Name: genotypic inference of hiv-1 tropism using population-based sequencing of v3
Uploaded: 2010-12-27T18:00:00
Duration: 11 min 10 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3 at JoVE.com

وأيد تطوير هذا الفحص من خلال الرعاية الصحية فييف والمعاهد الكندية للأبحاث الصحية (CIHR) ومن خلال رئيس شركة جلاكسو سميث كلاين / CIHR في علم الفيروسات السريرية لهاريجان د. الدعم المقدم من قبل شركة فايزر والرعاية الصحية فييف.

<ol>
	<li>Feng, Y., Broder, C. C., Kennedy, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-1+entry+cofactor:+functional+cDNA+cloning+of+a+seven+transmembrane,+G+protein-coupled+receptor.">HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven transmembrane, G protein-coupled receptor.</a> Science. 272, 872-877 (1996).</li><li>Dragic, T., Litwin, V., Allaway, G. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-1+entry+into+CD4++cells+is+mediated+by+the+chemokine+receptor+CC-CKR-5.">HIV-1 entry into CD4+ cells is mediated by the chemokine receptor CC-CKR-5.</a> Nature. 381, 667-673 (1996).</li><li>Dorr, P., Westby, M., Dobbs, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maraviroc+(UK-427,857),+a+potent,+orally+bioavailable,+and+selective+small-molecule+inhibitor+of+chemokine+receptor+CCR5+with+broad-spectrum+anti-human+immunodeficiency+virus+type+1+activity.">Maraviroc (UK-427,857), a potent, orally bioavailable, and selective small-molecule inhibitor of chemokine receptor CCR5 with broad-spectrum anti-human immunodeficiency virus type 1 activity.</a> Antimicrob. Agents Chemother. 49, 4721-4732 (2005).</li><li>Gulick, R. M., Lalezari, J., Goodrich, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maraviroc+for+previously+treated+patients+with+R5+HIV-1+infection.">Maraviroc for previously treated patients with R5 HIV-1 infection.</a> N. Engl. J. Med. 359, 1429-1441 (2008).</li><li>Cooper, D. A., Heera, J., Goodrich, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maraviroc+versus+efavirenz,+both+in+combination+with+zidovudine/lamivudine,+for+the+treatment+of+antiretroviral-na&#237;ve+subjects+with+CCR5-tropic+HIV-1.">Maraviroc versus efavirenz, both in combination with zidovudine/lamivudine, for the treatment of antiretroviral-na&#237;ve subjects with CCR5-tropic HIV-1.</a> J. Infect. Dis. 201, 803-813 (2010).</li><li>Low, A. J., McGovern, R. A., Harrigan, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trofile+HIV+co-receptor+usage+assay.">Trofile HIV co-receptor usage assay.</a> Expert Opin. Med. Diagnostics. 3, 181-191 (2000).</li><li>Sing, T., Low, A. J., Beerenwinkel, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Predicting+HIV+co-receptor+usage+based+on+genetic+and+clinical+covariates.">Predicting HIV co-receptor usage based on genetic and clinical covariates.</a> Antiviral Ther. 12, 1097-1106 (2007).</li><li>Harrigan, P. R., McGovern, R., Dong, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+for+HIV+tropism+using+population-based+V3+genotypic+analysis:+a+retrospective+virological+outcome+analysis+using+stored+plasma+screening+samples+from+MOTIVATE-1.">Screening for HIV tropism using population-based V3 genotypic analysis: a retrospective virological outcome analysis using stored plasma screening samples from MOTIVATE-1.</a> , (2009).</li><li>Harrigan, P. R., McGovern, R., Dong, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimization+of+clinically+relevant+cut-points+for+the+determination+of+HIV+co-receptor+usage+to+predict+maraviroc+responses+in+treatment+experienced+(TE)+patients+using+population+V3+genotyping.">Optimization of clinically relevant cut-points for the determination of HIV co-receptor usage to predict maraviroc responses in treatment experienced (TE) patients using population V3 genotyping.</a> , (2009).</li><li>Swenson, L. C., McGovern, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimization+of+clinically+relevant+cutoffs+for+determining+HIV+co-receptor+use+by+population+and+"deep"+sequencing+methods.">Optimization of clinically relevant cutoffs for determining HIV co-receptor use by population and "deep" sequencing methods.</a> , (2009).</li><li>Swenson, L., McGovern, R., Dong, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phenotypic+screening+for+HIV+tropism+versus+both+population-based+and+"deep"+sequencing.">Phenotypic screening for HIV tropism versus both population-based and "deep" sequencing.</a> , (2009).</li><li>Swenson, L. C., Moores, A., Low, A. J., Thielen, A., Dong, W., Woods, C., Jensen, M. A., Wynhoven, B., Chan, D., Glascock, C., Harrigan, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+Detection+of+CXCR4-Using+HIV+by+V3+Genotyping:+Application+of+Population-based+and+'Deep'+Sequencing+to+Plasma+RNA+and+Proviral+DNA.">Improved Detection of CXCR4-Using HIV by V3 Genotyping: Application of Population-based and 'Deep' Sequencing to Plasma RNA and Proviral DNA.</a> Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. 54, 506-510 (2010).</li><li>Swenson, L. C., Boehme, R., Thielen, A., McGovern, R. A., Harrigan, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genotypic+determination+of+HIV-1+tropism+in+the+clinical+setting.">Genotypic determination of HIV-1 tropism in the clinical setting.</a> HIV Therapy. 4, 293-303 (2010).</li></ol>

