Name: competitive genomic screens of barcoded yeast libraries
Uploaded: 2011-08-11T14:00:00
Duration: 11 min 59 s
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우리는 론 데이비스, 아담 Deutschbauer, 그리고 토론과 조언 토론토 대학에서 전체 힙합 실험실 감사합니다. CN은 국가 인간 게놈 연구소 (부여 번호 HG000205), RO1 HG003317, CIHR 청소 - 84,305, 그리고 캐나다 암 협회 (# 020380)에서 기금에 의해 지원됩니다. JO는 스탠포드 게놈 연수 프로그램 (부여 번호 T32 HG00044 국가 인간 게놈 연구소에서)와 국립 보건원 (부여 번호 P01 GH000205)에 의해 지원되었다. GG는 DRS으로 혁신에 대한 캐나다 재단의 보조금에 의해 일부 지원 NHGRI RO1 HG003317와 캐나다 암 협회, 그랜트 # 020380, TD 및 도널리 시퀀싱 센터에 의해 지원됩니다. 브렌다 앤드류스와 잭 그린 블. AMS는 토론토 오픈 원정대의 대학에 의해 지원됩니다.

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	<li>Giaever, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Functional+profiling+of+the+Saccharomyces+cerevisiae+genome.">Functional profiling of the Saccharomyces cerevisiae genome.</a> Nature. 418, 387-391 (2002).</li><li>Baba, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Construction+of+Escherichia+coli+K-12+in-frame,+single-gene+knockout+mutants:+the+Keio+collection.">Construction of Escherichia coli K-12 in-frame, single-gene knockout mutants: the Keio collection.</a> Molecular systems biology. 2, 2006.0008-2006.0008 (2006).</li><li>Claus, H., Frosch, M., Vogel, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+a+hotspot+for+transformation+of+Neisseria+meningitidis+by+shuttle+mutagenesis+using+signature-tagged+transposons.">Identification of a hotspot for transformation of Neisseria meningitidis by shuttle mutagenesis using signature-tagged transposons.</a> Mol Gen Genet. 259, 363-371 (1998).</li><li>Hava, D. 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관심 없음 충돌 선언하지 않습니다.

여기, 우리가 쉽게 태그 돌연변이 컬렉션을 만드는 다른 미생물의 barcoded 돌연변이 컬렉션의 기존 컬렉션의 다양한 적용할 수 있습니다, 겸손한 수정과 프로토콜을 설명했다. 우리가 병원성 효모 C.에 대한 태그 transposon의 돌연변이 유발에 대한 프로토콜을보고있을 때 우리가 그것을 강조 albicans는 매우 유사한 프로토콜은 단세포 진균류의 다양한 적응 수 있습니다. 수정이 프로토콜은 박테리아 13 잘 작동하고, 현재 추가로 곰팡이와 세균 genomes의 번호 컬렉션 공사중입니다. 현재,이 분석은 유전자 작은 분자 상호 작용에 대한 유일한 종합 게놈 차원의 편견 화면을 제공합니다. 분석 중 하나는 특히 강력한 기능은 유전자 또는 작은 분자에 대한 사전 지식이 필요하지 않습니다 것입니다. 이러한 assays의 범위와 능력에도 불구하고, 다른 실험실 자신의 양도는 결과의 분석을위한 초기 자본 투자 및 정보학 도구에 의해 다소 방해했습니다. 분석을위한 강력한 도구와 함께 차세대 시퀀스 판독의 채택과 함께, 우리는 그들의 채택이 증가 기대합니다.

