Name: microdissection of zebrafish embryonic eye tissues
Uploaded: 2010-06-27T23:34:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Microdissection of Zebrafish Embryonic Eye Tissues at JoVE.com

Questo lavoro è sostenuto da un fondo di avvio del Dipartimento di Scienze Biologiche presso la Purdue University.

Parte 1: Preparativi prima di microdissezione <ol><li> Soluzioni <ol class="lalpha"><li> E3 media 4 (5 mM NaCl, 0,17 mM KCl, 0,33 mM CaCl 2 e 0,33 mM MgSO 4). </li><li> Soluzione di Ringer 1, 5 (116 mM NaCl, 2.9 mM KCl, 1,8 mM CaCl 2, 5 mM HEPES, pH7.2), filtro sterilizzato. </li><li> 5N NaOH. </li></ol></li><li> Attacco chimico di aghi di tungsteno <ol class="lalpha"><li> Fissare un piccolo becher contenente NaOH 5N su una piastra di Petri di argilla. </li><li> F...

<ol>
	<li>Leung, Y. F., Dowling, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+expression+profiling+of+zebrafish+embryonic+retina.">Gene expression profiling of zebrafish embryonic retina.</a> Zebrafish. 2, 269-283 (2005).</li><li>Leung, Y. F., Ma, P., Link, B. A., Dowling, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Factorial+microarray+analysis+of+zebrafish+retinal+development.">Factorial microarray analysis of zebrafish retinal development.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105, 12909-12914 (2008).</li><li>Leung, Y. F., Ma, P., Dowling, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Gene+expression+profiling+of+zebrafish+embryonic+retinal+pigment+epithelium+in+vivo.">Gene expression profiling of zebrafish embryonic retinal pigment epithelium in vivo.</a> Invest Ophthalmol Vis Sci. 48, 881-890 (2007).</li><li>Nusslein-Volhard, C., Dahm, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Zebrafish : a practical approach. , (2002).</li><li>Westerfield, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+zebrafish+book+:+a+guide+for+the+laboratory+use+of+zebrafish+(Danio+rerio).">The zebrafish book : a guide for the laboratory use of zebrafish (Danio rerio).</a> , (2000).</li><li>Kimmel, C. B., Ballard, W. W., Kimmel, S. R., Ullmann, B., Schilling, T. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stages+of+embryonic+development+of+the+zebrafish.">Stages of embryonic development of the zebrafish.</a> Dev Dyn. 203, 253-310 (1995).</li><li>Fadool, J. M., Dowling, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Zebrafish:+a+model+system+for+the+study+of+eye+genetics.">Zebrafish: a model system for the study of eye genetics.</a> Prog Retin Eye Res. 27, 89-110 (2008).</li></ol>

