Name: chemotactic response of marine micro-organisms to micro-scale nutrient layers
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Chemotactic Response of Marine Micro-Organisms to Micro-Scale Nutrient Layers at JoVE.com

نود أن نشكر مايكروسيستمز تكنولوجيا مختبرات في معهد ماساتشوستس للتكنولوجيا على السماح لنا الفيلم جزء من هذا الفيديو في غرفة نظيفة.

إعداد 1. إنشاء قناع <blockquote style=";text-align:right;direction:rtl"> باستخدام برامج CAD ، تصميم قناة للطباعة عالية الدقة على الشفافية. وسوف يكون هذا &quot;قناع&quot;. </blockquote> في غرفة نظيف...

<ol>
	<li>Azam, F., Malfatti, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+structuring+of+marine+ecosystems.">Microbial structuring of marine ecosystems.</a> Nature Reviews Microbiology. 5, 782-791 (2007).</li><li>Blackburn, N., Azam, F., Hagstrom, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatially+explicit+simulations+of+a+microbial+food+web.+.">Spatially explicit simulations of a microbial food web. .</a> Limnology and Oceanography. 42, 613-622 (1997).</li><li>Blackburn, N., Fenchel, T., Mitchell, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microscale+nutrient+patches+in+plankton+habitats+shown+by+chemotactic+bacteria.">Microscale nutrient patches in plankton habitats shown by chemotactic bacteria.</a> Science. 282, 2254-2256 (1998).</li><li>Keymer, J. E., Galajda, P., Muldoon, C., Park, S., Austin, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+metapopulations+in+nanofabricated+landscapes.">Bacterial metapopulations in nanofabricated landscapes.</a> Proceedings of the National Academy of Science. 103, 17290-17295 (2006).</li><li>Mao, H., Cremer, P. S., Manson, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+sensitive,+versatile+microfluidic+assay+for+bacterial+chemotaxis.">A sensitive, versatile microfluidic assay for bacterial chemotaxis.</a> Proceedings of the National Academy of Science. 100, 5449-5454 (2003).</li><li>Marcos, R., Stocker, <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microorganisms+in+vortices:+a+microfluidic+setup.">Microorganisms in vortices: a microfluidic setup.</a> Limnology and Oceanography: Methods. 4, 392-398 (2006).</li><li>Park, S., Wolanin, P. M., Yuzbahyan, E. A., Lin, H., Darnton, N. C., Stock, J. B., Silberzan, P., Austin, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+topology+on+bacterial+social+interaction.">Influence of topology on bacterial social interaction.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 100, 13910-13915 (2003).</li><li>Whitesides, G. M., Ostuni, E., Takayama, S., Jiang, X., Ingber, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Soft+lithography+in+biology+and+biochemistry.">Soft lithography in biology and biochemistry.</a> Annual Review of Biomedical Engineering. 3, 335-373 (2001).</li></ol>

فهم كيف تتفاعل مع الجراثيم البحرية الكيماوية المحلية والبيئة المادية أمر حتمي لتصور أكثر اكتمالا والدقيق للدور الكائنات الدقيقة في العوالق المغذيات المحيطات ودورات الكربون (عزام وMalfatti 2007). ومع ذلك ، ونظرا لجداول صغيرة (&lt;ملم) على كثير من التفاعلات التي تجري الميكروبية الهامة ،...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>PDMS, Sylgard 184</td>
<td>Silicone Elastomer Kit</td>
<td>Dow Corning, Midland, MI, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>http://www.ellsworth.com/sylgard.html</td>
</tr>
<tr>
<td>SU8-2100</td>
<td>Photoresist</td>
<td>MicroChem, Newton, MA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>www.microchem.com
</td>
</tr>
<tr>
<td>Nikon Eclipse TE2000-E inverted microscope</td>
<td>Microscope</td>
<td>Nikon, Japan</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>PEEK tubing (0.762 mm ID, 1.59 mm OD)</td>
<td>Tool</td>
<td>Upchurch Scientific, Oak Harbor, WA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>www.upchurch.com</td>
</tr>
<tr>
<td>Syringes (Luer-Lok Tip)</td>
<td>Tool</td>
<td>BD, Franklin Lakes, NJ, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Fitting Part P-704-01</td>
<td>Tool</td>
<td>Upchurch Scientific, Oak Harbor, WA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>To connect tubing to Luer-Lok Tip Syringes</td>
</tr>
<tr>
<td>Syringe Pump (PHD 2000 Programmable)</td>
<td>Equipment</td>
<td>Harvard Apparatus, Holliston, MA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>CCD Camera (PCO 1600)</td>
<td>Equipment</td>
<td>Cooke, Romulus, MI, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

