Name: microtiter dish biofilm formation assay
Uploaded: 2011-01-30T18:00:00
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Mi agradecimiento a Sherry Kuchma, Pete Newell y Robert Shanks para ofrecer las imágenes en la Figura 1. Este trabajo fue apoyado por el NIH subvención R01AI083256 de la GAO

1. El crecimiento de un biofilm <ol><li> Cultivar una cultura de la de tipo salvaje aeruginosa Pseudomonas o cepa mutante durante la noche en un medio rico (LB es decir) </li><li> Diluir el 1:100 noche sobre la cultura en un nuevo medio para los ensayos de biofilm. Un biofilm estándar medio de cultivo de P. aeruginosa es M63 medio mínimo suplementado con sulfato de magnesio, la glucosa y los ácidos casamino (véase el cuadro). Como un biofilm, la promoción de alternativas de medio que estimula el...

<ol>
	<li>O'Toole, G. A., Kolter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Initiation+of+biofilm+formation+in+Pseudomonas+fluorescens+WCS365+proceeds+via+multiple,+convergent+signalling+pathways:+a+genetic+analysis.">Initiation of biofilm formation in Pseudomonas fluorescens WCS365 proceeds via multiple, convergent signalling pathways: a genetic analysis.</a> Mol. Microbiol. 28, 449-461 (1998).</li><li>O'Toole, G. A., Doyle, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Methods in Enzymology. , 91-109 (1999).</li><li>Mah, T. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+genetic+basis+for+Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+antibiotic+resistance.">A genetic basis for Pseudomonas aeruginosa biofilm antibiotic resistance.</a> Nature. 426, 306-310 (2003).</li><li>Kuchma, S. L., Connolly, J. P., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+three-component+regulatory+system+regulates+biofilm+maturation+and+type+III+secretion+in+Pseudomonas+aeruginosa.">A three-component regulatory system regulates biofilm maturation and type III secretion in Pseudomonas aeruginosa.</a> J Bacteriol. 187, 1441-1454 (2005).</li><li>Caiazza, N. C., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SadB+is+required+for+the+transition+from+reversible+to+irreversible+attachment+during+biofilm+formation+by+Pseudomonas+aeruginosa+PA14.">SadB is required for the transition from reversible to irreversible attachment during biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa PA14.</a> J Bacteriol. 186, 4476-4485 (2004).</li><li>Shanks, R. M., Sargent, J. L., Martinez, R. M., Graber, M. L., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Catheter+lock+solutions+influence+staphylococcal+biofilm+formation+on+abiotic+surfaces.">Catheter lock solutions influence staphylococcal biofilm formation on abiotic surfaces.</a> Nephrol Dial Transplant. 21, 2247-2255 (2006).</li><li>Caiazza, N. C., Merritt, J. H., Brothers, K. M., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Inverse+regulation+of+biofilm+formation+and+swarming+motility+by+Pseudomonas+aeruginosa+PA14.">Inverse regulation of biofilm formation and swarming motility by Pseudomonas aeruginosa PA14.</a> J. Bacteriol. 189, 3603-3612 (2007).</li><li>Hinsa, S. M., Espinosa-Urgel, M., Ramos, J. L., O'Toole, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transition+from+reversible+to+irreversible+attachment+during+biofilm+formation+by+Pseudomonas+fluorescens+WCS365+requires+an+ABC+transporter+and+a+large+secreted+protein.">Transition from reversible to irreversible attachment during biofilm formation by Pseudomonas fluorescens WCS365 requires an ABC transporter and a large secreted protein.</a> Mol Microbiol. 49, 905-918 (2003).</li><li>Mack, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Characterization+of+transposon+mutants+of+biofilm-producing+Staphylococcus+epidermidis+impaired+in+the+accumulative+phase+of+biofilm+production:+genetic+identification+of+a+hexosamine-containing+polysaccharide+intracellular+adhesin.">Characterization of transposon mutants of biofilm-producing Staphylococcus epidermidis impaired in the accumulative phase of biofilm production: genetic identification of a hexosamine-containing polysaccharide intracellular adhesin.</a> Infect. Immun. 62, 3244-3253 (1994).</li><li>Vidal, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+an+Escherichia+coli+K-12+mutant+strain+able+to+form+biofilms+on+inert+surfaces:+involvement+of+a+new+ompR+allele+that+increases+curli+expression.">Isolation of an Escherichia coli K-12 mutant strain able to form biofilms on inert surfaces: involvement of a new ompR allele that increases curli expression.</a> J. Bacteriol. 180, 2442-2449 (1998).</li><li>Junker, L. M., Clardy, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+screens+for+small-molecule+inhibitors+of+Pseudomonas+aeruginosa+biofilm+development.">High-throughput screens for small-molecule inhibitors of Pseudomonas aeruginosa biofilm development.</a> Antimicrob Agents Chemother. 51, 3582-3590 (2007).</li></ol>

Este método puede ser modificado para su uso con una amplia variedad de especies microbianas. Microbios móviles suelen adherirse a las paredes y / o en el fondo de los pozos, mientras que los no-móviles microbios normalmente se adhieren al fondo de los pozos. Las condiciones óptimas para la formación de biofilm (es decir, el medio de cultivo, temperatura, tiempo de incubación) debe ser determinada empíricamente para cada microbio. Recomiendo la realización de múltiples repeticiones para cada cepa o condición (...

