Name: sequencing of bacterial microflora in peripheral blood: our experience with hiv-infected patients
Uploaded: 2011-06-11T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients at JoVE.com

Gianni Scimone video yapma ile mükemmel destek için minnettar.

HIV ile enfekte kan örneklerinin taşınması için bazı önemli tavsiyeler gerektirir. Tüm kan örnekleri sağlam sızdırmaz kaplarda taşınmalıdır. Konteyner dış ve numune ile birlikte herhangi bir evrak kirlenmesini önlemek için numune toplarken dikkatli olmalıdır. Enfekte kan işleme tüm kişilerin eldiven giymelidir. Eldiven değişti ve ellerini örnek işlem tamamlandıktan sonra yıkanmış olmalıdır. HIV virüslü kan örnekleri İşleme sınıf II biohazard kabin kaput yap?...

<ol>
	<li>Hooper, L. V., Macpherson, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Immune+adaptations+that+maintain+homeostasis+with+the+intestinal+microbiota.">Immune adaptations that maintain homeostasis with the intestinal microbiota.</a> Nat Rev Immunol. 10, 159-169 (2010).</li><li>Macpherson, A. J., Harris, N. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Interactions+between+commensal+intestinal+bacteria+and+the+immune+system.">Interactions between commensal intestinal bacteria and the immune system.</a> Nat Rev Immunol. 4, 478-485 (2004).</li><li>Kanauchi, O., Mitsuyama, K., Araki, Y., Andoh, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modification+of+intestinal+flora+in+the+treatment+of+inflammatory+bowel+disease.">Modification of intestinal flora in the treatment of inflammatory bowel disease.</a> Curr Pharm Des. 9, 333-346 (2003).</li><li>Brenchley, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+translocation+is+a+cause+of+systemic+immune+activation+in+chronic+HIV+infection.">Microbial translocation is a cause of systemic immune activation in chronic HIV infection.</a> Nat Med. 12, 1365-1371 (2006).</li><li>Brenchley, J. M., Price, D. A., Douek, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV+disease:+fallout+from+a+mucosal+catastrophe.">HIV disease: fallout from a mucosal catastrophe.</a> Nat Immunol. 7, 235-239 (2006).</li><li>Jiang, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plasma+levels+of+bacterial+DNA+correlate+with+immune+activation+and+the+magnitude+of+immune+restoration+in+persons+with+antiretroviral-treated+HIV+infection.">Plasma levels of bacterial DNA correlate with immune activation and the magnitude of immune restoration in persons with antiretroviral-treated HIV infection.</a> J Infect Dis. 199, 1177-1185 (2009).</li><li>Marchetti, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+translocation+is+associated+with+sustained+failure+in+CD4++T-cell+reconstitution+in+HIV-infected+patients+on+long-term+highly+active+antiretroviral+therapy.">Microbial translocation is associated with sustained failure in CD4+ T-cell reconstitution in HIV-infected patients on long-term highly active antiretroviral therapy.</a> AIDS. 22, 2035-2038 (2008).</li><li>Marchetti, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+Microbial+Translocation+and+Immune+Hyperactivation+in+Disease+Progression+of+HIV++Patients+with+Preserved+CD4+Count+in+the+Absence+of+ART.">Role of Microbial Translocation and Immune Hyperactivation in Disease Progression of HIV+ Patients with Preserved CD4 Count in the Absence of ART.</a> , (2010).</li><li>Greisen, K., Loeffelholz, M., Purohit, A., Leong, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=PCR+primers+and+probes+for+the+16S+rRNA+gene+of+most+species+of+pathogenic+bacteria,+including+bacteria+found+in+cerebrospinal+fluid.">PCR primers and probes for the 16S rRNA gene of most species of pathogenic bacteria, including bacteria found in cerebrospinal fluid.</a> J Clin Microbiol. 32, 335-351 (1994).</li></ol>

<p class="jove_content"&gt; Biz, burada, HIV ile enfekte bireylerin periferik kan bakteri translokasyonu karakterize bir PCR / sıralama protokol göstermektedir.</p&gt;<p class="jove_content"EDTA içeren tüplere toplanan plazma kullanırken&gt; En güvenilir sonuçlar elde edilir. Kan örneklemesi sonra, plazma hemoliz ve DNA parçası bozulması önlemek için, 2 / 3 saat içinde santrifüj ile ayrılmış olmalıdır. Örnekler -80 sonra yaklaşık 5 gün ve ° C -20 ° C&#39;de saklanır Birden fazla donma ve çözülme döngüleri bakteri...

