Name: generation of comprehensive thoracic oncology database - tool for translational research
Uploaded: 2011-01-22T17:15:00
Duration: 11 min 18 s
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<p class="jove_content"> Ce travail a été soutenu par des subventions du NIH 5R01CA100750-07, 5R01CA125541-04, 3R01CA125541-03S1, 5R01CA129501-03, 3R01CA129501-02S1 à RS </p>

<ol>
	<li>Adamski, J., Finnegan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+Perspectives+on+Microsoft+Office+Access.">New Perspectives on Microsoft Office Access.</a> , (2007).</li><li>Giltnane, J., Rimm, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Technology+Insight:+Identification+of+biomarkers+with+tissue+microarray+technology.">Technology Insight: Identification of biomarkers with tissue microarray technology.</a> <em style='font-style: italic'>Nat Clin Pract Oncol</em>. <b>1</b>, 104-111 (2004).</li></ol>

<table border="1"><tbody><tr><td> <strong>Nom du produit</strong> </td><td> <strong>Société</strong> </td><td> <strong>Numéro de catalogue</strong> </td></tr><tr><td> Centrifugeuse </td><td> Eppendorf </td><td><br /></td></tr><tr><td> Tube à centrifuger conique </td><td> Falcon </td><td> 518-PG </td></tr><tr><td> Milieu essentiel minimum Eagle (MEM) </td><td> Sigma </td><td> M4655-500ML </td></tr><tr><td> Sérum de veau foetal </td><td> FBS Cellgro HI </td><td> MTT35011CV </td></tr><tr><td> Diméthylsulfoxyde (DMSO) </td><td> Américaine bioanalytiques </td><td> AB03091 </td></tr><tr><td> Tubes BD Vacutainer Sérum </td><td> Fischer Scientific </td><td> 367815 </td></tr></tbody></table>

generation of comprehensive thoracic oncology database - tool for translational research

<p class="jove_content"> Le projet de programme de base de données oncologie thoracique a été créé pour servir une approche globale, référentiel vérifiée et accessible pour les spécimens de cancer bien annotée et des données cliniques à la disposition des chercheurs au sein du Programme de recherche en oncologie thoracique. Cette base de données capture également un grand volume de données génomiques et protéomiques obtenus à partir de diverses études tissu tumoral. Une équipe de chercheurs en sciences cliniques et fondamentales, un biostatisticien, et un expert a été convoqué en bioinformatique à la conception de la base de données. Les variables d&#39;intérêt ont été clairement définies et leurs descriptions ont été écrites dans un manuel d&#39;exploitation standard pour assurer la cohérence de l&#39;annotation des données. En utilisant un protocole de banques de tissus potentiels et un autre protocole pour les services bancaires rétrospective, la tumeur et les échantillons de tissus provenant de patients normaux consenti à ces protocoles ont été collectés. Informations cliniques tels que la démographie, la caractérisation du cancer et des plans de traitement pour ces patients ont été extraites et sont entrés dans une base de données Access. Données protéomiques et génomiques ont été inclus dans la base de données et ont été liés à l&#39;information clinique pour les patients décrits dans la base de données. Les données de chaque table ont été liés en utilisant la fonction des relations dans Microsoft Access pour permettre au gestionnaire de bases de données pour connecter des informations cliniques et de laboratoire lors d&#39;une requête. Les données interrogées peuvent ensuite être exportés pour une analyse statistique et de génération d&#39;hypothèses. </p>

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Generation of Comprehensive Thoracic Oncology Database - Tool for Translational Research

<p class="jove_content">Une base de données oncologie thoracique a été développé pour servir de référentiel exhaustif de données cliniques et de laboratoire aux fins de la recherche translationnelle. La base de données servira aux chercheurs translationnelle sur le cancer au sein du Programme de recherche en oncologie thoracique. Cette base est adaptable à d&#39;autres modèles de cancer, ainsi que d&#39;autres maladies humaines.</p>

Génération de base de données complète en oncologie thoracique - Outil de recherche translationnelle

The Thoracic Oncology Program Database Project was created to serve as a comprehensive, verified, and accessible repository for well-annotated cancer ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Bronchoalveolar Lavage (BAL) for Research; Obtaining Adequate Sample Yield

Bronchoalveolar Lavage BAL for Research; Obtaining Adequate Sample Yield

Lavage broncho-alvéolaire (LBA) pour la recherche; obtention adéquate rendement de l&#39;échantillon

We describe a research technique for fiberoptic bronchoscopy with bronchoalveolar lavage (BAL) using manual hand held suction in order to remove ...