P. ريتشارد هاريجان وتضارب المصالح مع الرعاية الصحية فييف ، Virco ، ميرك ، ابوت ، والسعي. ويرعى هذا الفيديو المقال فييف الرعاية الصحية.

الطريقة المعروضة هنا هي طريقة التسلسل القياسية المطبقة على اختبار tropism. التطبيق السريري لفيروس نقص المناعة البشرية المغلف حلقة V3 تسلسل للتنبؤ tropism الفيروسية وحتى وقت متأخر كان محدودا. وقد تبين أن هذا الأسلوب ، في تحليلات بأثر رجعي للمحاكمات (فييف الرعاية الصحية) maraviroc السريرية ، لتكون قادرة على قدم المساواة في الحد الأدنى للتنبؤ الفيروسي في tropism بالمقارنة مع غيرها من فحوصات التحقق من صحة استخدامها سريريا. هناك العديد من الفوائد لأداء تحليل الوراثي من الحلقة V3 للتنبؤ tropism. أولا وأخيرا ، يمكن تنفيذ هذا الإجراء في أي منشأة بمعدات تسلسل العمليات ، زيادة كبيرة في الوصول وتقليل الفترة الزمنية اللازمة لاختبار tropism. في المقارنة ، يتم تنفيذ المظهري Trofile الحساسية الفحص المعزز (ESTA) (حرف واحد فقط العلوم البيولوجية) ، والتي كانت بمثابة معيار الذهب لاختبار tropism ، في مركز واحد في جنوب كاليفورنيا. مزايا إضافية تشمل متطلبات أقل من المواد ابتداء والحد الأدنى المطلوب تحميل البلازما الفيروسية 500copies/mL. كذلك ، فإن التكاليف التشغيلية لتشغيل الفحص الوراثي منخفضة نسبيا بالمقارنة مع تلك التي لفحص المظهري. استخدام البرمجيات نتذكر بشكل خاص يلغي الحاجة إلى استعراض التسلسل اليدوي ، الذي يميل إلى أن يكون جزءا من العمل المكثف يحلل التركيب الوراثي. الطريقة المعروضة هنا واضحة إلى حد ما ، مع عدم وجود خطوة معينة أخرى تفوق في أهميتها. نحن لا نقترح تشغيل PCR والتسلسل في ثلاث نسخ لزيادة احتمالات الأنواع التقاط أقلية بين السكان الفيروسية لعينة. لا يمكن أن يؤديها يعيد أكبر من ثلاثة ، إلا أننا وجدنا أن كلا triplicates كفاءة وموثوق بها. علينا أيضا أن توحي باستخدام خطوة واحدة عكس المنتسخة PCR كيت (Qiagen) الذي ينفذ على حد سواء RT - PCR PCR وأول جولة في نفس رد الفعل مع الحفاظ على خصوصية وحساسية عالية.

