Name: agar-block microcosms for controlled plant tissue decomposition by aerobic fungi
Uploaded: 2011-02-03T17:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi at JoVE.com

ينطبق هذا البروتوكول على ركائز الخشبية وغير الخشبية ، على النحو المبين ، فضلا عن الفرن أو الهواء المجففة المواد. قراءة من خلال البروتوكول الأول ، ولكن ، قبل انشاء. هناك عدة نقاط أثارها التي قد تنطبق على دراستك ، وهذه نقطة (مسطرة) تتطلب التخطيط. أيضا ، علما أن هناك نشرا ?...

<ol>
	<li>ASTM D1413-07. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standard+test+method+for+testing+wood+preservatives+by+laboratory+soil-block+cultures.+.">Standard test method for testing wood preservatives by laboratory soil-block cultures. .</a> Annual Book of ASTM Standards. , 185-192 (2007).</li><li>Bravery, A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A miniaturized wood block for the rapid evaluation of wood preservative fungicides. , (1978).</li><li>Low, G. A., Young, M. E., Martin, P., Palfreyman, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assessing+the+relationship+between+the+dry+rot+fungus+Serpula+lacrymans+and+selected+forms+of+masonry.">Assessing the relationship between the dry rot fungus Serpula lacrymans and selected forms of masonry.</a> Int. Biodeterior. Biodegrad. 46, 141-150 (2000).</li><li>Nicolas, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Volume+I+(One/1)+-+Degradation+and+Protection+of+Wood+(Syracuse+Wood+Science+Series+#5).">Volume I (One/1) - Degradation and Protection of Wood (Syracuse Wood Science Series #5).</a> Wood Deterioration and Its Prevention by Preservative Treatments. , (1973).</li><li>Schilling, J. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Effects+of+calcium-based+materials+and+iron+impurities+on+wood+degradation+by+the+brown+rot+fungus+Serpula+lacrymans.">Effects of calcium-based materials and iron impurities on wood degradation by the brown rot fungus Serpula lacrymans.</a> Holzforschung. 64, 93-99 (2010).</li></ol>

باستخدام لدينا أجار انشاء كتلة (الشكل 1) نمت Serpula lacrymans في اتصال مباشر مع الجبس والسطوح إلى كتل الخشب (الشكل 2) ، مما أدى إلى أكثر من 60 ٪ خسارة الوزن في البني فسدت تحكم كتل الصنوبر (الشكل 3 ). هذا يرضي بسهولة هدف القياسية ASTM تسوس&gt; 50 ٪ ، ومتوسط ​​معامل الاختلاف (C V)</sub...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Petri dishes</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Nunc</td>
<td>4014</td>
<td>25 x 150 mm</td>
</tr>
<tr>
<td>Agar, Type A</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>A4550</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Ammonium nitrate, NH4NO3</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Millinckrodt</td>
<td>3436-12</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Potassium phosphate, KH2PO4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>J.T. Baker</td>
<td>3246-01</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Magnesium sulfate 7-hydrate, MgSO4&bull;7H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>230391</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>D-(+)-Glucose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>G8270</td>
<td>Dextrose</td>
</tr>
<tr>
<td>Boric acid, H3BO4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Mallinckrodt</td>
<td>2549-04</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Zinc sulfate 7-hydrate, ZnSO4&bull;7H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Mallinckrodt</td>
<td>8880-12</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Manganous chloride 4-hydrate, MnCl2&bull;4H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>J.T. Baker</td>
<td>2540-04</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Copper(II) sulfate 5-hydrate, CuSO4&bull;5H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>209198</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Ammonium heptamolybdate 4-hydrate, (NH4)6Mo7O24&bull;4H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma-Aldrich</td>
<td>431346</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Calcium chloride dihydrate, CaCl2&bull;2H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Mallinckrodt</td>
<td>4160-12</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sodium chloride, NaCl</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Mallinckrodt</td>
<td>7581-12</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Ferrous sulfate 7-hydrate, FeSO4&bull;7H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Mallinckrodt</td>
<td>5056-12</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Pipet-aid</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Drummond</td>
<td>4-000-110</td>
<td>Cordless 
EtOH the surface</td>
</tr>
<tr>
<td>10 ml sterile polystyrene pipette</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>BD Biosciences</td>
<td>357551</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Gutter Guard</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Thermwell Products Co.</td>
<td>VX620</td>
<td>Pre-scrubbed with soap 
Hardware store</td>
</tr>
<tr>
<td>Calcium sulfate hemihydrate, CaSO4&bull;0.5H2O</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Acros Organics</td>
<td>385355000</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>#4 cork borer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Boekel</td>
<td>1601</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Parafilm "M"</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Pechiney</td>
<td>PM-996</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

