Name: arabidopsis thaliana polar glycerolipid profiling by thin layer chromatography (tlc) coupled with gas-liquid chromatography (glc)
Uploaded: 2011-03-18T11:00:00
Duration: 13 min 2 s
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Este trabajo es apoyado por una beca de EE.UU. National Science Foundation de Christoph Benning.

1. La extracción de lípidos <ol><li> Comenzar la extracción de lípidos de la cosecha de 30 mg de 4 semanas de edad, hojas de Arabidopsis a partir de plantas cultivadas en agar solidificado medio o en el suelo y transferirlas a tubos de 1,5 ml de la reacción de polipropileno. Las hojas frescas se puede flash congelado en nitrógeno líquido y se almacenan a -80 ° C. </li><li> Añadir 300 l de extracción de solventes compuesto por metanol, cloroformo y ácido fórmico (20:10:01, v / v / v) para cada muestra. Agitar vigorosamente (con un agitador de pintura o similar) durante 5 minutos. </li><li> Añadir 150 ml de ácido fosfórico 0,2 M (H 3 PO 4), 1 M de cloruro de potasio (KCL) y agitar brevemente. </li><li> Se centrifuga a 13.000 xg a temperatura ambiente durante 1 minuto. Lípidos disueltos en la fase inferior de cloroformo se colocan sobre placas TLC. </li></ol> 2. Cromatografía en capa fina (TLC) 15 <ol><li> Para preparar las placas de TLC, se sumergen una placa de gel de sílice recubiertas 20cmx20cm TLC con la carga de la tira durante 30 segundos en 0,15 M de sulfato de amonio ((NH 4) 2 SO 4) solución, después de sumergir durante 30 segundos, secar la placa por lo menos 2 días un recipiente tapado. Durante la activación de la sublimación de amonio deja tras de ácido sulfúrico, que protona fosfatidilglicerol necesarios para su separación de glicerolípidos otros. </li><li> En el día de experimento, activar TLC placas de hornear en un horno a 120 ° C durante 2,5 horas. </li><li> Después del enfriamiento de las placas activa a temperatura ambiente, utilice un lápiz para dibujar una línea recta (1,5 cm del borde de la placa) a través de la placa en el origen del cromatograma. </li><li> En una campana extractora, lentamente entregar 3 x 20 l de extracto de lípidos en la fase inferior de cloroformo con una pipeta 20 ml con 200 l puntas amarillas de plástico bajo una corriente lenta de N 2. Para ello, un tubo de Tygon se conecta al regulador de la N 2 tanque. Mantenga el lugar de menos de 1 cm de diámetro. Cada placa tiene capacidad para 10 muestras (al posterior análisis de GLC está previsto). </li><li> Como los lípidos manchas completamente seca en la campana de humos, preparar el disolvente de desarrollo compuesto de acetona, tolueno, agua (91 ml: 30 ml: 7,5 ml). Si la humedad ambiental relativa del aire es alta, la separación podría ser afectada. En este caso el agua debe ser reducida para dar (91 ml: 30 ml: 7,0 ml) para conseguir la separación deseada. </li><li> Verter 80 ml de disolvente en el desarrollo de un TLC sellar el desarrollo de la cámara (L: H: W = 27,0: 26,5: 7.0, cm / cm / cm) y se coloca la placa en el tanque con el fin de la muestra hacia abajo. Sellar el tanque con la abrazadera. El disolvente ascenderá la placa y los lípidos se separarse. El tiempo de desarrollo es de aproximadamente 50 minutos a temperatura ambiente. </li><li> Cuando el frente del disolvente se sitúe a 1 cm de la parte superior de la placa, retire con cuidado la placa de la cubeta y se seque por completo en la campana de humos durante 10 minutos aproximadamente. </li><li> Lípidos separados por TLC puede ser reversible manchado brevemente con yodo para el análisis cuantitativo o irreversiblemente teñidas con ácido sulfúrico o α-naftol. <ol><li> Sulfúrico carbonización ácido: Pulverizar la placa con el 50% de ácido sulfúrico en agua en una botella rociadora de vidrio en la campana extractora de humos y hornee a 120 ° C durante 15 minutos (Figura 2). </li><li> α-naftol la tinción de glicolípidos: Pulverizar la placa con el 2,4% (w / v) α-naftol en el 10% (v / v) de