Efter etablering af stromalendotelcellesamkulturen erhverves GFP-signalet fra GFP huvec ved hjælp af fluorescensmikroskopi med indstillinger, der er egnede til kvantificering. Forbehandle alle de billeder, der er erhvervet samme dag for yderligere at forbedre kontrasten. Hvis du bruger fiji eller billede J, skal du åbne alle de forbedrede GFP-kanalbilleder på samme tidspunkt og åbne lysstyrke- og kontrastmenuen.
Vælg et billede, der repræsenterer en mellemliggende tilstand, og juster kontrasten automatisk ved at vælge auto. Klik på indstil, og kontroller forplantning til alle andre åbne billeder. Vurder visuelt, om det automatisk valgte område passer til alle billederne af det aktuelle tidspunkt.
Hvis det er nødvendigt, skal du manuelt justere og overføre området til alle billederne og gemme de justerede billeder som TIFF-filer. Anvend derefter et mediansløringsfilter på alle billederne. Reducer størrelsen ved at binning, og gem dem som gråskala RGB-farve TIFF-filer i en mappe til kvantificering.
Dette kan gøres manuelt eller i batch-tilstand ved hjælp af makroer. Analyser alle de oprettede billeder ved hjælp af batchprocestilstanden i angiogeneseanalysatoren til billede J.Derefter valideres kvantificeringsresultaterne ved at undersøge overlejringerne af de anerkendte strukturer og de originale billeder. Juster forbehandlingsparametre, genanalyser originale billeder, eller ekskluder problematiske områder, hvis algoritmen registrerer kunstige strukturer med få eller ingen celler synlige i det originale billede.
Endelig normaliseres de opnåede værdier til et areal på en kvadratmillimeter ved at multiplicere værdierne for hver prøve med forholdet mellem det analyserede område og en kvadratmillimeter. Kvantificerede parametre for GFP huvec-netværkene viste, at den samlede netværkslængde var højest ved tilstedeværelse af FGF-2 og lavest i fravær af vækstfaktorer. Antallet af knudepunkter, der angiver forgreningspunkter i nettene, fulgte samme tendens som den samlede længde.
Omvendt havde begge vækstfaktorer betydeligt færre isolerede segmenter, hvilket indikerer højere sammenkobling end tilstanden uden vækstfaktor.