Name: amplifying and quantifying hiv-1 rna in hiv infected individuals with viral loads below the limit of detection by standard clinical assays
Uploaded: 2011-09-26T12:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays at JoVE.com

המחברים מבקשים להודות חולים שהשתתפו במחקרים רבים של HIV-1. JMC היה פרופסור מחקר של האגודה האמריקנית לסרטן בתמיכת קרן קירבי FM.

1. הוצאה של RNA מתוך כמויות גדולות של פלסמה סקירה של assay עותק יחיד (SCA) ו הגנום רצף אחד (SGS) פרוטוקול ניתנים איורים 1 ו -2. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> כדי להשיג 7 מ&quot;ל של פלסמה, ספין כ 14 מ&quot;ל של דם נאספו 15 מ&quot;ל EDTA (לא...

<ol>
	<li>Amara, R. R., Villinger, F., Altman, J. D., Lydy, S. L., O'Neil, S. P., Staprans, S. I., Montefiori, D. C., Xu, Y., Herndon, J. G., Wyatt, L. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Control+of+a+mucosal+challenge+and+prevention+of+AIDS+by+a+multiprotein+DNA/MVA+vaccine.">Control of a mucosal challenge and prevention of AIDS by a multiprotein DNA/MVA vaccine.</a> Vaccine. 20, 1949-1955 (2002).</li><li>Dinoso, J., Kim, S., Blankson, J., Siliciano, R. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Viral+Dynamics+of+Elite+Suppressors+in+HIV-1+Infection.">Viral Dynamics of Elite Suppressors in HIV-1 Infection.</a> Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections. , (2008).</li><li>Dinoso, J. B., Kim, S. Y., Wiegand, A. M., Palmer, S. E., Gange, S. J., Cranmer, L., O'Shea, A., Callender, M., Spivak, A., Brennan, T., Kearney, . <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Treatment+intensification+does+not+reduce+residual+HIV-1+viremia+in+patients+on+highly+active+antiretroviral+therapy.">Treatment intensification does not reduce residual HIV-1 viremia in patients on highly active antiretroviral therapy.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106, 9403-9408 (2009).</li><li>Doria-Rose, N. A., Klein, R. M., Manion, M. M., O'Dell, S., Phogat, A., Chakrabarti, B., Hallahan, C. W., Migueles, S. A., Wrammert, J., Ahmed, R., Nason, M., Wyatt, R. T., Mascola, J. R., Connors, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Frequency+and+phenotype+of+human+immunodeficiency+virus+envelope-specific+B+cells+from+patients+with+broadly+cross-neutralizing+antibodies.">Frequency and phenotype of human immunodeficiency virus envelope-specific B cells from patients with broadly cross-neutralizing antibodies.</a> J. Virol. 83, 188-199 (2009).</li><li>Dornadula, G., Zhang, H., Uitert, B. V. a. n., Stern, J., Livornese, L., Ingerman, M. J., Witek, J., Kedanis, R. J., Natkin, J., DeSimone, J., Pomerantz, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Residual+HIV-1+RNA+in+blood+plasma+of+patients+taking+suppressive+highly+active+antiretroviral+therapy.">Residual HIV-1 RNA in blood plasma of patients taking suppressive highly active antiretroviral therapy.</a> JAMA. 282, 1627-1632 (1999).</li><li>Gandhi, R. T., Zheng, L., Bosch, R. J., Chan, E. S., Margolis, D. M., Read, S., Kallungal, B., Palmer, S., Medvik, K., Lederman, M. M., Alatrakchi, N., Jacobson, J. M., Wiegand, A., Kearney, M., Coffin, J. M., Mellors, J. W., Eron, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+effect+of+raltegravir+intensification+on+low-level+residual+viremia+in+HIV-infected+patients+on+antiretroviral+therapy:+a+randomized+controlled+trial.">The effect of raltegravir intensification on low-level residual viremia in HIV-infected patients on antiretroviral therapy: a randomized controlled trial.