Name: direct analysis of single cells by mass spectrometry at atmospheric pressure
Uploaded: 2010-09-04T17:00:00
Duration: 8 min 19 s
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लेखकों निम्नलिखित संस्थाओं द्वारा वित्तीय सहायता स्वीकार करते हैं, राष्ट्रीय विज्ञान फाउंडेशन (0719232 अनुदान), ऊर्जा विभाग (अनुदान DEFG02 - 01ER15129), WM उबकना फाउंडेशन (041,904 अनुदान), और जॉर्ज वॉशिंगटन विश्वविद्यालय के अनुसंधान संवर्धन फंड. लेखकों GeO2 आधारित ऑप्टिकल फाइबर के लिए उदारता मार्क ई. Reeves और जॉर्ज वॉशिंगटन के Joan ए Hoffmann द्वारा फाइबर नक़्क़ाशी के बारे में प्रोटोकॉल पर प्रारंभिक चर्चा के लिए इन्फ्रारेड फाइबर (सिल्वर स्प्रिंग, एमडी) सिस्टम के रूप में के रूप में अच्छी तरह के द्वारा आपूर्ति की आभारी हैं विश्वविद्यालय. लेखकों को भी उसकी मदद करने के लिए प्रोटोकॉल के वीडियोटैपिंग दौरान जेसिका ए Stolee धन्यवाद देना चाहूंगा.

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	<li>Cooks, R. G., Ouyang, Z., Takats, Z., Wiseman, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ambient+Mass+Spectrometry.">Ambient Mass Spectrometry.</a> Science. 311, 1566-1570 (2006).</li><li>Chen, Z. Y., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Early+plume+expansion+in+atmospheric+pressure+midinfrared+laser+ablation+of+water-rich+targets.">Early plume expansion in atmospheric pressure midinfrared laser ablation of water-rich targets.</a> Physical Review E. E77, 036316-036316 (2008).</li><li>Li, Y., Shrestha, B., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Atmospheric+Pressure+Molecular+Imaging+by+Infrared+MALDI.">Atmospheric Pressure Molecular Imaging by Infrared MALDI.</a> Mass Spectrometry. Analytical Chemistry. 79, 523-532 (2006).</li><li>Li, Y., Shrestha, B., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Atmospheric+Pressure+Infrared+MALDI+Imaging+Mass+Spectrometry+for+Plant+Metabolomics.">Atmospheric Pressure Infrared MALDI Imaging Mass Spectrometry for Plant Metabolomics.</a> Analytical Chemistry. 80, 407-420 (2007).</li><li>Nemes, P., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Laser+Ablation+Electrospray+Ionization+for+Atmospheric+Pressure+in+Vivo,+and+Imaging+Mass+Spectrometry.">Laser Ablation Electrospray Ionization for Atmospheric Pressure in Vivo, and Imaging Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 79, 8098-8106 (2007).</li><li>Shrestha, B., Li, Y., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+analysis+of+pharmaceuticals+and+excreted+xenobiotic+and+endogenous+metabolites+with+atmospheric+pressure+infrared+MALDI+mass+spectrometry.">Rapid analysis of pharmaceuticals and excreted xenobiotic and endogenous metabolites with atmospheric pressure infrared MALDI mass spectrometry.</a> Metabolomics. 4, 297-311 (2008).</li><li>Nemes, P., Barton, A. A., Li, Y., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ambient+Molecular+Imaging+and+Depth+Profiling+of+Live+Tissue+by+Infrared+Laser+Ablation+Electrospray+Ionization+Mass+Spectrometry.">Ambient Molecular Imaging and Depth Profiling of Live Tissue by Infrared Laser Ablation Electrospray Ionization Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 80, 4575-4582 (2008).</li><li>Nemes, P., Barton, A. A., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Three-Dimensional+Imaging+of+Metabolites+in+Tissues+under+Ambient+Conditions+by+Laser+Ablation+Electrospray+Ionization+Mass+Spectrometry.">Three-Dimensional Imaging of Metabolites in Tissues under Ambient Conditions by Laser Ablation Electrospray Ionization Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 81, 6668-6675 (2009).</li><li>Nemes, P., Woods, A. S., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simultaneous+Imaging+of+Small+Metabolites+and+Lipids+in+Rat+Brain+Tissues+at+Atmospheric+Pressure+by+Laser+Ablation+Electrospray+Ionization+Mass+Spectrometry.">Simultaneous Imaging of Small Metabolites and Lipids in Rat Brain Tissues at Atmospheric Pressure by Laser Ablation Electrospray Ionization Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 82, 982-988 (2010).</li><li>Shrestha, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Direct+analysis+of+lipids+and+small+metabolites+in+mouse+brain+tissue+by+AP+IR-MALDI+and+reactive+LAESI+mass+spectrometry.">Direct analysis of lipids and small metabolites in mouse brain tissue by AP IR-MALDI and reactive LAESI mass spectrometry.</a> Analyst. , (2010).</li><li>Sripadi, P., Nazarian, J., Hathout, Y., Hoffman, E., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+analysis+of+metabolites+from+the+untreated+tissue+of+Torpedo+californica+electric+organ+by+mid-infrared+laser+ablation+electrospray+ionization+mass+spectrometry.">In vitro analysis of metabolites from the untreated tissue of Torpedo californica electric organ by mid-infrared laser ablation electrospray ionization mass spectrometry.</a> Metabolomics. 5, 263-276 (2009).</li><li>Shrestha, B., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+Situ+Metabolic+Profiling+of+Single+Cells+by+Laser+Ablation+Electrospray+Ionization+Mass+Spectrometry.">In Situ Metabolic Profiling of Single Cells by Laser Ablation Electrospray Ionization Mass Spectrometry.</a> Analytical Chemistry. 81, 8265-8271 (2009).</li><li>Shrestha, B., Nemes, P., Vertes, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ablation+and+Analysis+of+a+Single+Cell+by+Consecutive+Laser+Pulses.">Ablation and Analysis of a Single Cell by Consecutive Laser Pulses.</a> Applied Physics A. , (2010).</li></ol>

