Name: analysis of gene expression in emerald ash borer (agrilus planipennis) using quantitative real time-pcr
Uploaded: 2010-05-04T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer Agrilus planipennis Using Quantitative Real Time-PCR at JoVE.com

نعترف مساعدة التي قدمتها لورديس Arrueta أنتقيرة الدلتا (قسم الحشرات ، جامعة ولاية أوهايو / OARDC ، وستر ، أوهايو) في الإعداد لهذه التجارب. نشكر الدكتور تريز بولندا (وزارة الزراعة ، وخدمات الغابات ، NRS) لارسال عينات من البنك المصري الامريكي اليرقات. مساعدة التي قدمها الدكتور لويس وكاناس ونورس M أكوستا مع تقديره هو الإعداد المجهر. تم توفير التمويل لهذا المشروع من أموال الدولة والحكومة الفيدرالية المخصصة للمركز ولاية أوهايو البحوث والتنمية الزراعية ، جامعة ولاية أوهايو.

ويصور بروتوكول الكامل مع الخطوات المختلفة في الرسم البياني في الشكل 1. الخطوات الفردية التي تشكل تشريح ، يتم استخراج الحمض النووي الريبي تفصيلا ، أولا توليف ستراند [كدنا] وqRT PCR - أدناه. أولا اليرقات تشريح <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><l...

<ol>
	<li>Lehane, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Peritrophic+matrix+structure+and+function.">Peritrophic matrix structure and function.</a> Annu Rev Entomol. 42, 525-550 (1997).</li><li>Mittapalli, O., Sardesai, N., Shukle, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=cDNA+cloning+and+transcriptional+expression+of+a+peritrophin-like+gene+in+the+Hessian+fly,+Mayetiola+destructor+[Say].">cDNA cloning and transcriptional expression of a peritrophin-like gene in the Hessian fly, Mayetiola destructor [Say].</a> Arc of Insect Bio. 64, 19-29 (2007).</li><li>Pauchet, Y., Wilkinson, P., van Munster, M., Augustin, S., Pauron, D., ffrench-Constant, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pyrosequencing+of+the+midgut+transcriptome+of+the+poplar+leaf+beetle+Chrysomela+tremulae+reveals+new+gene+families+in+Coleoptera.+Ins+Bio+and+Mol.">Pyrosequencing of the midgut transcriptome of the poplar leaf beetle Chrysomela tremulae reveals new gene families in Coleoptera. Ins Bio and Mol.</a> 39, 403-413 (2009).</li><li>Pfaffl, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+mathematical+model+for+relative+quantification+in+real-time+RT-PCR.">A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR.</a> Nucleic Acids Res. 29, 2002-2007 (2001).</li><li>Tellam, R. L., Lehane, M. J., Billingsley, P. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biology of the Insect Midgut. , 86-114 (1996).</li></ol>

دورات العتبة (CT) يتم الحصول على قيمة لكل عينة في لوحة qRT - PCR. لجعل منحنى القياسية ، ورسم الحصول على قيمة ط م لكل تمييع ضد السجل من تركيزه. ثم تم التخطيط القيم ط م للالعينات التجريبية على تخفيف هذا المعيار منحنى السلسلة. وحسبت كميات الهدف من إنشاء منحنيات معيار منفصلة لكل ...

analysis of gene expression in emerald ash borer (agrilus planipennis) using quantitative real time-pcr

الزمرد الرماد حفار (MNG ،<em&gt; Agrilus planipennis</em&gt;) هو الآفات الغريبة الغازية ، والتي أودت بحياة الملايين من أشجار الدردار (<em&gt; Fraxinus</em&gt; SPP) في أمريكا الشمالية.<strong&gt;</strong&gt; البنك المصري الامريكي يواصل انتشاره السريع والهجمات الرماد الأشجار من مختلف الأعمار ، من الشتلات لأشجار ناضجة. ومع ذلك ، حتى الآن سوى القليل جدا أو لا وجود لمعرفة الجزيئية البنك المصري الامريكي. ونحن مهتمون في فك رموز العمليات الفسيولوجية الجزيئية المستندة على الصعيد المصري الامريكي الأنسجة التي تساعد في نجاح الاستعمار من أشجار الدردار. في هذا التقرير نعرض الاستخدام الفعال للPCR الوقت الحقيقي الكمية (qRT - PCR) إلى مستويات مرنا التأكد من اليرقات في أنسجة مختلفة (بما في ذلك الهيئات المعي المتوسط ​​الدهون ، وإهاب) ومراحل النمو المختلفة (بما في ذلك 1<sup&gt; ش</sup&gt; -- ، 2<sup&gt; الثانية</sup&gt; -- ، 3<sup&gt; الثالثة</sup&gt; -- ، 4<sup&gt; عشر</sup&gt; - instars ، prepupae والكبار) من البنك المصري الامريكي. كمثال ، وهو الجين peritrophin (يسمى هنا ،<em&gt; AP - PERI1</emويتمثل&gt;) وهذا الجين من الفائدة والبروتين الريباسي (<em&gt; AP - RP1</em&gt;) مثل الرقابة الداخلية. Peritrophins تشكل عناصر مهمة في الغشاء المحيط بالغاذية / مصفوفة (بعد الظهر) ، والذي هو بطانة القناة الهضمية للحشرات. رئيس الوزراء وظائف متنوعة بما في ذلك عملية الهضم والحماية الميكانيكية لظهارة المعى المتوسط.