</a> PLoS medicine. 7, (2010).</li><li>Gay, C., Dibben, O., Anderson, J. A., Stacey, A., Mayo, A. J., Norris, P. J., Kuruc, J. D., Salazar-Gonzalez, J. F., Li, H., Keele, B. F., Hicks, C., Margolis, D., Ferrari, G., Haynes, B., Swanstrom, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cross-sectional+detection+of+acute+HIV+infection:+timing+of+transmission,+inflammation+and+antiretroviral+therapy.">Cross-sectional detection of acute HIV infection: timing of transmission, inflammation and antiretroviral therapy.</a> PLoS One. 6, 19617-19617 (2011).</li><li>Hatano, H., Delwart, E. L., Norris, P. J., Lee, T. H., Dunn-Williams, J., Hunt, P. W., Hoh, R., Stramer, S. L., Linnen, J. M., McCune, J. M., Martin, J. N., Busch, M. P., Deeks, S. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evidence+for+persistent+low-level+viremia+in+individuals+who+control+human+immunodeficiency+virus+in+the+absence+of+antiretroviral+therapy.">Evidence for persistent low-level viremia in individuals who control human immunodeficiency virus in the absence of antiretroviral therapy.</a> J. Virol. 83, 329-335 (2009).</li><li>Havlir, D. V., Bassett, R., Levitan, D., Gilbert, P., Tebas, P., Collier, A. C., Hirsch, M. S., Ignacio, C., Condra, J., Gunthard, H. F., Richman, D. D., Wong, J. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Prevalence+and+predictive+value+of+intermittent+viremia+with+combination+hiv+therapy.">Prevalence and predictive value of intermittent viremia with combination hiv therapy.</a> JAMA. 286, 171-179 (2001).</li><li>Jordan, M. R., Kearney, M., Palmer, S., Shao, W., Maldarelli, F., Coakley, E. P., Chappey, C., Wanke, C., Coffin, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+standard+PCR/cloning+to+single+genome+sequencing+for+analysis+of+HIV-1+populations.">Comparison of standard PCR/cloning to single genome sequencing for analysis of HIV-1 populations.</a> J Virol Methods. 168, 114-120 (2010).</li><li>Kaufmann, D. E., Kavanagh, D. G., Pereyra, F., Zaunders, J. J., Mackey, E. W., Miura, T., Palmer, S., Brockman, M., Rathod, A., Piechocka-Trocha, A., Baker, B., Zhu, B., Gall, S. L. e., Waring, M. T., Ahern, R., Moss, K., Kelleher, A. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Upregulation+of+CTLA-4+by+HIV-specific+CD4++T+cells+correlates+with+disease+progression+and+defines+a+reversible+immune+dysfunction.">Upregulation of CTLA-4 by HIV-specific CD4+ T cells correlates with disease progression and defines a reversible immune dysfunction.</a> Nat Immunol. 8, 1246-1254 (2007).</li><li>Kearney, M., Maldarelli, F., Shao, W., Margolick, J. B., Daar, E. S., Mellors, J. W., Rao, V., Coffin, J. M., Palmer, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV-1+Population+Genetics+and+Adaptation+in+Newly+Infected+Individuals.">HIV-1 Population Genetics and Adaptation in Newly Infected Individuals.</a> J. Virol. 83, 2715-2727 (2008).</li><li>Kearney, M., Palmer, S., Maldarelli, F., Shao, W., Polis, M. A., Mican, J., Rock-Kress, D., Margolick, J. B., Coffin, J. M., Mellors, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Frequent+polymorphism+at+drug+resistance+sites+in+HIV-1+protease+and+reverse+transcriptase.">Frequent polymorphism at drug resistance sites in HIV-1 protease and reverse transcriptase.