Name: identifying dysregulated genes induced by kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (kshv)
Uploaded: 2010-09-14T17:00:00
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우리는 그의 조언이 원고의 검토를 위해 제임스 EK 힐드레스, 메해리 의료 대학, 감사합니다. 우리는 또한 원고의 편집 다이아나 Marver 감사합니다. 에이즈 건강 불균형 연구 센터, NIH 그랜트 5U54 RR019192 - 05,, 임상 연구 메해리 센터, NIH 그랜트 P20RR011792,이 작품은 에이즈 연구 메해리 밴더빌트 센터 (NIH 그랜트 P30 AI054999 - 05)에 의해 지원되었으며 NIH에 의해 부여 P01 CA113239. DJA는 부분적으로 에이즈 연구 밴더빌트 - 메해리 센터 (CFAR) 및 임상 연구에 대한 메해리 센터 (CRC)에서 파일럿 부여에 의해 투자되었다.

1. DMVEC의 KSVH 재배 및 감염 <ol><li> BCBL - 1 세포주, 인간의 뱃속을 기반으로 림프종에서 처음을 격리가 완료 RPMI 1640 미디어 (Gibco, 그랜드 아일랜드, NY)에서 양식입니다. BCBL - 1 세포가 37, 액체 질소 제거 드라이 아이스에 운반하고, 신속하게 1 분 해동 아르 ° C. 밀도 1x10 4 셀 / ML에서 BCBL - 1 세포의 50 μL 나누어지는 50 ML / 플라스크에 10 % 태아 송아지 혈청, 1X 페니실린 / 스트렙토 마이신과 보?...

<ol>
	<li>Sitas, F., Newton, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kaposi's+sarcoma+in+South+Africa.">Kaposi's sarcoma in South Africa.</a> J Natl Cancer Inst Monogr. 28, 1-4 (2001).</li><li>Moore, P. S., Chang, Y., Knipe, D. M., Howley, P. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kaposi's+sarcoma+associated+herpesvirus.">Kaposi's sarcoma associated herpesvirus.</a> Field's Virology. , 2803-2833 (2002).</li><li>Chang, Y., Cesarman, E., Pessin, M. S., Lee, F., Culpepper, J., Knowles, D. M., Moore, P. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+herpesvirus-like+DNA+sequences+in+AIDS-associated+Kaposi's+sarcoma.">Identification of herpesvirus-like DNA sequences in AIDS-associated Kaposi's sarcoma.</a> Science. 266, 1865-1869 (1994).</li><li>Cesarman, E., Chang, Y., Moore, P., Said, J. W., Knowles, D. M., M, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kaposi's+sarcoma-associated+herpesvirus-like+DNA+sequences+in+AIDS-related+body-cavity-based+lymphomas.">Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus-like DNA sequences in AIDS-related body-cavity-based lymphomas.</a> N Engl J Med. 18, 1186-1191 (1995).</li><li>Cesarman, E., Knowles, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kaposi's+sarcoma-associated+herpesvirus:+a+lymphotropic+human+herpesvirus+associated+with+Kaposi's+sarcoma,+primary+effusion+lymphoma,+and+multicentric+Castleman's+disease.">Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus: a lymphotropic human herpesvirus associated with Kaposi's sarcoma, primary effusion lymphoma, and multicentric Castleman's disease.</a> Semin Diagn Pathol. 14, 54-66 (1997).</li><li>Chiou, C. J., Poole, L. J., Kim, P. S., Ciufo, D. M., Cannon, J. S., ap Rhys, C. M., Alcendor, D. J., Zong, J. C., Ambinder, R. F., Hayward, G. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Patterns+of+gene+expression+and+a+transactivation+function+exhibited+by+the+vGCR+(ORF74)+chemokine+receptor+protein+of+Kaposi's+sarcoma-associated+herpesvirus.">Patterns of gene expression and a transactivation function exhibited by the vGCR (ORF74) chemokine receptor protein of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus.</a> J Virol. 76, 3421-3439 (2002).</li><li>Staskus, K. A., Zhong, W., Gebhard, K., Herndier, B., Wang, H., Renne, R., Beneke, J., Pudney, J., Anderson, D. J., Ganem, D., Haase, A. T., T, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kaposi's+sarcoma-associated+herpesvirus+gene+expression+in+endothelial+(spindle)+tumor+cells.">Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus gene expression in endothelial (spindle) tumor cells.</a> J Virol. 71, 715-719 (1997).</li><li>Alcendor, D. J., Zhu, W. Q., Desai, P., Vigil, H. E., Hayward, G. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=KSHV+downregulation+of+galectin-3+in+kaposi's+sarcoma.">KSHV downregulation of galectin-3 in kaposi's sarcoma.</a> Glycobiology. , (2009).</li><li>Ciufo, D. M., Cannon, J. S., Poole, L. J., Wu, F. Y., Murray, P., Ambinder, R. F., Hayward, G. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spindle+cell+conversion+by+Kaposi's+sarcoma-associated+herpesvirus:+formation+of+colonies+and+plaques+with+mixed+lytic+and+latent+gene+expression+in+infected+primary+dermal+microvascular+endothelial+cell+cultures.">Spindle cell conversion by Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus: formation of colonies and plaques with mixed lytic and latent gene expression in infected primary dermal microvascular endothelial cell cultures.</a> J Virol. 75, 5614-5626 (2001).</li><li>Long, E., Ilie, M., Hofman, V., Havet, K., Selva, E., Butori, C., Lacour, J. P., Nelson, A. M., Cathomas, G., Hofman, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=LANA-1,+Bcl-2,+Mcl-1+and+HIF-1alpha+protein+expression+in+HIV-associated+Kaposi+sarcoma.">LANA-1, Bcl-2, Mcl-1 and HIF-1alpha protein expression in HIV-associated Kaposi sarcoma.</a> Virchows Arch. 2, 159-170 (2009).</li></ol>

