Name: computer-assisted large-scale visualization and quantification of pancreatic islet mass, size distribution and architecture
Uploaded: 2011-03-04T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Computer-assisted Large-scale Visualization and Quantification of Pancreatic Islet Mass, Size Distribution and Architecture at JoVE.com

<p class="jove_content" style=";text-align:right;direction:rtl"> وتدعم هذه الدراسة من قبل الولايات المتحدة الصحة العامة خدمة المنح DK - 081527 ، 072473 وDK DK - 20595 لجامعة شيكاغو ومركز أبحاث السكري التدريب (الحيوان النماذج الأساسية) ، وهبة من مؤسسة أسرة Kovler. </p>

<p class="jove_title" style=";text-align:right;direction:rtl"> 1. خلق شرائح الظاهري من صور Immunohistochemically الملون </p><ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> فتح StereoInvestigator. ضع الشريحة النظيفة عقد العينة في حامل المجهر وذلك في تصور الباحث ستيريو بالنقر على &quot;شراء&quot; ثم &quot;صورة لايف&quot; (اقتناء → الصورة الحية). تحديد مستويات الت?...

<ol>
	<li>Steiner, D. J., Kim, A., Miller, K., Hara, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pancreatic+islet+plasticity+-+Interspecies+comparison+of+islet+architecture+and+composition.">Pancreatic islet plasticity - Interspecies comparison of islet architecture and composition.</a> <em style='font-style: italic'>ISLETS</em>. <b>2</b>, 135-145 (2010).</li><li>Kim, A., Miller, K., Jo, J., Wojcik, P. l., Kilimnik, G., Hara, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Islet+architecture+-+a+comparative+study.">Islet architecture - a comparative study.</a> <em style='font-style: italic'>ISLETS</em>. <b>1</b>, 129-136 (2009).</li><li>Kilimnik, G., Kim, A., Jo, J., Miller, K., Hara, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantification+of+pancreatic+islet+distribution+in+situ+in+mice.">Quantification of pancreatic islet distribution in situ in mice.</a> <em style='font-style: italic'>Am J Physiol Endocrinol Metab</em>. <b>297</b>, E1331-E1338 (2009).</li><li>Hara, M., Dizon, R. F., Glick, B. S., Lee, C. S., Kaestner, K. H., Piston, D. W., Bindokas, V. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+pancreatic+beta-cells+in+the+intact+pancreas.">Imaging pancreatic beta-cells in the intact pancreas.</a> <em style='font-style: italic'>Am J Physiol Endocrinol Metab</em>. <b>290</b>, E1041-E1047 (2006).</li><li>Hara, M., Wang, X., Kawamura, T., Bindokas, V. P., Dizon, R. F., Alcoser, S. Y., Magnuson, M. A., Bell, G. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Transgenic+mice+with+green+fluorescent+protein-labeled+pancreatic+beta+-cells.">Transgenic mice with green fluorescent protein-labeled pancreatic beta -cells.</a> <em style='font-style: italic'>Am J Physiol Endocrinol Metab</em>. <b>284</b>, E177-E183 (2003).</li></ol>

<p class="jove_content" style=";text-align:right;direction:rtl"> قدم بمساعدة الحاسوب على نطاق واسع وتقدير تحمل التصور هنا أربع نقاط رئيسية في الدراسات جزيرة البنكرياس : (1) تحليل واسع النطاق للعينات البنكرياس يوفر رؤية شاملة للجزيرة العام توزيع حجم وهيكل الجزيرة. (2) وإعادة الإعمار 3D والتحليل الرياضي لتكوين بنية الخلوية وزيادة تيسي...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Fluorescent microscope</td>
<td>Microscope</td>
<td>Olympus </td>
<td>IX-81
</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Stereo Investigator</td>
<td>Program</td>
<td>MicroBrightField</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>MIP-GFP mice</td>
<td>Mice</td>
<td>Jackson Laboratory</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Mathematica</td>
<td>Program</td>
<td>Wolfram</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Image J</td>
<td>Program</td>
<td>NIH</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Slidebook</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Program</td>
<td>Olympus</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>
	

computer-assisted large-scale visualization and quantification of pancreatic islet mass, size distribution and architecture

