Name: examination of the telomere g-overhang structure in trypanosoma brucei
Uploaded: 2011-01-26T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei at JoVE.com

Biz bilimsel tartışmalar ve anlayışlı önerileri için Dr. Carolyn Fiyat teşekkür etmek istiyorum. Bu çalışma NIH hibe AI066095 (PI: Bibo Li) tarafından desteklenmektedir.

1. Algılama T. brucei Telomer Native kullanarak G-çıkıntı-jel Hibridizasyon 3 Prensibi (Şekil 1): yerli koşul altında, bir uç-etiketlenmiş (CCCTAA) 4 (TELC) oligo prob sadece tek iplikçikli telomer G-çıkıntı bölge melezleşme yapabilirsiniz. Hibridizasyon yoğunluğu çıkıntı uzunluğu ile doğru orantılıdır. Denatürasyon ve nötralizasyon sonra, aynı prob tüm telomer bölgesi melezleşme mümkün olacak. Hibridizasyon yoğunluğu toplam ...

<ol>
	<li>Munoz-Jordan, J. L., Cross, G. A., de Lange, T., Griffith, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=t-loops+at+trypanosome+telomeres.">t-loops at trypanosome telomeres.</a> EMBO J. 20, 579-588 (2001).</li><li>Li, B., Espinal, A., Cross, G. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trypanosome+telomeres+are+protected+by+a+homologue+of+mammalian+TRF2.">Trypanosome telomeres are protected by a homologue of mammalian TRF2.</a> Mol Cell Biol. 25, 5011-5021 (2005).</li><li>Wellinger, R. J., Wolf, A. J., Zakian, V. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Saccharomyces+telomeres+acquire+single-strand+TG1-3+tails+late+in+S+phase.">Saccharomyces telomeres acquire single-strand TG1-3 tails late in S phase.</a> Cell. 72, 51-60 (1993).</li><li>McElligott, R., Wellinger, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+terminal+DNA+structure+of+mammalian+chromosomes.">The terminal DNA structure of mammalian chromosomes.</a> EMBO J. 16, 3705-3714 (1997).</li><li>Harrington, L. A., Greider, C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Telomerase+primer+specificity+and+chromosome+healing.">Telomerase primer specificity and chromosome healing.</a> Nature. 353, 451-454 (1991).</li><li>Jacob, N. K., Skopp, R., Price, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=G-overhang+dynamics+at+Tetrahymena+telomeres.">G-overhang dynamics at Tetrahymena telomeres.</a> Embo J. 20, 4299-4308 (2001).</li><li>Barry, J. D., McCulloch, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antigenic+variation+in+trypanosomes:+enhanced+phenotypic+variation+in+a+eukaryotic+parasite.">Antigenic variation in trypanosomes: enhanced phenotypic variation in a eukaryotic parasite.</a> Adv Parasitol. 49, 1-70 (2001).</li><li>Yang, X., Figueiredo, L. M., Espinal, A., Okubo, E., Li, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RAP1+is+essential+for+silencing+telomeric+variant+surface+glycoprotein+genes+in+Trypanosoma+brucei.">RAP1 is essential for silencing telomeric variant surface glycoprotein genes in Trypanosoma brucei.</a> Cell. 137, 99-109 (2009).</li></ol>

Trypanosoma brucei insanlarda hastalık uyku neden olur. Bu hastalık, tedavi edilmediği takdirde, kaçınılmaz olarak ölümcül T. memeli ev sahipliği brucei hücrelerin düzenli konağın bağışıklık saldırı 7 kaçınmak için antijenik değişim yaşanmadığını. Bu nedenle T. ortadan kaldırmak için çok zordur. brucei bir enfeksiyon kez hücreleri kurulmuştur. Biz son zamanlarda telomer T. ifade düzenlenmesinde önemli bir rol oynadığ...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>SeaKem LE Agarose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Lonza</td>
<td>50004</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Agarose Type VII (low melting agarose)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>A4018</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Proteinase K, recombinant, PCR grade</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostic</td>
<td>03 115801001</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Exo I</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0293</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Exo T</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0265</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>T7 exonuclease</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0263</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>T4 DNA polymerase</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NEB</td>
<td>M0203</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>QIAquick nucleotide removal kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Qiagen</td>
<td>28304</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

examination of the telomere g-overhang structure in trypanosoma brucei

Maya, omurgalıların ve Trypanosoma brucei dahil olmak üzere pek çok ökaryotlarda telomer G-çıkıntı yapı tespit edilmiştir. Telomeraz için de novo telomer DNA sentezi için substrat olarak görür ve bu nedenle telomer bakımı için önemlidir. T. brucei sığır ve nagana insanlarda uyku hastalığa neden olan bir protozoa bir parazittir . Hastalığa yakalandıktan sonra konak memeli, T. brucei hücre yüzey antijeni konağın bağışıklık saldırı kaçınmak için düzenli geçer. Yakın zamanda göstermiştir ki T. brucei telomer yapısı T. için kritik yüzey antijeni gen ekspresyonu, düzenlenmesinde önemli bir rol oynar brucei patogenezinde. Ancak, T. brucei telomer yapısı bu özel yapının analizi için yöntemler sınırlaması nedeniyle yoğun çalışma yapılmamıştır. Şimdi başarıyla hibridizasyon ve telomer G-çıkıntı yapısının incelenmesi ve T. telomer terminal nükleotid belirlenmesi için bir adaptör ligasyonu yöntemi ligasyonu aracılı astar uzatma yöntemleri jel doğal kabul brucei hücreleri. Burada ayrıntılı olarak protokolleri anlatmak ve onların farklı avantajları ve sınırlamaları karşılaştırın.