ब्याज की कोई संघर्ष की घोषणा की.

cytoplasm कोशिका और कोशिका दीवार या झिल्ली के तन्य शक्ति के पानी की सामग्री LAESI एमएस विश्लेषण के दौरान एकल कक्षों के पृथक गवर्निंग महत्वपूर्ण कारक हैं. लेजर प्रभाव के लिए अलग सेल प्रकार के पृथक थ्रेसहोल्ड तक पहुँचने के लिए समायोजित किया जा है. वितरित प्रभाव लेजर लेजर पल्स की ऊर्जा और फाइबर टिप और कोशिका की सतह के बीच की दूरी पर निर्भर करता है. एकल कक्ष विश्लेषण के दौरान पड़ोसी कोशिकाओं की बेचैनी कम से कम महत्वपूर्ण है. पृथक दहलीज पर लेजर ऊर्जा को ध्यान में रखते हुए सन्निकट कक्षों पर विश्लेषण के प्रभाव को सीमित करता है. रासायनिक इमेजिंग के लिए प्राकृतिक बड़ा (voxels) एमएस द्वारा पिक्सल के रूप में संभावित अनुप्रयोगों के एकल कक्षों का उपयोग कर रहा है. एक कृत्रिम अक्सर आयताकार ग्रिड पर डाटा एकत्रित करने के लिए तुलना में, एक ऊतक एक कक्ष एक समय में रासायनिक इमेजिंग अधिक कोशिकाओं के बीच जैव रासायनिक बातचीत के स्थानिक संगठन बनाए रखने होने की संभावना है.