chemotactic response of marine micro-organisms to micro-scale nutrient layers

والدرجة التي يمكن أن تستغل الميكروبات العوالق بقع الموارد الميكروسكيل لها آثار كبيرة للالديناميكية المحيطية والتمويه البيوجيوكيميائية. ومع ذلك ، للاستفادة من بقع المغذيات في المحيطات ، والميكروبات السباحة يجب التغلب على تأثيرات القوى المادية بما في ذلك نشر الجزيئية والقص المضطربة ، والتي سوف تحد من توافر بقع وقدرة البكتيريا على العثور عليهم. حتى وقت قريب ، قد حالت دون قيود المنهجية الفحوص الجرثومية المباشرة للسلوك داخل الموائل غير متجانسة وواقعية ظروف التدفق على نطاق صغير. وبالتالي ، فقد تم شراء الكثير من معرفتنا الحالية بشأن السلوك الميكروبي في المحيط من التنبؤات النظرية. للحصول على معلومات جديدة عن السلوك تستخدم علفا للميكروبات في المحيطات لدينا تطبيق تقنيات التصنيع لينة الطباعة الحجرية لتطوير أجهزة ميكروفلويديك 2 ، والتي استخدمناها لإنشاء (ط) الميكروسكيل بقع المغذيات ذات أبعاد وخصائص ناشر ذات الصلة لعمليات المحيطات والميكروسكيل (II) الدوامات ، مع معدلات مماثلة لتلك القص المتوقع في المحيط. وقد أتاحت هذه الأجهزة ميكروفلويديك الفحص الاول المباشر للسباحة الميكروبية والسلوك الكيميائي داخل المناظر البحرية غير المتجانسة والحيوية. الجمع بين استخدام والتخلص epifluorescence المجهري المقابل تسمح الامتحانات مباشرة للأبعاد المادية والخصائص ناشر من بقع المواد الغذائية ، مع مراعاة استجابة حصري على مستوى السكان ، بالإضافة إلى السلوك الفردي للسباحة الميكروبات. وقد كشفت هذه التجارب أن بعض أنواع العوالق النباتية والبكتيريا متغايرة والأولانيات ابتلاعي التغذي بارعون في تحديد مكان واستغلال الموارد الميكروسكيل بقع نشرها ضمن أطر زمنية قصيرة جدا. أظهرنا أيضا أن تصل إلى معدلات معتدلة القص ، والبكتيريا البحرية قادرة على مكافحة تدفق والسباحة من خلال بيئتهم في تلقاء نفسها. ومع ذلك ، ما وراء القص مستوى عتبة عالية ، تتماشى البكتيريا في تدفق القص وأقل قدرة على السباحة من دون إزعاج من التدفق. على microfluidics يمثل نهجا جديدا وغير مكلفة لدراسة البيئة المائية الميكروبية ، ونظرا لمدى ملاءمتها لخلق مجالات تدفق بدقة واقعية والتدرجات الركيزة في microscale ، ينطبق بشكل مثالي لامتحانات السلوك الميكروبية في موازين أصغر من التفاعل. ولذلك نقترح على microfluidics يمثل أداة قيمة للحصول على فهم أفضل لإيكولوجيا كائنات دقيقة في المحيط.

