Name: genotypic inference of hiv-1 tropism using population-based sequencing of v3
Uploaded: 2010-12-27T18:00:00
Duration: 11 min 10 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3 at JoVE.com

इस परख के विकास Viiv हेल्थकेयर और स्वास्थ्य अनुसंधान (CIHR) की कनाडा के संस्थानों द्वारा समर्थित किया गया और डा. Harrigan के लिए नैदानिक ​​विषाणु विज्ञान में एक कुर्सी / ग्लैक्सोस्मिथक्लाइन CIHR के माध्यम से. फाइजर और ViiV हेल्थकेयर द्वारा प्रदान का समर्थन करें.

<ol>
	<li>Feng, Y., Broder, C. C., Kennedy, P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-1+entry+cofactor:+functional+cDNA+cloning+of+a+seven+transmembrane,+G+protein-coupled+receptor.">HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven transmembrane, G protein-coupled receptor.</a> Science. 272, 872-877 (1996).</li><li>Dragic, T., Litwin, V., Allaway, G. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-1+entry+into+CD4++cells+is+mediated+by+the+chemokine+receptor+CC-CKR-5.">HIV-1 entry into CD4+ cells is mediated by the chemokine receptor CC-CKR-5.</a> Nature. 381, 667-673 (1996).</li><li>Dorr, P., Westby, M., Dobbs, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maraviroc+(UK-427,857),+a+potent,+orally+bioavailable,+and+selective+small-molecule+inhibitor+of+chemokine+receptor+CCR5+with+broad-spectrum+anti-human+immunodeficiency+virus+type+1+activity.">Maraviroc (UK-427,857), a potent, orally bioavailable, and selective small-molecule inhibitor of chemokine receptor CCR5 with broad-spectrum anti-human immunodeficiency virus type 1 activity.</a> Antimicrob. Agents Chemother. 49, 4721-4732 (2005).</li><li>Gulick, R. M., Lalezari, J., Goodrich, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maraviroc+for+previously+treated+patients+with+R5+HIV-1+infection.">Maraviroc for previously treated patients with R5 HIV-1 infection.</a> N. Engl. J. Med. 359, 1429-1441 (2008).</li><li>Cooper, D. A., Heera, J., Goodrich, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maraviroc+versus+efavirenz,+both+in+combination+with+zidovudine/lamivudine,+for+the+treatment+of+antiretroviral-na&#237;ve+subjects+with+CCR5-tropic+HIV-1.">Maraviroc versus efavirenz, both in combination with zidovudine/lamivudine, for the treatment of antiretroviral-na&#237;ve subjects with CCR5-tropic HIV-1.</a> J. Infect. Dis. 201, 803-813 (2010).</li><li>Low, A. J., McGovern, R. A., Harrigan, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Trofile+HIV+co-receptor+usage+assay.">Trofile HIV co-receptor usage assay.</a> Expert Opin. Med. Diagnostics. 3, 181-191 (2000).</li><li>Sing, T., Low, A. J., Beerenwinkel, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Predicting+HIV+co-receptor+usage+based+on+genetic+and+clinical+covariates.">Predicting HIV co-receptor usage based on genetic and clinical covariates.</a> Antiviral Ther. 12, 1097-1106 (2007).</li><li>Harrigan, P. R., McGovern, R., Dong, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+for+HIV+tropism+using+population-based+V3+genotypic+analysis:+a+retrospective+virological+outcome+analysis+using+stored+plasma+screening+samples+from+MOTIVATE-1.">Screening for HIV tropism using population-based V3 genotypic analysis: a retrospective virological outcome analysis using stored plasma screening samples from MOTIVATE-1.</a> , (2009).</li><li>Harrigan, P. R., McGovern, R., Dong, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimization+of+clinically+relevant+cut-points+for+the+determination+of+HIV+co-receptor+usage+to+predict+maraviroc+responses+in+treatment+experienced+(TE)+patients+using+population+V3+genotyping.">Optimization of clinically relevant cut-points for the determination of HIV co-receptor usage to predict maraviroc responses in treatment experienced (TE) patients using population V3 genotyping.</a> , (2009).</li><li>Swenson, L. C., McGovern, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optimization+of+clinically+relevant+cutoffs+for+determining+HIV+co-receptor+use+by+population+and+"deep"+sequencing+methods.">Optimization of clinically relevant cutoffs for determining HIV co-receptor use by population and "deep" sequencing methods.</a> , (2009).</li><li>Swenson, L., McGovern, R., Dong, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phenotypic+screening+for+HIV+tropism+versus+both+population-based+and+"deep"+sequencing.">Phenotypic screening for HIV tropism versus both population-based and "deep" sequencing.</a> , (2009).</li><li>Swenson, L. C., Moores, A., Low, A. J., Thielen, A., Dong, W., Woods, C., Jensen, M. A., Wynhoven, B., Chan, D., Glascock, C., Harrigan, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+Detection+of+CXCR4-Using+HIV+by+V3+Genotyping:+Application+of+Population-based+and+'Deep'+Sequencing+to+Plasma+RNA+and+Proviral+DNA.">Improved Detection of CXCR4-Using HIV by V3 Genotyping: Application of Population-based and 'Deep' Sequencing to Plasma RNA and Proviral DNA.</a> Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes. 54, 506-510 (2010).</li><li>Swenson, L. C., Boehme, R., Thielen, A., McGovern, R. A., Harrigan, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genotypic+determination+of+HIV-1+tropism+in+the+clinical+setting.">Genotypic determination of HIV-1 tropism in the clinical setting.</a> HIV Therapy. 4, 293-303 (2010).</li></ol>