agar-block microcosms for controlled plant tissue decomposition by aerobic fungi

تم تطوير طرق الاساسيان لدراسة التحلل الحيوي للأنسجة النباتات الفطرية lignocellulosic لاختبار المواد الحافظة الخشب (كتلة التربة ؛ أجار كتلة). هل هو جيد أن تقبل التربة ومنع ارتفاع معدلات العائد عوالم مصغرة الاضمحلال ، وقضايا أقل رطوبة ، وخفض التباين بين الدراسات ، وارتفاع عتبات سمية المواد الحافظة. اختبار التربة لبنة وهكذا استخدمت تقنية أكثر وكانت موحدة من قبل الجمعية الأمريكية للاختبارات والمواد (ASTM) (D الأسلوب 1413-1407). تصميم كتلة التربة والسلبيات ، ولكن ، وذلك باستخدام مصادر التربة محليا ومتغير. في الحد من السيطرة على العناصر الغذائية الخارجية (خارجية) إلى الأنسجة المتحللة وقد ظهرت هذه العيوب بوصفها مشكلة في تطبيق هذا الأسلوب لأخرى ، وتهدف الأبحاث شعبية متزايدة. وتشمل هذه الأهداف الحديثة lignocellulosics المهينة للبحوث الطاقة الحيوية ، واختبار المعالجة البيولوجية للمشاركين في استقلاب المواد السامة ، وتقييم آليات الأكسدة ، وتتبع العناصر translocated على طول شبكات خوطي. كتل التربة لا تقرض تحكم بما فيه الكفاية في هذه التطبيقات. A المكرر أجار كتلة النهج هو ضروري. هنا ، فإننا نستخدم بالعفن البني من الخشب والمهينة الفطر Serpula lacrymans للحط من الخشب في أجار كتلة عوالم مصغرة ، وذلك باستخدام أطباق بتري العميق مع منخفضة الكالسيوم آغار. نحن اختبار دور الجبس الخارجية على الاضمحلال في سلسلة من الوقت ، لإثبات فائدة والتباين المتوقع. كتل هي مشروطة من مجلس واحد مزق (قطع طولية) ، وزنه ، تعقيمها ، وقدم جو معقم و مطهر فوق شبكة من البلاستيك. التطعيمات هي فطرية في كل مواجهة الكتلة ، مع إضافة الجبس الخارجية في الواجهات. الحصاد وحتى الحصاد العقيم المدمرة النهائي. وقد صممت هذه عوالم مصغرة لتجنب الاتصال مع كتلة أجار أو جدران صحن بتري. يتم التقليل من خلال التكثيف وخلال لوحة يصب الحضانة. أخيرا ، يتم تصغير قيحة / الجبس / الخشب تباعد ولكن من دون السماح للإتصال به. هذه الجوانب التقنية أقل من أجار كتلة التصميم هي أيضا الأسباب الأكثر شيوعا من الفشل ومصدرا رئيسيا للتقلب بين الدراسات. نشر الفيديو وبالتالي من المفيد في هذه الحالة ، وعلينا أن نظهر التباين المنخفضة والعالية الجودة النتائج.

Watch this Scientific Journal Video about Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi at JoVE.com

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

هذا الفيديو يوضح نهجا بيئة تسيطر عليها لدراسة تحلل الأنسجة النباتية lignocellulosic بواسطة الفطريات الهوائية. القدرة على السيطرة على مصادر المواد الغذائية والرطوبة هي الميزة الرئيسية للأجار كتلة عوالم مصغرة ، ولكن كثيرا ما تؤدي نهج متفاوتة من النجاح. نعالج المزالق الحرجة لمحصول استنساخه ، وانخفاض تقلب النتائج.

