Name: an introduction to worm lab: from culturing worms to mutagenesis
Uploaded: 2011-01-11T22:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about An Introduction to Worm Lab: from Culturing Worms to Mutagenesis at JoVE.com

Detta arbete har finansierats av NSF bevilja IOB # 0.615.996.

Del 1: Förbereda rundmasken tillväxt media (NGM) Petri plattor Experimentell nematoder såsom C. elegans och P. pacificus är oftast odlas i laboratorium på 6 cm Petri plattor innehåller Medium Nematode Tillväxt (NGM) 1. Maskar hålls vid 20 ° C, men kan inkuberas vid olika temperaturer (mellan 4 ° C - 25 ° C), beroende på nematoden arter och experimentell design. För att förbereda tallrikar med NGM, standard sterila tekniker måste användas för att f?...

<ol>
	<li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Genetics. 77 (1), 71-71 (1974).</li><li>Anderson, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Methods Cell Biol. 48, 31-31 (1995).</li><li>Yandell, M. D., Edgar, L. G., Wood, W. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 91 (4), 1381-1381 (1994).</li><li>Pires-daSilva, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> WormBook. , 1-1 (2005).</li><li>Kenning, C., Kipping, I., Sommer, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> J. Genesis. 40 (3), 176-176 (2004).</li><li>Sommer, R. J., Carta, L. K., Kim, S. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Fundamental and Applied Nematology. 19 (6), 511-511 (1996).</li><li>Pires-daSilva, A., Sommer, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Genes &#38; development. 18 (10), 1198-1198 (2004).</li><li>Wei, A., Yuan, A., Fawcett, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Nucleic acids research. 30 (20), 110-110 (2002).</li><li>Jorgensen, E. M., Mango, S. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Nat Rev Genet. 3 (5), 356-356 (2002).</li></ol>

Mutagenes är en allmänt används teknik för genetiska studier i olika experimentella modeller organismer. Mutagenes experiment används ofta för att identifiera funktionen av en gen 2. Den mutagenes förfaranden som beskrivs här kan användas inte bara för P. pacificus, men också för C. elegans och andra närbesläktade arter nematoder. Här beskriver vi två metoder, EMS och TMP / UV-mutagenes. EMS är en kemikalie som inducerar punktmutationer eller sm?...

an introduction to worm lab: from culturing worms to mutagenesis

Detta protokoll beskriver förfaranden för att upprätthålla nematoder i laboratoriet och hur man mutagenize dem med två alternativa metoder: etyl metan sulfonat (EMS) och 4, 5 &#39;, 8-trimethylpsoralen kombination med ultraviolett ljus (TMP / UV). Nematoder är kraftfulla biologiska system för genetik studier på grund av deras enkla kropp plan och parning, som består av självbefruktande hermafroditer och hannar som kan generera hundratals avkommor per djur. Nematoder hålls i agarplattor innehållande en gräsmatta av bakterier och kan lätt överföras från en tallrik till en annan med en pick. EMS är ett alkylerande medel används ofta för att framkalla punktmutationer och mindre deletioner, medan TMP / UV främst inducerar strykningar. Beroende på arter av nematoder som används, kommer halterna av EMS och TMP måste optimeras. Att isolera recessiva mutationer i nematoden Pristionchus pacificus var djur av F2-generationen visuellt screenas för fenotyper. För att illustrera dessa metoder, mutagenized vi maskar och letade efter Icke samordnade (UNC), Dumpy (Dpy) och Transformator (TRA) mutanter.

Watch this Scientific Journal Video about An Introduction to Worm Lab: from Culturing Worms to Mutagenesis at JoVE.com

An Introduction to Worm Lab: from Culturing Worms to Mutagenesis

Screening för mutanter med fenotypisk defekter är en enkel metod för att identifiera gener som fungerar i en viss biologisk process. I denna artikel beskriver vi hur kultur fritt levande maskar (t ex<em&gt; Pristionchus pacificus</em&gt;) I laboratoriet och visar två olika mutagenes metoder, EMS och TMP / UV.