पी. रिचर्ड Harrigan ब्याज की ViiV हेल्थकेयर, Virco, मर्क, Abbott, और क्वेस्ट के साथ संघर्ष है. इस वीडियो लेख ViiV हेल्थकेयर द्वारा प्रायोजित है.

यहाँ प्रस्तुत विधि एक मानक अनुक्रमण विधि tropism परीक्षण करने के लिए लागू है. एचआईवी लिफाफा V3 पाश वायरल tropism भविष्यवाणी अनुक्रमण के नैदानिक ​​आवेदन किया है जब तक देर से सीमित किया गया है. इस विधि maraviroc (ViiV हेल्थकेयर) नैदानिक ​​परीक्षणों के पूर्वव्यापी विश्लेषण में दिखाया गया है, कम से कम समान रूप से अन्य मान्य नैदानिक ​​इस्तेमाल assays की तुलना में वायरल tropism भविष्यवाणी करने में सक्षम है. Tropism भविष्यवाणी के लिए V3 पाश की genotypic विश्लेषण प्रदर्शन करने के लिए कई लाभ हैं. और सबसे पहले, इस कार्यविधि का परिचालन अनुक्रमण उपकरण के साथ किसी भी सुविधा पर प्रदर्शन किया जा सकता है, बहुत पहुंच बढ़ाने और tropism परीक्षण के बदलाव का समय कम करने के. इसकी तुलना में, प्ररूपी बढ़ी संवेदनशीलता Trofile (एस्टा) परख (गुंथे बायोसाइंसेज), जो tropism परीक्षण के लिए सोने के मानक के रूप में सेवा की है दक्षिणी कैलिफोर्निया में एक केंद्र पर किया जाता है. अतिरिक्त लाभ कम प्रारंभिक सामग्री और 500copies/mL की एक न्यूनतम आवश्यक प्लाज्मा वायरल लोड की आवश्यकता शामिल हैं. के रूप में अच्छी तरह से, genotypic परख चलाने की परिचालन लागत एक प्ररूपी परख के उन लोगों की तुलना में अपेक्षाकृत कम हैं. विशेष रूप में याद सॉफ्टवेयर का उपयोग पुस्तिका अनुक्रम समीक्षा, जो जीनोटाइप के विश्लेषण के एक श्रम गहन हिस्सा हो जाता है के लिए आवश्यकता eliminates. यहाँ प्रस्तुत पद्धति काफी सरल है, कोई विशेष महत्व में एक और outweighing कदम के साथ, है. हम तीन प्रतियों में सुझाव है पीसीआर और अनुक्रमण चलाने के लिए एक नमूना वायरल जनसंख्या के भीतर अल्पसंख्यक प्रजातियों पर कब्जा करने की मुश्किलों में वृद्धि. Replicates तीन से अधिक से अधिक किया जा सकता है, लेकिन हमने पाया है दोनों कुशल और विश्वसनीय हो triplicates. हम भी एक चरण रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस पीसीआर (Qiagen) किट, जो जबकि उच्च संवेदनशीलता और विशिष्टता बनाए रखने के लिए एक ही प्रतिक्रिया में दोनों RT-पीसीआर और पहले दौर पीसीआर प्रदर्शन का उपयोग कर सुझाव देते हैं.