Watch this Scientific Journal Video about Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei at JoVE.com

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Telomerler kromozom istikrar için çok önemlidir ve telomer G-çıkıntı yapısı, telomeraz aracılı telomer bakımı için önemlidir. Biz son zamanlarda telomer G-çıkıntı yapı tespit etmek için iki yöntem kabul<em&gt; Trypanosoma brucei</em&gt; Jel hibridizasyon ve açıklanacaktır ligasyonu aracılı astar uzantısı, yerli vardır.

Telomer G-çıkıntı Yapısı incelenmesi Trypanosoma brucei</em

The telomere G-overhang structure has been identified in many eukaryotes including yeast, vertebrates, and Trypanosoma brucei. It serves as the substrate ...

Research

Education

JoVE Journal

JoVE Core

Biology

Immunology and Infection

Examination of the Telomere G-overhang Structure in Trypanosoma brucei

Genetics

DNA Structure and Function

SCIENTISTS IN ACTION

Microwave Assisted Rapid Diagnosis of Plant Virus Diseases by Transmission Electron Microscopy

Mikrodalga Transmisyon Elektron Mikroskobu ile Bitki Virüs Hastalıkları Hızlı Tanı Destekli

Investigations of ultrastructural changes induced by viruses are often necessary to clearly identify viral diseases in plants. With conventional sample ...

Multi-target Parallel Processing Approach for Gene-to-structure Determination of the Influenza Polymerase PB2 Subunit

Grip Polimeraz Gen-to-yapı belirlenmesi PB2 alt birimi için çoklu hedef Paralel İşleme Yaklaşımı

Pandemic outbreaks of highly virulent influenza strains can cause widespread morbidity and mortality in human populations worldwide. In the United States ...

Examination of Thymic Positive and Negative Selection by Flow Cytometry

Akım Sitometri tarafından Timik Pozitif ve Negatif Seçim incelenmesi

A healthy immune system requires that T cells respond to foreign  antigens while remaining tolerant to self-antigens. Random rearrangement of the  T cell ...

Culturing Microglia from the Neonatal and Adult Central Nervous System

Yenidoğan ve Erişkin Merkezi sinir sisteminin Kültüre Mikroglia

Microglia are the resident macrophage-like cells of the central nervous system (CNS) and, as such, have critically important roles in physiological and ...

Isolation, Characterization and Functional Examination of the Gingival Immune Cell Network

İzolasyon, Karakterizasyonu ve Dişeti Bağışıklık Hücre Ağı Fonksiyonel Sınav

Immune cell networks in tissues play a vital role in mediating local immunity and maintaining tissue homeostasis, yet little is known of the resident ...

High-throughput Gene Tagging in Trypanosoma brucei

High-throughput Gene Tagging in Trypanosoma brucei

Yüksek verimli Gen Etiketleme içinde<em&gt; Trypanosoma brucei</em

Improvements in mass spectrometry, sequencing and bioinformatics have generated large datasets of potentially interesting genes. Tagging these proteins ...

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

Algılama<em&gt; Trypanosoma brucei</emManyetik Aktif Hücre Sorting ve Akış Sitometrisi ile&gt; Varyant Yüzey Glikoprotein Değiştirme

Trypanosoma brucei, a protozoan parasite that causes both Human and Animal African Trypanosomiasis (known as sleeping sickness and nagana, respectively) ...

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Examination of Host Phenotypes in Gambusia affinis Following Antibiotic Treatment

Ana fenotipleri incelenmesi halinde<em&gt; Gambusia affinis</em&gt; Takiben Antibiyotik Tedavisi

The commonality of antibiotic usage in medicine means that understanding the resulting consequences to the host is vital. Antibiotics often decrease host ...

Assessment of the Cytotoxic and Immunomodulatory Effects of Substances in Human Precision-cut Lung Slices

Sitotoksik değerlendirilmesi ve insan hassas kesim akciğer dilimleri maddelerin etkileri Immunomodulatory

Respiratory diseases in their broad diversity need appropriate model systems to understand the underlying mechanisms and enable development of new ...

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Quantitative Examination of Antibiotic Susceptibility of Neisseria gonorrhoeae Aggregates Using ATP-utilization Commercial Assays and Live/Dead Staining

Nicel muayene, antibiyotik duyarlılık Neisseria gonorrhoeae toplamları kullanarak ATP-kullanımı ticari deneyleri ve canlı/ölü boyama

The emergence of antibiotic resistant Neisseria gonorrhoeae (GC) is a worldwide health threat and highlights the need to identify individuals who fail ...