एक दोहन मोड डीएनए प्लाज्मिड, cytoplasmic प्रोटीन और डीएनए प्रोटीन परिसरों के दृश्य के लिए परमाणु बल सूक्ष्मदर्शी विधि (AFM) में वर्णित है. विधि जैव रासायनिक हेरफेर के बाद AFM इमेजिंग के लिए नमूने तैयार करने के लिए वैकल्पिक दृष्टिकोण शामिल हैं. विशिष्ट प्रोटीन बातचीत क्षेत्रों युक्त डीएनए के पास शारीरिक बफर स्थितियों में मनाया जाता है.