Visualisering protein prøver av negative stain elektronmikroskopi (EM) har blitt et populært strukturell analysemetode. Det er nyttig for kvantitativ strukturell analyse, for eksempel beregne en 3D-rekonstruksjon av molekyler som studeres, og også for kvalitativ undersøkelse av kvaliteten på protein preparater. I denne artikkelen presenterer vi detaljerte protokoller for å forberede EM nett, flekker prøven og visualisere prøven i et elektronmikroskop. Uerfarne brukere kan følge disse protokollene og enkelt å bruke negative beis EM som en rutinemessig analyse, i tillegg til andre biokjemiske analyser, for å vurdere deres protein prøver.