<table border="1"><tbody><tr><td> 항생제 </td><td> 공급 업체 및 카탈로그 번호 </td></tr><tr><td> Carbenicillin </td><td> 시그마, 부분 # C1613 </td></tr><tr><td> Kanamycin </td><td> 시그마, 부분 # K1876 </td></tr><tr><td> spectinomycin </td><td> 시그마, 부분 # S0692 </td></tr><tr><td> Chloramphenicol </td><td> 시그마, 부분 # C0378 </td></tr><tr><td> DNA 클린 - 업 및 농도 키트 </td><td></td></tr><tr><td> QIAprep 스핀 Miniprep 키트 </td><td> Qiagen, 부분 # 27106 </td></tr><tr><td> HiSpeed​​ 플라스미드 맥시 키트 </td><td> Qiagen, 부분 # 12663 </td></tr><tr><td> QIAquick PCR의 정제 키트 </td><td> Qiagen, 부분 # 28106 </td></tr><tr><td> QIAquick 겔 추출 키트 </td><td> Qiagen, 부분 # 28704 </td></tr><tr><td> PCR과 전기 영동의 시약 </td><td></td></tr><tr><td> DNA 형성 촉매의 DNA 중합 효소 (MG - 무료) 버퍼 </td><td> 뉴 잉글랜드 Biolabs, 부분 # M0320L </td></tr><tr><td> Deoxynucleotide 솔루션 믹스 </td><td> 뉴 잉글랜드 Biolabs, 부분 # N0447L </td></tr><tr><td> 25 MM MgCl 2 </td><td> 시그마, 부분 # 63036 </td></tr><tr><td> 아가로 오스, 로딩 염색하고, 핵산은 겔 전기 영동에 적합 얼룩 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 10X 태 버퍼 </td><td> 시그마, 부분 # T8280 </td></tr><tr><td> 1 KB 플러스 DNA 레더 </td><td> Invitrogen, 부분 # 10787026 </td></tr><tr><td> YPD 수프 </td><td></td></tr><tr><td> 효모 추출물의 10g </td><td> 시그마, 부분 # Y1625 </td></tr><tr><td> 20g Bacto 펩톤 </td><td> BD Biosciences, 부분 # 211677 </td></tr><tr><td> 덱스 트로 오스의 20g </td><td> 시그마, 부분 # D9434 </td></tr><tr><td> Labware </td><td></td></tr><tr><td> 멀티채널 pipettes (1000, 200, 20 μL) </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 일회용 pipetting 저수지 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 15 50 ML 원심 분리기 튜브 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 96 - 및 384 자 딥 웰 플레이트 </td><td> Axygen 과학, 부분 # P - 2ML - SQ - CS &amp; P - 384240SQCS </td></tr><tr><td> 96 - 잘하고 384 잘 PCR 플레이트 및 밀봉 필름 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 실링 멀티 잘 번호판을위한 플레이트 롤러 </td><td> 시그마, 부분 # R1275 </td></tr><tr><td> 30 ° C와 37 ° C 접시에 박테리아와 효모 성장과 튜브에 incubators를 흔들어 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 체외 transposon 돌연변이 유발에 </td><td></td></tr><tr><td> EZ - Tn5의 Transposase </td><td> Epicentre의 Biotechnologies, 부분 # TNP92110 </td></tr><tr><td> 높은 처리량 변환 </td><td></td></tr><tr><td> Seqprep 96 HT 플라스미드 준비 키트 </td><td> 에지 Biosystems, 부분 # 84359 </td></tr><tr><td> 폴리에틸렌 글리콜, 분자량 3,350 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 리튬 아세테이트 </td><td> 시그마, 부분 # 517992 </td></tr><tr><td> 무균, 접시 6 - 웰 </td><td> 코닝, 부분 # 3335 </td></tr><tr><td> 50 MG / ML 유리딘 </td><td> 시그마, 부분 # U3750 </td></tr><tr><td> 100X 트리스 - EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) 버퍼 솔루션 </td><td> 시그마, 부분 # T9285 </td></tr><tr><td> 1X TE/0.1M LiOAc </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 연어 testis DNA </td><td> 시그마, 부분 # 1626 </td></tr><tr><td> barcoded 컬렉션의 성장 </td><td></td></tr><tr><td> 48 잘 접시, 접시의 문화를 성장하는 경우 </td><td> 그레 이너 부분 # M9437 </td></tr><tr><td> 접착제 플레이트 씰 </td><td> ABgene, 부분 # AB - 0580 </td></tr><tr><td> 200 ML 문화 flasks </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 흡광도 수있는 분광 광도계 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 250 ML flasks이나 흔들림 분광 광도계를위한 온도 제어 흔드는 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 안전 잠금 Microcentrifuge 튜브, 2 ML </td><td> Eppendorf, 부분 # 0030 120.094 </td></tr><tr><td> 하이브리드화 장비 </td><td></td></tr><tr><td> 하이브 리다이 제이션 오븐 640 </td><td> Affymetrix, 부분 # 800138 </td></tr><tr><td> GeneChip 유체 역 450 </td><td> Affymetrix, 부분 # 00-0079 </td></tr><tr><td> GeneArray 스캐너 3000 </td><td> Affymetrix, 부분 # 00-0212 </td></tr><tr><td> 플로팅 랙과 함께 끓는 물 목욕 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 하이브 리다이 제이션 소모품 </td><td></td></tr><tr><td> Genflex 태그 16K 배열 V2 </td><td> Affymetrix, 부분 # 511331 </td></tr><tr><td> Denhardt의 솔루션, 50X 집중 </td><td> 시그마, 부분 # D2532 </td></tr><tr><td> Streptavidin, R - phycoerythrin 공액 (SAPE) </td><td> Invitrogen, 부분 # S866 </td></tr><tr><td> 안전 잠금 Microcentrifuge 튜브, 0.5 ML </td><td> Eppendorf, 부분 # 0030 123.301 </td></tr><tr><td> 작은 터프 - 명소 </td><td> 다양 생명 공학, 부분 # LTTM - 1000 </td></tr><tr><td> 0.5 M EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) </td><td> BioRad, 부​​분 # 161-0729 </td></tr><tr><td> 10% 트윈 </td><td> 시그마, 부분 # T2700 </td></tr><tr><td> MES 무료 산성 일수화물 </td><td> 시그마, 부분 # M5287 </td></tr><tr><td> MES 나트륨 소금 </td><td> 시그마, 부분 # M5057 </td></tr><tr><td> 5 M NaCl </td><td> 시그마, 부분 # 71386 </td></tr><tr><td> 20X SSPE </td><td> 시그마, 부분 # S2015 </td></tr><tr><td> 분자 생물학 등급 물 </td><td> 시그마, 부분 # W4502 </td></tr><tr><td> 하이브 리다이 제이션 Primers </td><td> 다양한 공급 업체 (표준 탈염) </td></tr><tr><td> Uptag </td><td> 5 &#39;GATGTCCACGAGGTCTCT 3&#39; </td></tr><tr><td> Buptagkanmx4 </td><td> 5 &#39;비오틴 - GTCGACCTGCAGCGTACG 3&#39; </td></tr><tr><td> Dntag </td><td> 5 &#39;CGGTGTCGGTCTCGTAG 3&#39; </td></tr><tr><td> Bdntagkanmx4 </td><td> 5 &#39;비오틴 - GAAAACGAGCTCGAATTCATCG 3&#39; </td></tr><tr><td> B213 </td><td> 5 &#39;비오틴 - CTGAACGGTAGCATCTTGAC 3&#39; </td></tr><tr><td> Uptagkanmx </td><td> 5 &#39;3 GTCGACCTGCAGCGTACG&#39; </td></tr><tr><td> Dntagkanmx </td><td> 