</a> AIDS. 22, 497-501 (2008).</li><li>Kearney, M., Spindler, J., Shao, W., Maldarelli, F., Palmer, S., Hu, S. L., Lifson, J. D., Kewal Ramani, V. N., Mellors, J. W., Coffin, J. M., Ambrose, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+diversity+of+simian+immunodeficiency+virus+encoding+HIV-1+reverse+transcriptase+persists+in+macaques+despite+antiretroviral+therapy.">Genetic diversity of simian immunodeficiency virus encoding HIV-1 reverse transcriptase persists in macaques despite antiretroviral therapy.</a> Journal of Virology. 85, 1067-1076 (2011).</li><li>Keele, B. F., Giorgi, E. E., Salazar-Gonzalez, J. F., Decker, J. M., Pham, K. T., Salazar, M. G., Sun, C., Grayson, T., Wang, S., Li, H., Wei, X., Jiang, C., Kirchherr, J. L., Gao, F., Anderson, J. A., Ping, L. H., Swanstrom, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+and+characterization+of+transmitted+and+early+founder+virus+envelopes+in+primary+HIV-1+infection.">Identification and characterization of transmitted and early founder virus envelopes in primary HIV-1 infection.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. , 105-7552 (2008).</li><li>Liu, S. L., Rodrigo, A. G., Shankarappa, R. G., Learn, H., Hsu, L., Davidov, O., Zhao, L. P., Mullins, J. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HIV+quasispecies+and+resampling.">HIV quasispecies and resampling.</a> Science. 273, 415-416 (1996).</li><li>Mahalanabis, M., Jayaraman, P., Miura, T., Pereyra, F., Chester, E. M., Richardson, B., Walker, B., Haigwood, N. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Continuous+viral+escape+and+selection+by+autologous+neutralizing+antibodies+in+drug-naive+human+immunodeficiency+virus+controllers.">Continuous viral escape and selection by autologous neutralizing antibodies in drug-naive human immunodeficiency virus controllers.</a> J. Virol. 83, 662-672 (2009).</li><li>Migueles, S. A., Connors, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Role+of+CD4(+)+and+CD8(+)+T+Cells+in+Controlling+HIV+Infection.">The Role of CD4(+) and CD8(+) T Cells in Controlling HIV Infection.</a> Curr. Infect. Dis. Rep. 4, 461-467 (2002).</li><li>Palmer, S., Kearney, M., Maldarelli, F., Halvas, E. K., Bixby, C. J., Bazmi, H., Rock, D., Falloon, J., Davey, R. T., Dewar, R. L., Metcalf, J. A., Hammer, S., Mellors, J. W., Coffin, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiple,+linked+human+immunodeficiency+virus+type+1+drug+resistance+mutations+in+treatment-experienced+patients+are+missed+by+standard+genotype+analysis.">Multiple, linked human immunodeficiency virus type 1 drug resistance mutations in treatment-experienced patients are missed by standard genotype analysis.</a> J. Clin. Microbiol. 43, 406-413 (2005).</li><li>Palmer, S., Wiegand, A. P., Maldarelli, F., Bazmi, H., Mican, J. M., Polis, M., Dewar, R. L., Planta, A., Liu, S., Metcalf, J. A., Mellors, J. W., Coffin, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=New+real-time+reverse+transcriptase-initiated+PCR+assay+with+single-copy+sensitivity+for+human+immunodeficiency+virus+type+1+RNA+in+plasma.">New real-time reverse transcriptase-initiated PCR assay with single-copy sensitivity for human immunodeficiency virus type 1 RNA in plasma.</a> J. Clin. Microbiol. 41, 4531-4536 (2003).</li></ol>