<table border="1"><tbody><tr><th> Reaktif Adı </th><th> Şirket </th><th> Katalog Numarası </th><th> Yorumlar (isteğe bağlı) </th></tr><tr><td> Easty-DNA Seti </td><td> Invitrogen </td><td> K 180.001 </td><td></td></tr><tr><td> Kloroform </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> C2432 </td><td></td></tr><tr><td> Etanol </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> E7203 </td><td></td><tr/><tr><td> Ultrapure Waer </td><td> Invitrogen </td><td> 10977049 </td><td></td></tr><tr><td> Lizozim </td><td> Fluka </td><td> 62970 </td><td> 10 mcg / mL distile su </td></tr><tr><td> AmpliTaq Gold </td><td> Uygulamalı Biosystem </td><td> 26478701 </td><td></td></tr><tr><td> Microcon 100 </td><td> Millipore </td><td> 42413 </td><td></td></tr><tr><td> PCR primerleri </td><td> Invitrogen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Agaroz </td><td> Eppendorf </td><td> C1343 </td><td></td></tr><tr><td> DNA merdiveni </td><td> Invitrogen </td><td> 15628019 </td><td></td></tr><tr><td> Purelink PCR mikro kiti </td><td> Invitrogen </td><td> K310050 </td><td></td></tr><tr><td> LB Agar, toz </td><td> Invitrogen </td><td> 22700025 </td><td></td></tr><tr><td> Bactoagar </td><td> Invitrogen </td><td></td><td></td></tr><tr><td> Ampisilin </td><td> Invitrogen </td><td> 11593027 </td><td> Distile su içinde 10 mg / ml </td></tr><tr><td> X-gal </td><td> Invitrogen </td><td> 15520034 </td><td> DMF içinde 40mg/mL </td></tr><tr><td> IPTG </td><td> Invitrogen </td><td> 15529019 </td><td> Distile su içinde 100 mM </td></tr><tr><td> Topo TA klonlama kiti </td><td> Invitrogen </td><td> K450002 </td><td></td></tr><tr><td> Purelink Hızlı Plazmid Miniprep kiti </td><td> Invitrogen </td><td> K210010 </td><td></td></tr><tr><td> Büyük boya </td><td> Uygulamalı Biosystem </td><td> 4337455 </td><td></td></tr><tr><td> DyeEx 2.0 dönmeye kiti </td><td> Qiagen </td><td> 63204 </td><td></td></tr></tbody></table>

sequencing of bacterial microflora in peripheral blood: our experience with hiv-infected patients

Sağlıklı bir gastrointestinal sistem, humoral ve hücresel mukozal bağışıklık sistemi 1,2 gelişimini etkileyen komensal mikropların çok çeşitli fizyolojik tarafından kolonize. Mikrobiyota bağışıklık sistemini güçlü bir mukozal bariyeri ile karşı korumalıdır. Enfeksiyonlar ve antibiyotikler normal gastrointestinal sistem bariyer ve yerleşik bakteri kompozisyonu, olası bağışıklık anormallikleri 3 sonuç değiştirmek için bilinmektedir. HIV, sistemik immün aktivasyon 4-7 katkıda lipopolisakkarid ve bakteriyel DNA parçaları gibi bakteriyel bioproducts, sistemik dolaşıma mukozal bağışıklık ve kaçak ilerici yetmezliği olan gastrointestinal bariyer ihlali neden olur . Mikrobiyal translokasyon, HIV / AIDS immünopatogenezi ve tedavisi 4,8 yanıt alakalıdır . Biz, HIV ile enfekte olan hastaların periferik kan translocating bakteriler bileşimi karakterize etmek amaçlanmıştır. Amacımız takip etmek, bir sıralama analizi ile takip panbacteric 16S ribosomial gen için PCR kurdu. Kısaca, hem de HIV ile enfekte ve sağlıklı kişilerde tam kan kullanılır. Sağlıklı bireyler normal bağırsak homeostazı mevcut olduğu göz önüne alındığında, bu hastalarda mikroflora hiçbir translokasyon bekleniyor. Venipunktür ve plazma ayırma ile tam kan toplama, DNA plazmasından elde edilen ve gen 9 ribosomial panbacteric 16S için geniş bir PCR reaksiyonu gerçekleştirmek için kullanılır. Takiben PCR ürün arıtma, klonlama ve sıralama analizleri yapılmaktadır.