5&#39;GAAAACGAGCTCGAATTCATCG 3 &#39; </td></tr><tr><td> Uptagcomp </td><td> 5&#39;AGAGACCTCGTGGACATC 3 &#39; </td></tr><tr><td> Dntagcomp </td><td> 3 5&#39;CTACGAGACCGACACCG &#39; </td></tr><tr><td> Upkancomp </td><td> 5&#39;CGTACGCTGCAGGTCGAC 3 &#39; </td></tr><tr><td> Dnkancomp </td><td> 5&#39;CGATGAATTCGAGCTCGTTTTC 3 &#39; </td></tr><tr><td> 시퀀싱 Primers : Illumina 플랫폼 </td><td> 다양한 공급 업체 </td></tr><tr><td> UpTag 전달 (100uM) </td><td> 5 &#39;CAA GCA GAA GAC GGC ATA CGA GCT CTT CCG GAT GTC ATC T CAC GTC TCT 개그 3&#39; </td></tr><tr><td> UpTag 역방향 (100uM) </td><td> 5 &#39;AAT GAT GCG ACG ACC ACC GAC ACT CTT TCC CTA CAC GAC CTT GCT CCG ATC T NNNNN GTC GAC CTG CGT 전투 편대 ACG 3&#39; </td></tr><tr><td> DownTag 전달 (100uM) </td><td> 5 &#39;CAA GCA GAA GAC GGC ATA CGA GCT CTT GAA CCG ATC T AAC 개그 CTC GAA TTC ATC G 3&#39; </td></tr><tr><td> DownTag 역방향 (100uM) </td><td> 5 &#39;AAT GAT GCG ACG ACC ACC GAC ACT CTT TCC CTA CAC GAC CTT GCT CCG ATC T NNNNN CGG TGT CGG TCT CGT AG 3` </td></tr><tr><td> 1 읽기 UP - 태그 seq 프라이머 (100uM) </td><td> 5 &#39;GTC GAC CTG C​​GT 전투 편대 ACG 3&#39; </td></tr><tr><td> 1 DOWN 태그 seq 프라이머 (100uM)을 읽기 </td><td> 5 &#39;CGG TGT CGG TCT CGT AG 3&#39; </td></tr><tr><td> 이 인덱스 시퀀싱 프라이머 (표준 Illumina R1 프라이머) (100uM)을 읽기 </td><td> 5 &#39;AC ACT CTT TCC CTA CAC GAC CTT GCT CCG ATC T 3&#39; </td></tr><tr><td> 추가 시퀀싱의 시약 / 장비 </td><td></td></tr><tr><td> Qiagen MinElute 96 UF PCR 정화 키트 </td><td> Qiagen, 부분 # 29051 </td></tr><tr><td> 배기기 </td><td> 모든 공급 업체 </td></tr><tr><td> Macherey - 나겔 진공 매니폴드 </td><td> Macherey - 나겔, 부분 # 740 681 </td></tr><tr><td> Invitrogen 퀀트 - IT dsDNA BR 어세이 키트 </td><td> Invitrogen, 부분 # Q32853 </td></tr><tr><td> Invitrogen Qubit 분석 튜브 </td><td> Invitrogen, 부분 # Q32856 </td></tr><tr><td> 40 % 아크릴 아미드 플러스 1 % N, N&#39; - 메틸렌 - 비스 - 아크릴 아미드, 37.5:1 </td><td> 바이오 래드, 부분 # 161-0148 </td></tr><tr><td> 트리스베이스 </td><td> 시그마, 부분 # T1503 - 1KG </td></tr><tr><td> 붕산 </td><td> 시그마, 부분 # B6768 - 500G </td></tr><tr><td> 0.5M EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산), 산도 8.0 </td><td> Teknova, 부분 # E0306 </td></tr><tr><td> 암모늄 Persulfate </td><td> 시그마, 부분 # A3678 - 25G </td></tr><tr><td> TEMED </td><td> Bioshop, 부분 # TEM001.25 </td></tr><tr><td> Ethidium의 브로마이드 솔루션 </td><td> Bioshop, 부분 # ETB444.10 </td></tr><tr><td> 0.5M 질산 에틸 </td><td> Teknova, 부분 # A2000 </td></tr><tr><td> 10mM 마그네슘 아세테이트 tetrahydrate </td><td> 시그마, 부분 # M0631 - 100G </td></tr><tr><td> 1mM EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산), 산도 8.0 </td><td> 