<p class="jove_content" style=";text-align:right;direction:rtl"> في جزيرة البنكرياس هي فريدة من نوعها الدقيقة الجهاز يتكون من عدة خلايا الغدد الصماء إفراز هرمون مثل خلايا بيتا (الأنسولين) ، خلايا ألفا (الجلوكاجون) ، ودلتا الخلايا (السوماتوستاتين) التي هي جزء لا يتجزأ في أنسجة الاكسوكرين وتشمل 1 -- 2 ٪ من البنكرياس بأكمله. هناك علاقة وثيقة بين الجسم والوزن البنكرياس. مجموع بيتا كتلة الخلايا يزيد أيضا نسبيا للتعويض عن الطلب على الأنسولين في الجسم. ما يهرب هذا التوسع متناسب هو توزيع حجم الجزر. الحيوانات الكبيرة مثل البشر حصة مماثلة مع توزيعات حجم جزيرة الفئران ، مما يشير إلى أن هذا الجهاز الصغير الحجم له حد معين لتكون وظيفية. يتم تعويض عجز بنكرياسات الحيوانات الكبيرة لتوليد الجزر أكبر نسبيا نتيجة للزيادة في عدد من الجزر ، وزيادة في نسبة أكبر الجزر في الجزيرة بشكل عام حجم التوزيع. علاوة على ذلك ، تبدي مرونة الجزر ضرب في تكوين الخلايا والعمارة بين الأنواع المختلفة ، وأيضا داخل نفس النوع في ظل الظروف الفيزيولوجية المرضية المختلفة. في هذه الدراسة ، ونحن تصف رواية نهج لتحليل بيانات الصور البيولوجي في سبيل تسهيل أتمتة العمليات التحليلية ، والتي تسمح لتحليل مجموعات البيانات الكبيرة وغير المتجانسة في دراسة مثل هذه العمليات البيولوجية الحيوية والهياكل المعقدة. وقد أعاقت هذه الدراسات بسبب الصعوبات التقنية لأخذ العينات غير منحازة وتوليد واسعة النطاق للقبض على مجموعات البيانات بدقة مدى تعقيد العمليات البيولوجية البيولوجيا جزيرة. هنا نعرض أساليب لجمع &quot;ممثل&quot; غير منحازة البيانات ضمن محدودية العينات (أو للتقليل من جمع العينات) وإعدادات القياسية التجريبية ، وعلى وجه التحديد إلى تحليل معقد ثلاثي الأبعاد هيكل الجزيرة. بمساعدة الحاسوب الآلي يسمح لجمع وتحليل البيانات لمجموعات واسعة النطاق وغير منحازة ويؤكد أيضا تفسير البيانات. وعلاوة على ذلك ، فإن القياس الكمي الدقيق لحجم التوزيع المكاني وينسق جزيرة (أي X ، Y ، Z - مناصب) لا يؤدي إلى تصور دقيق لهيكل جزيرة البنكرياس وتكوينها ، ولكن أيضا يتيح لنا التعرف على الأنماط خلال التنمية والتكيف مع الظروف تغيير من خلال النمذجة الرياضية. الأساليب المتقدمة في هذه الدراسة تنطبق على دراسات للكثير من النظم الأخرى والكائنات كذلك. </p>

Watch this Scientific Journal Video about Computer-assisted Large-scale Visualization and Quantification of Pancreatic Islet Mass, Size Distribution and Architecture at JoVE.com

Computer-assisted Large-scale Visualization and Quantification of Pancreatic Islet Mass, Size Distribution and Architecture

<p class="jove_content">يتم وصف أساليب بمساعدة الحاسوب الرواية على نطاق واسع الشراء وتحليل العينات immunohistochemically البنكرياس الملون : (1) القبض على شريحة افتراضية للقسم كامل ، (2) التحليل الشامل للبيانات واسعة النطاق ، (3) إعادة بناء شرائح الظاهري 2D ، (4) رسم الخرائط 3D جزيرة ، و (5) التحليل الرياضي.</p>

بمساعدة الحاسوب على نطاق واسع التصور النوعي والكمي لقداس جزيرة البنكرياس والتوزيع الحجم والعمارة

The pancreatic islet is a unique micro-organ composed of several hormone secreting endocrine cells such as beta-cells (insulin), alpha-cells (glucagon), ...

Research

JoVE Journal

Biology

Large-Scale Screens of Metagenomic Libraries

على نطاق واسع من شاشات مكتبات Metagenomic

Metagenomic libraries archive large fragments of contiguous genomic sequences from microorganisms without requiring prior cultivation.  Generating a ...

Murine Pancreatic Islet Isolation

فأري عزل جزيرة البنكرياس

Human Pancreatic Islet Isolation: Part I: Digestion and Collection of Pancreatic Tissue

الإنسان عزل جزيرة البنكرياس : الجزء الأول : الهضم ومجموعة من الأنسجة البنكرياس

Management of Type 1 diabetes is burdensome, both to the individual and society, costing over 100 billion dollars annually. Despite the widespread use of ...

Human Pancreatic Islet Isolation: Part II: Purification and Culture of Human Islets

الإنسان عزل جزيرة البنكرياس : الجزء الثاني : تنقية الثقافة والإنسان من الفشوت

Isolation and Large Scale Expansion of Adult Human Endothelial Colony Forming Progenitor Cells

العزلة وتوقعات بنمو كبير من الكبار الإنسان خلايا غشائي السلف تشكيل مستعمرة

This paper introduces a novel recovery strategy for endothelial colony forming progenitor cells (ECFCs) from heparinized but otherwise unmanipulated adult ...

<em>In situ</em> Quantification of Pancreatic Beta-cell Mass in Mice

In situ Quantification of Pancreatic Beta-cell Mass in Mice

<em>في الوضع الطبيعي</em> للقداس الكمي بيتا في البنكرياس خلايا الفئران

Tracing changes of specific cell populations in health and disease is an important goal of biomedical research. The process of monitoring pancreatic ...

A Method for Mouse Pancreatic Islet Isolation and Intracellular cAMP Determination

وهناك طريقة للماوس البنكرياس جزيرة العزلة وبين الخلايا المخيم تقدير

Uncontrolled glycemia is a hallmark of diabetes mellitus and promotes morbidities like neuropathy, nephropathy, and retinopathy. With the increasing ...

Infinium Assay for Large-scale SNP Genotyping Applications

Infinium الفحص على نطاق واسع لتطبيقات SNP التنميط الجيني

Genotyping variants in the human genome has proven to be an efficient method to identify genetic associations with phenotypes. The distribution of ...

An Innovative Method for Exosome Quantification and Size Measurement

طريقة مبتكرة لExosome الكمي وقياس الحجم

Although the biological importance of exosomes has recently gained an increasing amount of scientific and clinical attention, much is still unknown about ...

A Strategy for Sensitive, Large Scale Quantitative Metabolomics

استراتيجية للحساسية، مقياس كبيرة الكمية الايض

Metabolite profiling has been a valuable asset in the study of metabolism in health and disease. However, current platforms have different limiting ...