Name: analysis of gene expression in emerald ash borer (agrilus planipennis) using quantitative real time-pcr
Uploaded: 2010-05-04T17:00:00
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हम प्रयोगों के सेटअप में लूर्डेस डेल्टा Arrueta Antequera (कीट विज्ञान विभाग, ओहियो स्टेट यूनिवर्सिटी / OARDC, Wooster, OH) द्वारा प्रदान की मदद को स्वीकार करते हैं. हम डा. Therese पोलैंड (USDA वन सेवा, एनआरएस) EAB लार्वा के नमूने भेजने के लिए धन्यवाद. डॉ. लुइस एक Canas और Nuris एम Acosta द्वारा प्रदान की खुर्दबीन सेटअप के साथ सराहना की है मदद. इस परियोजना के लिए अनुदान राज्य और संघीय ओहियो कृषि अनुसंधान और विकास केंद्र, ओहियो स्टेट यूनिवर्सिटी के लिए विनियोजित धन द्वारा प्रदान की गई थी.

विभिन्न चरणों के साथ पूरा प्रोटोकॉल चित्र 1 में प्रवाह चार्ट में दिखाया गया है. व्यक्तिगत कदम गठन विच्छेदन, शाही सेना निकासी, पहले Strand सीडीएनए संश्लेषण और QRT-पीसीआर नीचे विस्तृत रहे हैं. I. लारवल ...

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	<li>Lehane, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Peritrophic+matrix+structure+and+function.">Peritrophic matrix structure and function.</a> Annu Rev Entomol. 42, 525-550 (1997).</li><li>Mittapalli, O., Sardesai, N., Shukle, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=cDNA+cloning+and+transcriptional+expression+of+a+peritrophin-like+gene+in+the+Hessian+fly,+Mayetiola+destructor+[Say].">cDNA cloning and transcriptional expression of a peritrophin-like gene in the Hessian fly, Mayetiola destructor [Say].</a> Arc of Insect Bio. 64, 19-29 (2007).</li><li>Pauchet, Y., Wilkinson, P., van Munster, M., Augustin, S., Pauron, D., ffrench-Constant, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pyrosequencing+of+the+midgut+transcriptome+of+the+poplar+leaf+beetle+Chrysomela+tremulae+reveals+new+gene+families+in+Coleoptera.+Ins+Bio+and+Mol.">Pyrosequencing of the midgut transcriptome of the poplar leaf beetle Chrysomela tremulae reveals new gene families in Coleoptera. Ins Bio and Mol.</a> 39, 403-413 (2009).</li><li>Pfaffl, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+mathematical+model+for+relative+quantification+in+real-time+RT-PCR.">A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR.</a> Nucleic Acids Res. 29, 2002-2007 (2001).</li><li>Tellam, R. L., Lehane, M. J., Billingsley, P. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Biology of the Insect Midgut. , 86-114 (1996).</li></ol>

दहलीज चक्र (सीटी) मूल्य QRT-पीसीआर थाली में प्रत्येक नमूना के लिए प्राप्त की है. मानक वक्र बनाने के लिए, सीटी प्रत्येक कमजोर पड़ने के लिए प्राप्त मान अपनी एकाग्रता के प्रवेश के खिलाफ प्लॉट था. प्रयोगात्मक ...

analysis of gene expression in emerald ash borer (agrilus planipennis) using quantitative real time-pcr

पन्ना राख छिद्रक (EAB,<em&gt; Agrilus planipennis</em&gt;) एक विदेशी आक्रामक कीट है, जो राख पेड़ों की लाखों को मार डाला है (<em&gt; Fraxinus</em&gt; एसपीपी) उत्तर अमेरिका में.<strong&gt;</strong&gt; EAB तेजी से फैल रहा है और हमलों अलग अलग उम्र के पेड़ पौधे से परिपक्व पेड़ों को राख. हालांकि, तिथि करने के लिए बहुत कम या कोई आणविक ज्ञान EAB के लिए मौजूद है. हम ऊतक के स्तर पर आणविक आधारित शारीरिक प्रक्रियाओं के गूढ़ रहस्य में रुचि रखते हैं कि राख पेड़ों की सफल उपनिवेशण में सहायता EAB. इस रिपोर्ट में हम अलग लार्वा (midgut, वसा शरीर और छल्ली सहित) ऊतकों और विभिन्न विकासात्मक चरणों (1 सहित में पता लगाने mRNA स्तर के लिए मात्रात्मक वास्तविक समय पीसीआर (QRT पीसीआर) के प्रभावी उपयोग के शो<sup&gt; सेंट</sup-&gt; 2,<sup&gt; एन डी</sup&gt; - 3<sup&gt; तीसरी</sup-&gt; -4,<sup&gt; वें</sup&gt; Instars prepupae, और EAB के वयस्कों). एक उदाहरण के रूप में, एक peritrophin (जीन के साथ साथ नाम,<em&gt; एपी के PERI1</em&gt;) ब्याज की जीन और एक ribosomal प्रोटीन के रूप में उदाहरण है (<em&gt; एपी के RP1</em&gt; आंतरिक नियंत्रण के रूप में). Peritrophins peritrophic झिल्ली / मैट्रिक्स (प्रधानमंत्री) है, जो कीट पेट के अस्तर के महत्वपूर्ण घटक हैं. PM पाचन और midgut उपकला के लिए यांत्रिक संरक्षण सहित विभिन्न कार्यों है.