ácido sulfúrico, 80% (v / v) de etanol y hornee a 120 ° C durante 3-5 minutos hasta que las bandas glicolípido se tiñen de color rosa o púrpura (Figura 2B). El tratamiento excesivo dará lugar a la carbonización de todos los lípidos debido a la presencia de ácido sulfúrico en el reactivo. </li><li> Tinción de yodo: en una campana de extracción, se coloca la placa en un tanque cerrado TLC con cristales de yodo (en una bandeja en la parte inferior que conduce a la saturación de la atmósfera con vapor de yodo hasta que los lípidos son visibles). No exponga la placa de yodo mucho tiempo como el yodo covalente puede modificar los ácidos grasos poliinsaturados (Figura 2C). Por otra parte, para evitar la oxidación de los lípidos, sólo los carriles estándar intercalados con los carriles de la muestra debe ser manchada con una lana de vidrio conectado pipeta Pasteur con cristales de yodo a través del cual N 2 es soplado sobre carriles individuales estándar. </li></ol></li></ol> 3. Acil éster metílico (FAME) Reacción 16 <ol><li> Eliminar la sílice rodean identificado puntos de lípidos de la placa de TLC con una cuchilla de afeitar. Raspe la sílice que contienen lípidos y transferir el polvo de sílice usando un embudo en un tubo de vidrio con tapón de rosca de teflón (PTFE) a ambos lados. </li><li> Añadir 1 ml 1 N de ácido clorhídrico (HCl) en metanol anhidro a cada muestra por pipeta. </li><li> Añadir 100 ml de 50 mg mL -1 pentadecanoico ácido (15:00) con una pipeta 200 l de cada muestra como patrón interno con una pipeta 200 l con 200 l punta de plástico amarillo. Mantenga un tubo con sólo ácido pentadecenoic metanólica de HCl como un control. Cerrar los tubos de vidrio herméticamente con tapas recubierto de teflón. </li><li> Incubar gltubos de culo en un baño de agua de 80 ° C durante 25 minutos. Los tubos deben ser sellados para que el disolvente no se evapora. </li><li> Después de los tubos se hayan enfriado, añada 1 ml de cloruro de sodio al 0,9% seguido de un ml de hexano y agitar vigorosamente. Centrifugar las muestras a 1000xg durante 3 minutos. </li><li> En la campana extractora de humos, retire la capa de hexano / superior de la muestra con pipeta Pasteur y colocarla en un tubo de vidrio nuevo 13x100 mm. </li><li> Evaporar hexano bajo una corriente lenta de N 2 sin secar por completo. </li><li> Disolver el resultado acil methylesters s en 60 l de hexano. Transferencia de las muestras en viales muestreador automático y tapa. Las muestras pueden ser almacenadas a 4 ° C para el corto plazo y -20 º C durante unos días. </li></ol> 4. Cromatografía de gas líquido (GLC) 10 <ol><li> Antes de comenzar GLC, asegúrese de que el hidrógeno helio, y los cilindros de aire se llenan. </li><li> Hexano suficiente hay que añadir a la reserva de disolvente y el contenedor de residuos debe estar vacío. Para la separación de grasas methylesters acilo, adjuntar una DB-23 columna de la máquina. </li><li> Viales lugar en el inyector automático. Inicie el software ChemStation en la CGL en el sistema informático. </li><li> Ajuste la temperatura de entrada a 250 ° C con una tasa de flujo de helio a 48.6 mL min-1 y la presión a 21,93 psi. La relación de separación es de 30,0: 1. </li><li> La temperatura del horno se establece inicialmente a 140 ° C durante 2 minutos y elevó a 160 ° C a una velocidad de 25 ° C min -1. A continuación, ajuste la temperatura aumentará de 160 ° C a 250 ° C a una velocidad de 8 ° C min -1 y mantener a 250 º C durante 4 minutos seguido de una disminución a 140 ° C a una velocidad de 38 ° C min - 1. Una carrera dura aproximadamente 21 minutos. </li><li> La temperatura del detector de ionización de llama es de 270 ° C con un caudal de hidrógeno de 30.0 mL min-1, la tasa de flujo de aire a 400 mL min-1 y la tasa de flujo de helio a 30.0 mL min-1. </li><li> Introduce el número de viales y nombre de la muestra en la tabla de secuencia de ejecución. Ajuste el inyector de 10 l para