Name: generation of composite plants in medicago truncatula used for nodulation assays
Uploaded: 2011-03-27T14:00:00
Duration: 13 min 37 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Generation of Composite Plants in Medicago truncatula used for Nodulation Assays at JoVE.com

저자는 우리 실험실과 DRS에 털이 루트 기술을 소개하는 박사 크리스 테일러 (오하이오 주립 대학)에 감사드립니다. Senthil Subramanian (사우 스다코타 주립 대학), 프로토콜 개선을위한 후안 장 (Ludong 대학 산동 중국). 우리는 또한이 비디오를 만드는 데 도움이 박사 하오 쳉 (남경 농업 대학) 감사합니다. 이 작품은 오우으로 DOE (DE - SC0001295), NSF (MCB - 0923779)과 USDA (2010-65116-20514)에서 부여에 의해 일부 지원

다음 프로토콜은 모델 콩과의 식물 종 M.에 털이 루트 복합 발전소를 생성하는 데 사용되었습니다 truncatula. 비슷한 프로토콜은 적어도 8 식물 종의 1-4에 맞게 조정되었습니다. 우리는 M. 사용 truncatula 털이 루트 복합 식물 뿌리와 결절 개발에 유전자 기능을 연구하기 위해 서요. 털이 루트 복합 발전소를 생성 2),, 3) 공생 Rhizobia 감염, 그리고 4) 유전자 변형 루트 식별을 준비하는 식물 재료에게) 1 : 프로토콜은 4 개의 섹션으로 분리되었습니다. 우리는 합성 유전자 변형 식물의 뿌리 3 검사의 기자로 녹색 형광 단백질 (GFP) 유전자를 포함하는 바이너리 벡터를 사용합니다. 항생제 기반의 선택에 비해 GFP 기반의 심사는 빠르고 쉽게, 그리고 저렴합니다. 우리 구조에서 ER 표현 최적화된 GFP 유전자는 유전자 변형이 아닌 유전자 변형 뿌리 사이에 쉽게 구별 수 있도록 유전자 변형 뿌리에 강한 제정 GFP 신호를 가지고있는 슈퍼 ubiquitin 발기인에 의해 구동됩니다. 1. 식물 재료 준비 <ol><li> M. truncautla의 씨앗은 온실 재배 식물 (50 % 상대 습도, ​​8분의 16 H 조명 / 어두운, 18분의 22 ° C 주 / 야 온도)에서 수확하고 있습니다. 성숙한 종자는 4 ° C.에 저장할 수 있습니다 </li><li> 약 100 씨앗은 정기 잡고 10 분 10 ML 집중 황산 (95-98%, 시그마 - 알드리치, MO)에 scarified 있습니다. </li><li> 씨앗은 부드러운 교반과 멸균 물을 5-7 번 씻어서 있습니다. </li><li> 씨앗은 다음 6 시간 동안 실온에서 물에 흠뻑 젖고 ° C가 36-48시간에 대한 발아를 동기화 4 보관됩니다. </li><li> 약 20-30 종자는 페트리 접시에 배치 젖은 여과지에 보급하고 있습니다. 그들은 22 ° C 유지를 μmol.m -2 8분의 16 H 조명 / 어두운주기, 그리고 40. S -1 빛의 강도는, 5-6 일간. </li><li> Germinated 모종은 흙으로 전송하고 한 달 동안 온실에 배치됩니다. </li></ol> 2. 헤어 루트 복합 식물을 생성 <ol><li> 관심 유전자를 갖고 이진 구성 요소 A.으로 변형되었다 표준 프로토콜을 사용 rhizogenes. 우리는 유전자 변형 조직 검사를 용이하게 마커로서 GFP 유전자를 포함하는 바이너리 벡터의 집합을 꾀하고있다. 이 벡터는 다양한 발기인을 포함하고 모두 이상 표현이나 타겟 유전자 3,5의 입을위한 게이트웨이 복제 사이트 (Invitrogen, 칼스 배드, CA) 있습니다. </li><li> A. rhizogenes의는 28에서 적절한 항생제 선택과 50ml LB 배지 ° 16~24시간 들면 C에서 양식입니다. </li><li> 박테리아는 질소없는 식물 영양소 솔루션 (표 1, 6) = 0.3를 수집하여 OD 600의 최종 농도에 다시 중지합니다. </li><li> 털이 루트 재생, 소독 지원 매트릭스 (이하 &quot;록 양모&quot;Hummert 국제, 지구시, MO)을 지원하기 위해하는 것은 약 3cm 3 플러그로 절단됩니다. 하나는 페트리 접시에 4 플러그를 놓으십시오. </li><li> 구멍 explants의 삽입을 용이하게하기 위해 피펫 팁을 사용하여 각 플러그 위에 찌르고있다. A. rhizogenes (5 ML)은 각 플러그인에 추가됩니다. </li><li> 2-3 겨드랑 꽃봉오리와 촬영 섹션 슬랜팅 절단에 의해 excised 수 있습니다. explant은 다음 플러그에 삽입하고, 22 ° C 3 주에 대한 성장이다. 우리는 물이 그들을 5 ML 질소 무료 솔루션을 필요한 경우와 다음, 처음 10 일 동안 물을없이 Medicago의 explants을 유지. 우리는 혀끝의 분열 조직을 제거하는 것은 우발적인 뿌리의 형성을 낮출 수있는 것으로 나타났습니다. </li></ol> 3. 공생 Rhizobia (Sinorhizobium Meliloti) 감염증 <ol><li> 3 주 후에 어떤 우발적인 뿌리가 록 양모에서 나타날 것입니다. 털이 루트 복합 식물은 록 양모에 관계없이, 모래 또는 vermiculite (소독)으로 전송됩니다. 그들은 22 온실에서 재배 ° C, 8분의 16 H 조명 / 어두운 사이클, 300 μmol.m -2. S는 1 주일 -1 빛의 강도. </li><li> rhizobia 감염, S. 