HIV-1 אנשים נגועים על טיפול משולב תרופתי (CART) או שמטבע הדברים לשלוט יש המון זיהום נגיפי נמוך מאוד, בדרך כלל סביב 1 מ&quot;ל לכל עותק של 4 פלזמה, 11, 12, 17, 18. המון נגיפי בחולים עם שליטה טבעית, לעתים קרובות תנודות סביב להגדיר אדם נקודה 1, 2, 17. מבחני הרגישות של המתוארים כאן...

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> שם מגיב </td><td> חברה </td><td> מספר קטלוגי </td><td> תגובות </td></tr><tr><td> Hexamers אקראיים (500 UG / ml) </td><td> Promega </td><td> C118A </td><td></td></tr><tr><td> TaqMan חיץ </td><td> Applied Biosystems </td><td> 4304441 </td><td></td></tr><tr><td> RNAsin (40 U / ul) </td><td> Promega </td><td> N211B </td><td></td></tr><tr><td> האנזים RT (200 U / ul) </td><td> Strategene </td><td> 600107-51 </td><td></td></tr><tr><td> Amplitaq זהב פולימראז ה-DNA </td><td> Applied Biosystems </td><td> 4311814 </td><td> 6-pack </td></tr><tr><td> Amplitaq 10XGold PCR חיץ II </td><td> Applied Biosystems </td><td> 4311814 </td><td> מגיע עם האנזים </td></tr><tr><td> Magnesiumcloride 25 מ&quot;מ </td><td> Applied Biosystems </td><td> 4311814 </td><td> מגיע עם האנזים </td></tr><tr><td> טריס-1M HCl חיץ, pH 8.0, 5 מ&quot;מ </td><td> Invitrogen </td><td> AM9855G </td><td></td></tr><tr><td> כתב עילי III הפוך האנזים transcriptase, 200 U / ul </td><td> Invitrogen </td><td> 18080-044 </td><td></td></tr><tr><td> כתב עילי III חיץ 10X </td><td> Invitrogen </td><td></td><td> מגיע עם האנזים </td></tr><tr><td> DTT 100 מ&quot;מ </td><td> Invitrogen </td><td></td><td> מגיע עם האנזים </td></tr><tr><td> פלטינום תקי DNA פולימראז נאמנות גבוהה 5 U / ul </td><td> Invitrogen </td><td> 11304-102 </td><td></td></tr><tr><td> 10X נאמנות גבוהה PCR הצפת </td><td> Invitrogen </td><td> 11304-102 </td><td> מגיע עם האנזים </td></tr><tr><td> Proteinase K-20 מ&quot;ג / מ&quot;ל </td><td> Ambion </td><td> 2546 </td><td></td></tr><tr><td> Guanidinium Thiocyanate פתרון 6M </td><td> FlukaBiochemica </td><td> 50983 </td><td></td></tr><tr><td> גליקוגן 20 מ&quot;ג / מ&quot;ל </td><td> רוש </td><td> 10901393001 </td><td></td></tr><tr><td> Isopropanol </td><td> סיגמא אולדריץ </td><td> 19516 </td><td></td></tr><tr><td> אתנול 70% </td><td> סיגמא אולדריץ </td><td> E702-3 </td><td></td></tr><tr><td> מים כיתה מולקולרית </td><td> Gibco / Invitrogen </td><td> 10977-015 </td><td></td></tr><tr><td> dNTPs (25 mmol כל אחת) </td><td> Bioline </td><td> BIO-39025 </td><td></td></tr></tbody></table><table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> שם Euipment </td><td> חברה </td><td> מספר קטלוגי </td><td> תגובות </td></tr><tr><td> Easy צנטריפוגה חותם צינורות (16x73mm) </td><td> סיטון מדעי </td><td> 6041 </td><td></td></tr><tr><td> לבן Delrin כתרים </td><td> סיטון מדעי </td><td> 4020 </td><td> Caps עבור צינורות חותם קל </td></tr><tr><td> Tube Rack עבור Bell-Top Tubes Optiseal, 8.9 מ&quot;ל </td><td> Beckman </td><td> 361642 </td><td></td></tr><tr><td> הנהג Hex ½ פתיחת inc </td><td> סיטון מדעי </td><td> 4013 </td><td></td></tr><tr><td> כובע tupe הסרת </td><td> סיטון מדעי </td><td> 4014 </td><td></td></tr><tr><td> 5 pipettes סרולוגיות מ&quot;ל </td><td> שחקן המשנה </td><td> 4051 </td><td></td></tr><tr><td> Pipetboy </td><td> כל </td><td></td><td></td></tr><tr><td> 15 מ&quot;ל pipettes העברה </td><td> ISC Bioexpress </td><td> P-5005-7 </td><td></td></tr><tr><td> 5.8 מ&quot;ל pipettes העברת Dispossable, טיפ מצוין </td><td> VWR </td><td> 14670-329 </td><td></td></tr><tr><td> 15 צנטריפוגות צינורות מ&quot;ל </td><td> בז </td><td></td><td></td></tr><tr><td> 1 מ&quot;ל צינורות צנטריפוגה </td><td> כל </td><td></td><td></td></tr><tr><td> טריס חיץ טבליות מלוחים </td><td> סיגמא אולדריץ </td><td> T5030-100TAB </td><td></td></tr><tr><td> Ultracentrifuge ואת הרוטור </td><td> Sorval </td><td> 90SE ו-T-1270 </td><td></td></tr><tr><td> 96-PCR גם צלחות </td><td> Biorad </td><td> HSS-9601 </td><td></td></tr><tr><td> 50 מ&quot;ל מאגר מגיב </td><td> שחקן המשנה </td><td> 4870 </td><td></td></tr><tr><td> Microamp אופטי 96-היטב צלחת תגובה </td><td> Applied Biosystems </td><td> N801-0560 </td><td></td></tr><tr><td> צלחת אופטית מכסה </td><td> Applied Biosystems </td><td> 4333183 </td><td></td></tr><tr><td> MicroAmp Pad דחיסה אופטי </td><td> Applied Biosystems </td><td> 4312639 </td><td></td></tr><tr><td> Microsealסרט </td><td> Biorad </td><td> MSA-5001 </td><td></td></tr><tr><td> 2 מ&quot;ל צינורות צנטריפוגה </td><td> כל </td><td></td><td></td></tr><tr><td> 1% agarose ג&#39;לים (E-ג&#39;ל, Invitrogen) </td><td> Invitrogen </td><td> G-7008-01 </td><td></td></tr><tr><td> E-הבסיס (Invitrogen) </td><td> Invitrogen </td><td> EB-M03 </td><td></td></tr></tbody></table> EDTA אוסף צינורות כל מותג

