Name: chemotactic response of marine micro-organisms to micro-scale nutrient layers
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00
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우리는 깨끗한 객실 시설이 비디오의 필름 부분에 우리를있게 위해 MIT에서 마이크로 시스템즈 기술 연구소 감사하고 싶습니다.

준비 1. 마스크 만들기 <blockquote> CAD 소프트웨어를 사용하여 투명성에 대한 고해상도 인쇄를위한 채널을 디자인합니다. 이것은 &quot;마스크&quot;가 될 것입니다. </blockquote> 클린 룸에서 : 2. 웨이퍼를 청소 구워 아세톤과 함께 첫째, 물총 웨이퍼 후 신속하게 메탄올과 다음 이소프로판올와 함께. 마지...

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	<li>Azam, F., Malfatti, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+structuring+of+marine+ecosystems.">Microbial structuring of marine ecosystems.</a> Nature Reviews Microbiology. 5, 782-791 (2007).</li><li>Blackburn, N., Azam, F., Hagstrom, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spatially+explicit+simulations+of+a+microbial+food+web.+.">Spatially explicit simulations of a microbial food web. .</a> Limnology and Oceanography. 42, 613-622 (1997).</li><li>Blackburn, N., Fenchel, T., Mitchell, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microscale+nutrient+patches+in+plankton+habitats+shown+by+chemotactic+bacteria.">Microscale nutrient patches in plankton habitats shown by chemotactic bacteria.</a> Science. 282, 2254-2256 (1998).</li><li>Keymer, J. E., Galajda, P., Muldoon, C., Park, S., Austin, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+metapopulations+in+nanofabricated+landscapes.">Bacterial metapopulations in nanofabricated landscapes.</a> Proceedings of the National Academy of Science. 103, 17290-17295 (2006).</li><li>Mao, H., Cremer, P. S., Manson, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+sensitive,+versatile+microfluidic+assay+for+bacterial+chemotaxis.">A sensitive, versatile microfluidic assay for bacterial chemotaxis.</a> Proceedings of the National Academy of Science. 100, 5449-5454 (2003).</li><li>Marcos, R., Stocker, <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microorganisms+in+vortices:+a+microfluidic+setup.">Microorganisms in vortices: a microfluidic setup.</a> Limnology and Oceanography: Methods. 4, 392-398 (2006).</li><li>Park, S., Wolanin, P. M., Yuzbahyan, E. A., Lin, H., Darnton, N. C., Stock, J. B., Silberzan, P., Austin, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Influence+of+topology+on+bacterial+social+interaction.">Influence of topology on bacterial social interaction.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 100, 13910-13915 (2003).</li><li>Whitesides, G. M., Ostuni, E., Takayama, S., Jiang, X., Ingber, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Soft+lithography+in+biology+and+biochemistry.">Soft lithography in biology and biochemistry.</a> Annual Review of Biomedical Engineering. 3, 335-373 (2001).</li></ol>

해양 미생물들이 지역의 화학 및 물리적 환경과 상호 작용하는 방법을 이해하는 바다의 영양분과 탄소 순환 (Azam 및 Malfatti 2007)에서 planktonic 미생물의 역할을보다 완벽하고 정확한 인식을 위해 필수적입니다. 그러나 많은 중요한 미생물의 상호 작용이 이루어지는있는 동안 작은 비늘 (&lt;㎜)로 인해, 기술적 제한이 이종 바이오 physico - 화학 풍경 내에서 미생물의 동작에 대한 자세한 시험을 예방할 필요하면 바다...

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		<div>
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		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>PDMS, Sylgard 184</td>
<td>Silicone Elastomer Kit</td>
<td>Dow Corning, Midland, MI, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>http://www.ellsworth.com/sylgard.html</td>
</tr>
<tr>
<td>SU8-2100</td>
<td>Photoresist</td>
<td>MicroChem, Newton, MA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>www.microchem.com
</td>
</tr>
<tr>
<td>Nikon Eclipse TE2000-E inverted microscope</td>
<td>Microscope</td>
<td>Nikon, Japan</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>PEEK tubing (0.762 mm ID, 1.59 mm OD)</td>
<td>Tool</td>
<td>Upchurch Scientific, Oak Harbor, WA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>www.upchurch.com</td>
</tr>
<tr>
<td>Syringes (Luer-Lok Tip)</td>
<td>Tool</td>
<td>BD, Franklin Lakes, NJ, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Fitting Part P-704-01</td>
<td>Tool</td>
<td>Upchurch Scientific, Oak Harbor, WA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>To connect tubing to Luer-Lok Tip Syringes</td>
</tr>
<tr>
<td>Syringe Pump (PHD 2000 Programmable)</td>
<td>Equipment</td>
<td>Harvard Apparatus, Holliston, MA, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>CCD Camera (PCO 1600)</td>
<td>Equipment</td>
<td>Cooke, Romulus, MI, USA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