이전에 meliloti 1201 50 ML 효모 추출물 - mannitol 30 ° C (표 2, 6,7)에서 7 일 동안 매체 양식입니다. </li><li> 다시 정지 rhizobia 세포는 OD 600의 최종 농도 = 0.08 사용하여 질소 무료로 영양 솔루션으로 희석하고 있습니다. S.의 10 ML 신선한 서스펜션 meliloti는 결절 형성을 유도하기 위해 각각의 합성 공장에 적용했다. </li></ol> 4. 유전자 변형 루트 식별 <ol><li> 두 주 rhizobi​​a 접종 후, 합성 식물은 물에 세척에 의해 뿌리입니다. 뿌리는 쉽게 물에 모래 또는 펄라이트 분리 수 있습니다. </li><li> 우리는 UV - 현미경 (니콘 SMZ1500, 여기 460 - 500nm, 505nm 이색성, 510nm 이상의 배리어)에서 털이 뿌리를 놓으십시오. 형질 뿌리는 GFP 양성하고 우발적인 뿌리는 GFP 아무것도 없습니다. 우리는 다음 뿌리 accordin를 수집g GFP 신호, 그리고 결절 번호를 카운트 루트 길이를 측정하고, 측면 루트 밀도를 계산합니다. GFP 부정적인 뿌리는 컨트롤로 사용됩니다. </li></ol> 5. 대표 결과 우리의 실험에서 새 머리카락 뿌리는 A. 후 2-3주에 explants에서 재생 rhizogenes innoculation. UV - 현미경, GFP 유전자를 가지고 유전자 변형 뿌리는 강한 녹색 형광 (그림 1)를 보여줍니다. 재생 뿌리와 GFP 긍정적인 뿌리 부분의 금액은 explants 및 복합 plants.On 평균의 성장 환경의 조건에 따라, 생산 뿌리의 25 %가 유전자 변형 털이 뿌리 셋 있었다. 변환 효율, 1)를 향상시키기 위해 로 비디오에 표시된 플라스틱 커버 운명은, 처음 몇 일 동안 성장 트레이에서 습도를 유지하기 위해 충분하고, 식물은 처음 며칠 동안 약간의 물을 필요로합니다. 과도한 관수는 털이 루트 형성에 해로운이며 2) Agrobacterium innoculant의 농도가 변화하는 것이 중요합니다. 세포의 과도한 금액은 털이 루트 형성 또는 결절 형성에 도움이되지 않습니다. 결절 형성은 물을 솔루션은 질소 무료 있어야합니다, 그렇지 않으면 몇 nodules가 형성됩니다. 털이 루트 복합 식물은 시작 물질로 cotyledons 또는 entact의 모종을 사용하여 생성할 수 있습니다. 위의 프로토콜만이 사소한 변경은 다른 조직 8 털이 뿌리를 생성할 수 ncessary 있습니다. 중요한 것은 각각의 털이 루트는 독립적인 변환 이벤트입니다. 따라서 하나의 합성 공장에서 관찰 phenotypes 여러 복합 식물의 반복에 의해 확인하는 데 필요한 몇 가지 transforamtion 이벤트의 총합으로 이루어진 <img src="/files/ftp_upload/2633/2633fig1.jpg" alt="그림 1" /> 그림 1. A. 형질 전환 뿌리는 털이 뿌리에서 밖으로 정렬할 수 있습니다. B.의 Nodules는 털이 루트 합성 공장에서 형성되었다. 우리는 4 주 된 M. 배치 UV - 현미경과 GFP 긍정적인 뿌리 아래에 truncatula 털이 뿌리 식물을 쉽게 확인할 수 있습니다. (레드 애로우 : GFP 루트, 노란색 화살표 : 비 - GFP 루트) <table border="1"><tbody><tr><td> 재고 </td><td> g/200ml </td><td> ML 재고 / 리터 </td></tr><tr><td> MgSO 4 0.7 H 2 O </td><td> 12.3 </td><td> 2 </td></tr><tr><td> CaCl 2 0.2 H 2 O </td><td> 14.7 </td><td> 4 </td></tr><tr><td> K 2 HPO 4 0.3 H 2 O </td><td> 6.8 </td><td> 1 </td></tr><tr><td> K 2 SO 4 </td><td> 11 </td><td> 4 </td></tr><tr><td> 철 Club 호텔 3 0.6 H 2 O </td><td> 0.49 </td><td> 2.5 </td></tr><tr><td> Micronutrients </td><td> 아래 참조 </td><td> 1 </td></tr></tbody></table><table border="1"><tbody><tr><td> Micronutrients </td><td> 리터 당 g </td></tr><tr><td> H 3 BO 3 </td><td> 0.142 </td></tr><tr><td> MnSO 4. H 2 O </td><td> 0.077 </td></tr><tr><td> ZnSO 4 0.7 H 2 O </td><td> 0.1725 </td></tr><tr><td> CuSO 4 0.5 H 2 O </td><td> 0.037 </td></tr><tr><td> NaMoO 4. H 2 O </td><td> 0.024 </td></tr><tr><td> CoCl 2. H 2 O </td><td> 0.0025 </td></tr><tr><td> NiSO 4 </td><td> 0.001 </td></tr></tbody></table> 표 1. Nitogen없는 영양 솔루션 <table border="1"><tbody><tr><td> K 2 HPO4 </td><td> 0.5g </td></tr><tr><td> NaCl </td><td> 0.1g </td></tr><tr><td> MgSO 4 명이 7H 2 O </td><td> 0.2g </td></tr><tr><td> 효모 추출 </td><td> 0.4g </td></tr><tr><td> Mannitol </td><td> 10g </td></tr><tr><td> 산도 = 6.8 </td><td></td></tr></tbody></table> 표 2. 효모는 (리터 당) mannitol 미디어를 추출