amplifying and quantifying hiv-1 rna in hiv infected individuals with viral loads below the limit of detection by standard clinical assays

הגברה גנים נגיפיים לכימות HIV-1-RNA של HIV-1 אנשים נגועים עם המון ויראלי מתחת לגבול של זיהוי על ידי מבחני סטנדרטית (להלן 50-75 עותקים / מ&quot;ל) יש צורך לקבל תובנות על הדינמיקה ויראלי מארח אינטראקציות וירוס בחולים באופן טבעי לשלוט זיהום מי על טיפול משולב תרופתי (CART). כאן אנו מתארים כיצד להגביר את הגנום הנגיפי על ידי ריצוף הגנום יחיד (פרוטוקול SGS) 13, 19, וכיצד לכמת במדויק HIV-1-RNA בחולים עם המון ויראלי נמוך (עותק יחיד (SCA) assay פרוטוקול) 12, 20. Assay עותק יחיד הוא assay בזמן אמת PCR עם רגישות בהתאם לכמות של פלזמה להיות assayed. אם גנום נגיף יחיד מזוהה ב 7 מ&quot;ל של פלסמה, ולאחר מכן במספר עותק RNA הוא דיווח להיות 0.3 עותקים / מ&quot;ל. Assay יש בדיקות הבקרה הפנימית יעילות של מיצוי RNA, בקרות על הגברה אפשרי מ-DNA או זיהום. דגימות החולה נמדדים בשלושה עותקים. יחיד ריצוף הגנום assay (SGS), כעת בשימוש נרחב נחשב ללא עבודה אינטנסיבית 3, 7, 12, 14, 15, הוא assay דילול מגביל, שבו הקצה בדילול מוצר cDNA משתרע על פני 96-טוב צלחת. על פי התפלגות פואסון, כאשר פחות מ 1 / 3 של בארות לתת מוצר, קיים סיכוי של 80% כתוצאה המוצר PCR להיות הגברה של cDNA של מולקולה בודדת. SGS יש יתרון על שיבוט של לא להיות נתון resampling ולא להיות מוטים על ידי רקומבינציה-PCR הציג 19. עם זאת, ההצלחה הגברה של SCA ו SGS תלוי בעיצוב פריימר. מבחני שניהם פותחו ב-HIV-1 תת, אבל יכול להיות מותאמים עבור תת אחרים באזורים אחרים של הגנום על ידי primers, בדיקות משתנה, סטנדרטים.

Watch this Scientific Journal Video about Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays at JoVE.com

Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays (Video) | JoVE

לכמת רמות של HIV-1 RNA בפלסמה רצף יחיד HIV-1 הגנום של אנשים עם המון ויראלי מתחת לגבול הגילוי (50-75 עותקים / מ&quot;ל) קשה. כאן אנו מתארים כיצד לחלץ ולכמת רנ&quot;א נגיפי בפלסמה בזמן אמיתי באמצעות PCR assay כי מהימן אמצעים HIV-1 RNA עד 0.3 עותקים / מ&quot;ל ​​וכיצד להגביר את הגנום הנגיפי על ידי רצף הגנום יחיד, ממדגמים עם המון ויראלי נמוך מאוד.

הגברה וכימות HIV-1 RNA אצל אנשים שנדבקו ב-HIV עם המון ויראלי מתחת לגבול של זיהוי על ידי מבחני קלינית רגילה

Amplifying viral genes and quantifying HIV-1 RNA in HIV-1 infected individuals with viral loads below the limit of detection by standard assays (below ...