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		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>1 X M63</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Prepare as a 5X M63 stock by dissolving 15g KH2PO4, 35g K2HPO4 and 10g (NH4)2SO4 in 1 L of water. This stock does not need to be autoclaved and can be stored at room temperature. Dilute 5X stock 1:5, autoclave, cool, then add the desired components.</td>
</tr>
<tr>
<td>KH2PO4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher</td>
<td>P285-500</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>K2HPO4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher</td>
<td>P288-500</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>(NH4)2SO4</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>A5132</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Magnesium sulfate</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher</td>
<td>M63-500</td>
<td>Add to 1 mM final concentration. Prepare as a 1 M stock in water and autoclave.</td>
</tr>
<tr>
<td>Glucose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher</td>
<td>D16-3</td>
<td>Add to 0.2% final concentration. Prepare as a 20% stock in water and autoclave.</td>
</tr>
<tr>
<td>Casamino acids</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Beckton-Dickinson</td>
<td>223050</td>
<td>Add to 0.5% final concentration. Prepare as a 20% stock in water and autoclave.</td>
</tr>
<tr>
<td>Arginine</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>A5131</td>
<td>Add to 0.4% final concentration. Prepare as a 20% stock in water and filter sterilize. This alternative carbon/energy source can replace glucose and casamino acids</td>
</tr>
<tr>
<td>Microtiter plates</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Beckton-Dickinson</td>
<td>353911</td>
<td>Falcon 3911, Microtest III, Flexible assay plates, 96 well, U-bottom, non-sterile, non-tissue-culture treated.</td>
</tr>
<tr>
<td>Microtiter plate lids</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Beckton-Dickinson</td>
<td>353913</td>
<td>The lids can be reused by cleaning with 95% ethanol in water.</td>
</tr>
<tr>
<td>Crystal violet</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>229641000</td>
<td>Prepare as a 0.1% solution in water.</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

microtiter dish biofilm formation assay

Los biofilms son comunidades de microorganismos adheridos a las superficies, que se puede encontrar en los centros médicos, industriales y naturales. De hecho, la vida en una biopelícula probablemente representa el modo predominante de crecimiento de los microbios en la mayoría de entornos. Biofilms maduros tienen algunas características distintas. Microbios biofilm son típicamente rodeados por una matriz extracelular que proporciona la estructura y la protección a la comunidad. Los microbios que crecen en un biofilm también tienen una arquitectura característica generalmente compuesto por macrocolonies (que contiene miles de células), rodeada de canales llenos de líquido. Biofilm crecido microbios también son conocidos por su resistencia a una amplia gama de agentes antimicrobianos, como los antibióticos clínicamente relevantes. El ensayo de placa de microtitulación es una herramienta importante para el estudio de las primeras etapas de formación del biofilm, y se ha aplicado principalmente para el estudio de las biopelículas bacterianas, aunque este ensayo también se ha utilizado para estudiar la formación de biopelículas fúngicas. Debido a que esta prueba se utiliza estática, el crecimiento de lotes condiciones, que no permite la formación de las biopelículas maduras típicamente asociados con los sistemas de celda de flujo. Sin embargo, el ensayo ha sido eficaz en la identificación de muchos factores necesarios para el inicio de la formación del biofilm (es decir, los flagelos, pili, adhesinas, enzimas que participan en cíclica-di-GMP vinculante y el metabolismo) y así como los genes implicados en la producción de polisacáridos extracelulares. Además, los trabajos publicados indican que los biofilms cultivadas en placas de microtitulación se desarrollan algunas de las propiedades de los biofilms maduros, con una tolerancia de antibióticos y la resistencia a los efectores del sistema inmune. Este ensayo de microtitulación plato sencillo permite la formación de un biofilm en la pared y / o fondo de un plato de microtitulación. La naturaleza de alto rendimiento de la prueba lo hace útil para las pantallas de genética, así como la formación de biofilm por pruebas de múltiples cepas en condiciones de crecimiento diferentes. Las variantes de este ensayo se han utilizado para evaluar la formación de biofilm principios para una amplia variedad de microbios, incluyendo pero no limitado a, Pseudomonas, Vibrio cholerae, Escherichia coli, staphylocci, enterococos, micobacterias y hongos. En el protocolo descrito aquí, nos centraremos en el uso de este ensayo para estudiar la formación de biofilm por el organismo Pseudomonas aeruginosa modelo. En este ensayo, la extensión de la formación de biopelículas se mide utilizando el colorante cristal violeta (CV). Sin embargo, una serie de manchas de colorimetría y metabólicas se han reportado para la cuantificación de la formación de biopelículas utilizando el ensayo de placa de microtitulación. La facilidad, bajo coste y la flexibilidad del ensayo de placa de microtitulación se ha convertido en una herramienta fundamental para el estudio de las biopelículas.

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Microtiter Dish Biofilm Formation Assay

El ensayo describe un método rápido para medir la formación de biopelículas a principios de bacterias y hongos. Este método utiliza una placa de microtitulación como sustrato para la formación de biopelículas microbianas, y el biofilm se visualiza utilizando la cepa de cristal violeta. El ensayo ofrece ya sea un ensayo cualitativo o cuantitativo de la formación de biofilm temprano.

Plato de microtitulación de formación de biopelículas de ensayo

Biofilms are communities of microbes attached to surfaces, which can be found in medical, industrial and natural settings.  In fact, life in a biofilm ...

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