<ol>
	<li>Limpens, E., Ramos, J., Franken, C., Raz, V., Compaan, B., Franssen, H., Bisseling, T., Geurts, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNA+interference+in+Agrobacterium+rhizogenes-transformed+roots+of+Arabidopsis+and+Medicago+truncatula.">RNA interference in Agrobacterium rhizogenes-transformed roots of Arabidopsis and Medicago truncatula.</a> J. Exp. Bot. 55, 983-992 (2004).</li><li>Collier, R., Fuchs, B., Walter, N., Kevin, L. W., Taylor, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ex+vitro+composite+plants:+an+inexpensive,+rapid+method+for+root+biology.">Ex vitro composite plants: an inexpensive, rapid method for root biology.</a> Plant J. 43, 449-457 (2005).</li><li>Zhang, J., Subramanian, S., Stacey, G., Yu, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flavones+and+flavonols+play+distinct+critical+roles+during+nodulation+of+Medicago+truncatula+by+Sinorhizobium+meliloti.">Flavones and flavonols play distinct critical roles during nodulation of Medicago truncatula by Sinorhizobium meliloti.</a> Plant J. 57, 171-183 (2009).</li><li>Boisson-Dernier, A., Chabaud, M., Garcia, F., Becard, G., Rosenberg, C., Barker, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Agrobacterium-rhizogenes-transformed+roots+of+Medicago+truncatula+for+the+study+of+nitrogen-fixing+and+endomycorrhizal+symbiotic+associations.">Agrobacterium-rhizogenes-transformed roots of Medicago truncatula for the study of nitrogen-fixing and endomycorrhizal symbiotic associations.</a> Mol. Plant-Microbe Interact. 14, 695-700 (2001).</li><li>Zhang, J., Subramanian, S., Zhang, Y., Yu, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flavone+synthases+from+Medicago+truncatula+are+flavanone-2-hydroxylases+and+are+important+for+nodulation.">Flavone synthases from Medicago truncatula are flavanone-2-hydroxylases and are important for nodulation.</a> Plant Physiol. 144, 741-751 .</li><li>Subramanian, S., Hu, X., Lu, G., Odelland, J., Yu, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+promoters+of+two+isoflavone+synthase+genes+respond+differentially+to+nodulation+and+defense+signals+in+transgenic+soybean+roots.">The promoters of two isoflavone synthase genes respond differentially to nodulation and defense signals in transgenic soybean roots.</a> Plant Mol Biol. 54, 623-639 (2004).</li><li>Vincent, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> A manual for the practical study of root nodule bacteria International Biological Program Handbook. , 1-13 (1970).</li><li>Subramanian, S., Graham, M. Y., Yu, O., Graham, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNA+Interference+of+Soybean+Isoflavone+Synthase+Genes+Leads+to+Silencing+in+Tissues+Distal+to+the+Transformation+Site+and+to+Enhanced+Susceptibility+to+Phytophthora+sojae.">RNA Interference of Soybean Isoflavone Synthase Genes Leads to Silencing in Tissues Distal to the Transformation Site and to Enhanced Susceptibility to Phytophthora sojae.</a> Plant Physiol. 137, 1345-1353 (2005).</li></ol>

