Name: specimen preparation, imaging, and analysis protocols for knife-edge scanning microscopy
Uploaded: 2011-12-09T13:00:00
Duration: 10 min 25 s
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इस परियोजना के NIH / NINDS द्वारा वित्त पोषित किया गया था (# 1R01-NS54252), NSF (0,905,041 #, # 0,079,874), टेक्सास उन्नत प्रौद्योगिकी कार्यक्रम (एटीपी # ०,००,५१२-+०,१४६-2001, एटीपी # ०००५१२-+०,२६१-2001), टेक्सास एक एंड एम रिसर्च फाउंडेशन, कंप्यूटर और टेक्सास ए एंड एम विश्वविद्यालय, और 3Scan में विज्ञान और इंजीनियरिंग विभाग. हम बर्नार्ड मेसा (माइक्रो सितारा प्रौद्योगिकी) के लिए तकनीकी परामर्श और KESM उपकरण के लिए समर्थन के लिए धन्यवाद देना चाहूंगा. KESM के डिजाइन और कार्यान्वयन के प्रमुख भागों ब्रूस एच. McCormick है, जो 2007 में मृत्यु हो गई के द्वारा किया गया था.

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	<li>Abbott, L. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+imaging+of+whole+small+animal+brains+with+the+knife-edge+scanning+microscope.">High-throughput imaging of whole small animal brains with the knife-edge scanning microscope.</a> Neuroscience Meeting Planner. Program No. 504.2, (2008).</li><li>Abbott, L. C., Sotelo, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ultrastructural+analysis+of+catecholaminergic+innervation+in+weaver+and+normal+mouse+cerebellar+cortices.">Ultrastructural analysis of catecholaminergic innervation in weaver and normal mouse cerebellar cortices.</a> Journal of Comparative Neurology. 426, 316-329 (2000).</li><li>Choe, Y., Abbott, L. C., Miller, D. E., Han, D., Yang, H. -. F., Chung, J. R., Sung, C., Mayerich, D., Kwon, J., Micheva, K., Smith, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiscale+imaging,+analysis,+and+integration+of+mouse+brain+networks.">Multiscale imaging, analysis, and integration of mouse brain networks.</a> Neuroscience Meeting Planner. Program No. 516.3, (2010).</li><li>Choe, Y., Han, D., Huang, P. -. S., Keyser, J., Kwon, J., Mayerich, D., Abbott, L. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Complete+submicrometer+scans+of+mouse+brain+microstructure:+Neurons+and+vasculatures.">Complete submicrometer scans of mouse brain microstructure: Neurons and vasculatures.</a> Neuroscience Meeting Planner. Program No. 389.10, (2009).</li><li>Choe, Y., Abbott, L. C., Han, D., Huang, P. S., Keyser, J., Kwon, J., Mayerich, D., Melek, Z., McCormick, B. H., Ravi Rao, A., Cecchi, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Knife-edge+scanning+microscopy:+High-throughput+imaging+and+analysis+of+massive+volumes+of+biological+microstructures.">Knife-edge scanning microscopy: High-throughput imaging and analysis of massive volumes of biological microstructures.</a> High-Throughput Image Reconstruction and Analysis: Intelligent Microscopy Applications. , 11-37 (2008).</li><li>Choe, Y., Abbott, L. C., Ponte, G., Keyser, J., Kwon, J., Mayerich, D., Miller, D., Han, D., Grimaldi, A. M., Fiorito, F., Edelman, D. B., McKinstry, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Charting+out+the+octopus+connectome+at+submicron+resolution+using+the+knife-edge+scanning+microscope.">Charting out the octopus connectome at submicron resolution using the knife-edge scanning microscope.</a> BMC Neuroscience. 11, 136-136 (2010).</li><li>Mayerich, D., Abbott, L. C., McCormick, B. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Knife-edge+scanning+microscopy+for+imaging+and+reconstruction+of+three-dimensional+anatomical+structures+of+the+mouse+brain.">Knife-edge scanning microscopy for imaging and reconstruction of three-dimensional anatomical structures of the mouse brain.</a> Journal of Microscopy. 231, 134-143 (2008).</li><li>Mayerich, D., Kwon, J., Sung, C., Abbott, L. C., Keyser, J., Choe, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fast+macro-scale+Transmission+Imaging+of+Microvascular+Networks+Using+KESM.">Fast macro-scale Transmission Imaging of Microvascular Networks Using KESM.</a> Biomedical Optics Express. 2, 2888-2896 (2008).</li><li>McCormick, B. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Development+of+the+Brain+Tissue+Scanner.">Development of the Brain Tissue Scanner.</a> Technical Report. , (2002).</li><li>Sporns, O., Tononi, G., K&#246;tter, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+human+connectome:+A+structural+description+of+the+human+brain.">The human connectome: A structural description of the human brain.</a> PLoS Computational Biology. 1, 42-42 (2005).</li></ol>

टोड Huffman 3Scan, एक वाणिज्यिक कंपनी है कि निर्माण और बाजार KESM प्रौद्योगिकी (अमेरिकी पेटेंट # 6,744,572) के साथ है.