chemotactic response of marine micro-organisms to micro-scale nutrient layers

planktonic의 미생물이 microscale 자원 패치를 악용 수있는 정도 해양 trophodynamics 및 biogeochemical 플럭스에 대한 상당한 영향을 것입니다. 그러나, 수영 미생물이 패치의 가용성과 그들을 찾을 박테리아의 능력을 제한합니다 분자 확산과 난류 전단을 포함한 물리적인 세력의 영향을 극복한다, 바다에 영양 패치를 활용할 수 있습니다. 최근까지, 방법 론적 한계 곳곳에 서식지와 현실적인 소규모 흐름 조건 내에서 미생물의 행동을 직접 시험을 배제했습니다. 따라서 많은 바다 미생물 행동에 관한 현재의 지식은 이론적 예측에서 procured되었습니다. 우리가 만드는 데 사용해야이 microfluidic 장치 (전) 해양 프로세스와 관련된 치수와 잘 퍼지는 특성과 영양 패치를 microscale 그리고 (ii) microscale 개발을 소프트 리소그래피 제조 기술을 적용 바다에 미생물의 식량 약탈을 배워 행동에 새로운 정보를 얻으려면 바다에서 예상되는 것과 해당 전단 속도 vortices. 이러한 microfluidic 장치는 이기종 및 동적 씨스 케이프 내에서 미생물 수영 chemotactic 행동의 첫번째 직접 시험을 허용했습니다. 개인 미생물의 수영장 행동 이외에, 인구 수준 aggregative 반응을 관찰하면서 epifluorescence와 위상 콘트라스트 현미경의 통합 사용, 물리적 치수 및 영양소 패치 잘 퍼지는 특성을 직접 시험을 수 있습니다. 이러한 실험은 식물성 플랑크톤, heterotrophic 박테리아와 phagotrophic protists의 일부 수종은 매우 짧은 시간 프레임 내에 diffusing microscale 자원 패치를 찾기 및 활용에 숙달되는 밝혀있다. 우리는 또한 전단 속도를 중간 그런 나타날, 해양 박테리아는 자신의 협정에서 자신의 환경을 통해 흐름과 수영을 싸울 수 있습니다. 그러나, 임계값 높은 전단 수준을 넘어, 박테리아는 전단 흐름에 부합하고 흐름의 방해없이 수영을 덜 수 있습니다. Microfluidics는 수생 미생물 생태학을 공부를위한 소설과 저렴한 접근을 대표하고, 정확하게 microscale에서 현실적인 흐름 필드와 기판 그라디언트를 만들에 대한 적합성으로 인해, 상호 작용의 가장 작은 비늘에 미생물의 행동 검사에 이상적으로 적용됩니다. 따라서 microfluidics가 바다에 미생물의 생태에 대한 이해를위한 유용한 도구를 대표하는 것이 좋습니다.

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Chemotactic Response of Marine Micro-Organisms to Micro-Scale Nutrient Layers

전단 흐름 내의 곳곳에 영양 씨스 케이프와 박테리아의 수영 동작 이내에 해양 미생물의 chemotactic 식량 약탈을 배워 동작을 공부를위한 microfluidic 채널과 실험에서 구현의 제조가 설명되어 있습니다.

마이크로 스케일 영양소 레이어에 해양 미생물의 Chemotactic 응답

The degree to which planktonic microbes can exploit microscale resource patches will have considerable implications for oceanic trophodynamics and ...

Research

JoVE Journal

Biology

Layers of Symbiosis - Visualizing the Termite Hindgut Microbial Community

공생의 레이어 - 마이트의 H​​indgut의 미생물 커뮤니티를 떠올리

Jared Leadbetter takes us for a nature walk through the diversity of life resident in the termite hindgut - a microenvironment containing 250 different ...

연구

생물학

Micro-scale Engineering for Cell Biology

세포 생물학을위한 미세 규모 공학

In vivo Imaging of Deep Cortical Layers using a Microprism

In vivo Imaging of Deep Cortical Layers using a Microprism

Microprism를 사용하여 딥 두피 레이어의 생체내 이미징에서

We present a protocol for in vivo imaging of cortical tissue using a deep-brain imaging probe in the shape of a microprism.  Microprisms are 1-mm in size ...

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Optokinetic response (OKR) is a behavior that an animal vibrates its eyes to follow a rotating grating around it. It has been widely used to assess the ...

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DNA double-strand breaks (DSBs), which are induced by either endogenous metabolic processes or by exogenous sources, are one of the most critical DNA ...

Measurement of Survival Time in Brachionus Rotifers: Synchronization of Maternal Conditions

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생존 시간의 측정에<em&gt; Brachionus</em&gt; 로티퍼 : 산모 조건의 동기화

Rotifers are microscopic cosmopolitan zooplankton used as models in ecotoxicological and aging studies due to their several advantages such as short ...

Hydroponics: A Versatile System to Study Nutrient Allocation and Plant Responses to Nutrient Availability and Exposure to Toxic Elements

수경법, • 다목적 시스템은 유해 요소에 영양소 가용성 및 노출에 영양 할당 및 플랜트 응답을 공부하기

Hydroponic systems have been utilized as one of the standard methods for plant biology research and are also used in commercial production for several ...

Characterization of Calcification Events Using Live Optical and Electron Microscopy Techniques in a Marine Tubeworm

해양 tubeworm 인 라이브 광학 및 전자 현미경 기술을 사용하여 석회화 이벤트의 특성

Characterizing the first event of biological production of calcium carbonate requires a combination of microscopy approaches. First, intracellular pH ...

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Dictyostelium discoideum 응답 심각한 기계적인 자극의 평가

Chemotaxis, or migration up a gradient of a chemoattractant, is the best understood mode of directed migration. Studies using social amoeba Dictyostelium ...

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해삼 장 세포의 1 차적인 배양에 있는 세포자멸 유도 그리고 탐지

Primary cultured cells are used in a variety of scientific disciplines as exceptionally important tools for the functional evaluation of biological ...