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Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer Agrilus planipennis Using Quantitative Real Time-PCR

मात्रात्मक वास्तविक समय पीसीआर (QRT-पीसीआर) विभिन्न कीट ऊतकों और विकास के चरणों में mRNA स्तर निदान के लिए एक प्रभावी उपकरण है. इस रिपोर्ट में हम पता लगाने mRNA स्तर के विभिन्न ऊतकों में लार्वा और आक्रामक कीट प्रजातियों, पन्ना राख बोरर के विकास के चरणों के लिए QRT-पीसीआर के उपयोग दिखाओ.

जीन एक्सप्रेशन का पन्ना ऐश छिद्रक में विश्लेषण ( Agrilus planipennis</emपीसीआर ->) का प्रयोग मात्रात्मक रीयल टाइम

Emerald ash borer (EAB, Agrilus planipennis) is an exotic invasive pest, which has killed millions of ash trees (Fraxinus spp) in North America. EAB ...

Research

JoVE Journal

Biology

Analysis of Gene Expression in Emerald Ash Borer (Agrilus planipennis) Using Quantitative Real Time-PCR

Bacterial Gene Expression Analysis Using Microarrays

बैक्टीरियल जीन एक्सप्रेशन प्रोटीन का उपयोग विश्लेषण

The Preparation of Primary Hematopoietic Cell Cultures From Murine Bone Marrow for Electroporation

प्राथमिक electroporation के लिए murine अस्थि मज्जा से hematopoietic सेल संस्कृतियों की तैयारी

It is becoming increasingly apparent that electroporation is the most effective way to introduce plasmid DNA or siRNA into primary cells. The Gene Pulser ...

Global Gene Expression Analysis Using a Zebrafish Oligonucleotide Microarray Platform

वैश्विक जीन एक्सप्रेशन विश्लेषण एक Zebrafish Oligonucleotide माइक्रोएरे प्लेटफार्म का उपयोग करना

Gene microarray technology permits quantitative measurement and gene expression profiling of transcript levels on a genome-wide basis. Gene microarray ...

Using the Gene Pulser MXcell Electroporation System to Transfect Primary Cells with High Efficiency

जीन Pulser MXcell electroporation प्रणाली का उपयोग करने के लिए उच्च क्षमता के साथ प्राथमिक कोशिकाओं transfect

Quantitative Real-Time PCR using the Thermo Scientific Solaris qPCR Assay

मात्रात्मक वास्तविक समय पीसीआर का उपयोग कर थर्मो वैज्ञानिक Solaris qPCR परख

The Solaris qPCR Gene Expression Assay is a novel type of primer/probe set, designed to simplify the qPCR process while maintaining the sensitivity and ...

Using an Automated Cell Counter to Simplify Gene Expression Studies: siRNA Knockdown of IL-4 Dependent Gene Expression in Namalwa Cells

एक स्वचालित सेल काउंटर का उपयोग करने के लिए जीन एक्सप्रेशन अध्ययन सरल: आईएल-4 निर्भर जीन एक्सप्रेशन के Namalwa कक्ष में siRNA नॉकडाउन

The use of siRNA mediated gene knockdown is continuing to be an important tool in studies of gene expression.  siRNA studies are being conducted not only ...

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR (qPCR) Arrays

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR qPCR Arrays

प्री - सूक्ष्म RNAs और मात्रात्मक वास्तविक समय पीसीआर Arrays (qPCR) का उपयोग microRNAs की रूपरेखा

Quantitative real-time PCR (QPCR) has emerged as an accurate and valuable tool in profiling gene expression levels.  One of its many advantages is a lower ...

Determining Genetic Expression Profiles in C. elegans Using Microarray and Real-time PCR

Determining Genetic Expression Profiles in C. elegans Using Microarray and Real-time PCR

में आनुवंशिक अभिव्यक्ति प्रोफाइल निर्धारण सी. एलिगेंस माइक्रोएरे और वास्तविक समय पीसीआर का उपयोग

Synapses are composed of a presynaptic active zone in the signaling cell and a postsynaptic terminal in the target cell. In the case of chemical synapses, ...

In vitro Reconstitution of the Active T. castaneum Telomerase

In vitro Reconstitution of the Active T. castaneum Telomerase

सक्रिय टी. के पुनर्गठन इन विट्रो में castaneum टेलोमिरेज

Efforts to isolate the catalytic subunit of telomerase, TERT, in sufficient quantities for structural studies, have been met with limited success for more ...

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

प्रतिदीप्ति का प्रयोग mRNA अणुओं के दृश्य और विश्लेषण<em&gt; स्वस्थानी</emमें&gt; संकरण<em&gt; Saccharomyces cerevisiae</em

The Fluorescence in situ Hybridization (FISH) method allows one to detect nucleic acids in the native cellular environment. Here we provide a protocol for ...

जीन एक्सप्रेशन का पन्ना ऐश छिद्रक में विश्लेषण ( Agrilus planipennis) का प्रयोग मात्रात्मक रीयल टाइम