Name: yeast colony embedding method
Uploaded: 2011-03-22T11:00:00
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अनुसंधान NIH 1R15GM094770 द्वारा वित्त पोषित किया गया था.

1. कालोनी अलगाव और फिक्सेशन <ol><li> अगर मध्यम पर संकेत समय के लिए 300 कालोनियों सेते हैं (एक अलग उपनिवेश 1-2 मिमी व्यास में होना चाहिए). </li><li> कॉलोनी (चेहरा) और अंतर्निहित मध्यम एक संकीर्ण रंग का उपयोग कर निकालें. </li><...

<ol>
	<li>Kimmel, A. R., Firtel, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Breaking+symmetries:+regulation+of+Dictyostelium+development+through+chemoattractant+and+morphogen+signal-response.">Breaking symmetries: regulation of Dictyostelium development through chemoattractant and morphogen signal-response.</a> Curr Opin Genet Dev. 14, 540-540 (2004).</li><li>Palkova, Z., Vachova, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Life+within+a+community:+benefit+to+yeast+long-term+survival.">Life within a community: benefit to yeast long-term survival.</a> FEMS Microbiol Rev. 30, 806-806 (2006).</li><li>Shapiro, J., Vachova, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+significances+of+bacterial+colony+patterns.">The significances of bacterial colony patterns.</a> Bioessays. 17, 597-597 (1995).</li><li>Shapiro, J., Vachova, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Thinking+about+bacterial+populations+as+multicellular+organisms.">Thinking about bacterial populations as multicellular organisms.</a> Annu Rev Microbiol. 52, 81-81 (1998).</li><li>Engelberg, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multicellular+stalk-like+structures+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Multicellular stalk-like structures in Saccharomyces cerevisiae.</a> J Bacteriol. 180, 3992-3992 (1998).</li><li>Scherz, R., Shinder, V., Engelberg, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Anatomical+analysis+of+Saccharomyces+cerevisiae+stalk-like+structures+reveals+spatial+organization+and+cell+specialization.">Anatomical analysis of Saccharomyces cerevisiae stalk-like structures reveals spatial organization and cell specialization.</a> J Bacteriol. 183, 5402-5402 (2001).</li><li>Piccirillo, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Rim101p/PacC+pathway+and+alkaline+pH+regulate+pattern+formation+in+yeast+colonies.">The Rim101p/PacC pathway and alkaline pH regulate pattern formation in yeast colonies.</a> Genetics. 184, 707-707 (2010).</li><li>Sniegowski, P. D., Dombrowski, P. G., Fingerman, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Saccharomyces+cerevisiae+and+Saccharomyces+paradoxus+coexist+in+a+natural+woodland+site+in+North+America+and+display+different+levels+of+reproductive+isolation+from+European+conspecifics.">Saccharomyces cerevisiae and Saccharomyces paradoxus coexist in a natural woodland site in North America and display different levels of reproductive isolation from European conspecifics.</a> FEMS Yeast Res. 1, 299-299 (2002).</li><li>Piccirillo, S., Honigberg, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Sporulation+patterning+and+invasive+growth+in+wild+and+domesticated+yeast+colonies.">Sporulation patterning and invasive growth in wild and domesticated yeast colonies.</a> Res Microbiol. 161, 390-390 (2002).</li><li>Vachova, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Architecture+of+developing+multicellular+yeast+colony:+spatio-temporal+expression+of+Ato1p+ammonium+exporter.">Architecture of developing multicellular yeast colony: spatio-temporal expression of Ato1p ammonium exporter.</a> Environ Microbiol. , (2009).</li></ol>

प्रस्तुत विधि कालोनियों की आंतरिक संरचनाओं पता चलता है. क्योंकि विधि एस के एक रेंज में सेल प्रकार के पैटर्न को निर्धारित करने में प्रभावी है अलग कॉलोनी morphologies के साथ cerevisiae उपभेदों, और यह भी एक संबंध?...

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		<div>
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		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Osmium tetroxide</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Electron Microscopy Sciences</td>
<td>RT 19152</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Silicone embedding molds</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Fisher Scientific</td>
<td>NC 9975029</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Cycloaliphatic epoxide resin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Electron Microscopy Sciences</td>
<td>RT 15004</td>
<td>ERL 4221</td>
</tr>
<tr>
<td>Epoxy resin</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Electron Microscopy Sciences</td>
<td>RT 13000</td>
<td>DER 736</td>
</tr>
<tr>
<td>Nonenyl Succinic Anhydride</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Electron Microscopy Sciences</td>
<td>RT 19050</td>
<td>NSA</td>
</tr>
<tr>
<td>2-Dimethyl aminoethanol	</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Electron Microscopy Sciences</td>
<td>RT 13300</td>
<td>DMAE</td>
</tr>
<tr>
<td>Mounting media</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>KPL</td>
<td>71-00-16</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Rotating wheel</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Ted Pella</td>
<td>Pelco 1055</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Microtome</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Leica</td>
<td>Ultracut S</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