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Amplifying and Quantifying HIV-1 RNA in HIV Infected Individuals with Viral Loads Below the Limit of Detection by Standard Clinical Assays

Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3 (Video) | JoVE

הסקה Genotypic של כמיהות HIV-1 שימוש אוכלוסייה מבוססת רצף של V3

Background: Prior to receiving a drug from CCR5-antagonist class in HIV therapy, a patient must undergo an HIV tropism test to confirm that his or her ...

Preparation and Use of HIV-1 Infected Primary CD4+ T-Cells as Target Cells in Natural Killer Cell Cytotoxic Assays

Preparation and Use of HIV-1 Infected Primary CD4+ T-Cells as Target Cells in Natural Killer Cell Cytotoxic Assays (Video) | JoVE

הכנה ושימוש של HIV-1 CD4 ראשי מאשרום + T-תאים כמו תאים היעד של טבע Cell מבחני Killer ציטוטוקסיות

 Natural killer (NK) cells are a vital component of the innate immune response to virus-infected cells. It is important to understand the ability of NK ...

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage Tropism by Sequence Analysis using a Genotypic Approach (Video) | JoVE

ניבוי של שימוש בנגיף HIV-1 Coreceptor (זיקה) על ידי ניתוח רצף באמצעות גישת genotypic

Maraviroc (MVC) is the first licensed antiretroviral drug from the class of coreceptor antagonists. It binds to the host coreceptor CCR5, which is used by ...

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores (Video) | JoVE

ב Uncoating במבחנה של HIV-1 ליבות

The genome of the retroviruses is encased in a capsid surrounded by a lipid envelope. For lentiviruses, such as HIV-1, the conical capsid shell is ...

Imaging of HIV-1 Envelope-induced Virological Synapse and Signaling on Synthetic Lipid Bilayers

Imaging of HIV-1 Envelope-induced Virological Synapse and Signaling on Synthetic Lipid Bilayers (Video) | JoVE

הדמיה של HIV-1 מעטפה הנגרמת סינפסה Virological והאיתות על bilayers שומנים סינתטי

Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection occurs most efficiently via cell to cell transmission2,10,11. This cell to cell transfer between ...

New Tools to Expand Regulatory T Cells from HIV-1-infected Individuals

New Tools to Expand Regulatory T Cells from HIV-1-infected Individuals (Video) | JoVE

כלים חדשים כדי להרחיב תאי T רגולטוריים מאנשים HIV-1 נגוע-

CD4+ Regulatory T cells (Tregs) are potent immune modulators and serve an important function in human immune homeostasis. Depletion of Tregs has led to ...

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System. (Video) | JoVE

הערכת חישה המולדת של CD4 הנגוע ב- HIV-1<sup&gt; +</sup&gt; T תאים על ידי תאים דנדריטים Plasmacytoid שימוש<em&gt; Ex vivo</em&gt; עמית תרבות מערכת.

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the ...

Nucleocapsid Annealing-Mediated Electrophoresis (NAME) Assay Allows the Rapid Identification of HIV-1 Nucleocapsid Inhibitors

Nucleocapsid Annealing-Mediated Electrophoresis NAME Assay Allows the Rapid Identification of HIV-1 Nucleocapsid Inhibitors (Video) | JoVE

חישול בתיווך Nucleocapsid אלקטרופורזה (NAME) Assay מאפשר זיהוי המהיר של HIV-1 Nucleocapsid המעכבים

RNA or DNA folded in stable tridimensional folding are interesting targets in the development of antitumor or antiviral drugs. In the case of HIV-1, viral ...

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals (Video) | JoVE

בידוד של Exosomes מהפלזמה של HIV-1 אנשים חיוביים

Exosomes are small vesicles ranging in size from 30 nm to 100 nm that are released both constitutively and upon stimulation from a variety of cell types. ...

Phagosome Migration and Velocity Measured in Live Primary Human Macrophages Infected with HIV-1

Phagosome Migration and Velocity Measured in Live Primary Human Macrophages Infected with HIV-1 (Video) | JoVE

הגירה ו מהירות Phagosome נמדד המקרופאגים אדם מן המעלה הראשונה חי עם HIV-1

Macrophages are phagocytic cells that play a major role at the crossroads between innate and specific immunity. They can be infected by the human ...