KESM जैविक नमूने (~ 1 3 सेमी) की बड़ी मात्रा के एक सर्वेक्षण submicrometer स्तर के लिए अनुमति देता है . मात्रा के इस तरह पूरे दिमाग, फेफड़े, हृदय, गुर्दे जैसे छोटे पशु अंगों, पकड़ के लिए पर्याप्त है, आदि ऐसे अंगों से छवियों को स्कैन इन अंगों के संरचनात्मक संगठन के बारे में अभूतपूर्व मात्रात्मक जानकारी प्रदान कर सकते हैं और विभिन्न कार्यात्मक के कम्प्यूटेशनल मॉडलिंग को सक्षम सर्किट और नेटवर्क गतिशीलता, बिजली के गुण, द्रव और हवा प्रवाह की गतिशीलता, और मांसपेशियों में गतिशीलता सहित इन अंगों के पहलुओं. नमूना तैयारी प्रोटोकॉल और प्रोटोकॉल विश्लेषण के बाद इस लेख में विस्तृत बाहर अनुसंधान समूहों को मदद करने के लिए KESM करने के लिए आसान पहुँच और परिणामी डेटा की उम्मीद कर रहे हैं. KESM आपरेशन प्रोटोकॉल इन बाह्य शोधकर्ताओं मदद करने के लिए इस अनूठी इमेजिंग साधन के लाभ और सीमाओं की सराहना करेंगे.

A correction was made to <a href="http://www.jove.com/video/3248">Specimen Preparation, Imaging, and Analysis Protocols for Knife-edge Scanning Microscopy</a>. Important modifications were made to the Nissl staining protocol.

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Erratum: Specimen Preparation, Imaging, and Analysis Protocols for Knife-edge Scanning Microscopy

specimen preparation, imaging, and analysis protocols for knife-edge scanning microscopy

उच्च throughput, उच्च संकल्प, 3 डी तकनीक माइक्रोस्कोपी में मेजर अग्रिम submicrometer संकल्प पर neuroanatomical डेटा की बड़ी मात्रा के अधिग्रहण सक्षम है. पहली ऐसी पूरे मस्तिष्क पैमाने पर डेटा के उत्पादन उपकरणों की एक चाकू - एज स्कैन (KESM) माइक्रोस्कोप 7, 5, 9, &#39;लेखक की प्रयोगशाला में विकसित और होस्ट है. KESM अनुभाग और छवि submicrometer संकल्प पर पूरे माउस दिमाग के लिए इस्तेमाल किया गया है, neuronal नेटवर्क के जटिल विवरण (Golgi) 1, 4, 8, संवहनी नेटवर्क (भारत स्याही) 1, 4, और सेल शरीर (Nissl) वितरण 3 खुलासा . KESM का उपयोग माउस और न ही मस्तिष्क के लिए सीमित नहीं है. हम सफलतापूर्वक ऑक्टोपस 6 मस्तिष्क, माउस फेफड़ों, और चूहे के मस्तिष्क imaged है . वर्तमान में हम पूरी ज़ेबरा मछली भ्रूण पर काम कर रहे हैं. इन जैसे डेटा connectomics अनुसंधान 10 के लिए बहुत योगदान कर सकते हैं, microcirculation और hemodynamic अनुसंधान, और प्रावधानों द्वारा stereology अनुसंधानडिंग एक सटीक जमीनी सच्चाई. इस अनुच्छेद में, हम नमूना तैयारी (फिक्सिंग, धुंधला, और एम्बेडिंग) सहित पाइप लाइन, KESM विन्यास और सेटअप, सेक्शनिंग और KESM साथ इमेजिंग, इमेज प्रोसेसिंग, डेटा तैयारी, और डेटा दृश्य और विश्लेषण का वर्णन करेंगे. नमूना तैयार करने और दृश्य / प्राप्त KESM डेटा के विश्लेषण पर जोर दिया जाएगा. हम KESM और इसके उपयोग को बढ़ाने के लिए उपयोग को व्यापक मदद करने के लिए इस लेख में प्रस्तुत विस्तृत प्रोटोकॉल की उम्मीद है.

