Segmentation of the Choroid Plexus Using Manual Delineations

まず、ツールバーの左上隅にあるDCMボタンをクリックし、DICOMファイルのインポートボタンをクリックして、医療またはDICOMデータのデジタルイメージングと通信をインポートします。画像の明るさを調整するには、[ウィンドウと音量レベルの調整]をクリックするか、画像を左クリックしてマウスを上下にドラッグします。次に、画像スライスを左クリックし、マウスを左または右に動かしてコントラストを調整します。

深部灰白質核またはコントラストスケールバーの信号強度を参照し、セグメンテーション全体で一貫していることを確認して、脈絡叢に適したコントラストを選択します。外側第3および第4脳室脈絡叢のセグメンテーションを開始するには、モジュールのドロップダウンメニューからセグメントエディターを選択します。次に、セグメンテーションのドロップダウンメニューをクリックして、別のセグメンテーションを選択し、選択したセグメンテーションの名前を変更します。

マスターボリュームのドロップダウンを使用して、編集が必要なNIfTIまたはDICOMセットを選択します。追加ボタンを 2 回クリックして、側脳室脈絡叢の 2 つのセグメントを含めます。タイトルをダブルクリックし、名前を右側心室脈絡叢と左側心室脈絡叢に変更します。

追加ボタンをもう一度クリックして、第3脳室と第4脳室の脈絡叢のセグメントを導入します。その後、それぞれ第3脳室脈絡叢と第4脳室脈絡叢と名前を変更します。軸面の側心室脈絡叢から始めて、双交連線に基づいて画像を配置するようにします。

側脳室脈絡叢を見つけるための基準点として三角側副を使用してください。手動セグメンテーションを開始するには、セグメントエディターのエフェクトセクションにあるペイントツールまたは描画ツールを選択します。ペイントツールの使用中に、ペイントするブラシの直径を選択します。

赤核レベルを使用して、側脳室の脈絡叢のセグメント化をいつ停止するかを決定します。第3脳室脈絡叢の位置を特定するには、矢状面から始めて、モンローの孔、円蓋、脳梁、視床、および内大脳静脈をランドマークとして使用します。同様に、第4脳室脈絡叢の場合、矢状面から始めて、上小脳脚、橋、および髄質を基準点として使用して、第4脳室の脈絡叢を特定します。

モジュールのドロップダウンメニューから「定量化」に移動し、「セグメント統計」を選択します。次に、入力セクションで、セグメンテーションツールで定量化のために新しく作成したセグメンテーションマップを選択し、スケーラーボリュームからMRIボリュームを選択します。出力テーブルの場合は、[出力]で[テーブル]オプションを選択し、[適用]をクリックします。

脈絡叢の体積を異なる単位で表示する表が表示されます。ツールバーの左上にある保存ボタンをクリックして、生成されたファイルを保存します。セグメンテーション ファイルを nrrd, nii の形式で保存します。

GZ、または TSV.