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		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>RNA extraction using NucliSens easyMAG version 1.0</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Magnetic Silica</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280133</td>
<td>(48 x 0.6 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Lysis Buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280134</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Extraction Buffer 1</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280130</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Extraction Buffer 2</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280131</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG Extraction Buffer 3</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>cat. # 280132</td>
<td>(4 x 1000 ml)</td>
</tr>
<tr>
<td>NucliSens easyMAG version 1.0 </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>bioMerieux</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Class II A2 biological safety cabinet</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>One-Step Reverse Transcriptase PCR and Second Round PCR</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>DEPC-treated water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Ambion Corp.</td>
<td>cat. # 9922</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>SuperScrip III One-Step RT-PCR System with Platinum Taq High Fidelty</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>cat#12574-035</td>
<td>Kit components used: 
- SuperScript III RT/ Platinum Taq High Fidelty Enzyme Mix 
- 2X Reaction Mix (a buffer containing 0.4mM of each dNTP, 2.4mM MgSO4)</td>
</tr>
<tr>
<td>Expand High Fidelity PCR System</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostics</td>
<td>cat. # 1 759 078</td>
<td>Kit components used: 
- Expand High Fidelity Buffer 10X conc. with 15 mM MgCl2 (lids labelled 2) 
- Expand HF PCR Enzyme Mix (3.5U/&mu;l) 
- MgCl2 Stock Solution (25mM) (lids labelled 4)</td>
</tr>
<tr>
<td>dNTPs: dATP, dGTP, dCTP, dTTP</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Roche Diagnostics</td>
<td>cat. # 11969064001</td>
<td>(100 mM)</td>
</tr>
<tr>
<td>Sucrose</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # S0389-500G</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Bromophenol blue sodium salt</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat.# B5525</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Cresol Red</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat.# 114472-5G</td>
<td>indicator grade</td>
</tr>
<tr>
<td>Thermocycler </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Gel Electrophoresis</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>50X TAE buffer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>cat. # 24710030</td>
<td>(1000 ml) </td>
</tr>
<tr>
<td>SYBR Safe DNA gel stain</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen Life Technologies</td>
<td>cat. # S33102</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Agarose (ultra pure)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen</td>
<td>cat. # 15510-027</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>E-Gel Low Range Quantitative DNA Ladder</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Invitrogen Life Technologies</td>
<td>cat. # 12373-031</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Reagent Grade Type II water</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Gel apparatus</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sequencing</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>ABI PRISM BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>cat. # 4337458</td>
<td>(25000 reactions)</td>
</tr>
<tr>
<td>Hi-Di Formamide</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>cat. # 4311320</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Sodium Acetate (NaOAc)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # S-2889</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>EDTA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma-Aldrich</td>
<td>Cat.# 03690-100ML</td>
<td>0.5M, pH=8.0</td>
</tr>
<tr>
<td>TRIZMA Hydrochloride Buffer Solution</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # T-2819</td>
<td>1 M, pH 9.0</td>
</tr>
<tr>
<td>Magnesium Chloride (MgCl2)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Sigma</td>
<td>cat. # M-1028</td>
<td>1 M</td>
</tr>
<tr>
<td>95% Ethanol</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Running Buffer (10X) with EDTA</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosystems</td>
<td>cat. # 4335613</td>
<td>500 mL</td>
</tr>
<tr>
<td>Polymer Pop-7 (25mL) Or Polymer Pop-7 (10mL)</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosystems</td>
<td>cat. # 44363929 or cat. # 4352759</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>3700/3730 BigDye Terminator v3.1 Sequencing Standard Kit</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>Cat# 4336943</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Thermocycler </td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>Centrifuge with plate holders</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>
<tr>
<td>3730xl DNA Analyzer</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>Applied Biosciences</td>
<td>&nbsp;</td>
<td>&nbsp;</td>		</tbody>
		</table>
		</div>

genotypic inference of hiv-1 tropism using population-based sequencing of v3

पृष्ठभूमि: पहले एचआईवी के उपचार में CCR5-प्रतिपक्षी वर्ग से एक दवा प्राप्त करने के लिए, एक मरीज को एचआईवी tropism परीक्षण से गुजरना करने के लिए पुष्टि है कि उसके या उसके वायरल जनसंख्या CCR5 coreceptor सेलुलर प्रवेश के लिए उपयोग करता है, और नहीं एक वैकल्पिक coreceptor चाहिए. एक tropism परीक्षण करने के लिए दृष्टिकोण एचआईवी लिफाफा, जो coreceptor के साथ interacts के V3 क्षेत्र के अनुक्रम की जांच करने के लिए है. तरीके: वायरल शाही सेना रक्त प्लाज्मा से निकाला जाता है. V3 के क्षेत्र में नेस्टेड रिवर्स ट्रांसक्रिपटेस पीसीआर के साथ तीन प्रतियों में परिलक्षित होता है. amplifications तो अनुक्रम और सॉफ्टवेयर, RE_Call विश्लेषण का उपयोग कर. दृश्यों को फिर geno2pheno जैसे bioinformatic एल्गोरिथ्म V3 क्षेत्र से वायरल tropism अनुमान को प्रस्तुत कर रहे हैं. दृश्यों गैर-R5 हो सकता है अगर अपनी geno2pheno झूठी सकारात्मक दर नीचे 5.75% गिर inferred रहे हैं. यदि एक नमूना से तीन दृश्यों में से किसी एक गैर-R5 inferred किया है, रोगी एक CCR5-प्रतिपक्षी का जवाब की संभावना नहीं है.

