Animal African Trypanosomiasis (known as sleeping sickness and nagana, respectively) ...

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Исследование хост фенотипы в<em&gt; Gambusia аШшз</em&gt; После Лечение антибиотиками

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host ...

Assessment of the Cytotoxic and Immunomodulatory Effects of Substances in Human Precision-cut Lung Slices

Оценка цитотоксических и иммуномодулирующих эффектов веществ в легкое человека точности cut ломтики

Respiratory diseases in their broad diversity need appropriate model systems to understand the underlying mechanisms and enable development of new ...

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Количественные экспертизы по чувствительности к антибиотикам Neisseria gonorrhoeae агрегатов с помощью АТФ использования коммерческих анализов и Live/мертвые пятнать

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...