inyectar 2 l de la muestra por vial. </li><li> Cuando el instrumento está listo, inicie la secuencia de ejecución. </li></ol> 5. Los resultados representativos: Ejemplos de tinción irreversible del TLC separados por los lípidos de plantas Arabidopsis de 4 semanas de edad se muestra en la Figura 2. Los lípidos de ácido sulfúrico manchada (Figura 2A) están carbonizados y aparecen como manchas de color marrón. α-naftol se prefiere a la mancha glicolípidos como MGDG, DGDG, SQDG glicolípidos etc teñidas con α-naftol llevar un color rosa-púrpura, mientras que otros lípidos polares mancha amarilla (Figura 2B). La tinción de yodo es reversible y lípidos da un color amarillento que va a desaparecer en un corto tiempo se evapora el yodo (Figura 2C). Lípidos brevemente manchados de yodo puede ser objeto de análisis por GLC a pesar de lípidos sin manchas son preferibles a reducir la descomposición de los lípidos. Si se hace correctamente, las señales distintivas que representan a diferentes grasos éster metílico de acilo se podrá realizar GLC (Figura 3). Éster metílico de acilo graso con cadena de carbono más cortas y menos enlaces dobles tienen menor tiempo de retención con el DB-23 de la columna. Acil perfiles de éster metílico es una herramienta sensible para identificar mutantes con la composición de lípidos alterados. En la Figura 4, el MGDG18: 3 proporción de ácidos grasos molar se encuentra disminuida en el mutante tgd4-1 en comparación con el tipo salvaje de 18 años. Dividiendo los moles de éster metílico de acil grasos de los lípidos de clase uno con los moles de todas las clases de lípidos, la relación molar de cada uno de los lípidos se calculan. Por ejemplo, para calcular la proporción molar de MGDG: (MGDG)% mol = Σ [FAME (MGDG)] / Σ [FAME (total)] x 100% Las proporciones resultantes molar de cada clase de lípidos, tanto la de tipo salvaje y el mutante se puede comparar. Por ejemplo, el mutante tgd4-1 ha aumentado las cantidades relativas de MGDG y PG, pero disminuyeron las cantidades de DGDG y PE (Figura 5) 18. <img src="/files/ftp_upload/2518/2518fig1.jpg" alt="Figura 1" /> Figura 1. Diagrama de flujo del análisis de los lípidos polares con plántulas de Arabidopsis. Lípidos totales se extraen de plantas Arabidopsis de 4 semanas de edad, y separados por TLC. Los lípidos separados puede ser raspado de la placa de TLC para la transesterificación seguida de análisis por GLC. <img src="/files/ftp_upload/2518/2518fig2.jpg" alt="Figura 2" /> Figura 2. Separación de los lípidos en las placas de TLC. Extractos de lípidos de 35 mg (peso fresco) plántulas de tipo silvestre están separados por TLC y teñidas por el ácido sulfúrico (A), α-naftol (B) o el vapor de yodo (C). Tres repeticiones se muestran en cada método de tinción. DGDG, digalactosyldiacylglycerol; MGDG, monogalactosyldiacylglycerol; PC, la fosfatidilcolina, PE, fosfatidiletanolamina, PG, phosphatidylglycerol, PI, fosfatidilinositol, SQDG, sulfoquinovosyldiacylglycerol. <img src="/files/ftp_upload/2518/2518fig3.jpg" alt="Figura 3" /> Figura 3. Análisis por GLC de Methylesters ácidos grasos (FAME) derivado de MGDG del tipo salvaje. FAME se separan en una columna de 30 m capilar y detectados por ionización de llama. Pentadecanoico ácido (15:00) se utiliza como estándar interno. <img src="/files/ftp_upload/2518/2518fig4.jpg" alt="Figura 4" /> Figura 4. Perfil de ácidos grasos de MGDG en el tipo salvaje Col2 (columnas blancas) y el tgd4-1 mutante (columnas de negro). Los ácidos grasos se presentan como el número de carbonos seguido por el número de dobles enlaces. Tres repeticiones se hacen un promedio y las desviaciones estándar se muestran. <img src="/files/ftp_upload/2518/2518fig5.jpg" alt="Figura 5" /> Figura 5. Composición de los lípidos polares del tipo salvaje Col2 (columnas blancas) y el tgd4-1 mutante (columnas de negro). Tres repeticiones se hacen un promedio y las desviaciones estándar se muestran con barras de error.

