Name: sequencing of bacterial microflora in peripheral blood: our experience with hiv-infected patients
Uploaded: 2011-06-11T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients at JoVE.com

אנו אסירי תודה ג&#39;יאני Scimone לסיוע מעולה עם ביצוע וידאו.

טיפול של דגימות דם נגוע ב-HIV דורש כמה המלצות חשובות. דגימות דם של כל חייב להיות מועבר דליפה הוכחה מכולות חזקים. יש להקפיד בעת לקיחת הדגימה, כדי למנוע זיהום חיצוני של מכולה של כל הניירת המלווה את הדגימה. כל האנשים עיבוד דם נגוע חייב ללבוש כפפות. כפפות יש לשנות לרח?...

<ol>
	<li>Hooper, L. V., Macpherson, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immune+adaptations+that+maintain+homeostasis+with+the+intestinal+microbiota.">Immune adaptations that maintain homeostasis with the intestinal microbiota.</a> Nat Rev Immunol. 10, 159-169 (2010).</li><li>Macpherson, A. J., Harris, N. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactions+between+commensal+intestinal+bacteria+and+the+immune+system.">Interactions between commensal intestinal bacteria and the immune system.</a> Nat Rev Immunol. 4, 478-485 (2004).</li><li>Kanauchi, O., Mitsuyama, K., Araki, Y., Andoh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modification+of+intestinal+flora+in+the+treatment+of+inflammatory+bowel+disease.">Modification of intestinal flora in the treatment of inflammatory bowel disease.</a> Curr Pharm Des. 9, 333-346 (2003).</li><li>Brenchley, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+translocation+is+a+cause+of+systemic+immune+activation+in+chronic+HIV+infection.">Microbial translocation is a cause of systemic immune activation in chronic HIV infection.</a> Nat Med. 12, 1365-1371 (2006).</li><li>Brenchley, J. M., Price, D. A., Douek, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV+disease:+fallout+from+a+mucosal+catastrophe.">HIV disease: fallout from a mucosal catastrophe.</a> Nat Immunol. 7, 235-239 (2006).</li><li>Jiang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plasma+levels+of+bacterial+DNA+correlate+with+immune+activation+and+the+magnitude+of+immune+restoration+in+persons+with+antiretroviral-treated+HIV+infection.">Plasma levels of bacterial DNA correlate with immune activation and the magnitude of immune restoration in persons with antiretroviral-treated HIV infection.</a> J Infect Dis. 199, 1177-1185 (2009).</li><li>Marchetti, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+translocation+is+associated+with+sustained+failure+in+CD4++T-cell+reconstitution+in+HIV-infected+patients+on+long-term+highly+active+antiretroviral+therapy.">Microbial translocation is associated with sustained failure in CD4+ T-cell reconstitution in HIV-infected patients on long-term highly active antiretroviral therapy.</a> AIDS. 22, 2035-2038 (2008).</li><li>Marchetti, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+Microbial+Translocation+and+Immune+Hyperactivation+in+Disease+Progression+of+HIV++Patients+with+Preserved+CD4+Count+in+the+Absence+of+ART.">Role of Microbial Translocation and Immune Hyperactivation in Disease Progression of HIV+ Patients with Preserved CD4 Count in the Absence of ART.</a> , (2010).</li><li>Greisen, K., Loeffelholz, M., Purohit, A., Leong, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PCR+primers+and+probes+for+the+16S+rRNA+gene+of+most+species+of+pathogenic+bacteria,+including+bacteria+found+in+cerebrospinal+fluid.">PCR primers and probes for the 16S rRNA gene of most species of pathogenic bacteria, including bacteria found in cerebrospinal fluid.</a> J Clin Microbiol. 32, 335-351 (1994).</li></ol>

<p class="jove_content"&gt; הננו להראות פרוטוקול ה-PCR / ריצוף לאפיין את טרנסלוקציה של חיידקים דם היקפיים של HIV-נגוע יחידים.</p&gt;<p class="jove_content"&gt; תוצאות אמינות ביותר מתקבלים בעת שימוש פלזמה שנאספו EDTA המכילים צינורות. לאחר דגימה דם, פלזמה צריכים להיות מופרדים על ידי צנטריפוגה בתוך 2 / 3 שעות, כדי למנוע שבר השפלה haemolysis ו-DNA. ?...