En introduktion till Worm Lab: från Odling Worms till Mutagenesis

This protocol describes procedures to maintain nematodes in the laboratory and how to mutagenize them using two alternative methods: ethyl methane ...

Research

JoVE Journal

Biology

Homemade Site Directed Mutagenesis of Whole Plasmids

Homemade Site Riktad mutagenes av Whole Plasmids

Site directed mutagenesis of whole plasmids is a simple way to create slightly different variations of an original plasmid. With this method the cloned ...

Single Oocyte Bisulfite Mutagenesis

Enda oocyt bisulfit Mutagenes

Epigenetics encompasses all heritable and reversible modifications to chromatin that alter gene accessibility, and thus are the primary mechanisms for ...

Regular Care and Maintenance of a Zebrafish (Danio rerio) Laboratory: An Introduction

Regular Care and Maintenance of a Zebrafish Danio rerio Laboratory: An Introduction

Regelbunden skötsel och underhåll av en zebrafisk (<em&gt; Danio rerio</em&gt;) Laboratorium: En introduktion

This protocol describes regular care and maintenance of a zebrafish laboratory. Zebrafish are now gaining popularity in genetics, pharmacological and ...

Introduction to Solid Supported Membrane Based Electrophysiology

Introduktion till Solid stöds membranbaserad Electrophysiology

The electrophysiological method we present is based on a solid supported membrane (SSM) composed of an octadecanethiol layer chemisorbed on a gold coated ...

In vivo Reprogramming of Adult Somatic Cells to Pluripotency by Overexpression of Yamanaka Factors

In vivo Reprogramming of Adult Somatic Cells to Pluripotency by Overexpression of Yamanaka Factors

Induced pluripotent stem (iPS) cells that result from the reprogramming of somatic cells to a pluripotent state by forced expression of defined factors ...

An in vivo Crosslinking Approach to Isolate Protein Complexes From Drosophila Embryos

An in vivo Crosslinking Approach to Isolate Protein Complexes From Drosophila Embryos

Ett In vivo Tvärbindning metod att isolera proteinkomplex från Drosophila Embryon

Many cellular processes are controlled by multisubunit protein complexes. Frequently these complexes form transiently and require native environment to ...

Culturing Caenorhabditis elegans in Axenic Liquid Media and Creation of Transgenic Worms by Microparticle Bombardment

Culturing Caenorhabditis elegans in Axenic Liquid Media and Creation of Transgenic Worms by Microparticle Bombardment

Odling<em&gt; Caenorhabditis elegans</em &gt; I axenisk Liquid Media och Skapande av transgena maskarna från mikropartikelbombardemang

In this protocol, we present the required materials, and the procedure for making modified&#160;C. elegans&#160;Habituation and Reproduction media ...

Using Mouse Mammary Tumor Cells to Teach Core Biology Concepts: A Simple Lab Module

Använda musbrösttumör celler att undervisa Kärn Biologi Concepts: En enkel Lab Modul

Undergraduate biology students are required to learn, understand and apply a variety of cellular and molecular biology concepts and techniques in ...

Measuring Lactase Enzymatic Activity in the Teaching Lab

Mäta laktas enzymatisk aktivitet i undervisningen labbet

Understanding how enzymes work, and relating this to real life examples, is critical to a wide range of undergraduate degrees in the biological and ...

Magnetic-Activated Cell Sorting Strategies to Isolate and Purify Synovial Fluid-Derived Mesenchymal Stem Cells from a Rabbit Model

Magnetisk-aktiverad Cell sortering strategier för att isolera och rena Synovial vätska-Derived mesenkymala stamceller från en kanin-modell

Mesenchymal stem cells (MSCs) are the main cell source for cell-based therapy. MSCs from articular cavity synovial fluid could potentially be used for ...