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Specimen Preparation, Imaging, and Analysis Protocols for Knife-edge Scanning Microscopy

मस्तिष्क नमूना तैयारी से धारावाहिक सेक्शनिंग स्कैन चाकू - एज माइक्रोस्कोप का उपयोग कर डेटा दृश्य और विश्लेषण करने के लिए, इमेजिंग के लिए पूरी प्रक्रिया में वर्णित है. वर्तमान में इस तकनीक के लिए माउस मस्तिष्क डेटा प्राप्त करने के लिए इस्तेमाल किया है, लेकिन यह अन्य अंगों, अन्य प्रजातियों के लिए लागू होता है.

चाकू बढ़त स्कैनिंग माइक्रोस्कोपी के लिए नमूना तैयार करना, इमेजिंग और विश्लेषण प्रोटोकॉल

Major advances in high-throughput, high-resolution, 3D microscopy techniques have enabled the acquisition of large volumes of neuroanatomical data at ...

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Three-dimensional Optical-resolution Photoacoustic Microscopy

तीन आयामी ऑप्टिकल संकल्प Photoacoustic माइक्रोस्कोपी

Optical microscopy, providing valuable insights at the cellular and organelle levels, has been widely recognized as an enabling biomedical technology. As ...

Bacterial Immobilization for Imaging by Atomic Force Microscopy

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Video-rate Scanning Confocal Microscopy and Microendoscopy

वीडियो दर स्कैन Confocal माइक्रोस्कोपी और Microendoscopy

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Creating Adhesive and Soluble Gradients for Imaging Cell Migration with Fluorescence Microscopy

प्रतिदीप्ति माइक्रोस्कोपी के साथ इमेजिंग सेल प्रवासन के लिए चिपकने वाला और घुलनशील Gradients बनाना

Cells can sense and migrate towards higher concentrations of adhesive cues such as the glycoproteins of the extracellular matrix and soluble cues such as ...

High-resolution Spatiotemporal Analysis of Receptor Dynamics by Single-molecule Fluorescence Microscopy

एकल अणु प्रतिदीप्ति माइक्रोस्कोपी द्वारा रिसेप्टर गतिशीलता के उच्च संकल्प Spatiotemporal विश्लेषण

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मीका की तैयारी उच्च संकल्प ऑप्टिकल माइक्रोस्कोपी इमेजिंग के लिए लिपिड bilayers समर्थित

Supported lipid bilayers (SLBs) are widely used as a model for studying membrane properties (phase separation, clustering, dynamics) and its interaction ...

Hybrid &#181;CT-FMT imaging and image analysis

Hybrid Ãƒâ€šÃ‚ÂµCT-FMT imaging and image analysis

हाइब्रिड μCT-FMT इमेजिंग और छवि विश्लेषण

Fluorescence-mediated tomography (FMT) enables longitudinal and quantitative determination of the fluorescence distribution in vivo and can be used to ...

Atomic Force Microscopy Imaging and Force Spectroscopy of Supported Lipid Bilayers

परमाणु शक्ति माइक्रोस्कोपी इमेजिंग और समर्थित लिपिड bilayers के बल स्पेक्ट्रोस्कोपी

Atomic force microscopy (AFM) is a versatile, high-resolution imaging technique that allows visualization of biological membranes. It has sufficient ...

Correlative Light Electron Microscopy (CLEM) for Tracking and Imaging Viral Protein Associated Structures in Cryo-immobilized Cells

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ट्रैकिंग और इमेजिंग के लिए Correlative लाइट इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी (भूखों) क्रायो-मैटीरियल कोशिकाओं में वायरल प्रोटीन संबद्ध संरचनाओं

Due to its high resolution, electron microscopy (EM) is an indispensable tool for virologists. However, one of the main difficulties when analyzing ...

Visualizing Adhesion Formation in Cells by Means of Advanced Spinning Disk-Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy

उन्नत कताई डिस्क के माध्यम से कोशिकाओं में आसंजन गठन visualizing-कुल आंतरिक प्रतिबिंब प्रतिदीप्ति माइक्रोस्कोपी

In living cells, processes such as adhesion formation involve extensive structural changes in the plasma membrane and the cell interior. In order to ...