이 보고서에 사용된 방법론은 실험 설정의 다양한 수행할 수 있습니다. 그들은 특별한 장비 또는 핵심 시설에 대한 액세스를 필요로합니다. biosaftey 수준 3 (BSL - 3) 시설의 사용을 요구할 수 있습니다 KSHV와 같은 전염성 바이러스성 병원체를 포함한 실험을 수행할 때 적절한주의가 이동해야합니다. 조직 인수도 해당 기관 검토 보드 (IRBs)에 의해 승인을 받아야합니다. 이러한 ?...

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		<div>
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		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>RPMI 1640</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>05-0001DJ</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>TPA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>P1585</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>PBS pH 7.4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>10010-023</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sodium butyrate</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>19364 (FLUKA)</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>EBM-2 media</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Lonza</td>
<td>CC-3156</td>
<td>+ bullet kits supplement </td>
</tr>
<tr>
<td>DMVEC cells (HMVEC)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Lonza</td>
<td>CC2543</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Fetal calf serum</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hyclone</td>
<td>SH30066.03</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Penicillin/streptomycin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>15140-122</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Chamber slides</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Nalgene</td>
<td>154461</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>KSHV LANA Mab</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Vector Labs</td>
<td>VP-H913</td>
<td>1:50 dilution/IFA</td>
</tr>
<tr>
<td>Galectin-3 goat pAb</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>R&D Systems</td>
<td>AF1154</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Donkey-anti-goat FITC</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Jackson ImmunoRessearch</td>
<td>705-095-1</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Donkey-anti-goat Rho</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Jackson ImmunoRessearch</td>
<td>705-295-003</td>
<td>1:100 dilution/IFA</td>
</tr>
<tr>
<td>Mounting media</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Vector Labs</td>
<td>H 1500</td>
<td>Vectashield with DAPI</td>
</tr>
<tr>
<td>BCA Protein Assay Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Pierce</td>
<td>23235</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Nitrocellulose </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Bio-Rad</td>
<td>161-0112</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Donkey-anti-goat-conj. </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Santa Cruz</td>
<td>SC 2020</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Western substrate</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Pierce</td>
<td>34075</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Biotin-rabbit-anti goat</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>DAKO</td>
<td>305-065-045</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>AP-Strepavidin conj.</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>DAKO</td>
<td>K 0492 (kit)</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>RNase DNase Free Set</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Qiagen</td>
<td>79254</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>MJ Mini Cycler</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Bio-Rad</td>
<td>PTC-1148C</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Bio-Photometer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Eppendorf</td>
<td>952000006</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>RC 6 Plus Centrifuge</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sorvall</td>
<td>46910</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Coulter Optima L-90K Ultracentrifuge</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Beckman</td>
<td>392052</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>MYiQ iCycler Real Time PCR Detection System</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Bio-Rad</td>
<td>170-9770</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>TE 2000S Fluorescent microscope</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NIKON</td>
<td>TE2000S</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>2100 Bioanalyzer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>G2938C</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Eclipse E 200</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>NIKON</td>
<td>E 200</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sorvall Legend RT Centrifuge</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Thermo</td>
<td>75004377</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

identifying dysregulated genes induced by kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (kshv)