Watch this Scientific Journal Video about Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients at JoVE.com

Sequencing of Bacterial Microflora in Peripheral Blood: our Experience with HIV-infected Patients

Bizim deney HIV pozitif hastaların periferik kan translocating bakteri türlerinin bir sıralama analizi gerçekleştirmek için nasıl gösterecektir.

Periferik Kan Bakteriyel Mikroflorası Sıralama: HIV ile enfekte olan hastalar ile bizim Deneyimi

The healthy gastrointestinal tract is physiologically colonized by a large variety of commensal microbes that influence the development 
	of the humoral ...

Research

JoVE Journal

Medicine

Modeling Intracerebral Hemorrhage in Mice: Injection of Autologous Blood or Bacterial Collagenase

Farelerde Modelleme İntraserebral Kanama: Otolog Kan veya bakteriyel kollajenaz Enjeksiyon

Spontaneous intracerebral hemorrhage (ICH) defines a potentially life-threatening neurological malady that accounts for 10-15% of all stroke-related ...

Measuring Frailty in HIV-infected Individuals. Identification of Frail Patients is the First Step to Amelioration and Reversal of Frailty

HIV ile enfekte Bireylerde Frailty ölçüm. Narin Hastalar tanımlanması Islahı ve Frailty iptali için ilk adımdır

A simple, validated protocol consisting of a battery of tests is available to identify elderly patients with frailty syndrome. This syndrome of decreased ...

Computerized Dynamic Posturography for Postural Control Assessment in Patients with Intermittent Claudication

Aralıklı topallama Hastalarda Postural Kontrol Değerlendirme için bilgisayarlı dinamik postürografi

Computerized dynamic posturography with the EquiTest is an objective technique for measuring postural strategies under challenging static and dynamic ...

Assessment of Vascular Function in Patients With Chronic Kidney Disease

Kronik Böbrek Hastalarında Vasküler Fonksiyon Değerlendirilmesi

Patients with chronic kidney disease (CKD) have significantly increased risk of cardiovascular disease (CVD) compared to the general population, and this ...

Orthotopic Implantation and Peripheral Immune Cell Monitoring in the II-45 Syngeneic Rat Mesothelioma Model

II-45 singenik Rat Mezotelyoma Modelinde Ortotopik Yerleştirilmesi ve Periferik Bağışıklık Hücre İzleme

The enormous upsurge of interest in immune-based treatments for cancer such as vaccines and immune checkpoint inhibitors, and increased understanding of ...

Endotoxin Activity Assay for the Detection of Whole Blood Endotoxemia in Critically Ill Patients

Eleştirel hasta hastalarda tam kan endotoksemi tespiti için endotoksin aktivite assay

Lipopolysaccharide, also known as endotoxin, is a fundamental component of gram-negative bacteria and plays a crucial role in the development of sepsis ...

Semi-quantitative Assessment Using [18F]FDG Tracer in Patients with Severe Brain Injury

Semi-quantitative Assessment Using [18F]FDG Tracer in Patients with Severe Brain Injury

Yarı kantitatif değerlendirmesi ağır beyin hasarı olan hastalarda [18F] FDG izleyici kullanarak

Patients with severe traumatic brain injury (sTBI) have difficulty knowing whether they are accurately expressing their thoughts and emotions because of ...

Digital Handwriting Analysis of Characters in Chinese Patients with Mild Cognitive Impairment

Hafif Bilişsel Bozukluğu Olan Çinli Hastalarda Karakterlerin Dijital El Yazısı Analizi

An increasing amount of evidence shows that cognitive deficits and movement dysfunctions are not separated. Patients with mild cognitive impairment (MCI) ...

Fertility Preservation in Patients with Severe Ovarian Dysfunction

Şiddetli Yumurtalık Disfonksiyonu Olan Hastalarda Doğurganlığın Korunması

Ovarian function progressively declines during aging and in some pathophysiological conditions including karyotype abnormality, autoimmune diseases, ...

Evaluation of a Point-of-Care Testing Analyzer for Measuring Peripheral Blood Leukocytes

Periferik Kan Lökositlerini Ölçmek için Bakım Noktası Test Analizörünün Değerlendirilmesi

White blood cell (WBC) is an important indicator of inflammation in the body, and it can help distinguish between bacterial and viral infections. At ...