शुरू करने के लिए, डीएनए के एक इलाज एएवी नमूना और dd_PCR मास्टर मिश्रण तैयार करें। पीसीआर आठ ट्यूब पट्टी के प्रत्येक ट्यूब में dd_PCR मास्टर मिश्रण के 19.8 माइक्रोलीटर पतला नमूने के 2.2 माइक्रोलीटर जोड़ें और अच्छी तरह मिलाएं। एक छोटी बूंद पैदा कारतूस के मध्य नमूना पंक्ति में निहित कुओं में मिश्रण के 20 माइक्रोलीटर स्थानांतरण.
फिर छोटी बूंद पीढ़ी के तेल के 60 माइक्रोलीटर को छोटी बूंद पैदा करने वाले कारतूस की निचली तेल पंक्ति में निहित कुओं में स्थानांतरित करें। छोटी बूंद पैदा करने वाले कारतूस के ऊपर एक रबर गैसकेट रखें, और फिर इसे छोटी बूंद जनरेटर में रखें। बूंदों के उत्पन्न होने के बाद, धीरे-धीरे छोटी बूंद पीढ़ी के कारतूस से 42.5 माइक्रोलीटर समाधान को बहु-अच्छी तरह से पीसीआर प्लेट में स्थानांतरित करने के लिए आठ-चैनल विंदुक का उपयोग करें।
180 डिग्री सेल्सियस पर पांच सेकंड के लिए हीट सीलिंग मशीन का उपयोग करके एल्यूमीनियम पन्नी कवर के साथ पीसीआर प्लेट को सील करें। प्रवर्धन के लिए, प्लेट को 96-गहरी अच्छी तरह से प्रतिक्रिया मॉड्यूल के साथ थर्मल साइक्लर में रखें और इसे सुरक्षित रूप से बंद करें और पीसीआर प्रोग्राम चलाएं। एक बार हो जाने के बाद, प्लेट को एक छोटी बूंद रीडर में लोड करें, सिस्टम सॉफ़्टवेयर में आवश्यक जानकारी इनपुट करें, और रीडिंग शुरू करें।
सकारात्मक और नकारात्मक बूंदों के बीच एक स्पष्ट जुदाई 1 डी आयाम साजिश में मनाया गया था, एक सफल माप का सुझाव. दूसरे 1 डी आयाम प्लॉट ने सकारात्मक और नकारात्मक बादलों के बीच बिखरे हुए बूंदों के साथ छोटी बूंद बारिश दिखाई, जो माप सटीकता के साथ एक संभावित समस्या का संकेत देती है। एएवी रन से आउटपुट डेटा ने लगातार परिणाम दिखाए जब एक नमूने को दो अलग-अलग कमजोर पड़ने पर डुप्लिकेट में मापा गया था।