관심 없음 충돌 선언하지 않습니다.

털이 루트 합성 공장을 생성하는 것은 많은 dicot 종족에 대한 유전자 변형 물질의 다량을 얻을 수있는 빠르고 쉬운 방법입니다. 이 방법은 유전자 변형 종자를 생산할 수 없지만, 그것은 몇 주 안에 유전자 변형 물질을 생성할 수 있습니다. 방법은 어려움이 조직 문화를 구축하거나 안정적인 transformants 생성을 가지고 식물에 특히 적합합니다. 수년에 걸쳐, 우리는 유전자 기능, 발기인 기능, microRNAs, 루트 및 측면 루트 개발, 국방 및 비생물적 스트레스 반응, 유괴 및 기타 공생 프로세스, 호르몬 반응, 신진 대사 프로 파일링, 유전자 프로 파일링, proteomic 분석, 연구를이 기술을 사용한 다른 생물 학적 처리합니다. 프로토콜은 강력하고 복제할 수 있습니다.

generation of composite plants in medicago truncatula used for nodulation assays

Agrobacterium의 tumerfaciens 마찬가지로, Agrobacterium rhizogenes의는 플라스미드 (리) 루트 - 유도하는 자율을 바탕으로 식물 세포에 외국 DNAs을 전송할 수 있습니다. 답변 rhizogenes는 식물 조직에 털이 루트 형성 원인 및 변환 후 복합 발전소를 형성할 수 있습니다. 이러한 복합 식물에서 생성 뿌리의 일부가 야생 타입 T - DNA와 엔지니어링 이진 벡터를 들고, 유전자 변형되며, 쏘고는 에너지 및 성장 지원을 제공하기 위해 제공 아직되지 않은 유전자 변형되는 동안. 이러한 털이 루트 복합 식물 유전자 변형 종자를 생산하지 않지만 식물 연구에 매우 유용 이러한 합성 공장을 만드는 중요한 기능은 여러 가지가있을 수 있습니다. 첫째, 광범위한 호스트 범위, ​​A. rhizogenes는 인류의 다양한 유전 공학을 허용, 특히 많은 식물 종, dicots를 변환하실 수 있습니다. 둘째, A. rhizogenes 직접 조직 및 explants 감염, 이전에 변환 할 조직 문화는 완강히 저항하는 식물 종의 변화에 이상적, 복합 발전소를 얻을 필요가 없습니다. 또한, 유전자 변형 루트 조직은 주 만에 생성할 수 있습니다. Medicago truncatula 들어, 우리는 정상적인 꽃 물놀이 Arabidopsis 변형보다 같은 짧은 셋처럼 주 형질 뿌리를 얻을 수 있습니다. 전반적으로, 털이 루트 복합 플랜트 기술은 유전자 기능을 연구하고 관련 - phenotypes를 루트에 다목적하고 유용한 도구입니다. 여기 털이 루트 복합 식물이 어려운 변환 종 M. 공장 - rhizobium 상호 작용과 유괴를 공부하는 데 사용할 수있는 방법을 보여줍니다 truncatula.