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TLC, junto con GLC proporciona una herramienta robusta y rápida para el análisis cuantitativo de los lípidos polares en las plantas. Pequeños cambios en la composición de los lípidos se pueden identificar, por lo tanto, este método ha sido utilizado para la detección a gran escala de los mutantes de alteración en los lípidos polares vías metabólicas 1,20. Este método también se usa ampliamente para las actividades de control de las enzimas que utilizan los lípidos polares como sustrato. 2,6,7 Además de las hojas, la composición de los lípidos de los tejidos vegetales tales como las raíces y las semillas o fracciones subcelulares como los cloroplastos y las mitocondrias también se puede determinar de la misma manera. El sistema de solventes (acetona, tolueno, agua) que se utiliza aquí está optimizado para la separación de glicolípidos y fosfolípidos en las plantas. Sin embargo, en tgd1, 2,3,4 mutantes y los cloroplastos aislados, TGDG corre junto con el PE, mientras que tetragalactosyldiacylglycerol funciona con PC. En este caso, un sistema disolvente de cloroformo, metanol, ácido acético y agua (85: 20: 10: 4, v / v / v / v) se utiliza 13. A veces, una TLC bidimensional utilizando dos sistemas de solventes diferentes se realiza para separar aún más glicolípidos y fosfolípidos 19. Además, los tejidos de las plantas pueden estar directamente sometidos a la reacción FAME seguido por GLC para determinar el perfil de ácidos grasos totales, sin separación inicial de TLC 5. Junto a la demostrada TLC-GLC sistema, otro método utilizado para la creación de perfiles de lípidos se basa en la ionización directa de masas electrospray tandem espectrometría 17. En este método la separación cromatográfica inicial de lípidos en el extracto se omite. Sin embargo, este método requiere un equipo costoso y personal experimentado, que hace que sea menos útil para los análisis de rutina en el laboratorio o para la detección de mutantes.