0.5M EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산), 산도 8.0를 참조 </td></tr><tr><td> 에탄올 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 아세트산 나트륨, 산도 5.2 </td><td> Teknova, 부분 # S0297 </td></tr><tr><td> 스피드 진공 </td><td> 여러 </td></tr><tr><td> 단일 읽기 클러스터 생성 키트 </td><td> Illumina, 부분 # GD - 300-1001 </td></tr><tr><td> V4 36c 시퀀싱 키트 </td><td>Illumina, 부분 # FC - 104-4002 </td></tr><tr><td></td><td></td></tr></tbody></table> 10X TBE 요리법 <table border="1"><tbody><tr><td> 금액 </td><td> 시약 </td></tr><tr><td> 108g </td><td> 트리스베이스 </td></tr><tr><td> 55g </td><td> 붕산 </td></tr><tr><td> 40mL </td><td> 0.5M EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) (산도 8.0) </td></tr><tr><td colspan="2"> 1L 표시 DH 2 O 추가 </td></tr></tbody></table> 12 % Polyacrylamide 젤 제조법 <table border="1"><tbody><tr><td> 볼륨 </td><td> 시약 </td></tr><tr><td> 5.8 ML </td><td> 40 % 아크릴 아미드 플러스 1 % N, N&#39; - 메틸렌 - 비스 - 아크릴 아미드, 37.5:1 </td></tr><tr><td> 12 ML </td><td> DH 2 O </td></tr><tr><td> 2 ML </td><td> 10X TBE </td></tr><tr><td> 140 μl </td><td> 10 % 질산 Persulfate </td></tr><tr><td> 총 부피 : 20ml </td><td></td></tr></tbody></table> 프라이머 믹스를 Uptag : Resuspend Uptag 100 μm의에서 ddH 2 O의 Buptagkanmx4 각각 다음 50 μm의 각 최종 농도에 대해 1:1 비율로 섞는다. -20 ° C.에 저장 프라이머 믹스를 Downtag : Resuspend Dntag 및 Bdntagkanmx4 100 μm의에서 ddH 2 O에서 각 후, 50 μm의 각 최종 농도에 대해 1:1 비율로 섞는다. -20 ° C.에 저장 혼합 oligonucleotides : 100 μm의에서 ddH 2 O에 다음과 같은 여덟 oligos (표준 desalted)의 각 Resuspend : Uptag, Dntag, Uptagkanmx, Dntagkanmx, Uptagcomp, Dntagcomp, Upkancomp, Dnkancomp. 12.5 μm의 각 최종 농도에 대한 8 oligonucleotides의 동일한 음량을 섞는다. 12 배 MES 재고 : 10 ML 들어, 8 ML 분자 생물학 등급 물 0.7 g MES 무료 산성 일수화물과 1.93 g MES 나트륨 소금을 풀다. 잘 혼합 후, 산도를 확인하고 산도 6.5-6.7 필요하면 조정합니다. 10 ML의 총 볼륨에 물을 추가합니다. 소독 필터와 4 저장 ° C 빛 (예 : 포일에있는 튜브를 랩)에서 보호. 솔루션은 눈에 보이게 노란색 또는 6 개월 후이된다면 바꿉니다. 2X 하이브 리다이 제이션 버퍼 : 50 ML 들어, 12 배 MES 재고 8.3 ML (2.9.14에서), 5 M NaCl, 0.5 M EDTA (에틸렌 다이아 민 테트라 초산) 10 % 트윈 20 0.1 ML (권 / 권)의 4.0 ML, 그리고 19.9 ML ddH 필터링의 17.7 ML를 섞어 2 O. 소독 필터. 와시 : 혼합 300 ML 20X SSPE, 1 ML 10% 트윈 (권 / 권), 699 ML ddH 2 O.을 소독 필터. 와시 B : 믹스 150 ML 20X SSPE, 1 ML 10% 트윈 (권 / 권), 849 ML ddH 2 O. 소독 필터. 바코드 시퀀싱의 primers UP - 태그 프라이머 시퀀스에서 5 &#39;꼬리 (굵게) F와 R 프라이머에 통합 Illumina 특정 어댑터 시퀀스입니다. 변수 순서 (이탤릭체)는 색인 / 멀티플렉싱 읽기 밖에서 사용하는 5 메르 색인 태그를 나타냅니다. 3 &#39;꼬리 (밑줄) uptag 바코드 측면을 노릴 일반적인 뇌관을 상징하고 효모 바코드를 증폭하기 위해 필요합니다. DOWN - 태그에 뇌관은 5 단, 3 &#39;꼬리가 (밑줄) 증폭하는 데 사용되는 일반 primers로 대체될 것이며, UP - 태그 primers (Illumina 특정 순서)의 꼬리&#39;꼬리가 5 동일 &#39;시퀀스 DOWN을 태그는 바코드.