Watch this Scientific Journal Video about Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer Agrilus planipennis Using Quantitative Real Time-PCR at JoVE.com

Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer Agrilus planipennis Using Quantitative Real Time-PCR

الكمية في الوقت الحقيقي PCR (qRT - PCR) هو أداة فعالة لتشخيص مستويات مرنا في أنسجة الحشرات المختلفة والمراحل التنموية. في هذا التقرير نعرض لاستخدام qRT - PCR إلى مستويات مرنا التأكد اليرقات في الأنسجة المختلفة ، ومراحل تطور من أنواع الحشرات الغازية ، والزمرد الرماد حفار.

تحليل التعبير الجيني في الحفار الرماد الزمرد ( Agrilus planipennis) عن طريق ريال الكمية من الزمن - PCR

Emerald ash borer (EAB, Agrilus planipennis) is an exotic invasive pest, which has killed millions of ash trees (Fraxinus spp) in North America. EAB ...

Research

JoVE Journal

Biology

Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer (Agrilus planipennis) Using Quantitative Real Time-PCR

Bacterial Gene Expression Analysis Using Microarrays

التحليل الجرثومي التعبير الجيني عن طريق ميكروأرس]

The Preparation of Primary Hematopoietic Cell Cultures From Murine Bone Marrow for Electroporation

التحضير لزراعة الخلايا المكونة للدم الابتدائية من نخاع عظام الفئران لElectroporation

It is becoming increasingly apparent that electroporation is the most effective way to introduce plasmid DNA or siRNA into primary cells. The Gene Pulser ...

Global Gene Expression Analysis Using a Zebrafish Oligonucleotide Microarray Platform

تحليل التعبير الجيني العالمي باستخدام ميكروأري قليل النوكليوتيد منهاج اسماك الزرد

Gene microarray technology permits quantitative measurement and gene expression profiling of transcript levels on a genome-wide basis. Gene microarray ...

Using the Gene Pulser MXcell Electroporation System to Transfect Primary Cells with High Efficiency

باستخدام الجينات Electroporation MXcell بولسير النظام لTransfect الخلايا الأولية ذات الكفاءة العالية

Quantitative Real-Time PCR using the Thermo Scientific Solaris qPCR Assay

الكمية في الوقت الحقيقي باستخدام PCR العلمية الحرارية سولاريس qPCR الفحص

The Solaris qPCR Gene Expression Assay is a novel type of primer/probe set, designed to simplify the qPCR process while maintaining the sensitivity and ...

Using an Automated Cell Counter to Simplify Gene Expression Studies: siRNA Knockdown of IL-4 Dependent Gene Expression in Namalwa Cells

باستخدام خلية مكافحة الآلي لتبسيط دراسات التعبير الجيني : ضربة قاضية سيرنا من IL - 4 التعبير الجيني في الخلايا التابعة Namalwa

The use of siRNA mediated gene knockdown is continuing to be an important tool in studies of gene expression.  siRNA studies are being conducted not only ...

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR (qPCR) Arrays

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR qPCR Arrays

من التنميط المسبق الجزئي الرناوات و microRNAs باستخدام الكمية في الوقت الحقيقي PCR (qPCR) صالحة

Quantitative real-time PCR (QPCR) has emerged as an accurate and valuable tool in profiling gene expression levels.  One of its many advantages is a lower ...

Determining Genetic Expression Profiles in C. elegans Using Microarray and Real-time PCR

Determining Genetic Expression Profiles in C. elegans Using Microarray and Real-time PCR

تحديد ملامح التعبير الجيني في C. ايليجانس استخدام ميكروأري وPCR الوقت الحقيقي

Synapses are composed of a presynaptic active zone in the signaling cell and a postsynaptic terminal in the target cell. In the case of chemical synapses, ...

In vitro Reconstitution of the Active T. castaneum Telomerase

In vitro Reconstitution of the Active T. castaneum Telomerase

إعادة إعماره في المختبر من أحدث T. castaneum تيلوميراز

Efforts to isolate the catalytic subunit of telomerase, TERT, in sufficient quantities for structural studies, have been met with limited success for more ...

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

التصور والتحليل من جزيئات الرنا المرسال عن طريق الإسفار<em&gt; في الموضع</em&gt; التهجين في<em&gt; خميرة الخباز</em

The Fluorescence in situ Hybridization (FISH) method allows one to detect nucleic acids in the native cellular environment. Here we provide a protocol for ...