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		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
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		<tbody>
		
<tr>
<td>&alpha;-naphthol</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma-Aldrich</td>
<td>N1000</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Methanolic HCL 3N</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma-Aldrich</td>
<td>33050-U</td>
<td>Dilute to 1N by methanol</td>
</tr>
<tr>
<td>Si250-PA TLC plates</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>J.T.Baker</td>
<td>7003-04</td>
<td>With pre-absorbent </td>
</tr>
<tr>
<td>TLC chamber</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma-Aldrich</td>
<td>Z266000</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Screw cap tubes</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>VWR</td>
<td>53283-800</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Scew caps</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sun Sri</td>
<td>13-425</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>PTFE disk</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sun Sri</td>
<td>200 608</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>GLC system</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Hewlett Packard</td>
<td>HP6890</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>DB-23 column</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>J&amp;W Scientific</td>
<td>122-2332</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>GLC vials</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sun Sri</td>
<td>500 132</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Caps of GLC vials</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sun Sri</td>
<td>201 828</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Chemstation software</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Agilent</td>
<td>G2070AA</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

arabidopsis thaliana polar glycerolipid profiling by thin layer chromatography (tlc) coupled with gas-liquid chromatography (glc)

Las células de las membranas biológicas separado del medio ambiente. De una sola célula de plantas y animales multicelulares, glicerolípidos, tales como la fosfatidilcolina o fosfatidiletanolamina, membranas forman dos capas que actúan como los límites y las interfaces para el intercambio químico entre las células y su entorno. A diferencia de los animales, las células vegetales tienen un orgánulo especial para la fotosíntesis, los cloroplastos. El sistema de membranas de los cloroplastos intrincada contiene glicerolípidos única, es decir, glicolípidos que carecen de fósforo: monogalactosyldiacylglycerol (MGDG), digalactosyldiacylglycerol (DGDG), sulfoquinovosyldiacylglycerol (SQDG) 4. Las funciones de estos lípidos están más allá de simplemente estructural. Estos glicolípidos y glicerolípidos otros fueron encontrados en las estructuras cristalinas del fotosistema I y II que indica la participación de glicerolípidos en la fotosíntesis 8,11. Durante la hambruna de fosfato, DGDG se transfirieron a membranas de extraplastidic para compensar la pérdida de los fosfolípidos de 9,12. Mucho de nuestro conocimiento de la biosíntesis y la función de estos lípidos se ha derivado de una combinación de estudios genéticos y bioquímicos con 14 Arabidopsis thaliana. Durante estos estudios, un procedimiento sencillo para el análisis de los lípidos polares ha sido esencial para la detección y el análisis de mutantes de lípidos y se describen en detalle. Un extracto lipídico de la hoja es primero separado por cromatografía en capa fina (TLC) y glicerolípidos se tiñen de forma reversible con vapor de yodo. Los lípidos son individuales raspado de la placa de TLC y se convierte en grasa methylesters acilo (FAME), que son analizados por cromatografía de gases acoplada con detección de ionización de llama (FID-GLC) (Figura 1). Este método ha demostrado ser una herramienta fiable para la detección de mutantes. Por ejemplo, el tgd1, 2,3,4 retículo endoplasmático a plastidio mutantes tráfico de lípidos fueron descubiertos sobre la base de la acumulación de una galactoglycerolipid anormal: trigalactosyldiacylglycerol (TGDG) y una disminución en la cantidad relativa de 18:3 (carbones: doble bonos) grupos acilo grasos en los lípidos de membrana 3,13,18,20. Este método también es aplicable para la determinación de actividades enzimáticas de las proteínas con los lípidos como sustrato 6.

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Arabidopsis thaliana Polar Glycerolipid Profiling by Thin Layer Chromatography TLC Coupled with Gas-Liquid Chromatography GLC

Composición de los extractos de lípidos polares y la composición de ácidos grasos de glicerolípidos individuales están determinados en un experimento de lípidos perfil simple y robusto. Para ello, glicerolípidos están aislados por cromatografía en capa fina y se somete a transmetilación de sus grupos acilo. Grasos methylesters acilo son cuantificados por cromatografía de gases.

Perfiles de Arabidopsis thaliana Polar Glycerolipid por cromatografía en capa fina (TLC), junto con cromatografía de gases (GLC)

Biological membranes separate cells from the environment. From a single cell to multicellular plants and animals, glycerolipids, such as ...

Research

JoVE Journal

Biology

Arabidopsis thaliana Polar Glycerolipid Profiling by Thin Layer Chromatography (TLC) Coupled with Gas-Liquid Chromatography (GLC)

MALDI Sample Preparation: the Ultra Thin Layer Method

MALDI preparación de la muestra: el método de ultra capa fina

This video demonstrates the preparation of an ultra-thin matrix/analyte layer for analyzing peptides and proteins by Matrix-Assisted Laser Desorption ...