Watch this Scientific Journal Video about Chemotactic Response of Marine Micro-Organisms to Micro-Scale Nutrient Layers at JoVE.com

Chemotactic Response of Marine Micro-Organisms to Micro-Scale Nutrient Layers

موصوفة تلفيق قنوات ميكروفلويديك وتنفيذها في تجارب لدراسة السلوك الكيميائي تستخدم علفا للميكروبات البحرية داخل المغذيات الطبيعية البرية والبحرية وسلوك غير مكتمل للسباحة داخل البكتيريا تدفق القص.

الكيميائي استجابة الكائنات المجهرية البحرية الصغيرة الحجم لطبقات غذائية

The degree to which planktonic microbes can exploit microscale resource patches will have considerable implications for oceanic trophodynamics and ...

Research

JoVE Journal

Biology

Layers of Symbiosis - Visualizing the Termite Hindgut Microbial Community

طبقات من التكافل -- الرؤية والميكروبية المعى المؤخر الجماعة النمل الأبيض

Jared Leadbetter takes us for a nature walk through the diversity of life resident in the termite hindgut - a microenvironment containing 250 different ...

Micro-scale Engineering for Cell Biology

متناهي الصغر الهندسية لبيولوجيا الخلية

In vivo Imaging of Deep Cortical Layers using a Microprism

In vivo Imaging of Deep Cortical Layers using a Microprism

في التصوير المجراة من الطبقات العميقة القشرية باستخدام Microprism

We present a protocol for in vivo imaging of cortical tissue using a deep-brain imaging probe in the shape of a microprism.  Microprisms are 1-mm in size ...

Using the optokinetic response to study visual function of zebrafish

باستخدام optokinetic استجابة لدراسة وظيفة البصرية من الزرد

Optokinetic response (OKR) is a behavior that an animal vibrates its eyes to follow a rotating grating around it. It has been widely used to assess the ...

Quantification of &gamma;H2AX Foci in Response to Ionising Radiation

Quantification of ÃƒÅ½Ã‚Â³H2AX Foci in Response to Ionising Radiation

الكمي بؤر γH2AX في الاستجابة للإشعاع المؤين

DNA double-strand breaks (DSBs), which are induced by either endogenous metabolic processes or by exogenous sources, are one of the most critical DNA ...

Measurement of Survival Time in Brachionus Rotifers: Synchronization of Maternal Conditions

Measurement of Survival Time in Brachionus Rotifers: Synchronization of Maternal Conditions

قياس الوقت البقاء على قيد الحياة في<em&gt; Brachionus</em&gt; الروتيفيرا: التزامن من شروط صحة الأم

Rotifers are microscopic cosmopolitan zooplankton used as models in ecotoxicological and aging studies due to their several advantages such as short ...

Hydroponics: A Versatile System to Study Nutrient Allocation and Plant Responses to Nutrient Availability and Exposure to Toxic Elements

الزراعة المائية: نظام تنوعا لدراسة الغذائية تخصيص ومصنع الردود على توافر المواد الغذائية والتعرض للعناصر السامة

Hydroponic systems have been utilized as one of the standard methods for plant biology research and are also used in commercial production for several ...

Characterization of Calcification Events Using Live Optical and Electron Microscopy Techniques in a Marine Tubeworm

توصيف تكلس الأحداث عن طريق لايف البصرية والمجهر الإلكتروني تقنيات في Tubeworm البحرية

Characterizing the first event of biological production of calcium carbonate requires a combination of microscopy approaches. First, intracellular pH ...

Assessment of Dictyostelium discoideum Response to Acute Mechanical Stimulation

Assessment of Dictyostelium discoideum Response to Acute Mechanical Stimulation

تقييم لاستجابة ديسكويديوم ديكتيوستيليوم "تحفيز الميكانيكية الحادة"

Chemotaxis, or migration up a gradient of a chemoattractant, is the best understood mode of directed migration. Studies using social amoeba Dictyostelium ...

Apoptosis Induction and Detection in a Primary Culture of Sea Cucumber Intestinal Cells

الحث المبرمج والكشف في الثقافة الاساسيه للخلايا المعوية الخيار البحر

Primary cultured cells are used in a variety of scientific disciplines as exceptionally important tools for the functional evaluation of biological ...