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		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Acetic acid</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fluka</td>
<td>45727</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Methanol</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fluka</td>
<td>65548</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>1-methyl-2-pyrrolidinon</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma Aldrich</td>
<td>M79603</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fluka</td>
<td>39259</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

direct analysis of single cells by mass spectrometry at atmospheric pressure

एकल कोशिकाओं में जैव रसायनों का विश्लेषण सेल चयापचय, कोशिका चक्र, अनुकूलन, रोग राज्यों, आदि को समझने के लिए महत्वपूर्ण है, यहां तक ​​कि एक ही सेल प्रकार विषम जैव रासायनिक श्रृंगार उनकी शारीरिक स्थिति और पर्यावरण के साथ बातचीत के आधार पर प्रदर्शन. मास स्पेक्ट्रोमेट्री (एमएस) के परम्परागत तरीकों एकल कोशिकाओं में biomolecules के विश्लेषण के लिए इस्तेमाल व्यापक नमूना तैयार करने पर भरोसा करते हैं. उनके प्राकृतिक वातावरण और व्यापक नमूना प्रसंस्करण से कोशिकाओं को हटाना सेलुलर संरचना में परिवर्तन करने के लिए नेतृत्व सकता है. परिवेश ionization तरीकों उनके पैतृक वातावरण में और व्यापक नमूना तैयारी के बिना नमूनों के विश्लेषण सक्षम के मध्य अवरक्त (मध्य IR) लेजर पृथक 2.94 सुक्ष्ममापी तरंग दैर्ध्य में जैविक सामग्री के आधार पर एक तकनीक पानी की अचानक उत्तेजना का उपयोग. कि चरण में परिणाम विस्फोट. 2 परिवेश ionization मध्य IR लेजर पृथक electrospray ionization (LAESI) और वायुमंडलीय दबाव अवरक्त मैट्रिक्स की मदद से desorption लेजर ionization (एपी आईआर - MALDI) के रूप में लेजर विकिरण, पर आधारित तकनीक, सफलतापूर्वक पानी के लिए सीधे - विश्लेषण करने की क्षमता का प्रदर्शन किया है अमीर ऊतकों और वायुमंडलीय दबाव में biofluids 3-11 मध्य IR लेजर पृथक पंख है कि ज्यादातर उच्च चार्ज electrospray आयनों उत्पादन बूंदों के साथ नमूना coalesces से तटस्थ बात कण होते LAESI में. हाल ही में, एकल कक्षों के मध्य आईआर पृथक एक etched फाइबर के माध्यम से मध्य आईआर विकिरण देने के द्वारा किया गया था. इस पृथक से उत्पन्न पंख एक एकल कक्षों में LAESI एमएस द्वारा विविध चयापचयों का विश्लेषण सक्षम electrospray द्वारा postionized 12 यह लेख LAESI एमएस एकल कक्ष का उपयोग विश्लेषण के लिए विस्तृत प्रोटोकॉल का वर्णन. वीडियो प्रस्तुत एक Allium CEPA बल्ब की त्वचा से एक एकल epidermal सेल का विश्लेषण दर्शाता है. प्रणाली के योजनाबद्ध चित्र 1 में दिखाया गया है. एकल कक्ष और कक्ष से एक LAESI जन स्पेक्ट्रम पृथक का एक प्रतिनिधि उदाहरण चित्रा 2 में प्रदान की जाती हैं.

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Direct Analysis of Single Cells by Mass Spectrometry at Atmospheric Pressure

सिंगल सेल विश्लेषण पौधे और पशु कोशिकाओं पर वायुमंडलीय दबाव में मास स्पेक्ट्रोमेट्री द्वारा एक तेज ऑप्टिकल फाइबर का उपयोग करने के लिए लेजर पृथक electrospray (LAESI) ionization मास स्पेक्ट्रोमेट्री के लिए कोशिकाओं का नमूना के द्वारा किया जाता है.

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MALDI Sample Preparation: the Ultra Thin Layer Method

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This video demonstrates the preparation of an ultra-thin matrix/analyte layer for analyzing peptides and proteins by Matrix-Assisted Laser Desorption ...

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