Microdissezione dei tessuti dell&#39;occhio zebrafish può effettivamente ottenere retine intatte e RPE-attached retine. Questo aiuta notevolmente studi di espressione relativi a un tessuto oculare specifico (retina o alla RPE). In effetti, abbiamo utilizzato con successo queste procedure per ottenere profili di espressione di RNA della retina tutto RPE 1 e 3. L&#39;utilità di questi profili è fortemente sostenuta dal nostro recente identificazione di percorsi e di famiglie di geni che sono pertu...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Cordless pestle motor</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>VWR</td>
<td>47747-370</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>DC power supply</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Lascar</td>
<td>PSU130</td>
<td>Any DC supply would work. The specific voltage of a different machine will need further optimization.</td>
</tr>
<tr>
<td>Disposable pestle &amp; microtube, 1.5 mL (DNase, RNase and pyrogen-free)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>VWR</td>
<td>47747-366</td>
<td>These are used for tissue collection in TRIzol for expression analysis.</td>
</tr>
<tr>
<td>Dumont #5 forceps, Tips: 0.05 x 0.01mm, Inox</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>World Precision Instruments</td>
<td>500341</td>
<td>Fine tip dimension is desirable but is not inflexible, as one may need to sharpen the tip from time to time.</td>
</tr>
<tr>
<td>Dumont #5SF forceps, Tips: 0.025 x 0.005mm, Inox</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fine Science Tools</td>
<td>11252-00</td>
<td>Fine tip dimension is desirable but is not inflexible, as one may need to sharpen the tip from time to time.</td>
</tr>
<tr>
<td>Falcon polystyrene culture plates, 60 X 15 mm</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>BD Biosciences</td>
<td>351007</td>
<td>These plates are used as dissection plates.</td>
</tr>
<tr>
<td>Olympus SZX16 Stereomicroscope</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Olympus</td>
<td>SZX16</td>
<td>Any stereomicroscope would work. We used Leica stereomicroscope in previous studies1-3 without any issues. We also use the 1X objective exclusively for the dissection even though we have a 2X objective installed. </td>
</tr>
<tr>
<td>Sharpening stone</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fine Science Tools</td>
<td>29008-01</td>
<td>Use this to sharpen the tip of the forceps if necessary</td>
</tr>
<tr>
<td>Thermo plate</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Tokai Hit</td>
<td>MATS-U55SZX2B</td>
<td>This is used to maintain the temperature of the tissue throughout dissection and minimize the influence of temperature fluctuation on gene expression. We also put the whole microscope in an environmentally controlled room at 28&deg;C during dissection in previous studies1-3 with good success.</td>
</tr>
<tr>
<td>Trizol, 100 mL</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>15596-026</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>tungsten wire, 0.015 inch diameter</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>World Precision Instruments</td>
<td>TGW1510</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Wooden Applicator</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Puritan</td>
<td>807</td>
<td>This is used for holding the chemically-etched tungsten needle.</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

microdissection of zebrafish embryonic eye tissues

Zebrafish è un modello animale popolare per la ricerca sullo sviluppo degli occhi a causa della sua rapida<em&gt; Ex utero</em&gt; Lo sviluppo e la fecondità bene. Entro 3 giorni dopo la fecondazione (DPF), le larve mostrerà la prima risposta visiva. Molti geni sono stati identificati per controllare un corretto sviluppo degli occhi, ma siamo lontani da una comprensione completa dell&#39;architettura di base genetica. Intero gene profiling genoma espressione è uno strumento utile per chiarire genetica rete normativo per lo sviluppo dell&#39;occhio. Tuttavia, le ridotte dimensioni dell&#39;occhio embrionale in zebrafish lo rende difficile da ottenere tessuti oculari integro e puro per analisi di espressione. Per esempio, la lunghezza antero-posteriore dell&#39;occhio tra il giorno 2 e 3 è di circa 200-300 micron, mentre il diametro della lente è circa 100 micron. Inoltre, l&#39;epitelio pigmentato retinico (RPE) sottostante la retina è solo un singolo strato epitelio. Mentre profili di espressione genica possono essere ottenute da un embrione intero, essi non rappresentano accuratamente l&#39;espressione di questi tessuti. Pertanto tessuto puro deve essere ottenuto per un profilo di espressione genica di successo dello sviluppo dell&#39;occhio. Per risolvere questo problema, abbiamo sviluppato un approccio alla microdissect retina intatta e retina con RPE attaccato da dpf 1-3, che coprono le fasi principali della morfogenesi dell&#39;occhio. Tutte le procedure possono essere fatte con una pinza sottile e materiale di laboratorio, in generale stereomicroscopi standard. Per la dissezione della retina, il monostrato RPE viene rimosso e staccata dalla spazzolatura azione e l&#39;adesione preferenziale dei resti RPE alla superficie della piastra di coltura per la dissezione. Per RPE-attached dissezione della retina, l&#39;adesione di RPE alla piastra dissezione viene rimosso prima che la dissezione in modo che la RPE può essere completamente conservato con la retina. Una attenta azione di sollevamento di questo tessuto può efficacemente separare la coroide presuntivo e nella sclera. L&#39;obiettivo può essere rimosso in entrambi i casi da un ago di tungsteno inciso chimicamente. In breve, il nostro approccio può ottenere tessuti oculari intatto ed è stato utilizzato con successo per lo studio dei tessuti specifici profili di espressione di retina zebrafish<sup&gt; 1, 2</sup&gt; E dell&#39;epitelio pigmentato retinico<sup&gt; 3</sup&gt;.