Watch this Scientific Journal Video about Generation of Composite Plants in Medicago truncatula used for Nodulation Assays at JoVE.com

Generation of Composite Plants in Medicago truncatula used for Nodulation Assays

털이 루트 복합 식물이 어려운 변환 종의 식물 rhizobi​​um 상호 작용과 유괴를 공부하는 데 사용할 수있는 방법을 우리가 보여<em&gt; Medicago truncatula</em&gt;.

의 복합 식물의 생성 Medicago truncatula 유괴의 Assays 사용

Similar to Agrobacterium tumerfaciens, Agrobacterium rhizogenes can transfer foreign DNAs into plant cells based on the autonomous root-inducing (Ri) ...

Research

JoVE Journal

Biology

Generation of Composite Plants in Medicago truncatula used for Nodulation Assays

Analysis of Schwann-astrocyte Interactions Using In Vitro Assays

Analysis of Schwann-astrocyte Interactions Using In Vitro Assays

사용 Schwann - astrocyte 상호 작용 분석 체외에서 Assays

Schwann cells are one of the commonly used cells in repair strategies following spinal cord injuries. Schwann cells are capable of supporting axonal ...

연구

생물학

In Situ Hybridization for the Precise Localization of Transcripts in Plants

In Situ Hybridization for the Precise Localization of Transcripts in Plants

식물의 성적 증명서의 정확한 현지화에 대한 원위치 하이브리드화에서

With the advances in genomics research of the past decade, plant biology has seen numerous studies presenting large-scale quantitative analyses of gene ...

Viability Assays for Cells in Culture

문화의 세포에 대한 생존 분석 실험

Manual cell counts on a microscope are a sensitive means of assessing cellular viability but are time-consuming and therefore expensive. Computerized ...

Efficient Generation Human Induced Pluripotent Stem Cells from Human Somatic Cells with Sendai-virus

센다이 바이러스와 인간의 체세포의 효율적인 생성 인간 유도 만능 줄기 세포

A few years ago, the establishment of human induced pluripotent stem cells (iPSCs) ushered in a new era in biomedicine. Potential uses of human iPSCs ...

MALDI-Mass Spectrometric Imaging for the Investigation of Metabolites in Medicago truncatula Root Nodules

MALDI-Mass Spectrometric Imaging for the Investigation of Metabolites in Medicago truncatula Root Nodules

의 대사 산물의 조사를위한 MALDI-질량 분석 이미징<em&gt; 개자리 truncatula</em&gt; 루트 결절

Most techniques used to study small molecules, such as pharmaceutical drugs or endogenous metabolites, employ tissue extracts which require the ...

Measuring Spatial and Temporal Ca2+ Signals in Arabidopsis Plants

Measuring Spatial and Temporal Ca2+ Signals in Arabidopsis Plants

측정 공간적 칼슘<sup&gt; 2 +</sup애기 장대 식물에서&gt; 신호

Developmental and environmental cues induce Ca2+ fluctuations in plant cells. Stimulus-specific spatial-temporal Ca2+ patterns are sensed by cellular Ca2+ ...

MRM Microcoil Performance Calibration and Usage Demonstrated on Medicago truncatula Roots at 22 T

MRM Microcoil Performance Calibration and Usage Demonstrated on Medicago truncatula Roots at 22 T

MRM 마이크로코일 성능 교정 및 사용 에 설명 된 메디카고 트런카툴라 뿌리에 22 T

This protocol describes a signal-to-noise ratio (SNR) calibration and sample preparation method for solenoidal microcoils combined with biological ...

Laser-Capture Microdissection RNA-Sequencing for Spatial and Temporal Tissue-Specific Gene Expression Analysis in Plants

레이저 캡처 미세 절 RNA-시퀀싱 용 공간 및 측두 조직 -특정 유전자 발현 분석

The development of a complex multicellular organism is governed by distinct cell types that have different transcriptional profiles. To identify ...

Microscopy Techniques for Interpreting Fungal Colonization in Mycoheterotrophic Plants Tissues and Symbiotic Germination of Seeds

균종속영양 식물 조직의 곰팡이 집락화 및 종자의 공생 발아를 해석하기 위한 현미경 기술

Structural botany is an indispensable perspective to fully understand the ecology, physiology, development, and evolution of plants. When researching ...

AirID-Based Proximity Labeling for Protein-Protein Interaction in Plants

식물의 단백질-단백질 상호작용을 위한 AirID 기반 근접 라벨링

In mammalian cells and plants, proximity labeling (PL) approaches using modified ascorbate peroxidase (APEX) or the Escherichia coli biotin ligase BirA ...