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>RNA extraction using NucliSens easyMAG version 1.0</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Magnetic Silica</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280133</td>
<td>(48 x 0.6 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Lysis Buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280134</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Extraction Buffer 1</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280130</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Extraction Buffer 2</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280131</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Extraction Buffer 3</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280132</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG version 1.0 </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Class II A2 biological safety cabinet</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>One-Step Reverse Transcriptase PCR and Second Round PCR</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>DEPC-treated water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Ambion Corp.</td>
<td>cat. # 9922</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>SuperScrip III One-Step RT-PCR System with Platinum Taq High Fidelty</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>cat#12574-035</td>
<td>Kit components used: 
- SuperScript III RT/ Platinum Taq High Fidelty Enzyme Mix 
- 2X Reaction Mix (a buffer containing 0.4mM of each dNTP, 2.4mM MgSO4)</td>
</tr>
<tr>
<td>Expand High Fidelity PCR System</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostics</td>
<td>cat. # 1 759 078</td>
<td>Kit components used: 
- Expand High Fidelity Buffer 10X conc. with 15 mM MgCl2 (lids labelled 2) 
- Expand HF PCR Enzyme Mix (3.5U/&mu;l) 
- MgCl2 Stock Solution (25mM) (lids labelled 4)</td>
</tr>
<tr>
<td>dNTPs: dATP, dGTP, dCTP, dTTP</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostics</td>
<td>cat. # 11969064001</td>
<td>(100 mM)</td>
</tr>
<tr>
<td>Sucrose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # S0389-500G</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Bromophenol blue sodium salt</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat.# B5525</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Cresol Red</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat.# 114472-5G</td>
<td>indicator grade</td>
</tr>
<tr>
<td>Thermocycler </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Gel Electrophoresis</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>50X TAE buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>cat. # 24710030</td>
<td>(1000 ml) </td>
</tr>
<tr>
<td>SYBR Safe DNA gel stain</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen Life Technologies</td>
<td>cat. # S33102</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Agarose (ultra pure)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>cat. # 15510-027</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>E-Gel Low Range Quantitative DNA Ladder</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen Life Technologies</td>
<td>cat. # 12373-031</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Reagent Grade Type II water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Gel apparatus</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sequencing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>cat. # 4337458</td>
<td>(25000 reactions)</td>
</tr>
<tr>
<td>Hi-Di Formamide</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>cat. # 4311320</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sodium Acetate (NaOAc)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # S-2889</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>EDTA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma-Aldrich</td>
<td>Cat.# 03690-100ML</td>
<td>0.5M, pH=8.0</td>
</tr>
<tr>
<td>TRIZMA Hydrochloride Buffer Solution</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # T-2819</td>
<td>1 M, pH 9.0</td>
</tr>
<tr>
<td>Magnesium Chloride (MgCl2)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # M-1028</td>
<td>1 M</td>
</tr>
<tr>
<td>95% Ethanol</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Running Buffer (10X) with EDTA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosystems</td>
<td>cat. # 4335613</td>
<td>500 mL</td>
</tr>
<tr>
<td>Polymer Pop-7 (25mL) Or Polymer Pop-7 (10mL)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosystems</td>
<td>cat. # 44363929 or cat. # 4352759</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>3700/3730 BigDye Terminator v3.1 Sequencing Standard Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>Cat# 4336943</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Thermocycler </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Centrifuge with plate holders</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>3730xl DNA Analyzer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

genotypic inference of hiv-1 tropism using population-based sequencing of v3

خلفية : قبل حصوله على المخدرات من فئة CCR5 - المتناحرين في علاج فيروس نقص المناعة البشرية ، يجب على المريض الخضوع لاختبار فيروس نقص المناعة البشرية tropism للتأكد من أن له أو لها السكان الفيروسية يستخدم coreceptor CCR5 لدخول الخليوي ، وليس coreceptor البديلة. نهج واحد لاختبار tropism هو دراسة تسلسل المنطقة V3 من المغلف فيروس نقص المناعة البشرية ، والتي تتفاعل مع coreceptor. يتم استخراج الحمض النووي الريبي الفيروسي من بلازما الدم : الأساليب. يتم تضخيمه في المنطقة V3 في ثلاث نسخ مع متداخلة عكس المنتسخة - PCR. والتسلسل ثم التكبير وتحليلها باستخدام البرنامج ، RE_Call. ثم تقدم متواليات لخوارزمية بيوينفورمتيك مثل geno2pheno لاستنتاج tropism الفيروسية من المنطقة V3. ويستدل على أن يكون تسلسل غير R5 إذا بهم geno2pheno معدل ايجابية كاذبة ينخفض ​​5.75 ٪. إذا تم الاستدلال على أي واحد من ثلاثة من متواليات عينة غير قابلة للR5 ، والمريض من غير المرجح أن يستجيب لCCR5 - المتناحرين.