yeast colony embedding method

भ्रूण में अलग सेल प्रकार के patterning metazoan विकास में एक महत्वपूर्ण तंत्र है. कालोनियों और biofilms जैसे सूक्ष्मजीवों के समुदाय को भी सेल प्रकार के पैटर्न प्रदर्शित करते हैं. उदाहरण के लिए, खमीर में एस cerevisiae, sporulated कोशिकाओं और pseudohyphal कोशिकाओं समान कालोनियों में वितरित कर रहे हैं. patterning और आणविक तंत्र है कि इन नमूनों को आबाद की कार्यात्मक महत्व अभी भी खराब समझ रहे हैं. कवक कालोनियों में सेल प्रकार के पैटर्न की जांच करने के लिए सम्मान के साथ एक चुनौती है कि metazoan ऊतक के विपरीत, कालोनियों में कोशिकाओं अपेक्षाकृत कमजोर कर रहे हैं एक दूसरे से जुड़ी है. विशेष रूप से, कवक कालोनियों सबसे ऊतकों में पाया कोशिकी मैट्रिक्स के एक ही व्यापक स्तर शामिल नहीं है. यहाँ हम एम्बेडिंग और सेक्शनिंग खमीर कालोनियों कि इन कालोनियों में सेल प्रकार के आंतरिक पैटर्न से पता चलता है के लिए एक विधि पर रिपोर्ट. विधि मोटी वर्गों को तैयार (0.5 μ) प्रकाश माइक्रोस्कोपी और पतली वर्गों (0.1 μ) संचरण इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी के लिए उपयुक्त के लिए उपयोगी किया जा सकता है. एएससीआई और pseudohyphal कोशिकाओं को आसानी से प्रकाश माइक्रोस्कोपी द्वारा ovoid खमीर कोशिकाओं से प्रतिष्ठित किया जा है, जबकि इन कोशिकाओं के आंतरिक संरचना EM द्वारा visualized किया जा सकता है. विधि अगर साथ आसपास कालोनियों, उन्हें Spurr माध्यम से घुसपैठ, और तब सेक्शनिंग पर आधारित है. 1-2 मिमी की रेंज में एक व्यास के साथ कालोनियों इस प्रोटोकॉल के लिए उपयुक्त हैं. कालोनियों के इंटीरियर visualizing अलावा, विधि है कि अंतर्निहित अगर आक्रमण कॉलोनी के क्षेत्र के दृश्य की अनुमति देता है.

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Yeast Colony Embedding Method

खमीर प्रकाश और इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी के लिए सेक्शनिंग अनुमति कालोनियों को एम्बेड करने के लिए एक विधि. इस प्रोटोकॉल sporulated एक कवक समुदाय के भीतर सेल प्रकार के संगठन को समझने की ओर एक नए उपकरण प्रदान कालोनियों के भीतर और कोशिकाओं pseudohyphal कोशिकाओं के वितरण का निर्धारण की अनुमति देता है.

खमीर कालोनी एम्बेडिंग विधि

Patterning of  different cell types in embryos is a key mechanism in metazoan development. Communities of microorganisms, such as colonies and biofilms ...

Research

JoVE Journal

Biology

Plastic Embedding and Sectioning of Xenopus laevis Embryos

प्लास्टिक एम्बेड और Xenopus laevis भ्रूण के सेक्शनिंग

Measuring Replicative Life Span in the Budding Yeast

नवोदित खमीर में Replicative लाइफ स्पैन मापने

Aging is a degenerative process characterized by a progressive deterioration of cellular components and organelles resulting in mortality. The budding ...

Purification of Mitochondria from Yeast Cells

Mitochondria के खमीर कक्ष से शोधन

Mitochondria are the main site of ATP production during aerobic metabolism in eukaryotic non-photosynthetic cells1. These complex organelles also play ...

High-throughput Yeast Plasmid Overexpression Screen

उच्च throughput खमीर प्लाज्मिड Overexpression स्क्रीन

The budding yeast, Saccharomyces cerevisiae, is a powerful model system for defining fundamental mechanisms of many important cellular processes, ...

A Quantitative Assay for Insulin-expressing Colony-forming Progenitors

इंसुलिन व्यक्त कालोनी बनाने progenitors के लिए एक मात्रात्मक परख

The field of pancreatic stem and progenitor cell biology has been hampered by a lack of in vitro functional and quantitative assays that allow for the ...

Cryosectioning Yeast Communities for Examining Fluorescence Patterns

प्रतिदीप्ति पैटर्न की जांच करने के लिए खमीर समुदाय Cryosectioning

Microbes typically live  in communities. The spatial organization  of cells within a community is believed to impact the survival and function of the  ...

The Soft Agar Colony Formation Assay

शीतल अग्रवाल कालोनी गठन परख

Anchorage-independent growth is the ability of transformed cells to grow independently of a solid surface, and is a hallmark of carcinogenesis. The soft ...

Surface Spreading and Immunostaining of Yeast Chromosomes

भूतल फैल रहा है और खमीर गुणसूत्रों के immunostaining

The small size of nuclei of the budding yeast Saccharomyces cerevisiae limits the utility of light microscopy for analysis of the subnuclear distribution ...

ODELAY: A Large-scale Method for Multi-parameter Quantification of Yeast Growth

ओडेलेय: खमीर विकास के बहु-पैरामीटर मात्राकरण के लिए एक बड़े पैमाने पर विधि

Growth phenotypes of microorganisms are a strong indicator of their underlying genetic fitness and can be segregated into 3 growth regimes: lag-phase, ...

Pancreatic Islet Embedding for Paraffin Sections

आयल सेक्शन के लिए अग्नाशय टाप एंबेडिंग

Experiments using isolated pancreatic islets are important for diabetes research, but islets are expensive and of limited abundance. Islets contain a ...