Başlamak için, DNA'nın işlenmiş bir AAV örneğini ve dd_PCR ana karışımını hazırlayın. PCR sekiz tüp şeridinin her bir tüpünde 2.2 mikrolitre seyreltilmiş numuneyi 19.8 mikrolitre dd_PCR ana karışımına ekleyin ve iyice karıştırın. Karışımın 20 mikrolitresini, damlacık üreten bir kartuşun orta numune sırasında bulunan kuyucuklara aktarın.
Daha sonra 60 mikrolitre damlacık üretim yağını, damlacık üreten kartuşun alt yağ sırasında bulunan kuyulara aktarın. Damlacık oluşturan kartuşun üzerine lastik bir conta yerleştirin ve ardından damlacık üretecine yerleştirin. Damlacıklar oluşturulduktan sonra, damlacık oluşturma kartuşundan 42,5 mikrolitre çözeltiyi çok kuyulu bir PCR plakasına yavaşça aktarmak için sekiz kanallı bir pipet kullanın.
PCR plakasını bir ısıyla yapıştırma makinesi kullanarak 180 santigrat derecede beş saniye boyunca bir alüminyum folyo kapakla kapatın. Amplifikasyon için, plakayı 96 derinliğinde kuyu reaksiyon modülüne sahip bir termal döngüleyiciye yerleştirin ve güvenli bir şekilde kapatın ve PCR programını çalıştırın. Bittiğinde, plakayı bir damlacık okuyucuya yükleyin, gerekli bilgileri sistem yazılımına girin ve okumaya başlayın.
1D genlik grafiğinde pozitif ve negatif damlacıklar arasında net bir ayrım gözlendi ve bu da başarılı bir ölçüm olduğunu düşündürdü. İkinci 1D genlik grafiği, pozitif ve negatif bulutlar arasına dağılmış damlacıklarla damlacık yağmuru gösterdi ve bu da ölçüm doğruluğu ile ilgili potansiyel bir sorunu gösterdi. Bir AAV çalışmasından elde edilen çıktı verileri, bir numune iki farklı seyreltmede iki kopya halinde ölçüldüğünde tutarlı sonuçlar gösterdi.