Investigación

Biología

Investigating Tissue- and Organ-specific Phytochrome Responses using FACS-assisted Cell-type Specific Expression Profiling in Arabidopsis thaliana

Investigating Tissue- and Organ-specific Phytochrome Responses using FACS-assisted Cell-type Specific Expression Profiling in Arabidopsis thaliana

La investigación de los tejidos y órganos específicos de las respuestas fitocromo usando FACS asistida por células de tipo Perfiles de expresión específica en Arabidopsis thaliana</em

Light mediates an array of developmental and adaptive processes throughout the life cycle of a plant. Plants utilize light-absorbing molecules called ...

Floral-dip Transformation of Arabidopsis thaliana to Examine pTSO2::&beta;-glucuronidase Reporter Gene Expression

Floral-dip Transformation of Arabidopsis thaliana to Examine pTSO2::ÃƒÅ½Ã‚Â²-glucuronidase Reporter Gene Expression

Floral dip transformación de la Arabidopsis thaliana Para el Examen de PTSO2:: β-glucuronidasa Reporter Expresión Génica

The ability to introduce foreign genes into an organism is the foundation for modern biology and biotechnology. In the model flowering plant Arabidopsis ...

Histochemical Staining of Arabidopsis thaliana Secondary Cell Wall Elements

Histochemical Staining of Arabidopsis thaliana Secondary Cell Wall Elements

La tinción histoquímica de<em&gt; Arabidopsis thaliana</em&gt; Celda Secundaria Elements Pared

Arabidopsis thaliana is a model organism commonly used to understand and manipulate various cellular processes in plants, and it has been used extensively ...

Analysis of Arabidopsis thaliana Growth Behavior in Different Light Qualities

Analysis of Arabidopsis thaliana Growth Behavior in Different Light Qualities

Análisis del comportamiento de crecimiento de Arabidopsis thaliana en diferentes calidades de luz

Plant biologists often need to observe the growth behavior of their chosen species. To this end, the plants need constant environmental and stable light ...

Using Microtiter Dish Radiolabeling for Multiple In Vivo Measurements Of Escherichia coli (p)ppGpp Followed by Thin Layer Chromatography

Using Microtiter Dish Radiolabeling for Multiple In Vivo Measurements Of Escherichia coli pppGpp Followed by Thin Layer Chromatography

Uso de Microtiter Dish Radiolabeling para mediciones múltiples in Vivo de Escherichia coli (p)ppGpp seguido de cromatografía de capa fina

The (p)ppGpp nucleotide functions as a global regulator in bacteria in response to a variety of physical and nutritional stress. It has a rapid onset, in ...

Spatiotemporal Investigation of ERL1 Dynamics via Confocal Imaging

Image-Based Methods to Study Membrane Trafficking Events in Stomatal Lineage Cells

Image-Based Methods to Study Membrane Trafficking Events in Stomatal Lineage Cells (Video) | JoVE 

In eukaryotic cells, membrane components, including proteins and lipids, are spatiotemporally transported to their destination within the endomembrane ...

An Improved Method to Measure Pollen Hydration Profiles in Arabidopsis thaliana

A High-Resolution, Single-Grain, In Vivo Pollen Hydration Bioassay for Arabidopsis thaliana

A High-Resolution, Single-Grain, In Vivo Pollen Hydration Bioassay for Arabidopsis thaliana (Video) | JoVE 

Un bioensayo de hidratación de polen in vivo de grano único de alta resolución para Arabidopsis thaliana

Sexual reproduction in flowering plants requires initial interaction between the pollen grain and the stigmatic surface, where a molecular dialog is ...

Pollen Hydration Assay in Arabidopsis thaliana: Raw Data Acquisition and its Measurements

Pollen Hydration Assay in Arabidopsis thaliana: Raw Data Acquisition and its Measurements (Video) | JoVE 

Ensayo de hidratación del polen en Arabidopsis thaliana: adquisición de datos brutos y sus mediciones

﻿Preparation of Dual-Colored F1 Transgenic Arabidopsis thaliana

ï»¿Preparation of Dual-Colored F1 Transgenic Arabidopsis thaliana (Video) | JoVE 

Preparación de Arabidopsis thaliana transgénica F1 de dos colores