Name: generation of comprehensive thoracic oncology database - tool for translational research
Uploaded: 2011-01-22T17:15:00
Duration: 11 min 18 s
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<p class="jove_content"> Diese Arbeit wurde vom NIH gewährt 5R01CA100750-07, 5R01CA125541-04, 3R01CA125541-03S1, 5R01CA129501-03, 3R01CA129501-02S1 zu RS unterstützt </p>

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	<li>Adamski, J., Finnegan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+Perspectives+on+Microsoft+Office+Access.">New Perspectives on Microsoft Office Access.</a> , (2007).</li><li>Giltnane, J., Rimm, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Technology+Insight:+Identification+of+biomarkers+with+tissue+microarray+technology.">Technology Insight: Identification of biomarkers with tissue microarray technology.</a> <em style='font-style: italic'>Nat Clin Pract Oncol</em>. <b>1</b>, 104-111 (2004).</li></ol>

<table border="1"><tbody><tr><td> <strong>Material Name</strong> </td><td> <strong>Firma</strong> </td><td> <strong>Katalog-Nummer</strong> </td></tr><tr><td> Zentrifuge </td><td> Eppendorf </td><td><br /></td></tr><tr><td> Konische Zentrifugenröhrchen </td><td> Falke </td><td> 518-PG </td></tr><tr><td> Minimum Essential Medium Eagle (MEM) </td><td> Sigma </td><td> M4655-500ML </td></tr><tr><td> Fetal Calf Serum </td><td> CellGro FBS HALLO </td><td> MTT35011CV </td></tr><tr><td> Dimethylsulfoxid (DMSO) </td><td> Amerikanischen Bioanalytische </td><td> AB03091 </td></tr><tr><td> BD Vacutainer Serumröhrchen </td><td> Fischer Scientific </td><td> 367815 </td></tr></tbody></table>

generation of comprehensive thoracic oncology database - tool for translational research

<p class="jove_content"> Das Thoracic Oncology Program Database Project wurde geschaffen, um ein umfassendes, verifiziert und zugänglich Repository für gut kommentierten Krebs Proben und klinischen Daten zur Verfügung zu stehen Forschern innerhalb der Thoracic Oncology Research Program dienen. Diese Datenbank erfasst auch eine große Menge von Genom-und Proteom-Daten aus verschiedenen Tumorgewebe Studien erhalten. Ein Team von klinischen und wissenschaftlichen Forschern, ein Biostatistiker, und ein Bioinformatik-Experte wurde einberufen, um die Datenbank-Design. Variablen von Interesse waren klar definiert und ihre Beschreibungen wurden in einem Standard-Betriebsanleitung geschrieben, um die Konsistenz der Daten-Annotation zu gewährleisten. Mit einem Protokoll für angehende Gewebe Banking und ein anderes Protokoll für die retrospektive Banking, Tumor-und Normalgewebe von Patienten zugestimmt, diese Protokolle gesammelt wurden. Klinische Daten wie Demographie, Krebs Charakterisierung und Behandlung Pläne für diese Patienten wurden abstrahiert und in eine Access-Datenbank. Proteomik und Genomik Daten in die Datenbank aufgenommen und haben zu klinischen Informationen für Patienten in der Datenbank beschrieben in Verbindung gebracht worden. Die Daten aus den einzelnen Tabellen verknüpft wurden unter Verwendung der Beziehungen Funktion in Microsoft Access, damit die Datenbank-Manager zu klinischen Informationen während einer Abfrage verbinden. Die abgefragten Daten können dann für statistische Analysen und Hypothesen Generation exportiert werden. </p>

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Generation of Comprehensive Thoracic Oncology Database - Tool for Translational Research

<p class="jove_content">Eine Brust-Onkologie-Datenbank wurde entwickelt, um als eine umfassende Quelle für klinische Daten und Laborwerte für die Zwecke der translationalen Forschung dienen. Die Datenbank wird translationalen Krebsforschung in der Thoracic Oncology Research Program dienen. Diese Datenbank ist anpassungsfähig zu anderen Krebs-Modelle, sowie andere Erkrankungen des Menschen.</p>

Generation umfassender Thoracic Oncology Database - Tool für Translational Research

The Thoracic Oncology Program Database Project was created to serve as a comprehensive, verified, and accessible repository for well-annotated cancer ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Bronchoalveolar Lavage (BAL) for Research; Obtaining Adequate Sample Yield

Bronchoalveolar Lavage BAL for Research; Obtaining Adequate Sample Yield

Bronchoalveoläre Lavage (BAL) für Forschung, Beschaffung angemessene Probenausbeute

We describe a research technique for fiberoptic bronchoscopy with bronchoalveolar lavage (BAL) using manual hand held suction in order to remove ...