competitive genomic screens of barcoded yeast libraries

차세대 시퀀싱 기술의 진보 미덕으로, 우리는 거의 매일 새로운 게놈 시퀀스에 액세스할 수 있습니다. 이러한 발전의 템포는보다 깊이와 폭이 약속, 가속됩니다. 이러한 놀라운 발전에 비추어, 유전자 기능을 정의하기 위해 고속, 병렬 방법에 대한 필요성이 점점 중요 해지고 있습니다. 효모와 E.의 게놈 전체 삭제 돌연변이의 컬렉션 대장균은 유전자 기능의 기능 특성에 대한 workhorses 역임 있지만,이 접근법은 확장성 아니라, 현재의 유전자 삭제 방법은 삭제하고 확인하는 게놈을 구성하는 유전자의 수천의 각 필요합니다. 이 작업이 완료 후에 우리는 높은 처리량 phenotyping을 추구하실 수 있습니다. 지난 10 년간 우리 연구실 경쟁, 소형, 높은 처리량 게놈 - 와이드 병렬로 수행할 수 있습니다 assays의 포트폴리오를 정제하고 있습니다. 이 parallelization은 바코드가 돌연변이에 대한 프록시 역할을 함께하기 때문에 DNA &#39;태그&#39;또는 각각의 돌연변이에 &#39;바코드&#39;의 포함 가능한이며 하나는 돌연변이 적합성을 평가하기위한 바코드 풍부한을 측정할 수 있습니다. 본 연구에서는, 우리는 DNA 시퀀스 및 barcoded 돌연변이 컬렉션 사이의 간격을 채우기 위해 추구합니다. 이를 위해 우리는 새로 합성 최대 병렬 바코드 assays를 열고 있지만, 제대로 미생물 특징 결합 transposon 중단 - barcoding 방식을 소개합니다. 이 접근법을 설명하기 위해 우리는 새로운 캔디다 albicans barcoded 중단 수집을 제시하고 모두 microarray 기반 및 차세대 시퀀싱 기반 플랫폼이 10,000 수집하는 데 사용할 수있는 방법에 대해 설명 - 단일 실험에서 1,000,000 유전자 - 유전자 및 약물 - 유전자 상호 작용합니다.

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Competitive Genomic Screens of Barcoded Yeast Libraries

우리는 유전자 - 약물 및 유전자 - 환경 상호 작용을 이해하는 포괄적인 불편 게놈 - 와이드 스크린을 개발했습니다. 이러한 돌연변이 컬렉션을 검사 방법이 제공됩니다.

Barcoded 효모 게놈 라이브러리의 경쟁력 화면

By virtue of advances in next generation sequencing technologies, we have access to new genome sequences almost daily.  The tempo of these advances is ...

Research

JoVE Journal

Biology

Large-Scale Screens of Metagenomic Libraries

Metagenomic 도서관 대규모 화면

Metagenomic libraries archive large fragments of contiguous genomic sequences from microorganisms without requiring prior cultivation.  Generating a ...

연구

생물학

Isolation of Genomic DNA from Mouse Tails

마우스 뒷면에서 게놈 DNA의 분리

Technical Demonstration of Whole Genome Array Comparative Genomic Hybridization

전체 게놈 배열 비교 게놈 하이브 리다이 제이션의 기술의 데모

Array comparative genomic hybridization (array CGH) is a method for detecting gains and losses of DNA segments or gene dosage in the genome 1.  Recent ...

Large Insert Environmental Genomic Library Production

대형 삽입 환경 게놈 라이브러리 제작

The vast majority of microbes in nature currently remain inaccessible to traditional cultivation methods. Over the past decade, culture-independent ...

Purification of Mitochondria from Yeast Cells

효모 세포 Mitochondria의 정화

Mitochondria are the main site of ATP production during aerobic metabolism in eukaryotic non-photosynthetic cells1. These complex organelles also play ...

Development of automated imaging and analysis for zebrafish chemical screens.

zebrafish 화학 화면을위한 자동화 이미징 및 분석의 개발.

We demonstrate the application of image-based high-content screening (HCS) methodology to identify small molecules that can modulate the FGF/RAS/MAPK ...

Yeast Colony Embedding Method

효모 콜로니 임베딩 방법

Patterning of  different cell types in embryos is a key mechanism in metazoan development. Communities of microorganisms, such as colonies and biofilms ...

Genomic MRI - a Public Resource for Studying Sequence Patterns within Genomic DNA

게놈 MRI - 게놈 DNA 시퀀스 내의 패턴을 학습에 대한 공개 자료

Non-coding genomic regions in complex eukaryotes, including intergenic areas, introns, and untranslated segments of exons, are profoundly non-random in ...

Genomic Transformation of the Picoeukaryote Ostreococcus tauri

Genomic Transformation of the Picoeukaryote Ostreococcus tauri

Picoeukaryote의 게놈 변환<em&gt; Ostreococcus 타우 리</em

Common problems hindering rapid progress in Plant Sciences include cellular, tissue and whole organism complexity, and notably the high level of genomic ...

Selective Capture of 5-hydroxymethylcytosine from Genomic DNA

게놈 DNA에서 도보로 5 hydroxymethylcytosine의 선택적 캡처

5-methylcytosine (5-mC) constitutes ~2-8% of the total cytosines in human genomic DNA and impacts a broad range of biological functions, including gene ...