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><th> שם מגיב </th><th> חברה </th><th> מספר קטלוגי </th><th> הערות (אופציונלי) </th></tr><tr><td> Easty-DNA Kit </td><td> Invitrogen </td><td> K 180001 </td><td></td></tr><tr><td> כלורופורם </td><td> סיגמא אולדריץ </td><td> C2432 </td><td></td></tr><tr><td> אתנול </td><td> סיגמא אולדריץ </td><td> E7203 </td><td></td><tr/><tr><td> Ultrapure Waer </td><td> Invitrogen </td><td> 10977049 </td><td></td></tr><tr><td> ליזוזים </td><td> Fluka </td><td> 62970 </td><td> 10 מיקרוגרם / מ&quot;ל ​​מים Distillated </td></tr><tr><td> AmpliTaq זהב </td><td> אפלייד Biosystem </td><td> 26478701 </td><td></td></tr><tr><td> Microcon 100 </td><td> Millipore </td><td> 42413 </td><td></td></tr><tr><td> PCR primers </td><td> Invitrogen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Agarose </td><td> Eppendorf </td><td> C1343 </td><td></td></tr><tr><td> ה-DNA סולם </td><td> Invitrogen </td><td> 15628019 </td><td></td></tr><tr><td> Purelink PCR מיקרו בערכה </td><td> Invitrogen </td><td> K310050 </td><td></td></tr><tr><td> אגר LB, אבקת </td><td> Invitrogen </td><td> 22700025 </td><td></td></tr><tr><td> Bactoagar </td><td> Invitrogen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> אמפיצילין </td><td> Invitrogen </td><td> 11593027 </td><td> 10 מ&quot;ג / מ&quot;ל ​​מים Distillated </td></tr><tr><td> X-gal </td><td> Invitrogen </td><td> 15520034 </td><td> 40mg/mL ב DMF </td></tr><tr><td> IPTG </td><td> Invitrogen </td><td> 15529019 </td><td> 100mm במים Distillated </td></tr><tr><td> Topo ת&quot;א ערכה שיבוט </td><td> Invitrogen </td><td> K450002 </td><td></td></tr><tr><td> Purelink מהירה ערכת פלסמיד Miniprep </td><td> Invitrogen </td><td> K210010 </td><td></td></tr><tr><td> ביג צבע </td><td> אפלייד Biosystem </td><td> 4337455 </td><td></td></tr><tr><td> DyeEx 2.0 ספין ערכת </td><td> Qiagen </td><td> 63204 </td><td></td></tr></tbody></table>

sequencing of bacterial microflora in peripheral blood: our experience with hiv-infected patients

מערכת העיכול בריאה מבחינה פיזיולוגית יישבו על ידי מגוון רחב של חיידקים commensal המשפיעים על התפתחות של 1,2 מערכת הריריות הלחות ואת החיסונית התאית. החיידקים הוא מוגן מפני מערכת החיסון דרך מחסום הרירית חזק. זיהומים ואנטיביוטיקה ידועים לשנות גם את המכשול נורמלי מערכת העיכול ואת הרכב של חיידקים תושב, אשר עלול לגרום הפרעות החיסון ניתן 3. HIV גורם פרצה מחסום העיכול עם כישלון מתמשך של חסינות זליגת הרירית תוך מחזור מערכתי של bioproducts חיידקי, כגון lipopolysaccharide ושברי DNA בקטריאלי, אשר תורמת להפעלת מערכת החיסון מערכתית 4-7. טרנסלוקציה מיקרוביאלית הוא מעורב immunopathogenesis HIV / איידס ועל התגובה לטיפול 4,8. אנו שמטרתו לאפיין את ההרכב של חיידקים translocating בדם ההיקפי של HIV-נגועים. כדי לרדוף אחרי המטרה שלנו הקמנו תגובת PCR עבור הגן 16S panbacteric ribosomial ואחריו ניתוח רצף. בקצרה, כל דם משני הנושאים HIV נגועים ובריאים משמש. בהתחשב בעובדה אנשים בריאים הנוכחית הומאוסטזיס מעיים רגילה ללא טרנסלוקציה של מיקרופלורת צפוי בחולים אלו. לאחר איסוף הדם כולו על ידי venipuncture והפרדה פלזמה, הדנ&quot;א מופק פלזמה המשמש לביצוע מגוון רחב PCR תגובה עבור 16S panbacteric ribosomial גן 9. ניתוחים לאחר טיהור PCR המוצר, שיבוט רצף מבוצעות.