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Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

एचआईवी tropism वायरल लिफाफा के V3 के क्षेत्र से inferred किया जा सकता है. V3 पीसीआर नेस्टेड RT-पीसीआर, अनुक्रम का उपयोग कर तीन प्रतियों में परिलक्षित है, और bioinformatic सॉफ्टवेयर का उपयोग कर व्याख्या. कम g2P स्कोर के साथ 1 या अधिक अनुक्रम (ओं) के साथ के साथ नमूने गैर-R5 वायरस के रूप में वर्गीकृत कर रहे हैं.

V3 के एचआईवी -1 tropism के genotypic निष्कर्ष का प्रयोग जनसंख्या आधारित अनुक्रमण

Background: Prior to receiving a drug from CCR5-antagonist class in HIV therapy, a patient must undergo an HIV tropism test to confirm that his or her ...

<a class="grey_button" href="/video/3538">Espa&ntilde;ol </a>

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding

Assessment of Immunologically Relevant Dynamic Tertiary Structural Features of the HIV-1 V3 Loop Crown R2 Sequence by ab initio Folding

V3 एचआईवी-1 लूप क्राउन R2 के अनुक्रम के immunologically प्रासंगिक गतिशील तृतीयक स्ट्रक्चरल सुविधाएँ के द्वारा आकलन अब initio तह

The antigenic diversity of HIV-1 has long been an obstacle to vaccine design, and this variability is especially pronounced in the V3 loop of the virus' ...

Specific Marking of HIV-1 Positive Cells using a Rev-dependent Lentiviral Vector Expressing the Green Fluorescent Protein

एचआईवी -1 सकारात्मक कक्ष का उपयोग एक रेव निर्भर lentiviral वेक्टर हरी फ्लोरोसेंट प्रोटीन व्यक्त की विशिष्ट चिह्नित

Most of HIV-responsive expression vectors are based on the HIV promoter, the long terminal repeat (LTR). While responsive to an early HIV protein, Tat, ...

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage Tropism by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

एचआईवी 1 अनुक्रम विश्लेषण द्वारा Coreceptor का उपयोग (tropism) की भविष्यवाणी एक genotypic दृष्टिकोण का उपयोग

Maraviroc (MVC) is the first licensed antiretroviral drug from the class of coreceptor antagonists. It binds to the host coreceptor CCR5, which is used by ...

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

एचआईवी-1 कोर की इन विट्रो Uncoating में

The genome of the retroviruses is encased in a capsid surrounded by a lipid envelope. For lentiviruses, such as HIV-1, the conical capsid shell is ...

New Tools to Expand Regulatory T Cells from HIV-1-infected Individuals

नई उपकरण एचआईवी -1 से संक्रमित व्यक्तियों से विनियामक टी कोशिकाओं का विस्तार करने के लिए

CD4+ Regulatory T cells (Tregs) are potent immune modulators and serve an important function in human immune homeostasis. Depletion of Tregs has led to ...

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

एचआईवी -1 संक्रमित सीडी 4 की सहज सेंसिंग का आकलन<sup&gt; +</sup&gt; एक का उपयोग Plasmacytoid वृक्ष के समान कोशिकाओं द्वारा टी कोशिकाओं<em&gt; पूर्व vivo</em&gt; प्रणाली सह संस्कृति।

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the ...

Conformational Evaluation of HIV-1 Trimeric Envelope Glycoproteins Using a Cell-based ELISA Assay

एक सेल आधारित एलिसा परख का उपयोग एचआईवी -1 trimeric लिफाफा glycoproteins के गठनात्मक मूल्यांकन

HIV-1 envelope glycoproteins (Env) mediate viral entry into target cells and are essential to the infectious cycle. Understanding how those glycoproteins ...

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals

एचआईवी -1 सकारात्मक व्यक्तियों के प्लाज्मा से Exosomes का अलगाव

Exosomes are small vesicles ranging in size from 30 nm to 100 nm that are released both constitutively and upon stimulation from a variety of cell types. ...

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle (GUV) Membranes

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle GUV Membranes

एचआईवी -1 चुप के दृश्य विशालकाय unilamellar पुटिका (GUV) झिल्ली के लिए बाइंडिंग

The structural protein of HIV-1, Pr55Gag (or Gag), binds to the plasma membrane in cells during the virus assembly process. Membrane binding of Gag is an ...

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

का नाप<em&gt; इन विट्रो</em&gt; एचआईवी -1 Preintegration परिसर की एकता गतिविधि

HIV-1 envelope proteins engage cognate receptors on the target cell surface, which leads to viral-cell membrane fusion followed by the release of the ...