Recherche

Médecine

Time-lapse Imaging of Primary Preneoplastic Mammary Epithelial Cells Derived from Genetically Engineered Mouse Models of Breast Cancer

Imagerie time-lapse de primaires prénéoplasiques cellules épithéliales mammaires issues de modèles de souris génétiquement modifiées de cancer du sein

Time-lapse  imaging can be used to compare behavior of cultured primary preneoplastic  mammary epithelial cells derived from different genetically ...

A Modified Heterotopic Swine Hind Limb Transplant Model for Translational Vascularized Composite Allotransplantation (VCA) Research

A Modified Heterotopic Swine Hind Limb Transplant Model for Translational Vascularized Composite Allotransplantation VCA Research

Un Heterotopic porcine Hind Membre Transplant modèle modifié translationnelle vascularisé composite Allotransplantation (VCA) de recherche

Vascularized Composite Allotransplantation (VCA) such as hand and face transplants represent a viable treatment option for complex musculoskeletal trauma ...

Three Dimensional Cultures: A Tool To Study Normal Acinar Architecture vs. Malignant Transformation Of Breast Cells

Trois Cultures dimensionnelles: un outil pour étudier l&#39;architecture normale Acinaire vs transformation maligne des cellules mammaires

Invasive breast carcinomas are a group of malignant epithelial tumors characterized by the invasion of adjacent tissues and propensity to metastasize. The ...

Working with Human Tissues for Translational Cancer Research

Travailler avec les tissus humains pour la recherche translationnelle sur le cancer

Medical research for human benefit is greatly impeded by the necessity for human tissues and subjects. However, upon obtaining consent for human ...

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC) Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer NSCLC Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomal miRNA Analyse en non-small cell lung cancer (NSCLC) Plasma de patients Par qPCR: A Faisable Liquid Biopsie outil

The discovery of alterations in the EGFR and ALK genes, amongst others, in NSCLC has driven the development of targeted-drug therapy using selective ...

Development of a Direct Pulp-capping Model for the Evaluation of Pulpal Wound Healing and Reparative Dentin Formation in Mice

Élaboration d&#39;un modèle de coiffage pulpaire direct pour l&#39;évaluation des pulpaire Wound Healing et Formation reconstructrice Dentin chez la souris

Dental pulp is a vital organ of a tooth fully protected by enamel and dentin. When the pulp is exposed due to cariogenic or iatrogenic injuries, it is ...

Neonatal Murine Cochlear Explant Technique as an <em>In Vitro</em> Screening Tool in Hearing Research

Neonatal Murine Cochlear Explant Technique as an In Vitro Screening Tool in Hearing Research

Technique explosive cochléaire murine néonatale en tant que<em&gt; In Vitro</em&gt; Outil de dépistage dans la recherche auditive

While there have been remarkable advances in hearing research over the past few decades, there is still no cure for Sensorineural Hearing Loss (SNHL), a ...

Second Harmonic Generation Signals in Rabbit Sclera As a Tool for Evaluation of Therapeutic Tissue Cross-linking (TXL) for Myopia

Second Harmonic Generation Signals in Rabbit Sclera As a Tool for Evaluation of Therapeutic Tissue Cross-linking TXL for Myopia

Deuxième génération d’harmoniques signaux dans la sclérotique de lapin comme un outil pour l’évaluation des thérapeutiques tissulaires réticulation (TXL) pour la myopie

Methods to strengthen tissue by introducing chemical bonds (non-enzymatic cross-linking) into structural proteins (fibrillar collagens) for therapy ...

Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures (3D-LTCs) for Disease Modeling

Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures 3D-LTCs for Disease Modeling

Génération de Cultures de tissus pulmonaires humains de 3D (3D-SFLC) pour la modélisation de la maladie

Translation of novel discoveries to human disease is limited by the availability of human tissue-based models of disease. Precision-cut lung slices (PCLS) ...