Watch this Scientific Journal Video about Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients at JoVE.com

Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients

הניסוי שלנו יציגו כיצד לבצע ניתוח רצף של מינים translocating חיידקי בדם ההיקפי של חולי איידס.

רצף של מיקרופלורת חיידקים דם היקפיים: הניסיון שלנו עם HIV נגועים חולים

The healthy gastrointestinal tract is physiologically colonized by a large variety of commensal microbes that influence the development 
	of the humoral ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Modeling Intracerebral Hemorrhage in Mice: Injection of Autologous Blood or Bacterial Collagenase

דימום דוגמנות intracerebral בעכברים: הזרקה של דם או השתלת collagenase קטריאלי

Spontaneous intracerebral hemorrhage (ICH) defines a potentially life-threatening neurological malady that accounts for 10-15% of all stroke-related ...

Measuring Frailty in HIV-infected Individuals. Identification of Frail Patients is the First Step to Amelioration and Reversal of Frailty

מדידת חולשה באנשים נגועים ב-HIV. זיהוי של חולים חלושים הוא הצעד הראשון להטבה והיפוך של חולשה

A simple, validated protocol consisting of a battery of tests is available to identify elderly patients with frailty syndrome. This syndrome of decreased ...

Computerized Dynamic Posturography for Postural Control Assessment in Patients with Intermittent Claudication

Computerized dynamic posturography with the EquiTest is an objective technique for measuring postural strategies under challenging static and dynamic ...

Assessment of Vascular Function in Patients With Chronic Kidney Disease

הערכה של תפקוד כלי דם בחולים עם מחלת כליות כרונית

Patients with chronic kidney disease (CKD) have significantly increased risk of cardiovascular disease (CVD) compared to the general population, and this ...

Orthotopic Implantation and Peripheral Immune Cell Monitoring in the II-45 Syngeneic Rat Mesothelioma Model

ניטור נייד Orthotopic השרשה והיקפי חיסון במודל השני-45 syngeneic עכברוש מזותליומה

The enormous upsurge of interest in immune-based treatments for cancer such as vaccines and immune checkpoint inhibitors, and increased understanding of ...

Endotoxin Activity Assay for the Detection of Whole Blood Endotoxemia in Critically Ill Patients

שיטת פעילות אנדוטוקסין לאיתור דם כולו אנדוטוקמיה בחולים חולי אנוש

Lipopolysaccharide, also known as endotoxin, is a fundamental component of gram-negative bacteria and plays a crucial role in the development of sepsis ...

Semi-quantitative Assessment Using [18F]FDG Tracer in Patients with Severe Brain Injury

Semi-quantitative Assessment Using [18F]FDG Tracer in Patients with Severe Brain Injury

הערכה כמותית למחצה באמצעות מעקב FDG [18F] בחולים עם פגיעה מוחית חמורה

Patients with severe traumatic brain injury (sTBI) have difficulty knowing whether they are accurately expressing their thoughts and emotions because of ...

Digital Handwriting Analysis of Characters in Chinese Patients with Mild Cognitive Impairment

ניתוח כתב יד דיגיטלי של תווים בחולים סינים עם פגיעה קוגניטיבית קלה

An increasing amount of evidence shows that cognitive deficits and movement dysfunctions are not separated. Patients with mild cognitive impairment (MCI) ...

Fertility Preservation in Patients with Severe Ovarian Dysfunction

שימור פוריות בחולים עם תפקוד לקוי של השחלות חמורות

Ovarian function progressively declines during aging and in some pathophysiological conditions including karyotype abnormality, autoimmune diseases, ...

Evaluation of a Point-of-Care Testing Analyzer for Measuring Peripheral Blood Leukocytes

הערכה של מנתח בדיקת נקודת טיפול למדידת לויקוציטים בדם היקפי

White blood cell (WBC) is an important indicator of inflammation in the body, and it can help distinguish between bacterial and viral infections. At ...