Name: generation of comprehensive thoracic oncology database - tool for translational research
Uploaded: 2011-01-22T17:15:00
Duration: 11 min 18 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Generation of Comprehensive Thoracic Oncology Database - Tool for Translational Research at JoVE.com

<p class="jove_content"> Dit werk werd ondersteund door NIH subsidie ​​5R01CA100750-07, 5R01CA125541-04, 3R01CA125541-03S1, 5R01CA129501-03, 3R01CA129501-02S1 naar RS </p>

<ol>
	<li>Adamski, J., Finnegan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+Perspectives+on+Microsoft+Office+Access.">New Perspectives on Microsoft Office Access.</a> , (2007).</li><li>Giltnane, J., Rimm, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Technology+Insight:+Identification+of+biomarkers+with+tissue+microarray+technology.">Technology Insight: Identification of biomarkers with tissue microarray technology.</a> <em style='font-style: italic'>Nat Clin Pract Oncol</em>. <b>1</b>, 104-111 (2004).</li></ol>

<table border="1"><tbody><tr><td> <strong>Materiaal Naam</strong> </td><td> <strong>Vennootschap</strong> </td><td> <strong>Catalogus Nummer</strong> </td></tr><tr><td> Centrifuge </td><td> Eppendorf </td><td><br /></td></tr><tr><td> Conische centrifugebuis </td><td> Valk </td><td> 518-PG </td></tr><tr><td> Minimum Essential Medium adelaar (MEM) </td><td> Sigma </td><td> M4655-500ML </td></tr><tr><td> Fetal Calf Serum </td><td> Cellgro FBS HI </td><td> MTT35011CV </td></tr><tr><td> Dimethylsulfoxide (DMSO) </td><td> Amerikaanse Bioanalytical </td><td> AB03091 </td></tr><tr><td> BD Vacutainer Serum Tubes </td><td> Fischer Scientific </td><td> 367815 </td></tr></tbody></table>

generation of comprehensive thoracic oncology database - tool for translational research

<p class="jove_content"> De thoracale oncologie Program Database Project werd opgericht om te dienen als een uitgebreide, geverifieerd, en toegankelijke repository voor goed geannoteerde kanker specimens en klinische gegevens beschikbaar voor onderzoekers binnen de Thoracic Oncology Research Program. Deze databank vangt ook een groot volume van genomics en proteomics data verkregen uit verschillende studies tumorweefsel. Een team van klinische en fundamentele wetenschap onderzoekers, een biostatisticus, en een bio-informatica expert was bijeengeroepen om het database-ontwerp. Variabelen belang zijn duidelijk omschreven en hun beschrijvingen werden geschreven in een standaard handleiding om de consistentie van de gegevens annotatie te verzekeren. Met behulp van een protocol voor aspirant-weefsel bank-en een ander protocol voor retrospectieve bank-, tumor-en normaal weefsel monsters van patiënten ingestemd met deze protocollen werden verzameld. Klinische informatie, zoals demografie, kanker karakterisering, en de behandeling plannen voor deze patiënten werden geabstraheerd en ingevoerd in een Access-database. Proteomics en genomische gegevens zijn opgenomen in de database en zijn gekoppeld aan klinische informatie voor patiënten beschreven in de database. De gegevens van elke tabel zijn gekoppeld met behulp van de relaties functie in Microsoft Access, zodat de database manager voor klinische en laboratorium gegevens verbinden met een query. De opgevraagde gegevens kunnen vervolgens worden geëxporteerd voor statistische analyse en hypothese generatie. </p>

Watch this Scientific Journal Video about Generation of Comprehensive Thoracic Oncology Database - Tool for Translational Research at JoVE.com

Generation of Comprehensive Thoracic Oncology Database - Tool for Translational Research

<p class="jove_content">Een thoracale oncologie databank werd ontwikkeld om te dienen als een algemene bewaarplaats voor klinische en laboratorium gegevens ten behoeve van translationeel onderzoek. De database zal dienen translationeel kankeronderzoek onderzoekers binnen de Thoracic Oncology Research Program. Deze database is aan te passen aan andere kanker modellen, evenals andere ziekten bij de mens.</p>

Generatie van Integrale Thoracale Oncologie Database - Tool voor Translationeel Onderzoek

The Thoracic Oncology Program Database Project was created to serve as a comprehensive, verified, and accessible repository for well-annotated cancer ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Bronchoalveolar Lavage (BAL) for Research; Obtaining Adequate Sample Yield

Bronchoalveolar Lavage BAL for Research; Obtaining Adequate Sample Yield

Bronchoalveolaire Lavage (BAL) voor onderzoek; verkrijgen adequaat monster Yield

We describe a research technique for fiberoptic bronchoscopy with bronchoalveolar lavage (BAL) using manual hand held suction in order to remove ...