Watch this Scientific Journal Video about Microdissection of Zebrafish Embryonic Eye Tissues at JoVE.com

Microdissection of Zebrafish Embryonic Eye Tissues

Questo articolo descrive un approccio alla microdissect retine zebrafish con e senza epitelio pigmentato retinico collegato, da una a tre embrioni postfertilization giorni.

Microdissezione dei tessuti oculari Zebrafish embrionali

Zebrafish is a popular animal model for research on eye development because of its rapid ex utero development and good fecundity. By 3 days post ...

Research

JoVE Journal

Biology

Laser Capture Microdissection of Mammalian Tissue

Laser Microdissezione Cattura di tessuti di mammiferi

Laser capture microscopy, also known as laser microdissection (LMD), enables the user to isolate small numbers of cells or tissues from frozen or ...

Ricerca

Biologia

Live Imaging of the Zebrafish Embryonic Brain by Confocal Microscopy

Vivere Imaging of the Brain Zebrafish embrionali da microscopia confocale

In this video, we demonstrate the method our lab has developed to analyze the cell shape changes and rearrangements required to bend and fold the ...

Lens Transplantation in Zebrafish and its Application in the Analysis of Eye Mutants

Lens trapianto in Zebrafish e la sua applicazione nell&#39;analisi dei Mutanti Eye

The lens plays an important role in the development of the optic cup[1,2]. Using the zebrafish as a model organism, questions regarding lens development ...

Tissue Targeted Embryonic Chimeras: Zebrafish Gastrula Cell Transplantation

Tessuto Chimere mirate embrionali: Zebrafish gastrula trapianto di cellule

Certain fundamental questions in the field of developmental biology can only be answered when cells are placed in novel environments or when small groups ...

RNA Isolation from Embryonic Zebrafish and cDNA Synthesis for Gene Expression Analysis

Isolamento RNA da embrionali Sintesi Zebrafish e cDNA per l&#39;analisi di espressione genica

Many important and complex laboratory procedures require an input of high quality, intact RNA.  A degraded sample or the presence of impurities can lead ...

Microdissection of Black Widow Spider Silk-producing Glands

Microdissezione di Black Widow Spider Silk ghiandole che producono

Modern spiders spin high-performance silk fibers with a broad range of biological functions, including locomotion, prey capture and protection of ...

Immunostaining of Dissected Zebrafish Embryonic Heart

Immunocolorazione di Dissected Cuore Zebrafish embrionali

Zebrafish embryo becomes a popular in vivo vertebrate model for studying cardiac development and human heart diseases due to its advantageous embryology ...

A System for ex vivo Culturing of Embryonic Pancreas

A System for ex vivo Culturing of Embryonic Pancreas

Un sistema per<em&gt; Ex vivo</emColtura&gt; del pancreas embrionale

The pancreas controls vital functions of our body,  including the production of digestive enzymes and regulation of blood sugar  levels1. Although in the ...

Laser-inflicted Injury of Zebrafish Embryonic Skeletal Muscle

Laser-lesioni del muscolo scheletrico embrionale Zebrafish

Various experimental approaches have been used in mouse to induce muscle injury with the aim to study muscle regeneration, including myotoxin injections ...

Analysis of Embryonic and Larval Zebrafish Skeletal Myofibers from Dissociated Preparations

Analisi delle embrionali e larvali Zebrafish scheletriche miofibre da Preparazioni dissociata

The zebrafish has  proven to be a valuable model system for exploring skeletal muscle function and  for studying human muscle diseases. Despite  the many ...