Forschung

Medizin

Time-lapse Imaging of Primary Preneoplastic Mammary Epithelial Cells Derived from Genetically Engineered Mouse Models of Breast Cancer

Zeitraffer-Imaging of Primary Präkanzeröse Brustepithelzellen aus gentechnisch veränderten Mausmodellen der Breast Cancer Abgeleitet

Time-lapse  imaging can be used to compare behavior of cultured primary preneoplastic  mammary epithelial cells derived from different genetically ...

A Modified Heterotopic Swine Hind Limb Transplant Model for Translational Vascularized Composite Allotransplantation (VCA) Research

A Modified Heterotopic Swine Hind Limb Transplant Model for Translational Vascularized Composite Allotransplantation VCA Research

Eine modifizierte Heterotope Schweine Hind Gliedmaßen-Transplantation Modell für Translationale Vaskularisierte Composite-Allotransplantation (VCA) Forschung

Vascularized Composite Allotransplantation (VCA) such as hand and face transplants represent a viable treatment option for complex musculoskeletal trauma ...

Three Dimensional Cultures: A Tool To Study Normal Acinar Architecture vs. Malignant Transformation Of Breast Cells

Dreidimensional Kulturen: Ein Werkzeug, um Architektur zu studieren Normale acinar gegen maligne Transformation von Brustzellen

Invasive breast carcinomas are a group of malignant epithelial tumors characterized by the invasion of adjacent tissues and propensity to metastasize. The ...

Working with Human Tissues for Translational Cancer Research

Arbeiten mit menschlichen Geweben für Translationale Krebsforschung

Medical research for human benefit is greatly impeded by the necessity for human tissues and subjects. However, upon obtaining consent for human ...

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC) Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomal miRNA Analysis in Non-small Cell Lung Cancer NSCLC Patients' Plasma Through qPCR: A Feasible Liquid Biopsy Tool

Exosomalen miRNA-Analyse in nicht-kleinzelligem Lungenkrebs (NSCLC) der Patienten Plasma durch qPCR: ein gangbarer Flüssiges Biopsy-Tool

The discovery of alterations in the EGFR and ALK genes, amongst others, in NSCLC has driven the development of targeted-drug therapy using selective ...

Development of a Direct Pulp-capping Model for the Evaluation of Pulpal Wound Healing and Reparative Dentin Formation in Mice

Entwicklung eines Direkt Pulp-Kappungsmodell für die Beurteilung von Pulpal Wundheilung und Reparative Dentinbildung bei Mäusen

Dental pulp is a vital organ of a tooth fully protected by enamel and dentin. When the pulp is exposed due to cariogenic or iatrogenic injuries, it is ...

Neonatal Murine Cochlear Explant Technique as an <em>In Vitro</em> Screening Tool in Hearing Research

Neonatal Murine Cochlear Explant Technique as an In Vitro Screening Tool in Hearing Research

Neonatal Murine Cochlear Explant Technik als<em&gt; In vitro</em&gt; Screening-Tool in der Hörforschung

While there have been remarkable advances in hearing research over the past few decades, there is still no cure for Sensorineural Hearing Loss (SNHL), a ...

Second Harmonic Generation Signals in Rabbit Sclera As a Tool for Evaluation of Therapeutic Tissue Cross-linking (TXL) for Myopia

Second Harmonic Generation Signals in Rabbit Sclera As a Tool for Evaluation of Therapeutic Tissue Cross-linking TXL for Myopia

Zweite harmonische Generation Signale in Kaninchen Sklera als Instrument für die Bewertung des therapeutischen Gewebes Vernetzung (TXL) für Kurzsichtigkeit

Methods to strengthen tissue by introducing chemical bonds (non-enzymatic cross-linking) into structural proteins (fibrillar collagens) for therapy ...

Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures (3D-LTCs) for Disease Modeling

Generation of Human 3D Lung Tissue Cultures 3D-LTCs for Disease Modeling

Generation von menschlichen 3D Lungengewebe Kulturen (3D-LTCs) für Krankheit Modellierung

Translation of novel discoveries to human disease is limited by the availability of human tissue-based models of disease. Precision-cut lung slices (PCLS) ...