Time-lapse Imaging of Primary Preneoplastic Mammary Epithelial Cells Derived from Genetically Engineered Mouse Models of Breast Cancer

Time-lapse imaging of Primary preneoplastische uier epitheelcellen afkomstig van de genetisch gemanipuleerde muis modellen van borstkanker

Time-lapse  imaging can be used to compare behavior of cultured primary preneoplastic  mammary epithelial cells derived from different genetically ...

A Modified Heterotopic Swine Hind Limb Transplant Model for Translational Vascularized Composite Allotransplantation (VCA) Research

A Modified Heterotopic Swine Hind Limb Transplant Model for Translational Vascularized Composite Allotransplantation VCA Research

Een Gemodificeerde Heterotope Varkens Hind Limb Transplant Model for Translational Gevasculariseerd Composite allotransplantatie (VCA) Onderzoek

Vascularized Composite Allotransplantation (VCA) such as hand and face transplants represent a viable treatment option for complex musculoskeletal trauma ...

Three Dimensional Cultures: A Tool To Study Normal Acinar Architecture vs. Malignant Transformation Of Breast Cells

Drie dimensionaal culturen: Een hulpmiddel om te studeren Normaal Acinaire Architectuur versus maligne transformatie van cellen borst

Invasive breast carcinomas are a group of malignant epithelial tumors characterized by the invasion of adjacent tissues and propensity to metastasize. The ...

Working with Human Tissues for Translational Cancer Research

Werken met menselijke weefsels for Translational Cancer Research

Medical research for human benefit is greatly impeded by the necessity for human tissues and subjects. However, upon obtaining consent for human ...

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC) Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer NSCLC Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomaal miRNA analyse in niet-kleincellige longkanker (NSCLC) patiënten Plasma Through qPCR: een haalbare Liquid biopsie Tool

The discovery of alterations in the EGFR and ALK genes, amongst others, in NSCLC has driven the development of targeted-drug therapy using selective ...

Development of a Direct Pulp-capping Model for the Evaluation of Pulpal Wound Healing and Reparative Dentin Formation in Mice

Ontwikkeling van een Direct-Pulp aftopping model voor de evaluatie van pulpal wondgenezing en Reparative Dentin Formation in Muizen

Dental pulp is a vital organ of a tooth fully protected by enamel and dentin. When the pulp is exposed due to cariogenic or iatrogenic injuries, it is ...

Neonatal Murine Cochlear Explant Technique as an <em>In Vitro</em> Screening Tool in Hearing Research

Neonatal Murine Cochlear Explant Technique as an In Vitro Screening Tool in Hearing Research

Neonatale Murine Cochlear Explantietechniek als een<em&gt; In Vitro</em&gt; Screening Tool in Hearing Research

While there have been remarkable advances in hearing research over the past few decades, there is still no cure for Sensorineural Hearing Loss (SNHL), a ...

Second Harmonic Generation Signals in Rabbit Sclera As a Tool for Evaluation of Therapeutic Tissue Cross-linking (TXL) for Myopia

Second Harmonic Generation Signals in Rabbit Sclera As a Tool for Evaluation of Therapeutic Tissue Cross-linking TXL for Myopia

Tweede harmonische generatie signalen in konijn Sclera als een instrument voor de beoordeling van de therapeutische weefsel dwarsbinding (TXL) voor bijziendheid

Methods to strengthen tissue by introducing chemical bonds (non-enzymatic cross-linking) into structural proteins (fibrillar collagens) for therapy ...

Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures (3D-LTCs) for Disease Modeling

Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures 3D-LTCs for Disease Modeling

Generatie van menselijke 3D longweefsel culturen (3D-LTCs) voor ziekte modelleren

Translation of novel discoveries to human disease is limited by the availability of human tissue-based models of disease. Precision-cut lung slices (PCLS) ...