현재 KS 남부 아프리카에서 가장 지배 HIV / AIDS 관련 강한 악의이며, 따라서 세계. 1,2은 그것이 혈관 내피 세포의 angioproliferative 종양으로 특징이며, 흉막 유출의 lymphomas의 형태로 드문 B 세포 lymphoproliferative 질병 (화소)을 생산 그리고 multicentric 캐슬맨의 질병 중 일부 형태. KS에서 세포의 3-5만이 1~5% 적극적으로 Kaposi의 육종 - 관련 herpesvirus (KSHV), KS과 관련된 etiological 에이전트 lytic 복제를 지원하는 병변, 그리고 그것은 세포 요인해야한다는 분명하다 oncogenesis 및 종양 진행의 과정에서 바이러스 요인과 상호 작용. KS 병리에 기여 6,7 식별 소설 호스트 팩터 determinants은 물론, KS의 치료를위한 소설 치료제 개발을위한 같은 종양 진행과 전이에 대한 전조 마커를 개발하기 위해 필수적입니다 dysregulated 유전자 microarray 분석에 의해 확인되면 8. 함께 비디오 내용을 우리가 KSHV 감염 후 KS 종양 조직에서 피부 microvascular 내피 세포 (DMVEC)에 변경 숙주 세포의 유전자 발현 프로그램을 식별하는 데 사용하는 방법. 9, 단백질 표현의 변화입니다 immunoblot 및 이중 레이블 immunofluorescence에 의해 확인했다. dysregulated 유전자의 transcriptional 표현의 변경은 양적 실시간 중합 효소의 연쇄 반응 (PCR qRT -)에 의해 체외로 확인됩니다. 아카이브 KS 종양 조직을 이용하여 체외의 결과에 검증도 듀얼 표시 immunochemistry 및 조직 microarrays에 의해 수행됩니다. 8,10 접근은 체외에서 이후 생체내 모델 시스템의 개발을 위해 허용되는 KS 종양 조직 microenvironment에 dysregulated 유전자를 식별하기 위해 KS의 치료를위한 잠재적인 소설 치료의 발견 및 평가.

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Identifying Dysregulated Genes Induced by Kaposi's Sarcoma-associated Herpesvirus KSHV

숙주 세포 요인은 설치 및 Kaposi의 육종 (KS)의 유지에 중요한 역할을한다. 우리는 KSHV에 감염된 DMVEC 전지 변경 숙주 세포 요소를 식별하는 방법을 설명하고, KS 종양 조직 인치 바이러스에 의해 변경 세포 유전자 소설 치료제에 대한 잠재적인 대상 (S) 역할을합니다.

Kaposi의 육종 - 관련 Herpesvirus (KSHV)에 의해 유도된 유전자를 식별 Dysregulated

Currently KS is the most predominant HIV/AIDS related malignancy in Southern Africa and hence the world.1,2 It is characterized as an angioproliferative ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Identifying Dysregulated Genes Induced by Kaposi's Sarcoma-associated Herpesvirus (KSHV)

Transfection and Mutagenesis of Target Genes in Mosquito Cells by Locked Nucleic Acid-modified Oligonucleotides

옥내 핵산 - 수정 Oligonucleotides에 의해 Transfection 및 모기 세포 대상 유전자의 돌연변이 유발

Plasmodium parasites, the causative agent of malaria, are transmitted through the bites of infected Anopheles mosquitoes resulting in over 250 million new ...

연구

면역학 및 감염병학

An Allelotyping PCR for Identifying Salmonella enterica serovars Enteritidis, Hadar, Heidelberg, and Typhimurium

An Allelotyping PCR for Identifying Salmonella enterica serovars Enteritidis, Hadar, Heidelberg, and Typhimurium

확인을 위해 Allelotyping PCR 살모넬라 enterica serovars Enteritidis, 해더, 하이 델베르크, 그리고 Typhimurium

Current commercial PCRs tests for identifying Salmonella target genes unique to this genus.  However, there are two species, six subspecies, and over ...

Dissecting Host-virus Interaction in Lytic Replication of a Model Herpesvirus

모델 Herpesvirus의 Lytic 복제의 해부 호스트 바이러스 상호 작용

In response to viral infection, a host develops various defensive responses, such as activating innate immune signaling pathways that lead to antiviral ...

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정제 된 조혈 줄기 / 전구 세포에 DNA 돌연변이를 확인

In recent years, it has become apparent that genomic instability is tightly related to many developmental disorders, cancers, and aging. Given that stem ...

Using RNA-interference to Investigate the Innate Immune Response in Mouse Macrophages

마우스 대 식세포의 타고난 면역 반응을 조사하기 위해 RNA 간섭을 사용하여

Macrophages are key phagocytic innate immune cells.  When macrophages encounter a pathogen, they produce antimicrobial proteins and compounds to kill the ...

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호흡기 유체의 Equid 헤르페스 바이러스-2 진단에 대한 정량적 PCR 방법의 개발 및 검증

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면역 마약 식별을위한 T 림프구에서 미토 겐 유도 블라스의 신속한 정량

Lymphocyte proliferation in response to antigenic or mitogenic stimulation is a readily quantifiable phenomenon useful for testing immunomodulatory (i.e., ...

A Method to Assess Fc-mediated Effector Functions Induced by Influenza Hemagglutinin Specific Antibodies

독감 조류 특정 항 체에 의해 유도 된 Fc 중재 Effector 기능을 평가 하는 방법

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Deep Vein Thrombosis Induced by Stasis in Mice Monitored by High Frequency Ultrasonography

스테이 시스 고주파 초음파에 의해 모니터링 하는 쥐에 의해 유도 된 깊은 정 맥 혈전 증

Venous thrombosis is a common condition affecting 1 - 2% of the population, with an annual incidence of 1 in 500. Venous thrombosis can lead to death ...