آغار بلوك عوالم مصغرة لتحليل الأنسجة النباتية الخاضعة للرقابة من قبل الفطريات الهوائية

The two principal methods for studying fungal biodegradation of lignocellulosic plant tissues were developed for wood preservative testing (soil-block; ...

Research

JoVE Journal

Biology

Measuring Plant Cell Wall Extension (Creep) Induced by Acidic pH and by Alpha-Expansin

Measuring Plant Cell Wall Extension Creep Induced by Acidic pH and by Alpha-Expansin

قياس جدار الخلية النباتية ملحق (زحف) المستحثة بواسطة الرقم الهيدروجيني حمضي والفا Expansin

Growing plant cell walls characteristically exhibit a property known as 'acid growth', by which we mean they are more extensible at low pH (&lt; 5) 1. The ...

Virus-induced Gene Silencing (VIGS) in Nicotiana benthamiana and Tomato

Virus-induced Gene Silencing VIGS in Nicotiana benthamiana and Tomato

فيروس من صنع جين إسكات (VIGS) في نيكوتيانا benthamiana والطماطم

RNA interference (RNAi) is a highly specific gene-silencing phenomenon triggered by dsRNA1. This silencing mechanism uses two major classes of RNA ...

Linking Predation Risk, Herbivore Physiological Stress and Microbial Decomposition of Plant Litter

ربط المخاطر الافتراس، والإجهاد الفسيولوجي آكل النبات والتحلل الميكروبي للنباتات القمامة

The quantity and quality of detritus entering the soil  determines the rate of decomposition by microbial communities as well as  recycle rates of ...

Isolation of Viable Multicellular Glands from Tissue of the Carnivorous Plant, Nepenthes

Isolation of Viable Multicellular Glands from Tissue of the Carnivorous Plant, Nepenthes

Many plants possess specialized structures that are involved in the production and secretion of specific low molecular weight compounds and proteins. ...

In Vivo 4-Dimensional Tracking of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Adult Mouse Calvarial Bone Marrow

In Vivo 4-Dimensional Tracking of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Adult Mouse Calvarial Bone Marrow

في فيفو تتبع 4 الأبعاد للالجذعية المكونة للدم والسلف الكبار في خلايا الفأر قبي نخاع العظم

Through a delicate balance between quiescence and proliferation, self renewal and production of differentiated progeny, hematopoietic stem cells (HSCs) ...

High-throughput CRISPR Vector Construction and Characterization of DNA Modifications by Generation of Tomato Hairy Roots

الإنتاجية العالية كريسبر ناقل البناء وتوصيف التعديلات الحمض النووي عن طريق توليد جذور الطماطم مشعر

Targeted DNA mutations generated by vectors with clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/Cas9 technology have proven useful for ...

Hybrid-Cut: An Improved Sectioning Method for Recalcitrant Plant Tissue Samples

الهجين قطع: طريقة محسنة باجتزاء لعينات الأنسجة النباتية المتمردة

Maintaining plant section integrity is essential for studying detailed anatomical structures at the cellular, tissue, or even organ level. However, some ...

Activating Autophagy by Aerobic Exercise in Mice

تفعيل الالتهام الذاتي من قبل بممارسة الهوائية في الفئران

Autophagy is a lysosomal degradation pathway essential for cell homeostasis, function and differentiation. Under stress conditions, autophagy is induced ...

Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants

الليزر التقاط Microdissection RNA تسلسل لتحليل التعبير الجيني المكاني والزماني محددة في النباتات

The development of a complex multicellular organism is governed by distinct cell types that have different transcriptional profiles. To identify ...

Determination of Tripartite Interaction between Two Monomers of a MADS-box Transcription Factor and a Calcium Sensor Protein by BiFC-FRET-FLIM Assay

تحديد التفاعل الثلاثي بين اثنين من مونومرات من عامل النسخ MADS مربع وبروتين استشعار الكالسيوم من قبل BiFC-FRET-FLIM المقايسة

Protein-protein interactions are an integral part of all biological processes in the cells as they play a crucial role in regulating, maintaining, and ...