Watch this Scientific Journal Video about Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3 at JoVE.com

Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

ويمكن الاستدلال على فيروس نقص المناعة البشرية من المنطقة tropism V3 من المغلف الفيروسية. V3 هو تضخيم PCR من ثلاث نسخ باستخدام المتداخلة RT - PCR ، متسلسلة ، وتفسيرها باستخدام البرمجيات بيوينفورمتيك. وتصنف مع عينات مع تسلسل 1 أو أكثر (s) مع عشرات g2P منخفضة غير R5 الفيروس.

الاستدلال الوراثي من HIV - 1 Tropism باستخدام السكان على أساس تسلسل V3

Background: Prior to receiving a drug from CCR5-antagonist class in HIV therapy, a patient must undergo an HIV tropism test to confirm that his or her ...

<a class="grey_button" href="/video/3538">Espa&ntilde;ol </a>

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding

Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding

تقييم ميزات التعليم العالي ذات الصلة مناعيا الديناميكية الهيكلية للHIV - 1 حلقة V3 تسلسل R2 بواسطة ولي العهد منذ البداية للطي

The antigenic diversity of HIV-1 has long been an obstacle to vaccine design, and this variability is especially pronounced in the V3 loop of the virus' ...

Specific Marking of HIV-1 Positive Cells using a Rev-dependent Lentiviral Vector Expressing the Green Fluorescent Protein

تمييز خلايا محددة HIV - 1 الإيجابية باستخدام المتجهات التي تعتمد على رؤيا Lentiviral وإذ تعرب عن البروتين الأخضر نيون

Most of HIV-responsive expression vectors are based on the HIV promoter, the long terminal repeat (LTR). While responsive to an early HIV protein, Tat, ...

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage Tropism by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

التنبؤ الإشتخدام HIV-1 Coreceptor (Tropism) من خلال تحليل تسلسل الوراثي باستخدام نهج

Maraviroc (MVC) is the first licensed antiretroviral drug from the class of coreceptor antagonists. It binds to the host coreceptor CCR5, which is used by ...

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

Uncoating في المختبر من HIV - 1 النوى

The genome of the retroviruses is encased in a capsid surrounded by a lipid envelope. For lentiviruses, such as HIV-1, the conical capsid shell is ...

New Tools to Expand Regulatory T Cells from HIV-1-infected Individuals

أدوات جديدة لتوسيع الخلايا التائية التنظيمية من الأفراد HIV-1-المصابة

CD4+ Regulatory T cells (Tregs) are potent immune modulators and serve an important function in human immune homeostasis. Depletion of Tregs has led to ...

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

تقييم الفطرية الاستشعار من HIV-1 CD4 المصابة<sup&gt; +</sup&gt; T الخلايا عن طريق الخلايا الجذعية بلازماوية الشكل باستخدام<em&gt; خارج الحي</em&gt; المشارك ثقافة النظام.

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the ...

Conformational Evaluation of HIV-1 Trimeric Envelope Glycoproteins Using a Cell-based ELISA Assay

تقييم بتكوين لHIV-1 مغلف مثلوثي بروتينات سكرية باستخدام خلية القاعدة ELISA الفحص

HIV-1 envelope glycoproteins (Env) mediate viral entry into target cells and are essential to the infectious cycle. Understanding how those glycoproteins ...

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals

عزل Exosomes من البلازما من HIV-1 الأفراد ايجابية

Exosomes are small vesicles ranging in size from 30 nm to 100 nm that are released both constitutively and upon stimulation from a variety of cell types. ...

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle (GUV) Membranes

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle GUV Membranes

تصور HIV-1 الكمامة ملزم لالعملاق Unilamellar الحويصلة (GUV) الأغشية

The structural protein of HIV-1, Pr55Gag (or Gag), binds to the plasma membrane in cells during the virus assembly process. Membrane binding of Gag is an ...

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

قياس ل<em&gt; في المختبر</em&gt; التكامل آخر من HIV-1 Preintegration مجمعات

HIV-1 envelope proteins engage cognate receptors on the target cell surface, which leads to viral-cell membrane fusion followed by the release of the ...